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Transcript
Ejercicio de Anotacion
1. Evaluar ala anotacion de un gen:
Utilizar el UCSC Genome Browser (http://genome.ucsc.edu) o Ensembl en el EBI
Encuentra el gen PIGS de humanos en el cromosome 17
a. Que evidencias apoyan la estructura en exones/intrones de la anotacion de Refseq?
b. ¿Que es un gen con splicing alternativo?
c. ¿Hay promotores alternativos o sitios alternatives de poliaadenilacion?
d. ¿Qué programa hace una mejor prediccion del gen?
e. ¿Qué funcion tiene el gen PIGS? ¿Qué evidencias encuentras para esta prediccion?
2. (Advanzado Annota la secuencia ADH del genoma de Droshopila melanoganster
usa programas de identificacion de genes
Genscan: http://genes.mit.edu/GENSCAN.html
Twinscan: http://genes.cs.wustl.edu/
Genid, Genie,
¿Qué programa funciona mejor?, que resultados son mejores?.
Utiliza otras estrategias para anotar la secuencia