Download Modelo para el gen g3pd Modelo para el gen trnL HKY+G 6420

Anexos
Tabla 1. Códigos de acceso GenBank
Houttuynia cordata
Peperomia blanda
Peperomia cavaleriei
Peperomia emarginella
Peperomia pellucida
Saururus cernuus
Piper augustum
Piper austrocaledonicum
Piper avellanum
Piper concepcionis
Piper hostmannianum
Piper imperiale
Piper magnificum
Piper nigrum
Piper obliquum
Piper rothianum
Piper semiimmersum
Piper thomsonii
Piper urophyllum
Piper wallichii
Piper yucatanense
Taxón
voucher J Smith 4922
voucher J Burrows 8521
voucher Li 06201
voucher C Davidson 10867
voucher E Tepe 578
voucher A Bornstein 853
voucher E Tepe 525
voucher G McPherson 19190
voucher E Tepe 616
voucher C Davidson 10880
voucher E Tepe 599
voucher C Davidson 10882
voucher T Flynn 4261
voucher J Smith 5807
voucher A Bornstein 738
voucher J Smith 6545
voucher Li 06161
voucher Li 061511
voucher C Davidson 10902
voucher Li 06212
voucher M Perez 2898
ndhF
EU519645.1
EU519650.1
EU519652.1
EU519666.1
EU519658.1
EU519644.1
EU519724.1
EU519688.1
EU519733.1
EU519725.1
EU519726.1
EU519732.1
EU519679.1
EU519689.1
EU519717.1
EU519682.1
EU519694.1
EU519693.1
EU519731.1
EU519691.1
EU519728.1
trnL-trnF
EU519555.1
EU519560.1
EU519562.1
EU519576.1
EU519568.1
EU519554.1
EU519634.1
EU519598.1
EU519643.1
EU519635.1
EU519636.1
EU519642.1
EU519589.1
EU519599.1
EU519627.1
EU519592.1
EU519604.1
EU519603.1
EU519641.1
EU519601.1
EU519638.1
trnL
EU519735.1
EU519740.1
EU519742.1
EU519756.1
EU519748.1
EU519734.1
EU519814.1
EU519778.1
EU519823.1
EU519815.1
EU519816.1
EU519822.1
EU519769.1
EU519779.1
EU519807.1
EU519772.1
EU519784.1
EU519783.1
EU519821.1
EU519781.1
EU519818.1
Tabla 2. Análisis de sensibilidad
g3pd
ts1tv2g4
ts1tv2g4
ts1tv2g4
ndhF
ts1tv1g1
ts1tv1g1
ts1tv1g1
trnL
ts1tv1g1
ts1tv1g1
ts1tv1g1
trnL-trnF
ts1tv1g1
ts1tv2g2
ts1tv2g4
ILD
0,040435967
0,058534085
0,072291449
Modelo
-LogL
Tabla 3. Modelos de evolución
Modelo
-LogL
AIC
!
Modelo
-LogL
AIC
AIC
"
Modelo
#
#
-LogL
!
AIC
g3pd
EU519469.1
EU519470.1
EU519472.1
EU519486.1
EU519478.1
EU519544.1
EU519508.1
EU519553.1
EU519545.1
EU519546.1
EU519552.1
EU519499.1
EU519509.1
EU519537.1
EU519502.1
EU519514.1
EU519513.1
EU519551.1
EU519511.1
EU519548.1
Fig1. Árbol de evidencia total obtenido bajo el criterio de parsimonia con un número de pasos igual a
3473. Los números sobre las ramas indican el soporte Bootstrap obtenido con 100 replicas. Los
números por debajo de las ramas indican el soporte de Bremer relativo.
Fig2. Árbol likelihood del gen g3pd a partir del modelo HKY+G. LnL=-6436.26218. Los números sobre
las ramas indican el soporte bootstrap obtenido con 100 replicas.
Fig3. Árbol likelihood del gen ndhf a partir del modelo TVM+G. LnL=-9285.53666. Los números sobre
las ramas indican el soporte bootstrap obtenido con 100 replicas.
Fig4. Árbol likelihood del gen trnL-trnF a partir del modelo TVM. LnL= -1686.68360. Los números
sobre las ramas indican el soporte bootstrap obtenido con 100 replicas.
Fig5. Árbol likelihood del gen trnL a partir del modelo GTR+G. LnL= - 1686.68360. Los números sobre
las ramas indican el soporte bootstrap obtenido con 100 replicas.
Fig 6. Topología obtenía mediante el criterio del factor bayes, a partir de la combinación de 4 genes
(g3pd, ndHf, trnL,trnL- trnF). Los números sobre las ramas indicas la probabilidad a posteriori de los
clados