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Dr. Francisco Barona Goméz Evolution of Metabolic Diversity lab El objetivo principal del laboratorio consiste en entender el mecanismo evolutivo de una bacteria, desde el punto de vista bioquímico, hasta su adaptación en sistemas ecológicos. Además de estudiar el metabolismo de las bacterias a través de la diferenciación morfológica desde una perspectiva genómica y la perdida de genes a lo largo del proceso evolutivo. Uno de los modelos de estudio es Streptomyces, por secuenciación masiva, se determinaron nuevas rutas metabólicas además del ensamblado de enzimas. Por lo general es la estrategia experimental que se sigue en el laboratorio. Se inicia con salidas al campo para la colecta de bacterias, se realiza un árbol filogenético con los sitios de conservación de esas baterías y en base al árbol se hace la reconstrucción de las redes metabólicas a escala genómica, la predicción funcional y composición de enzimas y determinar sí existen huecos metabólicos en las rutas bacterianas por medio de un análisis evolutivo. Finalmente se realiza la validación experimental por espectrometría de masas. En el laboratorio se elaboró una base de datos con el registro de rutas metabólicas prevenientes de enzimas que antes ya se habían reportado en mutantes. Con ésta base se pueden realizar predicciones de enzimas y reacciones, y se realizan construcciones biosintéticas. Además se pueden identificar condiciones de expresión génica para metabolitos de especialidad y el estudio de evolución enzimática para “missing genes” que se expresen en enzimas “promiscuas”.
