Una transpeptidasa (EC 3.4.16.4) es una enzima bacteriana cuya función es realizar enlaces cruzados en la formación de las cadenas que constituyen al peptidoglicano en la pared celular de muchas bacterias. Esta enzima es también conocida como una carboxipeptidasa D-Alanina-D-Alanina tipo serina por tener dos residuos de alanina en el carbono terminal.