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TEMA 17. BIOSÍNTESIS Y REGULACIÓN DEL METABOLISMO. TEMA 17 BIOSÍNTESIS Y REGULACIÓN DEL METABOLISMO ANABOLISMO Anabolismo. Conjunto de procesos bioquímicos mediante los cuales las células sintetizan la mayoría de las sustancias que las constituyen. En estos procesos se sintetizan los monómeros (glúcidos, ácidos grasos, etc) y tiene lugar la polimerización de estos monómeros en macromoléculas. Muchas reacciones anabólicas conducen a un aumento del orden biológico, lo que en términos termodinámicos significa que requieren un aporte de energía para poder llevarse a cabo. Esta energía la proporciona la hidrólisis del ATP, una reacción altamente exergónica (que libera energía). Para sintetizar moléculas biológicas, la célula necesita llevar a cabo una serie de reacciones de reducción, acoplando estas reacciones a la oxidación del NADH o del NADPH (reductores – se oxidan-). BIOSÍNTESIS DE GLÚCIDOS 1. BIOSÍNTESIS DE HEXOSAS EN ORGANISMOS AUTÓTROFOS. Los organismos fotosintéticos utilizan la energía lumínica para obtener ATP y poder reductor en forma de NADPH. Emplean la energía captada de la luz para sintetizar materia orgánica a partir de CO2. Este proceso se denomina fijación del CO2 y tiene lugar mediante un conjunto de reacciones conocidas con el nombre de ciclo de Calvin o ciclo reductor de las pentosas. Véase el esquema del libro. 1. FIJACIÓN DEL ÁTOMO DE CARBONO. La fijación del átomo de carbono del CO2 se produce al reaccionar con la pentosa ribulosa difosfato. Esta reacción está catalizada por la ribulosa-1,5-difosfato Página 1 de 10 TEMA 17. BIOSÍNTESIS Y REGULACIÓN DEL METABOLISMO. carboxilasa oxidasa, también llamada rubisCo, considerada la enzima más abundante del planeta. La rubisCo, que cataliza la reacción de fijación del CO2, también puede catalizar la unión de O2 a la ribulosa 1,5 difosfato, si la concentración de CO2 es baja (el O2 compite con el CO2), en un proceso que se conoce como fotorrespiración. Este proceso supone una limitación de la eficacia fotosintética y su función no está muy clara, aunque se piensa que es un mecanismo para proteger a las plantas de la fotooxidación que, en ausencia de CO2, puede causar daños irreversibles en los cloroplastos. Véase el esquema del libro. Ruta de Hatch-Slack Los efectos de la fotorrespiración son más acusados en las plantas de climas calurosos y con elevada insolación. Algunas de estas plantas (plantas C4), presentan una anatomía especial: las células del mesófilo son las que fijan el CO2, y el ciclo de Calvin tiene lugar en las células que rodean los haces vasculares (células envolventes del haz). Las plantas adaptadas a ambientes desérticos captan CO2 durante la noche, cuando pueden abrir los estomas sin peligro de pérdida de agua, y lo almacenan en forma de ácido málico, que se incorporará al ciclo de Calvin durante el día (metabolismo ácido de las crasuláceas, CAM). Véase el esquema del libro. 2. REDUCCIÓN DEL ÁTOMO DE CARBONO. La reacción de fosforilación requiere ATP. 3. REGENERACIÓN DE LA RIBULOSA FOSFATO PARA INCORPORAR CO2. La enzima que cataliza la reacción es la fosforribuloquinasa. 4. ESTEQUIOMETRÍA DEL CICLO DE CALVIN. En cada “vuelta” del ciclo de Calvin, se fija un átomo de carbono procedente de CO2 Página 2 de 10 TEMA 17. BIOSÍNTESIS Y REGULACIÓN DEL METABOLISMO. Para incorporar seis moléculas de CO2, la enzima rubisCo necesita seis moléculas de ribulosa-1,5-difosfato. Para producir las doce moléculas de fosfoglicerato son necesarias 12 moléculas de ATP y otras 12 de NADH + H+. Para fosforilar seis moléculas de ribulosa fosfato son necesarias otras seis moléculas de ATP. Para obtener una molécula de hexosa a partir de CO2 los organismos fotosintéticos gastan 12 moléculas de NADPH + H+ y 18 moléculas de ATP. 2. BIOSÍNTESIS DE POLISACÁRIDOS EN ORGANISMOS AUTÓTROFOS. 1. BIOSÍNTESIS DEL ALMIDÓN Y DE LA CELULOSA. El almidón y la celulosa son dos homopolímeros, constituidos por subunidades de glucosa. Se dan en vegetales. El almidón es un polímero de reserva, y la celulosa, estructural. Almidón. Se localiza en los amiloplastos, bulbos, tubérculos y muchas semillas. Constituye la reserva energética que la planta utilizará durante la germinación. Consta de dos polisacáridos diferentes: amilosa y amilopectina. EXAMEN La biosíntesis del almidón se produce a partir del gliceraldehído-3-fosfato generando en el ciclo de Calvin, gracias a un proceso de gluconeogénesis que tiene lugar en el estroma de los cloroplastos y que origina glucosa. La polimerización de esta hexosa da lugar a las cadenas de almidón. Celulosa. Largas cadenas de forma aplanada, semejante a cintas, que se disponen paralelamente uniéndose mediante enlaces de hidrógeno para constituir las microfibrillas de celulosa. EXAMEN Se sintetizan en el exterior de la célula gracias a la acción de un complejo enzimático ligado a la membrana plasmática que utiliza un precursor activado, el UDPglucosa. Este precursor se obtiene en un proceso semejante al descrito para la biosíntesis del almidón. Las cadenas de celulosa se autoensamblan en el exterior formando las microfibrillas. Página 3 de 10 TEMA 17. BIOSÍNTESIS Y REGULACIÓN DEL METABOLISMO. 3. BIOSÍNTESIS DE HEXOSAS EN ORGANISMOS HETERÓTROFOS. Intervienen dos compuestos clave: La glucosa-6-fosfato. reacciona con el UTP para convertirse en UDPglucosa, incorporándose de este modo a las rutas de biosíntesis de los polisacáridos. El UDP-glucosa. Es un intermediario clave. Constituye la molécula de partida para la biosíntesis de polisacáridos. Véase el esquema del libro. 1. GLUCONEOGÉNESIS. Cuando una célula se encuentra en un ambiente carente de glucosa, debe realizar una síntesis de esta hexosa. Las células animales tienen que sintetizar la glucosa de novo a partir de precursores celulares. Este proceso se denomina gluconeogénesis y constituye una ruta metabólica inversa a la glucosa. Los metabolitos intermedios son iguales a los que se producen en la glucólisis, sin embargo, intervienen enzimas diferentes. Es un proceso energéticamente desfavorable, es decir, cuesta energía a la célula, la cual debe consumir 6 ATP por cada molécula de glucosa sintetizada. Algunas reacciones transcurren en la mitocondria y otras en el citoplasma. Véase el esquema del libro. 4. BIOSÍNTESIS DE POLISACÁRIDOS EN ORGANISMOS HETERÓTROFOS. A partir de moléculas de monosacáridos, generalmente Hexosas. Las moléculas de partida deben ser activadas. Esta activación se consigue mediante su unión a nucleótidos fosforilados, generalmente el ATP, y se forman UDPhexosas. Algunos polisacáridos, como el glucógeno, son sintetizados para permitir el almacenamiento de los excedentes de glucosa. Página 4 de 10 TEMA 17. BIOSÍNTESIS Y REGULACIÓN DEL METABOLISMO. La biosíntesis del glucógeno (glucogenogénesis) comienza a partir de la glucosa1-fosfato. La enzima glucógeno sintetasa cataliza la reacción del UDP-glucosa con la cadena preexistente de glucógeno que se alarga. Posteriormente actúa una enzima ramificante que cataliza la formación de uniones (1→6). Véase el esquema del libro. BIOSÍNTESIS DE AMINOÁCIDOS Únicamente los vegetales, organismos autótrofos, y algunas bacterias son capaces de sintetizar todos los aminoácidos proteicos. Aquellos que no pueden sintetizarse son los aminoácidos esenciales y deben ser ingeridos en la dieta. Aunque la producción de algunos precursores transcurre en la mitocondria, la biosíntesis de aminoácidos tiene lugar en el citosol. 2 procesos: Síntesis del esqueleto carbonado. Incorporación del grupo amino. Mediante transaminación. Los aminoácidos suelen agruparse en familias. prolina -cetoglutarato → glutamato glutamina arginina lisina oxalacetato → aspartato asparagina homoserina metionina treonina isoleucina alanina piruvato valina leucina Página 5 de 10 TEMA 17. BIOSÍNTESIS Y REGULACIÓN DEL METABOLISMO. 3-fosfoglicerato → serina (+ ácido fólico) glicocola (+H2S) cisteína (+ serina) triptófano fosfoenol piruvato + → ácido corísmico eritosa-4-fosfato fenilalanina tirosina ribosa-5-fosfato → histidina 1. ORIGEN DEL GRUPO AMINO. Ninguno de los precursores metabólicos contiene nitrógeno y, dado que los aminoácidos son compuestos nitrogenados, su biosíntesis requiere una fuente de este elemento. Los vegetales pueden emplear como fuente de nitrógeno el nitrato del suelo. Las bacterias, además del nitrato, son capaces de utilizar nitrito, amoníaco e incluso nitrógeno molecular. Los animales sólo pueden incorporar nitrógeno como grupos amino, por lo que dependen de las proteínas de la dieta. El glutamato actúa como donador de grupos amino. Estas reacciones de transaminación están catalizadas por transaminasas. La unión de los aminoácidos mediante enlaces peptídicos constituye la síntesis de proteínas. BIOSÍNTESIS DE LÍPIDOS Los triglicéridos o grasas se forman por esterificación de tres moléculas de ácidos grasos con una glicerina. Para que se produzca la esterificación ambos componentes tienen que estar activados. Los ácidos grasos de activan uniéndose a la coenzima A (CoA) y a la glicerina en forma de -glicerolfosfato. 1. BIOSÍNTESIS DE ÁCIDOS GRASOS. HÉLICE DE LYNEN. Los ácidos grasos se sintetizan mediante reacciones de condensación de unidades de dos átomos de carbono. El proceso está catalizado por el complejo enzimático ácido graso sintetasa. Página 6 de 10 TEMA 17. BIOSÍNTESIS Y REGULACIÓN DEL METABOLISMO. El acetil-CoA sintetasa es el precursor metabólico. Se forma fundamentalmente en la mitocondria y sale hasta el citosol, donde tienen lugar las reacciones de condensación que conducen a la síntesis de los ácidos grasos. Para iniciar la biosíntesis de una cadena de ácido graso, una molécula de acetilCoA actúa de cebador. Las otras moléculas de acetil-CoA que se van a añadir posteriormente sufren una carboxilación, catalizada por la acetil-CoA carboxilasa, y originan una molécula de tres carbonos, el malonil-CoA. Esta molécula se condensa con el acetil-CoA cebador, lo que provoca una descarboxilación que origina una cadena de ácido graso de cuatro carbonos. Véase el esquema del libro. 2. BIOSÍNTESIS DE TRIGLICÉRIDOS. Gracias a la reacción de esterificación de dos moléculas de acil-CoA con el glicerolfosfato. El producto de esta reacción es el ácido fosfatídico, que reacciona a continuación con otras moléculas de acil-CoA para formar el triglicérido. Se sintetiza en el citosol de las células hepáticas y en los adipositos. Las células del músculo cardíaco pueden almacenar, así mismo, cierta reserva de grasas. BIOSÍNTESIS DE PURINAS Y PIRIMIDINAS Son bases nitrogenadas que forman parte de los nucleótidos. Por tanto, están presentes en los ácidos nucleicos, los nucleótidos trifosfato como ATP y UTP, coenzimas como el NAD y FAD, y también algunas vitaminas. El proceso es sumamente complejo. La mayoría de los átomos derivan de aminoácidos. La biosíntesis de las bases púricas se inicia a partir de la ribosa fosfato. En ella interviene el ácido fólico. Las sulfamidas Las sulfamidas son compuestos antibacterianos que actúan bloqueando la síntesis de ácido fólico en las bacterias, lo que impide la síntesis de bases púricas y, en consecuencia, el crecimiento bacteriano. El ser humano es incapaz de sintetizar el ácido fólico y debe ingerirlo en la dieta. Por esta razón, las sulfamidas no bloquean ninguna ruta metabólica en el organismo. Página 7 de 10 TEMA 17. BIOSÍNTESIS Y REGULACIÓN DEL METABOLISMO. REGULACIÓN DEL METABOLISMO En una célula viva se produce simultáneamente miles de reacciones químicas independientes, catabólicas y anabólicas. Los requerimientos de las células no son siempre iguales y varían son arreglo a la actividad física, estado de salud, ingesta de nutrientes, etc. Por tanto, las enzimas no trabajan con la misma eficacia en todas las circunstancias. EXAMEN Rutas anfibólicas Se llaman así las que participan en el catabolismo y en el anabolismo. Un ejemplo es el ciclo de Krebs. Algunos de los compuestos que aparecen en estas rutas anfibólicas se denominan intermediarios llave: glucosa-6-fosfato, piruvato, gliceraldehído-3-fosfato, fosfoenol-piruvato. Véase el esquema del libro. Las células poseen unos mecanismos básicos de regulación metabólica. 1. REGULACIÓN DE LA SÍNTESIS DE ENZIMAS. Es un sistema de regulación lento. 1. CONTROL DE LA TRANSCRIPCIÓN. Las células son capaces de “conocer” el estado del medio extracelular gracias a la recepción de señales químicas. Éstas tienen como efecto el que determinados genes se transcriban o que otros dejen de transcribirse. Los mecanismos de regulación de la transcripción son la represión y la inducción. 2. REPRESIÓN ENZIMÁTICA. La síntesis de una enzima se reprime cuando el producto de la reacción catalizada por esa enzima se encuentra presente en el medio. 3. INDUCCIÓN ENZIMÁTICA. Es un mecanismo de control positivo, ya que sólo se produce la síntesis de la enzima cuando está presente el sustrato de la reacción enzimática. Este tipo de enzimas se llaman inducibles. Página 8 de 10 TEMA 17. BIOSÍNTESIS Y REGULACIÓN DEL METABOLISMO. Existen unas proteínas, denominadas proteínas activadoras de genes, cuya función consiste en facilitar la unión de la ARN polimerasa al gen que se va a transcribir. 4. REGULACIÓN POSTRADUCCIONAL. Algunas proteínas son sintetizadas en forma de cadena polipeptídica muy larga como resultado de la traducción del ARNm, pero no son activas. La enzima activa se produce como consecuencia de la escisión de uno o varios fragmentos de esta proteína. 2. REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA. 1. REGULACIÓN POR PRODUCTO FINAL. El producto de la reacción inhibe la actividad de la enzima. Este tipo de control es propio de reacciones cuyo producto no se consume inmediatamente y, por tanto, puede acumularse. 2. REGULACIÓN DE LA RETOINHIBICIÓN: ENZIMAS ALOSTÉRICAS. Suele darse en vías metabólicas completas y no en reacciones aisladas. En este tipo de control, la enzima inicial de una ruta metabólica está inhibida por el producto final de dicha ruta. Cuando se trata de rutas metabólicas ramificadas, intervienen varias enzimas, que son reguladas por diferentes productos finales (regulación feedback). La regulación por retroinhibición se efectúa mediante enzimas alostéricas, que pueden cambiar reversiblemente de una configuración activa a otra inactiva por unión de un ligando o efector. 3. REGULACIÓN POR ISOENZIMAS. Las isoenzimas son enzimas que catalizan la misma reacción, pero están sujetas a una regulación diferente. Este tipo de control suele darse en rutas metabólicas ramificadas, en las que uno de los pasos iniciales está ligado por varias isoenzimas, cada una de las cuales es inhibida por uno de los productos finales. Página 9 de 10 TEMA 17. BIOSÍNTESIS Y REGULACIÓN DEL METABOLISMO. 4. REGULACIÓN POR MODIFICACIÓN COVALENTE. En ella se produce un cambio drástico en la actividad catalítica de una enzima por unión covalente de una pequeña molécula a la proteína. Es propia de muchos sistemas de tipo regulador que afectan a cambios en el metabolismo como respuesta a estímulos externos. Son proteínas quinasas las que unen covalentemente grupos fosfato procedentes del ATP a otras enzimas, variando así la actividad de éstas. Para revertir a su estado “normal”, es necesaria la actuación de proteínas fosfatasas, que escinden los grupos fosfato. 3. REGULACIÓN MEDIANTE COMPARTIMENTACIÓN DE RUTAS METABÓLICAS. La presencia de sistemas de membrana intracelulares en las células eucariotas delimita compartimentos. La forma más sencilla de este tipo de control tiene lugar en los complejos multienzimáticos, en los que el producto de una reacción enzimática es el sustrato de la enzima siguiente, con lo cual no difunde al citosol. La existencia de orgánulos celulares en los que tienen lugar procesos metabólicos completos, como la respiración o l fotosíntesis, constituye un nivel superior de este tipo de control. Las enzimas implicadas en estos procesos se localizan en orgánulos concretos. De esta forma, los diferentes orgánulos celulares se especializan en funciones celulares concretas. Página 10 de 10