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TEMA 13. INTRODUCCIÓN AL METABOLISMO 1. METABOLISMO. 2. TIPOS DE ORGANISMOS SEGÚN SU NUTRICIÓN. 3. LAS ENZIMAS A. EL CENTRO ACTIVO B. PROPIEDADES C. INHIBIDORES D. ENZIMAS REGULADORAS 4. EL ATP 5. COENZIMAS DE OXIDO-REDUCCIÓN A. VITAMINAS 1. METABOLISMO. La nutrición de las células supone una serie de complejos procesos químicos catalizados por enzimas que tienen como finalidad la obtención de materiales y/o energía. Este conjunto de procesos recibe el nombre de metabolismo. En el metabolismo las reacciones químicas están encadenadas, de forma que el producto de una reacción es el sustrato o metabolito de la siguiente. Cada uno de los conjuntos de reacciones encadenadas que constituyen el metabolismo se denomina ruta o vía metabólica. Existen dos tipos de vías principales: Anabolismo: vías metabólicas que tienen como finalidad la obtención de sustancias orgánicas complejas a partir de sustancias más simples con un consumo energía. Catabolismo: vías en las que las moléculas complejas que son degradadas a moléculas más sencillas. Esta degradación va acompañada de una liberación de energía (reacciones exergónicas o exotérmicas) que se almacena en forma de ATP, que posteriormente se usa en el anabolismo. 2. TIPOS DE NUTRICIÓN. ORGANISMOS SEGÚN SU Ciertos organismos las obtienen a partir de sustancias inorgánicas, como el CO2, H2O, NO3-, PO4-3, etc. A estos organismos se les llama autótrofos. Otros son incapaces de elaborar los compuestos orgánicos a partir de compuestos inorgánicos y deben obtenerlos del medio, son los organismos heterótrofos. Los organismos además de materiales necesitan también energía. Esta puede ser obtenida de la luz o de sustancias químicas, tanto orgánicas como inorgánicas. Combinando la forma de obtener materiales y la de obtener energía, tendremos cuatro tipos básicos de metabolismo: ▪ Fotolitotrofos: Obtienen la energía de la luz y los materiales a partir de sustancias inorgánicas. Se les llama también fotoautotrofos y fotosintéticos. Ejemplo: las plantas verdes. ▪ Fotoorganotrofos: Obtienen la energía de la luz y los materiales de sustancias orgánicas. Este raro tipo de nutrición sólo es propio de ciertas bacterias como las bacterias purpúreas. ▪ Quimiolitotrofos: Obtienen la energía de procesos químicos y los materiales a partir de sustancias inorgánicas. Se les denomina también quimiosintéticos. Ejemplo: las bacterias férricas, las sulfurosas y las nitrificantes y nitrosificantes. ▪ Quimioorganótrofos: Obtienen la energía y los materiales a partir de sustancias orgánicas. Se les llama también quimioheterotrofos. Ejemplo: los animales y los hongos. 3. LAS ENZIMAS Las enzimas son, en general, proteínas globulares que actúan catalizando los procesos químicos que se dan en los seres vivos. Esto es, actúan facilitando las transformaciones químicas; acelerando considerablemente las reacciones y disminuyendo la energía de activación que muchas reacciones requieren. Intervienen en estas reacciones en muy pequeñas concentraciones, ya que no se consumen ni se alteran durante la reacción y pueden, por lo tanto, actuar sucesivas veces. . Algunas son proteínas en sentido estricto (proteínas simples), y otras son holoenzimas que poseen: una parte proteica (apoenzima) y una parte no proteica, (cofactor) que puede estar formada por iones o moléculas orgánicas (coenzimas) HOLOENZIMA = APOENZIMA (parte proteica) + COFACTOR (iones o coenzimas) A. EL CENTRO ACTIVO Las enzimas tienen una concavidad llamada centro activo o catalítico. Este centro activo está formado por unos determinados segmentos de la cadena de aminoácidos de la enzima (E) que determina una superficie complementaria a la molécula del reactivo o sustrato (S). El centro activo se une al sustrato mediante interacciones débiles, formándose así el complejo enzima-sustrato (ES). Esta unión cambia el sustrato y el complejo ES se transforma en el complejo enzima-producto (EP). A continuación se separan enzima y producto: E + S → ES → E+P En la actualidad se acepta el modelo de ajuste inducido, según el cual el centro activo se adapta al sustrato, aunque ya posea de antemano cierta complementariedad. Por tanto, el centro activo están presentes dos grupos de aminoácidos: Aminoácidos encargados de unir el sustrato. Aminoácidos encargados de transformar químicamente el sustrato para dar los productos. El cofactor es imprescindible e interviene generalmente en la fase catalítica. B. PROPIEDADES Además de todo lo dicho, las enzimas tienen las siguientes propiedades: Especificidad: una enzima actúa sólo sobre un sustrato o un grupo de substratos relacionados, y solo efectúa un tipo de reacción. La especificidad por el tipo de sustrato y por el tipo de reacción catalizada son la base de los criterios de clasificación de las enzimas. Así, las enzimas se nombran añadiendo la terminación asa, bien al nombre del substrato sobre el que actúan (sacarasa), al tipo de actuación que realizan (hidrolasas), o ambos (ADN polimerasa). DENOMINACIÓN 1. Oxidorreductasas 2. Transferasas 3. Hidrolasas 4. Liasas 5. Isomerasas 6. Ligasas FUNCIÓN Reacciones de oxidación-reducción Transferencia de un grupo funcional. Ruptura de una molécula mediante adicción de H2O Ruptura no hidrolítica de enlaces Transformación en su isómero Formación de enlaces. Requiere energía (ATP) Localización: muchas enzimas se encuentran en orgánulos específicos, lo que permite un ambiente favorable para cada tipo de reacción metabólica y evitando interferencias de moléculas con estructuras similares. Las enzimas presentan saturación por el sustrato: la velocidad de una reacción enzimática crece con la concentración de sustrato de forma asintótica hasta un límite denominado velocidad máxima. La actividad enzimática depende de factores como el pH y la temperatura. Las enzimas tienen una temperatura óptima y un pH óptimo. Al aumentar la temperatura, la actividad enzimática también aumenta, pero hasta un límite, ya que los enzimas, como proteínas que son, se desnaturalizan a elevadas temperaturas. Por otra parte, el pH, al influir sobre las cargas eléctricas, podrá alterar la estructura del centro activo y por lo tanto también influirá sobre la actividad enzimática. C. INHIBIDORES Son compuestos químicos que se unen al enzima, en distintos puntos del mismo y disminuyen o incluso impiden su actividad. Estos compuestos pueden ser de distintos tipos: iones, moléculas orgánicas y a veces, el producto final de la reacción. A la acción que realizan se la denomina inhibición. La inhibición puede ser: Inhibición irreversible: Cuando el inhibidor impide permanentemente la actividad enzimática, bien porque se une de forma permanente con grupos funcionales importantes del centro activo o bien porque altera su estructura. Ej. La penicilina inhibe las enzimas que sintetizan la pared bacteriana. Inhibición reversible: El inhibidor se une al enzima de forma temporal mediante enlaces débiles e impide el normal funcionamiento del mismo, pero no la inutiliza permanentemente. Puede ser de dos tipos: Competitiva: El inhibidor es similar al sustrato y se puede unir al centro activo del enzima impidiendo que lo haga el sustrato. Es decir ambos, inhibidor y sustrato compiten por unirse al centro activo del enzima. Inhibición competitiva sustrato inhibidor Enzima Sin inhibidor Enzima con inhibidor No competitiva: El inhibidor no compite con el sustrato, puede actuar de 2 formas: Los inhibidores competitivos son sustancias, muchas veces similares químicamente a los sustratos, que se unen al centro activo impidiendo con ello que se una el sustrato. El proceso es reversible y depende de la cantidad de sustrato y de inhibidor, pues ambos compiten por la enzima. Sobre el enzima, uniéndose a él en un lugar diferente al centro activo y modificando su estructura, lo que dificulta que el enzima se pueda unir con el sustrato. Sobre el complejo E-S, uniéndose a él y dificultando su desintegración y por lo tanto la formación de los productos. D. ENZIMAS REGULADORAS. Estas enzimas poseen además del centro activo, otro centro llamado centro regulador o alostérico donde se puede unir un modulador o regulador alostérico que, puede ser un activador o un inhibidor de la enzima. Si el centro regulador esta vacío la enzima actúa a velocidad normal; si está ocupado por el regulador se producen cambios en la conformación, y dependiendo de que sea activador o inhibidor adoptará una forma más o menos activa. Los enzimas alostéricos desempeñan un papel muy importante en la regulación de las reacciones metabólicas, suelen actuar en puntos estratégicos de las rutas metabólicas como son: la primera reacción de una ruta metabólica o los puntos de ramificación de una ruta metabólica. El propio sustrato de la primera reacción es el que actúa como activador alostérico, al unirse con el enzima produce el cambio que da lugar a la conformación activa. También el producto final de la ruta metabólica puede actuar como inhibidor alostérico, produciendo la aparición de la conformación inactiva. Este proceso se denomina retroinhibición 4. EL ATP El Adenosín Trifosfato (ATP) es un nucleótido que actúa almacenando y transportando energía libre en los procesos metabólicos de todas las células. Es la moneda de intercambio energético que permite todas las funciones celulares. La energía liberada en las reacciones catabólicas se usa para fosforilar ADP, generando ATP. La energía almacenada en el ATP se utiliza en la mayoría de los trabajos celulares. Por lo tanto, el ATP acopla los procesos productores de energía de la célula a los consumidores de energía. Trabajo Mecánico: batido de cilios y flagelos, lcontracción de las células musculares, el movimiento de los cromosomas durante la división celular. Trabajo de Transporte endocitosis y exocitosis. activo, Trabajo Químico: impulso de reacciones endergónicos (anabólicas) Adenosín trifosfato La capacidad para ceder y captar energía del sistema ATP → ADP se debe a la repulsión entre las cargas negativas de los grupos fosfato. Estos grupos almacenan la energía, que se libera cuando dichos grupos se hidrolizan. Además del ATP, existen otros nucleótidos con funciones similares. Por ejemplo, en la síntesis de proteínas interviene el GTP (guanosín trifosfato) 5. COENZIMAS DE OXIDO-REDUCCIÓN En general la oxidación consiste en la perdida de electrones y la reducción en la ganancia de electrones: oxidación Fe2+ Fe3+ + e- reducción Cl + e- Cl- . Para que un compuesto se oxide es necesario que otro se reduzca, es decir la oxidación de un compuesto siempre va acoplada a la reducción de otro. Las oxidaciones, también se denominan combustiones y en ellas se desprende energía, mientras que en las reducciones se requiere un aporte energético. Los procesos de oxido-reducción tienen gran importancia en el metabolismo, porque muchas de las reacciones del catabolismo son oxidaciones en las que se liberan electrones; mientras que muchas de las reacciones anabólicas son reducciones en las que se requieren electrones. Los electrones son transportados desde las reacciones catabólicas de oxidación en las que se libera, hasta las reacciones anabólicas de reducción en las que se necesitan. Este transporte lo realizan principalmente 3 coenzimas: NAD+ (dinucleótido de nicotidamina y de adenina), NADP (fosfato del dinucleótido de nicotidamina y de adenina)y FAD (mononucleótido de flavina). Estas coenzimas no se gastan, ya que actúan únicamente como intermediarios, cuando captan los electrones se reducen y al cederlos se oxidan regenerándose de nuevo. A. LAS VITAMINAS Las vitaminas son un conjunto de moléculas esenciales que intervienen en numerosas funciones celulares específicas y que no pueden ser sintetizadas por ningún proceso metabólico en nuestro cuerpo, por lo que deben formar parte de nuestra dieta. Pues bien, la función de las vitaminas hidrosolubles consiste en formar parte de lo coenzimas: Por ejemplo, la Niacina (vitamina B3) forma parte de la coenzima NAD+.