Download Introducción a la genética de poblaciones: entendiendo la teoría y

Introducción a la genética de poblaciones: entendiendo la teoría y
aprendiendo a analizar los datos.
Breve justificación
La genética de poblaciones es una disciplina que integra a la ecología, la genética y la
evolución y se encarga de analizar las bases de la evolución. Es una herramienta poderosa
para estudiar aspectos relacionados con la ecología, como aspectos demográficos y de
parentesco, de biología general, por ejemplo, para la descripción de los sistemas
reproductivos y para la evolución, ya que permite cuantificar procesos de divergencia y
especiación. Adicionalmente, el uso conjunto de datos ecológicos y de genética de
poblaciones es una herramienta crítica para la conservación y el manejo de las especies. Por
lo tanto, es importante para el biólogo moderno tener una noción de los conceptos básicos
de genética de poblaciones así como saber la manera de aplicarlos e integrarlos a distintos
análisis ecológicos.
El presente curso es una introducción a los conceptos básicos de genética de
poblaciones y al uso de distintas plataformas de análisis de datos de genética de
poblaciones que permitan realizar análisis e interpretar la información de manera que se
logre integrar ecología y evolución.
Profesores
Dra. Gabriela Castellanos Morales (FES-Iztacala/IE, UNAM;
[email protected]), M en C. Enrique Scheinvar Gottdiener (IE, UNAM;
[email protected]); Dr. Luis E. Eguiarte (IE, UNAM; [email protected]).
Resumen curricular
Dra. Gabriela Castellanos Morales
I. Datos personales:
Correo electrónico: [email protected]
Dirección del sitio web personal: https://scholar.google.es/citations?user=1mG3xIAAAAJ&hl=es
II. Datos Laborales:
Institución de adscripción: UBIPRO, FES Iztacala e Instituto de Ecología, UNAM
Nombramiento académico: Asociado postdoctoral de proyecto
III. Líneas de investigación: Ecología evolutiva, genética de poblaciones, filogeografía y
genética de la conservación.
IV. Actividad reciente: Producción Científica: 5 artículos científicos indexados de circulación
internacional, 1 artículo arbitrado de circulación nacional, 2 capítulos de libro. Tesis
terminadas: 1 de licenciatura.
M en C. Enrique Scheinvar Gottdiener
I. Datos personales:
Correo electrónico: [email protected]
Dirección del sitio web personal: https://www.researchgate.net/profile/Enrique_Scheinvar
https://unam.academia.edu/EnriqueScheinvar
II. Datos Laborales:
Institución de adscripción: Instituto de Ecología UNAM
Nombramiento académico: Prof. Asignatura A, Fac. Ciencias, UNAM.
III. Líneas de investigación: Ecología evolutiva, genética de poblaciones y filogeografía.
IV. Actividad reciente: Producción Científica: 8 artículos internacionales indexados, 3
capítulos de libro y 3 tesis de licenciatura dirigidas.
Dr. Luis E. Eguiarte
I. Datos personales:
Correo electrónico: [email protected]
Dirección del sitio web personal:
https://scholar.google.com.mx/citations?user=rddAc6cAAAAJ&hl=en
II. Datos Laborales:
Institución de adscripción: Instituto de Ecología, UNAM
Nombramiento académico: Investigador Titular C tiempo completo
III. Líneas de investigación:
Ecología evolutiva, genética de poblaciones, filogeografía, evolución molecular y evolución
experimental
IV. Actividad reciente:
Producción Científica: 157 artículos científicos indexados de circulación internacional, 14
artículos arbitrados no indexados, 44 capítulos de libros. Tesis dirigidas terminadas: 29 de
licenciatura, 7 de maestría, 11 de doctorado.
Objetivo
Que el alumno comprenda la teoría básica detrás de conceptos de genética de poblaciones,
conozca el manejo de algunas herramientas bioinformáticas modernas para la obtención de
información genética poblacional y sea capaz de interpretar los datos obtenidos en un
contexto ecológico poblacional.
Temario/temas generales
Unidad 1. Introducción. (día 1)
1.1 Introducción a la genética de poblaciones. (1 hora)
1.2 Equilibrio Hardy Weinberg. (1 hora)
1.3 Marcadores moleculares tradicionales y de nueva generación. (30 min)
1.4 Preparación de los datos: alineamiento de secuencias y construcción de bases de datos
de microsatélites. (1 1/2 horas).
Unidad 2. Variación y estructura genética (día 1 y 2)
2.1 Medidas de variación molecular. (1 hora)
2.2 Flujo génico y estructura poblacional. (2 horas)
2.3 Estimación de medidas básicas de variación genética: GenePop, Arlequin, DNAsp, R
(adegenet, hierfstat, ape, pegas) (1 hora)
2.4 Análisis de estructura genética: Métodos tradicionales (Fst, AMOVA), bayesianos
(Structure) y multivariados (discri. de Comps. Prin). de la estructura genética. (1 hora)
Unidad 3. Selección natural, neutralidad y demografía (días 2 y 3)
3.1 La mutación, la deriva y el equilibrio Wright-Fisher. (1 hora)
3.2 Selección natural, neutralidad y demografía. (2 horas)
3.3 Estimando la selección y deriva: Medidas de neutralidad y medidas de demografía
histórica (R: ape, pegas, DNAsp, Arlequin). (2 horas)
Unidad 4. Endogamia, depresión por endogamia y genética de la conservación (día 3)
4.1 Endogamia y depresión por endogamia. (2 horas)
4.2 Estimando la endogamia: Fis (desviaciones del equilibrio de Hardy-Weinberg, f
individual, análisis de parentesco). (2 horas)
4.3 La importancia de la genética en la conservación y algunas aplicaciones y ejemplos. (1
hora)
Bibliografía básica
Dray S, Dufour AB. 2007. The ade4 package: implementing the duality diagram for ecologists. J Stat
Software. 22:1-20.
Eguiarte Luis E., V. Souza y X. Aguirre (Compiladores). 2007. Ecología molecular. Semarnat, Conabio,
Inst. de Ecología UNAM. D. F., México.574 págs. Disponible como pdf sin costo en
http://www2.ine.gob.mx/publicaciones/consultaPublicacion.html?id_pub=530
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Selkoe KA y Toonen RJ. 2006. Microsatellites for ecologists: a practical guide to using and evaluating
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Duración
3 días, 7 horas diarias, en dos sesiones una de 4 horas (mañana) y otra de 3 (tarde)
respectivamente.
Cupo máximo
10 personas con computadoras personales para instalar programas (cada quien tiene que
conseguir su computadora).
Costos (materiales, equipos, reactivos)
No se identifican
Requerimientos técnicos
1) Cañones y pantallas para proyección
2) Contactos eléctricos para varias computadoras
3) Internet
Contacto
[email protected]; [email protected]; [email protected]