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Uso de recursos informáticos en Biología y Genética Molecular
Objetivos de aprendizaje.
Que los asistentes al curso se inicien en el uso de algunos programas bioinformáticos y
bases de datos disponibles en la “World Wide Web” de aplicación rutinaria en Biología y
Genética molecular. Estas herramientas informáticas permiten la búsqueda y obtención de
información acerca de genes relacionados con enfermedades hereditarias humanas.
Metodología.
Tras una breve introducción de conceptos básicos de Biología Computacional y
Bioinformática, los asistentes al curso llevan a cabo todas las actividades utilizando un
ordenador personal conectado a Internet. Los alumnos cuentan con un guión detallado de
las actividades, las tareas específicas a realizar, y una lista de los sitios web que
utilizarán. En paralelo con los alumnos el profesor lleva a cabo las actividades propuestas,
y guía a los asistentes mediante proyección en pantalla de su ventana informática de
trabajo.
Programa de actividades:
En este curso se usará como ejemplo el gen Frataxina, cuya mutación provoca la
enfermedad de la ataxia de Friedreich.
1) Búsqueda de información en la literatura científica usando PubMed
Artículos de investigación
Libros especializados y manuales
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Literature/
2) Búsqueda de información en OMIM, una base de datos de enfermedades
hereditarias humanas y sus genes asociados.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Literature/
3) Exploración de la estructura genómica de Frataxina en el genomio humano con
ENSEMBL.
http://www.ensembl.org/index.html
4) Recopilar datos acerca de la función y otras propiedades de la proteína Frataxina
mediante su clasificación GO (Ontología Génica) con el programa AmiGO.
http://www.geneontology.org
5) Búsqueda de las propiedades de la proteína Frataxina derivadas de su estructura
primaria y secundaria en Swiss-Prot.
http://www.expasy.org/
6) Exploración de la estructura terciaria y cuaternaria de la proteína Frataxina en PDB y
PDBsum.
http://www.ebi.ac.uk/pdbsum/