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Dos tipos de reacciones de sellado de muescas de DNA. Se representan dos formas de sellado de muesca; estos procesos proceden en cuatro pasos (i)
→ (iv). Las enzimas involucradas se denotan por E (arriba, abajo), mientras que los reactivos y productos de molécula pequeña se indican como fosfato
(P); pirofosfato (PP), fosfato inorgánico (Pi; generado a partir de PP por la acción de pirofosfatasas omnipresentes), ribosa (R) y adenina (A). La reacción
de sellado de muesca en la parte superior es catalizada por DNA a topoisomerasa I, y es independiente de energía de ATP porque la energía para la
reformación de enlaces fosfodiéster de DNA es almacenada dentro de la unión covalente de topoisomerasa a DNA (-P-E; arriba) como se muestra por el
ataque nucleofílico del grupo OH 3′ (flecha verde, paso iii) al fosfato del complejo P-E. La reacción de sellado de muesca catalizada por DNA ligasa
De: Organización, replicación y reparación del DNA, Harper. Bioquímica ilustrada, 30e
(abajo) repara roturas en el esqueleto fosfodiéster de DNA que se producen por replicación del DNA y/o reparación del DNA. La reacción de DNA ligasa
Citación:
Rodwell
DA, Botham
KM, Kennelly
Weil P.
Bioquímica
ilustrada,
30e;
En: http://mhmedical.com/
completa requiere
hidrólisis
deVW,
dos Bender
de los enlaces
fosfodiéster
de altaPJ,
energía
delHarper.
ATP. Se
describe el
esquema
de 2016
la reacción
general de la DNA ligasa
Recuperado:
June
06,
2017
desde enzima libre, pasando por activación de enzima que libera pirofosfato (PP), hasta la liberación de enzima libre y liberación de AMP (abajo; como se
© 2017 McGraw-Hill
mencionó, elCopyright
PP es convertido
con rapidez Education.
en 2 molesAll
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Pi porreserved
la acción de pirofosfatasas omnipresentes). La ligasa activada (E-P-R-A) reacciona con
el P 5′ en el sitio de la muesca para formar un complejo de DNA-P-P-R-A(P-R-A=AMP) transitorio que libera la enzima, E. El ataque nucleofílico del grupo