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TITULACIÓN: Máster Universitario en Biotecnología y Biomedicina
CURSO ACADÉMICO: 2010-2011
GUÍA DOCENTE
1. DATOS BÁSICOS DE LA ASIGNATURA
NOMBRE: Microscopía avanzada y análisis de imagen
CÓDIGO1: 90030006
CURSO ACADÉMICO: 2010-11
TIPO: Presencial
Créditos ECTS: 4
FECHAS IMPARTICIÓN2:
Semana 24 a 28 enero: 4 sesiones de 2h de teoría (total 8h)
Semana 31 enero al 4 febrero: 4 sesiones de 2h teoría (total 8h)
Semana del 7 al 11 febrero: 4 sesiones de 4h de laboratorio (total 16h)
Semana de 14 al 18 febrero: 4 sesiones de 2h (2 de laboratorio y 2 seminarios de
exposición de trabajos), (total 8h)
Horas totales presenciales: 40
2 Indíquese las fechas y número de horas semanales dedicadas a cada actividad, trabajo autónomo y
evaluación. Especifíquese cuáles son estas actividades (clases expositivas, seminarios, laboratorios,
prácticas, trabajo en grupo, tutorías colectivas, etc.) de acuerdo a lo expuesto en el apartado 6 de esta
ficha “Metodología y Actividades”.
2. DATOS BÁSICOS DEL PROFESORADO
NOMBRE: Juan Ángel Pedrosa Raya
CENTRO/DEPARTAMENTO: Dpto. Biología Experimental
INSTITUCIÓN: Universidad de Jaén
ÁREA: Biología Celular
Nº DESPACHO: B3-341
E-MAIL: [email protected]
URL WEB:
NOMBRE: Raquel Hernández Cobo
CENTRO/DEPARTAMENTO: Dpto. Biología Experimental
INSTITUCIÓN: Universidad de Jaén
ÁREA: Biología Celular
Nº DESPACHO: B3-303
E-MAIL: [email protected]
URL WEB: http://www4.ujaen.es/~rhernand/
NOMBRE: Mª Isabel Torres López
CENTRO/DEPARTAMENTO: Dpto. Biología Experimental
INSTITUCIÓN: Universidad de Jaén
ÁREA: Biología Celular
Nº DESPACHO:B3-361
E-MAIL: [email protected]
URL WEB:
TLF:953212155
TLF: 953212763
TLF: 953212762
NOMBRE: Jorge Nicolás Domínguez Macías
CENTRO/DEPARTAMENTO: Depto. Biología Experimental
INSTITUCIÓN: Universidad de Jaén
ÁREA: Biología Celular
Nº DESPACHO: B3-304
E-MAIL: [email protected]
URL WEB:
NOMBRE: José Rodrigo García
CENTRO/DEPARTAMENTO: Instituto Cajal
INSTITUCIÓN: Consejo Superior de Investigaciones Científicas
ÁREA:
Nº DESPACHO:
E-MAIL: [email protected]
URL WEB:
TLF: 953213361
TLF: 915654714
3. PRERREQUISITOS, CONTEXTO Y RECOMENDACIONES
PRERREQUISITOS:
Ninguno
CONTEXTO DENTRO DE LA TITULACIÓN:
La asignatura está encuadrada dentro del módulo “Técnicas de Biología Molecular y
Celular” y sus contenidos, referentes al conocimiento del manejo y tipos de
microscopios, así como a la gestión y trabajo con imágenes digitalizadas son
herramientas de uso habitual en una gran mayoría de líneas de investigación biomédica.
RECOMENDACIONES Y ADAPTACIONES CURRICULARES:
4. COMPETENCIAS Y RESULTADOS DE APRENDIZAJE
Código
CG1
CG2
CG3
CG4
CE12
Denominación de la competencia
Diseñar y planificar experimentos de investigación.
Ejecutar dichos experimentos así como interpretar los resultados.
Diseñar estrategias experimentales alternativas.
Manejo de bibliografía y documentación científica en inglés
Conocer los fundamentos y el manejo de las diferentes opciones
en microscopía avanzada y técnicas de preparación histológica
Resultados de aprendizaje
Resultado 1
Resultado 2
Resultado 3
El alumno sabrá utilizar todos los tipos de microscopios así como
realizar la preparación previa de las muestras biológicas
Resultado n
5. CONTENIDOS
Conocer los fundamentos y manejo de los distintos tipos de microscopios y su aplicación
en los diferentes campos de la investigación, así como los métodos más usuales de
captura y tratamiento de las imágenes obtenidas.
Bloques temáticos:
1. El microscopio óptico biológico. Componentes ópticos y mecánicos.
2. Otros tipos de microscopios ópticos, elementos que los integran, manejo y
aplicaciones de los mismos
3. Microscopios electrónicos: bases de su funcionamiento y componentes.
4. Métodos de preparación de muestras con destino a los diferentes tipos de
microscopios electrónicos.
5. Técnicas especializadas en detección y análisis aplicadas a la microscopía.
6. Sistemas de captura de imágenes en microscopía óptica y electrónica
7. Tratamiento y gestión de las imágenes digitales.
8. Fundamentos del análisis de imagen y manejo de aplicaciones informáticas al efecto
9. Técnicas de reconstrucción fotográfica en microscopía óptica, tanto en 2D como en
3D.
6. METODOLOGÍA Y ACTIVIDADES
ACTIVIDADES
HORAS
PRESENCIALES
HORAS DE TOTAL
CRÉDITOS COMPETENCIAS
TRABAJO
DE
ECTS
(Códigos)
AUTÓNOMO HORAS
Clases expositivas en
gran grupo:

Actividades
introductorias
 Sesión magistral
 Conferencias
Clases en grupos de
prácticas:
 Prácticas
 Laboratorios
 Seminarios
 Debates
 Resolución
ejercicios
 Presentaciones y
exposiciones
Tutorías colectivas e
10
15
25
1
CE12
24
36
60
2.4
CE12, CG4,
CG6
6
9
15
0.6
CE12, CG4,
individuales:
 Supervisión de
trabajos dirigidos
 Seminarios
 Debates
 Aclaración de dudas
 Comentarios de
trabajos individuales
 Presentaciones y
exposiciones
TOTALES:
CG6
40
60
100
4
7. SISTEMA DE EVALUACIÓN
ASPECTO
CRITERIOS
-Participación activa en la clase.
Asistencia y
-Participación en los debates
participación
-Participación en el trabajo grupal
-Entrega de los casos-problemas bien
resueltos.
-En cada trabajo se analizará:
Realización de trabajos
- Estructura del trabajo
o casos
- Calidad de la documentación
- Originalidad
-Ortografía y presentación
INSTRUMENTO
PESO
Observación y
notas del profesor
50%
2 Trabajos (1
individual; 1 en
grupo)
50%
El sistema de calificación se regirá por lo establecido en el RD 1125/2003 de 5 de septiembre por el que
se establece el sistema europeo de créditos y el sistema de calificaciones en las titulaciones universitarias
de carácter oficial.
8. DOCUMENTACIÓN/BIBLIOGRAFÍA
ESPECÍFICA o BÁSICA:
Fundamentos de microscopía y tipos de microscopios
HERMAN B, LEMASTER JJ. (1992). Optical microscopy. Emerging methods and
applications, Academic Press Inc.
LOCQUIN M, LANGERON M. (1985) Manual de microscopía, Ed. Labor
MONTUENGA L., ESTEBAN F. y CALVO A. (2009). Técnicas en histología y biología
celular. Ed. Elsevier Masson. Barcelona
SAMAR ME, ÁVILA R, ESTEBAN FJ. (2000) Técnicas Histológicas: fundamentos y
aplicaciones. SeisC, Córdoba (Argentina).
MICROSCOPY AND ANALYSIS, Wiley, Edición Europea. Revista mensual gratuita
sobre microscopía en general. Suscripciones a través de la página: www.microscopyanalysis.com
Molecular Expressions Primer_ Introduction to Microscopy
http://nobelprize.org/educational_games/physics/microscopes/tem/tem.html
http://nobelprize.org/educational_games/physics/microscopes/phase/index.html
http://nobelprize.org/educational_games/physics/microscopes/fluorescence/index.html
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/virtual/confocal/index.html
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/java/phasecontrast/phasemicroscope/index.html
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/virtual/fluorescence/index.html
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/virtual/combination/index.html
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/java/dic/lightpaths/index.html
http://www.microscopyu.com/tutorials/java/phasecontrast/opticaltrain/index.html
http://www.microscopyu.com/tutorials/java/phasedicmorph/index.html
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/virtual/confocal/index.html
http://www.olympusconfocal.com/java/confocalvswidefield/index.html
http://www.olympusconfocal.com/java/confocalsimulator/index.html
Microscopios electrónicos: bases de su funcionamiento y componentes
BOZZOLA JJ, RUSSELL LD. (1992). Electron Microscopy: Principles and Techniques for
Biologists. Jones and Bartlett Publishers, Boston.
HAYAT MA. (2000). Principles and techniques of electron microscopy. Biological
applications. Cambridge University Press.
MARTI O, AMREIM M. (1993). STM and SFM in biology. Academic Press Inc.
MERCER EH, BIRBECK MSC. (1974). Manual de microscopía electrónica para
biólogos. Ed. Blume. Madrid.
OJEDA JL. (1997). Métodos de microscopía electrónica de barrido en biología.
Universidad de Cantabria.
RENAU J, MEGÍAS L. (1998). Manual de técnicas de microscopía electrónica (M.E.T.),
Universidad de Granada.
Scanning Electron Microscopy
The Transmission Electron Microscope
What are Electron Microscopes_
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/java/electronmicroscopy/magnify1/index.html
Técnicas especializadas en detección y análisis aplicadas a la microscopía
JUAN J. (1998). Técnicas Instrumentales en Biología Celular. Ed. Club Universitario. S
Vicente.
MONTUENGA L., ESTEBAN F. y CALVO A. (2009). Técnicas en histología y biología
celular. Ed. Elsevier Masson. Barcelona
PEINADO MA, PEDROSA JA, RODRIGO J.(1996), Avances en inmunocitoquímica y
técnicas relacionadas, Universidad de Jaén.
SAMAR ME, ÁVILA R, ESTEBAN FJ. (2000) Técnicas Histológicas: fundamentos y
aplicaciones. SeisC, Córdoba (Argentina).
Laboratory Protocols - University of Bristol, Veterinary Pathology.
Tratamiento y gestión de las imágenes digitales
PERTUSA JF. (2003) Técnicas de análisis de imagen: aplicaciones en biología.
Publicacions de la Universitat de València, Valencia
GLASBEY C.A. y HORGAN G.W. (1995). Image Analysis for the Biological Sciences.
John Wiley and Sons, Chichester, UK
SAMAR ME, ÁVILA R, ESTEBAN FJ. (2000) Técnicas Histológicas: fundamentos y
aplicaciones. SeisC, Córdoba (Argentina).
MONTUENGA L., ESTEBAN F. y CALVO A. (2009). Técnicas en histología y biología
celular. Ed. Elsevier Masson. Barcelona
Scion Corporation
Servicio de Proceso de Imágenes
SYNCROSCOPY - Digital 3D Microscopy
Técnicas de Imágenes en Biología - Presentación
Tutorial de Digitalización de Imágenes - Contenido
http://rsbweb.nih.gov/ij/
http://rsbweb.nih.gov/ij/links.html
GENERAL y COMPLEMENTARIA :
BOZZOLA JJ, RUSSELL LD. (1992). Electron Microscopy: Principles and Techniques for
Biologists. Jones and Bartlett Publishers, Boston.
GLASBEY C.A. y HORGAN G.W. (1995). Image Analysis for the Biological Sciences.
John Wiley and Sons, Chichester, UK
HAYAT MA. (2000). Principles and techniques of electron microscopy. Biological
applications. Cambridge University Press.
HERMAN B, LEMASTER JJ. (1992). Optical microscopy. Emerging methods and
applications, Academic Press Inc.
JUAN J. (1998). Técnicas Instrumentales en Biología Celular. Ed. Club Universitario. S
Vicente.
LOCQUIN M, LANGERON M. (1985) Manual de microscopía, Ed. Labor
MARTI O, AMREIM M. (1993). STM and SFM in biology. Academic Press Inc.
MERCER EH, BIRBECK MSC. (1974). Manual de microscopía electrónica para
biólogos. Ed. Blume. Madrid.
MONTUENGA L., ESTEBAN F. y CALVO A. (2009). Técnicas en histología y biología
celular. Ed. Elsevier Masson. Barcelona
OJEDA JL. (1997). Métodos de microscopía electrónica de barrido en biología.
Universidad de Cantabria.
PEINADO MA, PEDROSA JA, RODRIGO J.(1996), Avances en inmunocitoquímica y
técnicas relacionadas, Universidad de Jaén.
PERTUSA JF. (2003) Técnicas de análisis de imagen: aplicaciones en biología.
Publicacions de la Universitat de València, Valencia
RENAU J, MEGÍAS L. (1998). Manual de técnicas de microscopía electrónica (M.E.T.),
Universidad de Granada.
SAMAR ME, ÁVILA R, ESTEBAN FJ. (2000) Técnicas Histológicas: fundamentos y
aplicaciones. SeisC, Córdoba (Argentina).
MICROSCOPY AND ANALYSIS, Wiley, Edición Europea. Revista mensual gratuita
sobre microscopía en general. Suscripciones a través de la página: www.microscopyanalysis.com
PÁGINAS WEB RELACIONADAS
MICROSCOPÍA
A Web Atlas of Cellular Structures
Confocal
Confocal Microscopy by Leica Microsystems Heidelberg GmbH
Dennis Kunkel Microscopy and Stock Photography Image Gallery
http--www.udel.edu-Biology-Wags-b617-b617.htm
Laboratory Protocols - University of Bristol, Veterinary Pathology.
Microscopes
Molecular Expressions Primer_ Introduction to Microscopy
NCMIR
Nikon MicroscopyU
Scanning Electron Microscopy
Scion Corporation
Servicio de Proceso de Imágenes
SYNCROSCOPY - Digital 3D Microscopy
Técnicas de Imágenes en Biología - Presentación
The Transmission Electron Microscope
Tutorial de Digitalización de Imágenes - Contenido
Virtual Microscope Demo Page
What are Electron Microscopes_
TUTORIALES SOBRE MANEJO DE MICROSCOPIOS
http://nobelprize.org/educational_games/physics/microscopes/tem/tem.html
http://nobelprize.org/educational_games/physics/microscopes/phase/index.html
http://nobelprize.org/educational_games/physics/microscopes/fluorescence/index.html
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/java/electronmicroscopy/magnify1/index.html
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/virtual/confocal/index.html
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/java/phasecontrast/phasemicroscope/index.html
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/virtual/fluorescence/index.html
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/virtual/combination/index.html
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/java/dic/lightpaths/index.html
http://www.microscopyu.com/tutorials/java/phasecontrast/opticaltrain/index.html
http://www.microscopyu.com/tutorials/java/phasedicmorph/index.html
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/virtual/confocal/index.html
http://www.olympusconfocal.com/java/confocalvswidefield/index.html
http://www.olympusconfocal.com/java/confocalsimulator/index.html
ANÁLISIS DE IMAGEN
http://rsbweb.nih.gov/ij/
http://rsbweb.nih.gov/ij/links.html