Download Mycoplasma genitalium

Características del genoma de E. coli.

4.639.331 pb

4.288 posibles ORFs (~ 88% genomio)

1 % genomio: genes ARNr y ARNt

0,5 % genomio: secuencias repetitivas no codificantes

10% genomio: secuencias reguladoras (promotores, terminadores, ori, etc.)

El 70% de las unidades transcripcionales son de un 1 solo gen.

Existe aproximadamente el mismo número de unidades transcripcionales en las
dos hebras del ADN. Muchos genes de alta expresión se encuentran dispuestos
de modo que se transcriben en el mismo sentido que avanza la horquilla de
replicación.

De las 4.288 potenciales ORFs, el 38% son de función desconocida o hipotética.

Tamaño medio de proteína: 300 aminoácidos. La más larga: 2383 aminoácidos
(función desconocida).

Muchos de los genes actuales han surgido por duplicación a lo largo de la
evolución. Existen grandes familias génicas (p. ej, una familia de 70 genes que
codifican proteínas transportadoras de membrana.

Existen diversas secuencias de inserción así como restos de profagos.

Aproximadamente el 18% del genomio de E. coli se ha incorporado mediante
transferencia horizontal.
Funciones génicas en genomios bacterianos.
Categorías
funcionales
Metabolismo
Estructurales
Transporte
Regulación
Traducción
Transcripción
Replicación
Otras (conocidas)
desconocidas
% de genes en cada categoría
Escherichia coli
Haemophilus
Mycoplasma
influenzae
genitalium
21,0
19,0
14,6
5,5
4,7
3,6
10,0
7,0
7,3
8,5
6,6
6,0
4,5
8,0
21,6
1,3
1,5
2,6
2,7
4,9
6,8
8,5
5,2
5,8
38,1
43,0
32,0
Algunos genomios procarióticos completamente secuenciados.
Organismo
Mycoplasma genitalium
Mycoplasma
pneumoniae
Borrelia burgdorferi
Tamaño (pb)
580.070
816.394
Chlamydia trachomatis
1.042.519
Rickettsia prowazekii
1.111.523
Treponema pallidum
Aquifex aeolicus
Methanococcus
jannaschii
Helicobacter pylori
Pyrococcus horikoshii
Haemophilus influenzae
Chlorobium tepidum
1.138.006
1.551.335
1.664.976
Eubacteria, espiroqueta, cromosoma linear,
causa la enfermedad de Lyme
894 Eubacteria, parásito intracelular obligado,
patógeno de humanos
834 Eubacteria, parásito intracelular obligado,
causa el tifus epidémico
1.041 Eubacteria, espiroqueta, causa la sífilis
1.512 Eubacteria hipertermófila
1.738 Arqueobacteria metanógena
1.667.867
1.738.505
1.830.137
2.100.000
1.590
2.061
1.743
1.900
Synechocystis sp.
Sinorhizobium meliloti
3.573.470
Crom: 3.654.135
pSymA:1.354.226
pSymB: 1.683.333
3.168
3.341
1.293
1.570
4.214.810
4.411.529
4.100
3.924
Bacillus subtilis
Mycobacterium
tuberculosis
Escherichia coli
Mesorhizobium loti
910.725
4.639.221
Crom: 7.036.071
pMLA: 351.911
pMLB: 208.315
ORFs Comentarios
470 Eubacteria, genomio menor conocido
677 Eubacteria, causa pneumonía
853
Eubacteria, causa úlceras pépticas
Arqueobacteria hipertermófila
Eubacteria patógena
Eubacteria, bacteria verde fototrofa
anoxigénica
Eubacteria, cianobacteria
Eubacteria, simbionte fijador de N2 de
leguminosas. La mayoría de los genes
simbióticos ( nod, fix, exo, etc) se localizan en
los pSym. Los genes “house-keeping” se
localizan en el cromosoma excepto 2 que
están en pSymB
Eubacteria, modelo genético de las Gram+
Eubacteria, causa la tuberculosis
4.288 Eubacteria, modelo genético de las Gram6.752 Eubacteria, simbionte fijador de N2 de
320 leguminosas
209
Fuente: página web del NCBI (http://www.ncbi.nih.gov/).
En septiembre de 2002 había 106 genomios de Eubacterias y 17 de Archaea
completamente secuenciados.