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Metodologías Básicas en Ecología Evolutiva. Curso de verano URJC.
Directores: José María Iriondo y Silvia Matesanz
Fecha: 6-10/07/2015; Horario: 9-18 (L-J), 9-13 (V)
Lugar: URJC, Campus de Vicálvaro. Sala 157 del Edificio Departamental,
Campus de Madrid, Facultad de Ciencias Jurídicas y Sociales, Paseo de los
Artilleros s/n
Número de plazas: 25
I Curso de Metodologías Básicas
en Ecología Evolutiva
Precio:
Matrícula ordinaria 150 €
Estudiantes, PDI y PAS de la URJC 100 €
Estudiantes de otras universidades, discapacitados, jubilados, desempleados y
miembros de familia numerosa 120 €
Organizan:
6-10 de julio de 2015. Universidad Rey Juan Carlos
http://uverano.urjc.es/event_detail/2352/detail/metodologiasbasicas-en-ecologia-evolutiva-codigo-uv-c-ecolo.html
Nota: las sesiones se acompañarán de ejercicios prácticos utilizando software
libre en entornos Linux y R.
Programa definitivo
Lunes 6 de julio
Módulo I. Conceptos y análisis básicos en genética cuantitativa
Ponente: Dr. Luis Santos del Blanco (Université de Lausanne) e Isabel Rodríguez-Quilón
(INIA)
• Introducción a la genética cuantitativa: caracteres poligénicos, diseño experimental con
estructura anidada y parentesco entre individuos.
• Cálculo de parámetros clave en genética cuantitativa: componentes de la varianza,
heredabilidad, interacción genotipo-ambiente y correlaciones entre caracteres.
• Cálculo de la diferenciación genética entre poblaciones a partir de datos moleculares (FST)
y datos fenotípicos (QST). Comparaciones FST-QST e interpretación de resultados.
• Modelos mixtos: obtención de BLUPs y componentes de la varianza utilizando
metodologías REML y de inferencia bayesiana.
Martes 7 de julio
Módulo II. Genotipado con SNPs: desde la producción de datos a sus aplicaciones en
ecología evolutiva y genética.
Ponente: Dr. Santiago C. González-Martínez (INRA)
• Producción práctica de genotipos utilizando secuenciación dirigida (exoma y genes). Toma
de muestras en campo y construcción de archivos VCF para análisis de genética de
poblaciones. Caso de estudio: la captura de genes en Taxus baccata.
• Análisis de genética de poblacionales (diversidad de nucleótidos, estructura poblacional,
test de neutralidad, etc.) para grandes conjuntos de datos.
• Genotipado con SNPs usando la tecnología Illumina Infinium. Caso de estudio: genotipado
en Pinus pinaster usando un chip bovino.
• Estudios de asociación genética entre genotipos SNP y fenotipos (BLUPs) utilizando
modelos mixtos estándar y bayesianos.
Módulo III. Respuesta funcional adaptativa de plantas a factores abióticos en un
contexto evolutivo
Ponente: Dr. Ismael Aranda (INIA)
• Introducción a la relación entre ambiente y adaptación en plantas dentro de un contexto
evolutivo: rasgos morfo-funcionales con valor adaptativo, equipamientos e infraestructuras
para el estudio ecofisiológico de plantas y precauciones metodológicas.
• Análisis de la respuesta funcional y morfológica a factores abióticos a distintos niveles
genéticos: jerarquización de la respuesta funcional en contextos macro- y micro-evolutivos,
integración de la respuesta funcional con otras escalas biológicas, contextualización de los
estudios ecofisiológicos ante nuevos escenarios climáticos y estudio de la respuesta
funcional futura.
Módulo IV. Introducción al papel de la variación epigenética de las especies vegetales
en un contexto evolutivo
• Ponente: Dr. María Teresa Cervera (INIA)
• Variabilidad epigenética versus variabilidad genética. Mecanismos moleculares de
variación epigenética en plantas.
• Metodología para el estudio de la variabilidad epigenética de plantas.
• Control epigenético del desarrollo y de la respuesta adaptativa en plantas.
Práctica: estudio de variabilidad de metilación de citosinas de especies vegetales no modelo
empleando MSAP.
Miércoles 8 de julio
Módulo VI. Método comparado filogenético
Ponente: Dr. Miguel Verdú (CIDE. CSIC/UV/GV)
• Obtención de filogenias a partir de bases de datos tipo PHYLOCOM, PHYLOMATIC.
• Reconstrucción del estado ancestral de caracteres discretos y continuos sobre filogenias,
utilizando máxima verosimilitud y métodos bayesianos.
• Cálculo de la señal filogenética en la evaluación de un rasgo y cómo interpretar dicha
señal.
• Análisis de evolución conjunta de rasgos, tanto discretos como continuos, utilizando
phylogenetic general least squares (PGLS).
Jueves 9 de julio
Módulo V. Análisis de selección fenotípica
Ponente: Dr. José María Gómez (Universidad de Granada, EEZA CSIC)
• Descripción básica de diferenciales y gradientes de selección fenotípica.
• Estudio de la forma e intensidad de la selección natural utilizando el método de LandeArnold.
• Diferenciación entre selección fenotípica directa e indirecta sobre un rasgo.
• Análisis de episodios de selección.
• Análisis de la causalidad en la relación entre rasgos y eficacia biológica utilizando análisis
de vías.
Viernes 10 de julio
Módulo VI. Discusión general
Ponente: Drs. José María Iriondo y Silvia Matesanz (URJC)
• Repaso de conceptos
• Realización de ejemplos con bases de datos.