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Laboratorio de Genómica Evolutiva Dr. Luis José Delaye Arredondo Lo que da origen a las líneas de investigación a cargo del Dr. Delaye es la evolución biológica. El descubrimiento del ADN atribuido a Watson y Crick ha dado origen a un enorme desarrollo en el campo de la biología molecular y ha abierto camino a una vasta cantidad de investigaciones. Con otros descubrimientos como las proteínas y su ordenamiento por Frederick Sanger, como las realizadas por Zuckerkandl y Pauling en su intento de reconstruir la historia de los seres vivos con su reloj molecular, los estudios evolutivos han tomado más forma y se ha logrado entender con más claridad como se ha distribuido las especies existentes. Se logró realizar una filogenia universal y dividir todo lo existente en tres grandes dominios, eucariotas, eubacterias y archaea. Más adelante vino la era genómica donde se comenzó a secuenciar genes, y con dichas herramientas se logró secuenciar el genoma humano. En el laboratorio trabajan con algunos proyectos tales como la simbiosis y la evolución celular, de un organismo llamado Paulinella chromatophora, la cual es una amiba que hizo simbiosis con una cianobacteria. Se presentó una evolución por simbiogénesis en la que dos especies pasaron a ser una sola, como ya se ha observado en diversos organismos estudiados en la actualidad. La comparación del genoma muestra que esta cianobacteria, denominado cromatóforo, evolucionó por la reducción de su genoma de un ancestro de la cianobacteria, un Synechococcus (WH5701). El Dr. Delaye, en conjunto con sus estudiantes, están desarrollando un modelo metabólico para entender como ocurrió la reducción de este genoma, están desarrollando patrones de selección en genomas de bacterias y estudiando la transferencia de genes horizontales. Para esto utilizan herramientas de programación, estadística, estudian genética de poblaciones, etc. Las tres preguntas fundamentales referentes a este proyecto son, cuál es el condescendiente más cercano, hace cuánto tiempo evolucionó el cromatóforo y cómo evolucionó su metabolismo. Para responder a estas preguntas se están utilizando marcadores evolutivos, métodos de concatenación de genes, entre otros. Los hallazgos han sido que a diferencia de lo que reporta la literatura, este organismo no tiene 60 millones de años, si no que existe desde mayor tiempo atrás, este ha perdido dos terceras partes de su genoma, ocasionando la modificación de su metabolismo. Todos estos estudios generarán conocimiento que permitirá entender con mayor claridad la genética y evolución de poblaciones con características similares, y mediante la reconstrucción del metabolismo generar aplicaciones biotecnológicas.
