Download Plataforma Para el Análisis de Datos Genómicos y Transcriptómicos

Technological platform for the
analysis of genomic and
transcriptomic data
Arturo Arismendi Espinosa
[email protected]
Grupo de Inmunología Evolutiva e Inmunogenética
Instituto de Genética de la Universidad Nacional
Grupo internacional de investigación en informática
comunicaciones y gestión del conocimiento
Universidad Distrital Francisco José de Caldas
Generate data
Data Analysis
Processing
Process
Preprocessing
Assemble
Anotation
Gene expression
Quantification
Software
FASTQC; FASTXTOOLKIT;
PICARD
VELVET, ABYSS, MULTIPLE-K
Description
Evaluate quality of data
Assenble sequences
BLAST, DESCARGA DE BASES DE Compare sequences vs data bases.
DATOS
Quantify how the sequences
R, DEGSEQ, TOP HAT,
represented are in the sequence
CUFFLINKS
assembled
Software for Assembly
Actual work
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Acropora Digitefera.
Coral reefs.
Environment.
Endangered specie.