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RELACIONES FILOGENÉTICAS EN SEIS FAMILIAS DEL ORDEN GASTEROSTEIFORMES
(ACTINOPTERYGII, PERCOMORPHA), CON ÉNFASIS EN LA FAMILIA GASTEROSTEIDAE
Edinson Rodrigo Sanchez Ortiz código: 2042641
ANEXOS
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Lateral_ethmoid_condition 0= not_extended_to_the_orbit 1=extended_to_the_orbit;
Vomer_location 0= between_ethmoids 1= superficially_anteriorly;
Lachrymal 0=short 1= elongated;
Infraorbitals 0=discontinuous 1=continuous;
Frontal 0=does_not_meet_parasphenoid_lateral_process
1=meet_parasphenoid_lateral_process;
Prootic_and_exoccipital 0= connected 1= widely_separated_by_pterotic;
Parasphenoid 0= narrow 1= expanded_between_the_lateral_ethmoids;
Occipital_condyle 0= concave 1= convex;
Maxillary_shaft 0=expanded_ventrally 1=uniform;
Palatine 0=separate 1= united_at_the_midline_and_to_vomer;
Palatine_head 0= Cylindrical 1= conical;
Metapterygoid 0= separate 1= fused_to_hyomandibula_or_symplectic;
Metapterygoid 0= posterior 1= anterior_to_the_orbit;
Quadrete 0= articulates_with_the_lower_jaw_below 1= in_front_of_orbit;
Interopercle 0= short 1= elongated;
Basihyal 0= small 1= elongated with_enlarged_anterior_cartilage;
Urohyal_blade 0= entire 1= incised_posteriorly;
Hypohyals 0= overlap_anterior_ceratohyal 1= articulate_with_posterior_ceratohyal;
Interhyal 0= cylindrical_and_free 1= round_and_satured_to_posterior_ceratohyal;
Branchiostegal_rays 0= more_than_four 1= four_or_fewer;
Gill_membrane 0= free_from_isthmus 1= united;
Ossified_basibranchials 0= three 1= fewer_than_three;
Epibranchials_1 0= separate 1= attached_to_pharyngeal_toothplate_2;
Epibranchial_3_and_4 0= not_associated 1=associated_with_their_processes_or_heads;
posttemporal_dorsal_process 0=tihgtly_attached_with_a_short_ligament_to_epioccipital
1= ossified_to_cranium;
Cleithrum 0= entire 1= divided_into_two_struts_ventrally;
Scapular_foramen 0= complete 1= incomplete;
scapula_and_first_actinost 0= separate 1= fused_together;
Actinost 0= with_diferent_sizes 1= with_the_same_size;
Actinost_4 0= separate 1= suturated_to_coracoid;
Dorsal_spine_distal_pterygiophores 0= not_expanding 1= expanding;
Dorsal_part_of_occipital_condyle
0=made_of_exoccipitals_1st_centrum_bearing_a_dorsal_facet_that_articulates_with_the
occipital_condyles
1=occipital_condyle_consisting_only_of_basioocipital_and_the_1st_vertebra_lacks_the_do
rsal_facet_but_bears_lateral_facets_that_articulate_with_the_occipital_facets
2=the_first_vertebra_directly_conected_only_to_the_basioccipital;
Anterior_centra 0= separate 1= suture_together;
Neural_arch_of_precaudal_vertebra 0=not_pierced 1=pierced_by_foramina;
Parhypural 0= autogenous 1= fused_to_centrum_or_hypurals;
Condition_of_hypurals 0= autogenous 1= all_fused_to_centrum;
Condition_of_hypural_plates 0= organized_into_three_or_more_plates
1= into_two_plates 2= into_a_single_plate;
Condition_of_the_uroneural_1 0= autogenous 1= fused;
Tabla 1. Caracteres morfológicos con sus estados (Keivany y Nelson, 2004; Mattern, 2004)
Matrix 1. Matriz morfológica generada por el software Winclada 1.00.08.
Tabla 2. Códigos de acceso al GeneBank (Mattern, 2004; Wilson et al., 2001;Chen et al., 2003;
Teske et al., 2007)
Tabla 3. Parámetros para el análisis de sensibilidad en POY 4.1.2.1
Tabla 4. Resultados del calculo del indice de incongruencia de Farris ILD.
Fig 1. Analisis de parsimonia para la evidencia total utilizando busqueda tradicional (1000 replicas,
reteniendo 10 arboles por replica) y soporte Bremer relativo.
Fig 2. Analisis de parsimonia para el Gen 12S, utilizando busqueda tradicional (1000 replicas,
reteniendo 10 arboles por replica) y soporte Bootstrap (100 replicas).
Fig 3. de parsimonia para el Gen 16S, utilizando busqueda tradicional (1000 replicas, reteniendo
10 arboles por replica) y soporte Bootstrap (100 replicas).
Fig 4. Analisis de parsimonia para la evidencia total, se utilizo una busqueda tradicional con 1000
replicas reteniendo 10 arboles por replica, luego se le dio soporte a los nodos con Bremer relativo
Fig 5. Mapeo de caracteres con el numero correspondiente del carácter que soporta el nodo,
hecho por el software Winclada 1.00.08, Parametros de búsqueda L=66 CI=59 Ri=79 heuristica
con 100 replicas.
Fig 1. Modelos evolutivos hallas con R-2.12.0 para el posterior analisis de Maxina Verosimilitud en
PhyML 3.0.
Fig 6. Analisis de Maxima Verosimilitud para el Gen 12S, utilizando el algoritmo SPR, el modelo
evoltivo GTR+gamma (con probabilidad para gamma de 0,374) y soporte Bootstrap con 100
replicas (terminales azules=Gasterosteidae; rojos+azules=Gasterosteiformes; verde= outgroup).
Fig 7. Analisis de Maxima Verosimilitud para el Gen 16S, utilizando el algoritmo SPR, el modelo
evoltivo GTR+gamma+I (con probabilidad para gamma de 0,663) y soporte Bootstrap con 100
replicas (terminales azules=Gasterosteidae; rojos+azules=Gasterosteiformes; verde= outgroup).
Fig 8. Análisis de inferencia bayesiana a partir de los datos moleculares, con probabilidades a
posteriori. (Terminales azules=Gasterosteidae; rojos+azules=Gasterosteiformes; verde= outgroup).
Fig 9. Análisis de inferencia bayesiana a partir de la evidencia total, con probabilidades a
posteriori. (Terminales azules=Gasterosteidae; rojos+azules=Gasterosteiformes; verde= outgroup).