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“Tu quoque fili mi”. Secuenciación y
ultrasecuenciación en la infección por HPV
Dra. Miren Basaras
Dpto. Inmunología, Microbiología y
Parasitología. Universidad del País Vasco
UPV/EHU
La infección por el virus papiloma humano
(VPH) es la más común de las infecciones de
transmisión sexual. Los virus papiloma
humano son responsables de una carga de
enfermedad significativa tanto en varones
como en mujeres. Este virus es un patógeno
que
provoca
infecciones
transitorias,
asintomáticas o subclínicas, sin consecuencia
clínica en los pacientes inmunocompetentes. La respuesta inmunitaria del
huésped parece jugar un papel fundamental en la regresión y persistencia de
los VPH especialmente en los relacionados con oncogénesis que están
asociados a un elevado riesgo de progresión a cáncer cervical.
Este virus se puede considerar un inmunógeno defectuoso puesto que la
presentación de antígenos es limitada, la infección no tiene fase virémica, las
células no sufren lisis y hay poca presentación antigénica; muchas de sus
proteínas se expresan a bajo nivel en el epitelio basal, que es el lugar donde el
sistema inmune es más accesible, y además este virus es muy efectivo en la
evasión de su detección inmune, por lo que el huésped solamente puede
presentar una respuesta lenta y débil.
El virus papiloma humano infecta el epitelio escamoso estratificado y estimula
la proliferación celular. Las células afectadas desarrollan un amplio abanico de
cambios que van desde una hiperplasia benigna a un carcinoma invasivo. La
integración de los VPH de alto riesgo en el cromosoma celular puede
acompañarse de inmortalización de la célula infectada y de una inestabilidad
genómica. La integración viral se acompaña de un paso previo que es la
alteración de la proteína viral E2, que actúa como represor transcripcional de la
expresión de las proteínas E6 y E7. Esta pérdida de E2 provoca un aumento
incontrolado en los niveles de E6 y E7 que son imprescindibles para la
posterior transformación celular. De esta manera se produce un ciclo replicativo
aberrante, abortivo sin producir nuevas partículas virales a diferencia de lo que
ocurre en el ciclo replicativo normal, donde los niveles de E6 y E7 son bajos,
permitiendo sobrevivir y expandirse a las células infectadas por el virus.
Este virus presenta una alta variabilidad genómica con más de 200 genotipos
descritos clasificados en cinco géneros distintos. La clasificación de este virus
se basa en la homología de las secuencias en las regiones E6, E7 y L1. De
esta manera los genotipos presentan una homología del 90%, los subtipos
dentro de un genotipo, presentan una homología del 90-98% y las variantes o
linajes dentro de un subtipo, una homología mayor al 98%. Se han descrito
linajes en varios genotipos. Así, en el genotipo 16 se han descrito 4 linajes
distintos y en el genotipo 18 tres. La presencia de algunos de estos linajes
parece que se han relacionado con un mayor pronóstico de enfermedad
invasiva y cáncer. Por un lado el linaje D del genotipo 16 y por otro el linaje B
del genotipo 18 se han asociado a CIN3.
Por otro lado, diversos estudios indican que hay discordancias entre las
distintas técnicas en el diagnóstico del VPH en relación al genotipo viral
implicado. Ello hace que se busquen nuevos métodos de diagnóstico con el fin
de subsanar estos errores. La secuenciación masiva y la ultrasecuenciación
parece que son las técnicas del futuro que pueden ayudar a mejorar el
diagnóstico y la clasificación del VPH. La secuenciación masiva presenta una
mayor sensibilidad para el VPH de copias bajas en infecciones múltiples. Estas
técnicas también pueden ayudar a determinar la actividad transcripcional y el
lugar de integración.
La utilización de técnicas de secuenciación masiva ha ayudado a
-
incrementar la sensibilidad en la detección de VPH con una mayor
detección de genotipos,
determinar
linajes
virales
a
través
de
sustituciones,
inserciones/delecciones, que aparecen durante la infección persistente
detectar virus cercanos filogenéticamente
Todo ello no sólo en muestras relacionadas con cáncer cervical sino
también en muestras relacionadas con
otras patologías como condilomas
acuminados, carcinomas de células
escamosas,…