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TRADUCCIÓN
- ARN de transferencia
- Aminoacil tRNA sintetasa
elementos
necesarios
- Ribosomas
-El proceso de traducción
en
eucariotas
en
procariotas
tRNA
aa tRNA
sintetasa
tRNA
cargado
mRN
ribosoma
A
tRNAs
Adaptan física e
informacionalmente
al mRNA con la
proteína codificada
Prokaryoti
c tRNA
genes
Eukaryotic tRNA genes
7 pb
5 pb
3-4 pb
5 pb
Elementos de identidad en los tRNA
Estructura
terciaria
de un
tRNA
AA + ATP + AARS
AARS AA-AMP + PPi
AARS AA-AMP + tRNA
+ AMP
AARS+AA-tRNA
enlace covalente
del aminoácido
al extremo
3´CCA del tRNA
Activación y anclaje covalente del aminoácido al tRNA
E. coli GlnRS·tRNAgln · ATP
Complejo del tipo I
Yeast AspRS·tRNAasp·ATP
Complejo del tipo II
Estructura y función del ribosoma
Eucariótico
Valor S
40S
Masa molecular 1,400 kDa
rRNAs
18S, 1900 nts
Proteínas
> 33
Procariótico
30S
900 kDa
16S, 1540 nts
21
Valor S
60S
Masa molecular 2,800 kDa
rRNAs
28S, 4700 nts
5.8S, 160 nts
5S, 120 nts
Proteínas
> 49
50S
1,600 kDa
23S, 2900 nts
5S, 120 nts
34
sitios funcionales en el ribosoma
5’
3’
Estructura de la subunidad grande
1. rRNA 16S
2. rRNA 5S
3. proteínas (LSU)
4. centro peptidil-transferasa y
mecanismo catalítico
rRNAs 23S y 5S en la estructura terciaria del ribosoma
estructura terciaria del rRNA 5s
Bases conservadas en la estructura
terciaria de la subunidad grande
bases muy conservadas (rojo)
-ligado de substrato y factores
-actvidad catalítica
-estabilización de estructura
tridimensional (gran número de
adeninas)
extensiones variables
(verde)
Estructura de
proteínas ribosomales
13/30 proteínas presentan
extensiones largas:
-estabilizan el plegamiento
terciario
- rellenan los huecos
- funcionan como un
pegamento molecular
-23/29 interaccionan con
más de un dominio
rRNA 23s
- 1157/2923 nucleótidos
hacen contactos de van der
Waals con proteínas
Localización de proteínas en la subunidad grande del ribosoma
Estructura cristalográfica del ribosoma de Haloarcula marismortui a 2.4Å
Túnel de salida de la proteína y extensiones
cercanas de proteínas ribosomales
Túnel de salida de la proteína en la subunidad grande del ribosoma
Comparación de las estructuras secundarias predichas
para los rRNAs 16S de (a) Halobacterium volcanii, (b)
levadura y (c) mitocondria bovina
Traducción
Fibroína
0.1 mm
Resumen del tema de la traducción
Bioquímica de la traducción
1. Activación del aminoácido (ATP, aminoacil-tRNA sintetasa)
2. Pegado covalente del AA al 3´OH del CCA terminal del
tRNA
3. Unión del tRNA al mRNA por apareaminento codónanticodón
4. Formación del enlace peptídico en el ribosoma
5. Terminación del polipéptido
Procariotes: 20aa/s = 20s por 400 AA/proteína
Eucariotes: 2 aa/s
INICIO DE LA TRADUCCIÓN
INICIO DE LA
TRADUCCIÓN
CAP
DEPENDIENTE
ELONGACIÓN DE LA TRADUCCIÓN
Mecanismo de formación del enlace peptídico
Formación del enlace peptídico
TERMINACIÓN DE LA TRADUCCIÓN
Mecanismo de terminación del polipéptido
Mecanismo de inicio de la traducción en E. coli
Estructura del factor de iniciación de la traducción EF-Tu unido
a GDP y a GDPNP
Orientación de las moléculas de tRNA unidas a los
sitios E-, A- y P-
anticodones
Algunos antibióticos
que funcionan como
inhibidores de la
traducción en
bacterias
Rescate de ribosomas bacterianos por tmRNAs
Modificación de los rRNA y funcionalidad del ribosoma