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Prólogo a la edición en español
Prefacio VIII
VII
11I
DIVERSIDAD MICROBIANA
2.8
Diversidad fisiológica de los
43
microorganismos
Bacterias 45
Arqueas 48
2.9
2.10
2.11
PRINCIPIOS
DE MICROBIOLOGíA
Microorganismos
eucarióticos
43
51
Capítulo 3 Química de los componentes
celulares 55
Capítulo 1 Microorganismos y
microbiología 1
ENLACESQUiMICOS. MACROMOLÉCULAS
~
I
1.1
INTRODUCCiÓN A LA MICROBIO LOGiA
1.2
Los microorganismos
como células
1.3
Los microorganismos
naturales
6
y sus ambientes
Microbiología
3.1
3.2
3
3
11
1.4 Antigüedad y amplitud de la vida
microbiana
6
1.5 Impacto de los microorganismos
el hombre 8
(11
sobre
EN MICROBIO LOGiA
11
1.8
1.9
1.10
Hooke, van Leeuwenhoek, y Cohn 11
Pasteur y la derrota de la generación
espontánea
13
Koch, la enfermedad infecciosa
y la microbiología del cultivo puro
16
Diversidad microbiana y el surgimiento
de la microbiología general
20
La Era Moderna de la microbiología
22
Información
adicional
Medios sólidos, la placa de Petri
y los cultivos puros 19
Capítulo 2 Un breve viaje por el mundo
microbiano 28
2.3
2.4
. 11
óptica 30
Imagen tridimensional de las células
Microscopía electrónica
35
2.5 Elementos estructurales
de las células
y de los virus 37
2.6 Organización del DNA en las células
microbianas
39
2.7 El árbol evolutivo de la vida 41
MACROMOLÉCULAS
INFORMACiÓN 60
SIN
Polisacáridos
Lípidos 62
11I
MACROMOLÉCULAS
INFORMACiÓN 63
3.5
Ácidos nucleicos
3.6
3.7
Aminoácidos y enlace peptídico
65
Proteínas: estructuras primaria
y secundaria
67
Proteínas: estructuras de orden superior
y desnaturalización 68
3.8
60
CON
63
Capítulo 4 Estructura y función celular
en Bacterias y Arqueas 73
I
MORFOLOGiA y TAMAÑO CELULAR
4.1
4.2
Morfología celular 74
El tamaño celular y la importancia
pequeño
75
11
MEMBRANA CITOPLASMÁTICA
y TRANSPORTE
78
4.4
4.5
PAREDES CELULARES
DE PROCARIOTAS 86
4.6
La pared celular de bacterias:
el peptidoglicano
86
La membrana externa de bacterias
gramnegativas
90
Paredes celulares de arqueas
93
4.7
4.8
74
de ser
Membrana citoplasmática en bacterias
y arqueas
78
Funciones de la membrana citoplasmática
Transporte y sistemas de transporte
82
11I
33
ESTRUCTURA CELULAR E HISTORIA
EVOLUTIVA 37
Enlaces fuertes y débiles 56
Las macromoléculas y el agua como disolvente
de la vida 58
3.3
4.3
LA VISiÓN DE LO MUY PEQUEÑO 29
, I
2.1 Fundamentos de microscopía óptica 29
2.2 Mejora y ajuste del contraste en microscopía
56
3.4
LOS CAMINOS DEL DESCUBRIMIENTO
1.6 Las raíces históricas de la microbiología:
1.7
Y AGUA
2
IV
OTRAS ESTRUCTURAS SUPERFICIALES
E INCLUSIONES CELULARES 94
4.9
Capas superficiales,
pelos y fimbrias
81
94
XXII!
XXIV Contenido
4.10
4.11
4.12
V
4.13
4.14
4.15
Inclusiones
celulares
96
Vesículas de gas 98
Endosporas
100
MOVIMIENTO MICROBIANO
Información
adicional
¿Cuánto tiempo puede sobrevivir
una espora? 102
Nutrición, cultivo y metabolismo
microbiano
117
NUTRICiÓN Y CULTIVO
DE MICROORGANISMOS
5.1
5.2
Nutrición microbiana
118
Medios de cultivo 121
5.3
Cultivo de microorganismos
laboratorio
123
11
6.9
Determinación del número total de células:
recuento microscópico
167
Recuento de células viables
168
Medida de la masa microbiana: métodos
turbidimétricos
170
6.13
Crecimiento microbiano
temperaturas
175
Crecimiento microbiano
temperaturas
178
a bajas
El NAD como un transportador
de electrones
131
5.8
Compuestos de alta energía y almacenamiento
de energía
132
Y COMPUESTOS
donadores y aceptores
redox
BASES DEL CATABOLlSMO
133
5.9
5.10
Conservación de la energía
La glucólisis como ejemplo
de fermentación
134
5.11
La respiración y los sistemas de membrana
transportadores
de electrones
137
Respiración y fuerza motriz de protones
140
Flujo del carbono en la respiración: el ciclo
del ácido cítrico
142
Diversidad catabólica
144
6.14
V
146
microbiano
154
I
DIVISiÓN CELULAR BACTERIANA
155
6.1
Crecimic::nto celular y fisión binaria
155
a altas
OTROS FACTORES AMBIENTALES
QUE AFECTAN AL CRECIMIENTO 180
Crecimiento microbiano y pH 180
Efectos osmóticos sobre el crecimiento
microbiano
182
6.17
6.18
Oxígeno y crecimiento microbiano
184
Formas tóxicas del oxígeno
186
Información
adicional
Crecimiento microbiano en el mundo real:
biopelículas 173
BIOLOGíA MOLECULAR
DE LOS MICROORGANISMOS
Capítulo 7
I
Información
adicional
Los productos de fermentación por levaduras
y el efecto Pasteur 136
TEMPERATURA Y CRECIMIENTO
MICROBIANO 172
6.15
6.16
134
de azúcares y polisacáridos
146
de aminoácidos y nucleótidos
147
de ácidos grasos y lípidos
148
de la actividad de enzimas
149
Crecimiento
MEDIDA DEL CRECIMIENTO
MICROBIANO 167
sobre el crecimiento
5.7
Capítulo 6
165
11I
126
BASES DEL ANABOLlSMO
Cultivo continuo: el quimiostato
162
Efecto de la temperatura
microbiano
172
Oxidación y reducción:
de electrones
129
Biosíntesis
Biosíntesis
Biosíntesis
Regulación
biosintéticas
6.6
6.7
6.8
Terminología y concepto de crecimiento
exponencial
161
Formulación del crecimiento exponencial
Ciclo del crecimiento microbiano
163
6.12
5.6
V
6.5
CRECIMIENTO DE POBLACIONES
BACTERIANAS 161
124
ENERGÉTICA Y ENZIMAS
OXIDACiÓN-REDUCCIÓN
DE ALTA ENERGiA 129
5.15
5.16
5.17
5.18
11
159
IV
11I
5.14
Síntesis de peptidoglicano y división celular
en el
Bioenergética
125
Catálisis yenzimas
5.12
5.13
6.4
6.10
6.11
118
5.4
5.5
IV
Proteínas Fts y división celular
156
MreB y los determinantes de la morfología
celular
157
105
Flagelos y movilidad
105
Movilidad por deslizamiento
110
El movimiento celular como respuesta
sensorial: tactismos microbianos
111
Capítulo 5
6.2
6.3
7.1
11
Fundamentos de biología
molecular
191
GENES y EXPRESiÓN GÉNICA
Macromoléculas
e información
LA ESTRUCTURA DEL DNA
192
genética
192
193
7.2
La doble hélice
7.3
7.4
Superenrollamiento
196
Cromosomas y otros elementos genéticos
193
DEL DNA
198
11I
LA REPLlCACIÓN
199
7.5
7.6
7.7
7.8
Moldes y enzimas 199
La horquilla de replicación 201
La replicación bidireccional yel replisoma 203
Corrección de errores y terminación 205
Contenido
IV
IV
LA SINTESIS DEL RNA:
TRANSCRIPCiÓN
206
7.9
7.10
7.11
7.12
V
Aspectos generales de la transcripción
Factores sigma y secuencias consenso
Terminación de la transcripción
210
La unidad de transcripción 211
LA SINTESIS DE PROTEINAS
7.13
7.14
7.15
7.16
7.17
Capítulo 8
V
REGULACiÓN DEL DESARROLLO
EN BACTERIAS MODELO 265
9.12
9.13
Esporulación en Bacillus 265
Diferenciación en Caulobacter 266
212
VI
9.14
9.15
9.16
221
Biología molecular de arqueas
y eucariotas
226
8.5
8.6
8.7
8.8
8.9
8.10
I
9.1
9.4
Una visión rápida de los virus
y la virología
274
10.1
10.2
10.3
10.4
BIOLOGiA MOLECULAR
EUCARIÓTICA 232
10.5
Características
vírica 282
10.6
10.7
Unión y penetración víricas 283
Producción de ácidos nucleicos y proteínas
víricas 285
11
Genes y cromosomas en los eucariotas
232
Visión general de la división celular
eucariótica
234
Replicación del DNA lineal 235
Procesamiento del RNA 237
Transcripción y traducción en eucariotas
240
Interferencia por RNA (RNAi) 242
Información
adicional
Inteínas y empalme de proteínas 238
Regulación de la expresión
génica 245
GENERALIDADES
DE LA REGULACiÓN
Principales tipos de regulación
246
246
Proteínas de unión al DNA 247
Control negativo de la transcripción:
represión e inducción
249
Control positivo de la transcripción
11I
10.8
10.9
10.10
10.11
10.12
IV
I 11 I PROTEiNAS DE UNiÓN AL DNA Y
REGULACiÓN DE LA TRANSCRIPCiÓN
9.2
9.3
267
en arqueas
227
Transcripción y procesamiento del RNA en
arqueas
229
Síntesis de proteínas en arqueas
230
Características comunes en bacterias
y arqueas
231
Capítulo 9
I
Regulación por RNA y RNA antisentido
Interruptores de RNA 268
Atenuación
270
ESTRUCTURA Y CRECIMIENTO
DE LOS VIRUS 275
8.1 Cromosomas y replicación del DNA
8.3
8.4
REGULACiÓN BASADA EN EL RNA 267
Capítulo 10
BIOLOGIA MOLECULAR
DE LAS ARQUEAS 227
8.2
MECANISMOS REGULADORES
GLOBALES 260
9.9 El control global y el operon lac 260
9.10 La respuesta estricta 261
9.11 Otras redes de control global 263
207
208
El código genético
212
RNA de transferencia
215
Traducción: el proceso de la síntesis
de proteínas
217
La incorporación de aminoácidos
no estándar
220
Plegamiento y secreción de proteínas
'X'J0I
10.13
10.14
10.15
Propiedades generales de los virus
Naturaleza del virión 276
El hospedador
Cuantificación
11I , PERCE..pCIÓN y TRANSDUCCIÓN
DE SENAL 253
Sistemas reguladores de dos componentes
253
9.6 Percepción de quórum
255
9.7 Regulación de la quimiotaxis
257
9.8 Control de la transcripción en arqueas 259
generales de la replicación
DIVERSIDAD ViRICA
Generalidades
de los virus bacterianos
ENTIDADES
SUBviRICAS
Virus defectuosos
Viroides
299
Priones
11.1
11.2
11.3
287
299
299
300
adicional
los virus el DNA?
288
Fundamentos de genética
bacteriana
304
CROMOSOMAS
y PLAsMIDOS
9.5
287
Bacteriófagos virulentos y T4 290
Bacteriófagos atemperados, lambda y Pl 292
Generalidades de los virus animales
295
Retrovirus
297
Capítulo 11
251
280
280
REPLlCACIÓN VIRICA 282
Información
¿Inventaron
247
del virus
de virus
275
BACTERIANOS
305
Mapa genético del cromosoma de Escherichia
co/i 305
Plásmidos: principios generales
308
Tipos de plásmidos y su significado
biológico
310
XXVI Contenido
11
11.4
11.5
11.6
11.7
11.8
11I
MUTACiÓN
312
Capítulo 13
Mutaciones y mutantes
312
Bases moleculares de la mutación
Tasas de mutación
317
Mutagénesis
318
Mutagénesis y carcinogénesis:
de Ames 322
315
la prueba
INTERCAMBIO GENÉTICO
EN PROCARIOTAS 323
I
Recombinación genética
Transformación
325
Transducción
328
11.14
11.15
11.16
Complementación
336
Transferencia génica en arqueas
338
DNA móvil: elementos transponibles
339
324
13.3
Genomas procarióticos: análisis
bioinformáticos y distribuciones génicas 382
El genoma de los orgánulos eucarióticos
385
Genomas microbianos eucarióticos
389
13.5
13.6
13.7
11I
13.9
13.10
Capítulo 12
Ingeniería gen ética
344
HERRAMIENTAS Y TÉCNICAS
DE INGENIERIA GENÉTICA 345
12.1
12.2
12.3
12.4
11
12.5
12.6
12.7
12.8
11I
12.9
12.10
IV
12.11
12.12
12.13
12.14
12.15
Enzimas de restricción y modificación
345
Hibridación de ácidos nudeicos y transferencia
Southern
347
Fundamentos de la donación molecular
348
Los plásmidos como vectores
de donación
349
13.11
13.12
IV
13.13
13.14
Secuenciación
del DNA
Métodos moleculares de mutagénesis
360
Fusiones génicas y genes testigo 362
TÉCNICAS DE AVANZADAS
DE CLONACIÓN 364
de los vectores
364
A la búsqueda del don correcto
365
Vectores lanzadera y vectores
de expresión
368
El bacteriófago lambda como vector
de donación
371
LA EVOLUCiÓN DEL GENOMA
396
Familias génicas, duplicaciones
y deleciones
396
DNA móvil: transposones y secuencias
de inserción
397
Transferencia
del genoma
Evolución de
de patogenia
génica horizontal y estabilidad
398
la virulencia: islas
400
GENÓMICA AMBIENTAL
401
Detección de microorganismos
no cultivados
401
Genomas víricos en la naturaleza
Capítulo 14
402
Evolución y sistemática
microbiana
405
LA TIERRA PRIMITIVA Y EL ORIGEN
Y DIVERSIFICACiÓN DE LA VIDA 406
14.1
14.2
14.3
14.4
11
14.5
14.6
14.7
14.8
14.9
y la secuenciación
Información
adicional
Identificación genética (huellas dactilares
de DNA) 358
391
LA DIVERSIDAD MICROBIANA
MANIPULACiÓN DE GENES
BACTERIANOS
360
Vectores para la donación
genómicas
373
Micromatrices y transcriptoma
Proteómica
394
Metabolómica
395
352
Amplificación de DNA: reacción en cadena
de la polimerasa
356
Hospedadores
de donación
FUNCiÓN Y REGULACiÓN
DEL GENOMA 391
Información
adicional
Edición del RNA 388
SECUENCIACIÓN. SINTESIS.
y AMPLIFICACiÓN DEL DNA 352
Secuenciación y registro de genomas completos
354
Síntesis de DNA 356
379
Breve historia de la genómica
379
Genomas procarióticos: tamaños y contenido
de ORF 379
11
Conjugación: características esenciales
331
Formación de las cepas Hfr y movilización
cromosómica
333
GENO MAS MICROBIANOS
378
13.1
13.2
13.4
13.5
11.9
11.10
11.11
11.12
11.13
Genómica microbiana
11I
14.10
14.11
Formación e historia primitiva de la Tierra 406
Origen de la vida celular 408
Diversificación microbiana: consecuencias
para la biosfera terrestre
412
Origen endosimbiótico de los eucariotas
413
EVOLUCiÓN MICROBIANA
416
El proceso evolutivo 416
Análisis evolutivo: aspectos teóricos
417
Análisis evolutivo: métodos analíticos
419
Filogenia microbiana
421
Aplicaciones de los métodos filogenéticos
basados en el SSU rRNA 423
SISTEMÁTICA MICROBIANA
Análisis fenotípico
Análisis genotípico
426
428
426
Contenido
14.12
14.13
14.14
Capítulo 15
Dominio Bacteria:
las proteobacterias
15.1
...11
16.7
16.8
Visión general de la filogenia de las
bacterias
441
PROTEOBACTERIAS
QUIMIOORGANÓTROFAS AEROBIAS
y ANAEROBIAS FACULTATIVAS 456
(iV
15.14
15.15
15.16
V
15.17
15.18
15.19
IV
PROTEOBACTERIAS FOTÓTROFAS,
QUIMIOLlTÓTROFAS
y METANÓTROFAS 443
(11I
15.11
15.12
15.13
11I
441
Bacterias
Bacterias
Bacterias
Bacterias
Bacterias
15.10
16.4
440
15.2
15.3
15.4
15.5
15.6
15.7
15.8
15.9
432
16.5
16.6
LA FILOGENIA DE LAS BACTERIAS
I
16.3
Análisis filogenético
431
El concepto de especie en microbiología
Clasificación y nomenclatura
435
16.9
fototróficas rojas 443
nitrificantes
446
oxidantes del azufre y el hierro
448
oxidantes del hidrógeno
451
metanótrofas y metilótrofas
453
Pseudomonas y pseudomonadáceas
Bacterias del ácido acético 459
Dominio Bacteria: grampositivas
y otras bacterias
491
VISiÓN GENERAL DE LAS BACTERIAS
BACTERIAS GRAMPOSITIVAS
y ACTINOBACTERIAS 942
Bacterias
16.2
de endosporas
492
Bacterias grampositivas
de endosporas 496
16.16
16.17
XII
16.18
XIII
16.19
16.20
XIV
16.21
CLAMIDIAS
516
PLANCTOMYCES/PIRELLULA
17.3
519
Planctomyces: una bacteria pendunculada
filogenéticamente única 519
LOS VERRUMICROBIOS
Verrumicrobium
520
y Prosthecobacter
LAS FLAVOBACTERIAS
EL GRUPO
CYTOPHAGA
Chlorobium
del azufre
VERDES
521
522
DEL AZUFRE
523
verdes
526
526
Espiroquetas
DEINOCOCCOS
Deinococcus
522
relacionados
y otras bacterias
523
LAS ESPIROQUETAS
520
521
Bacteroides y Flavobacterium
Acidobacterias
521
529
y Thermus
529
BACTERIAS VERDES NO DEL AZUFRE
Chloroflexus y organismos
relacionados
BACTERIAS HIPERTERMÓFILAS
NITROSPIRA
y DEFERRIBACTER
531
531
533
533
Thermotoga y Thermodesulfobacterium
Aquifex, Thermocrinis y organismos
relacionados 534
535
Nitrospira, Deferribacter, y organismos
relacionados
535
Dominio Archaea
FILOGENIA
GENERAL
17.1
17.2
511
516
Clamidias
Capítulo 17
11
formadoras
511
515
BACTERIAS
grampositivas no formadoras
16.1
CIANOBACTERIAS y PROCLOROFITAS
Cianobacterias
Proclorofitas
IX
,
16.15
GRAMPOSITIVAS
y OTRAS
BACTERIAS
492
11
Actinobacterias
filamentosas: Streptomyces
y organismos
relacionados
507
Cytophaga y organismos
XI
481
Bacterias grampositivas
que carecen de pared:
los micoplasmas
501
Actinobacterias:
corineformes y bacterias
del ácido propiónico
503
Actinobacteria:
Mycobacterium 504
16.14
X
Espirilos
472
Proteobacterias con vainas: Sphaerotilus
y Leptothrix
475
Bacterias pedunculadas con prostecas
y que forman yemas 477
Capítulo 16
16.11
VIII
MORFOLÓGICAMENTE
Mixobacterias deslizantes
481
Proteobacterias reductoras de sulfato
y reductoras de azufre 485
Las epsilonproteobacterias
488
VI
16.12
16.13
456
DELTAY EPSILONPROTEOBACTERIAS
16.10
VII
Bacterias fijadoras de nitrógeno aerobias
de vida libre 460
Neisseria, Chromobacterium y géneros
relacionados
462
Enterobacterias 463
Vibrio, Aliivibrio, y Photobacterium
467
Rickettsias
469
PROTEOBACTERIAS
INUSUALES 472
V
XXVII
538
y METABOLISMO
539
Visión general filogenética de las arqueas
Conservación
de la energía y autotrofia
en arqueas
540
FILUM EURYARCHAEOTA
541
Arqueas
541
halófilas
extremas
539
XXVIII Contenido
17.4
17.5
17.6
17.7
17.8
11I
17.9
17.10
FILUM CRENARCHAEOTA
17.12
Crenarqueotas
17.14
17.15
I
no termófilas
19.1
19.2
19.3
19.4
563
11
EVOLUCiÓN Y VIDA A ALTAS
TEMPERATURAS
564
19.5
Un límite superior de temperatura para la vida
microbiana
564
Adaptaciones de la vida a alta temperatura
565
Arqueas hipertermófilas, H2 y evolución
microbiana
567
Capítulo 18
Biología celular y
microorganismos eucariotas
18.2
18.3
18.4
18.5
11
18.6
11I
18.7
18.8
18.9
18.10
18.11
18.12
IV
18.13
18.14
18.15
18.16
18.17
18.18
18.19
11I
19.6
19.7
19.8
19.9
571
ESTRUCTURA Y FUNCiÓN DE LA CÉLULA
EUCARIOTA 572
18.1
Estructura de la célula eucariota
y del núcleo 572
Orgánulos respiratorios y fermentativos:
la mitocondria y el hidrogenosoma
573
Orgánulos fotosintéticos: el cloroplasto
575
Endosimbiosis: relaciones de mitocondrias
y cloroplastos en las bacterias
575
Otros orgánulos y estructuras celulares
de eucariotas
577
IV
19.10
19.11
19.12
19.13
19.14
V
19.15
DIVERSIDAD MICROBIANA EN
EUCARIOTAS 580
Filogenia del dominio Eukarya
PROTISTAS
Estramenópilos
587
Cercozoos y radiolarios
Amoebozoos
589
Diversidad viral
VIRUS DE BACTERIAS
602
603
607
608
Bacteriófagos de RNA 608
Bacteriófagos de DNA de cadena sencilla 610
Bacteriófagos de DNA de doble cadena
613
Mu: un bacteriófago de DNA de doble cadena
transponible
615
VIRUS DE ARQUEAS
Virus de arqueas
617
617
VIRUS RNA DE EUCARIOTAS
619
Virus de RNA de plantas
619
Virus animales de RNA de cadena positiva:
poliovirus y coronavirus
620
Virus animales de RNA de cadena negativa:
rabia, gripe y virus relacionados
623
Virus de RNA de cadena doble: reovirus
626
VIRUS DE DNA DE EUCARIOTAS
627
Virus vegetales de DNA 627
Replicación de virus animales de DNA de doble
cadena
629
Virus de DNA de doble cadena:
herpesvirus
631
Virus de DNA de doble cadena: poxvirus
633
Virus de DNA de doble cadena: adenovirus
634
VIRUS QUE EMPLEAN TRANSCRIPTASA
INVERSA 635
Retrovirus y hepadnavirus
635
Información
adicional
Mimivirus y la evolución de los virus
628
580
582
Diplomónados y parabasálidos
Euglenozoos
583
Alveolados 585
HONGOS
Algas rojas unicelulares
Algas verdes unicelulares
Capítulo 19
Hábitats y metabolismo energético
en las crenarqueotas
556
Hipertermófilos de hábitats volcánicos
terrestres
558
Hipertermófilos de hábitats volcánicos
submarinos
560
17.13
18.20
18.21
ALGAS UNICELULARES VERDES
y ROJAS 601
556
17.11
IV
V
Arqueas productoras de metano:
metanógenos
546
Thermoplasmatales
550
Thermococcales y Methanopyrus
552
Archaeoglobales
553
Nanoarchaeum y Aciduliprofundum
554
DIVERSIDAD METABÓLlCA y
ECOLOGíA MICROBIANA
583
Capítulo 20
589
592
Fisiología y estructura de los hongos;
asociaciones con otros organismos
592
Reproducción y filogenia de los hongos 595
Quitridiomicetos
597
Zigomicetos
597
Glomeromicetos
598
Ascomicetos
598
Basidiomicetos
601
I
20.1
20.2
20.3
20.4
20.5
11
20.6
20.7
Diversidad metabólica: fototrofia,
autotrofia, quimiolitotrofia y
fijación del nitrógeno 640
EL SISTEMA DE VIDA FOTÓTROFO
Fotosíntesis
641
641
Clorofilas y bacterioclorofilas
642
Carotenoides y ficobilinas
645
Fotosíntesis anoxigénica
647
Fotosíntesis oxigénica
652
AUTOTROFIA
654
El ciclo de Calvin
Otras vías autótrofas
654
en los fotótrofos
656
XXIX
Contenido
11I
20.8
20.9
20.10
20.11
20.12
20.13
IV
20.14
20.15
QUIMIOLlTOTROFIA
21.1
21.2
21.3
21.4
21.5
11
21.6
21.7
21.8
21.9
21.10
21.11
21.12
21.13
11I
21.14
21.15
21.16
21.17
21.18
21.19
11
Energética de la quimiolitotrofia
658
Oxidación del hidrógeno
659
Oxidación de compuestos reducidos
del azufre 660
Oxidación del hierro 663
Nitrificación
666
Anamox 668
FIJACiÓN DEL NITRÓGENO
22.3
22.4
22.5
22.6
11I
669
Nitrogenasa y la fijación del nitrógeno
669
Genética y regulación de la fijación de N2 673
adicional
Información
Winogradsky y la quimiolitoautrofia
662
Capítulo 21
I
658
Diversidad metabólica:
catabolismo de los compuestos
orgánicos
677
FERMENTACIONES
Fermentaciones: consideraciones energéticas
y redox 678
Diversidad fermentativa: fermentaciones
del ácido láctico y ácido mixta 680
Diversidad fermentativa: fermentaciones
de los clostridios y del ácido propiónico
683
Fermentaciones sin fosforilación a nivel
del sustrato
686
Sintrofismo
688
Metilotrofia y metanotrofia
711
Metabolismo de hexosas, pentosas
y polisacáridos
713
Metabolismo de los ácidos orgánicos
Metabolismo de los lípidos 717
716
ANÁLISIS DE LAS COMUNIDADES
MICROBIANAS BASADOS EN TÉCNICAS
DE CULTIVO 721
721
725
736
Análisis químicos, métodos radioisotópicos
y microelectrodos
736
Isótopos estables
739
Ecosistemas
microbianos
744
11
23.3
23.4
23.5
11I
23.6
23.7
23.8
IV
23.9
23.10
Conceptos de ecología 745
Ecosistemas microbianos y ciclo
biogeoquímico
746
EL HÁBITAT MICROBIANO
Ambientes y
Biopelículas:
superficies
Biopelículas:
747
microambientes
747
crecimiento microbiano sobre las
749
ventajas y control
751
ECOSISTEMAS MICROBIANOS DE AGUA
DULCE, TERRESTRE Y VEGETAL 752
Ambientes de agua dulce 752
Ambientes terrestres
754
Plantas como hábitat para los
microorganismos
757
ECOSISTEMAS MICROBIANOS
MARINOS 759
Mar abierto
759
Profundidades marinas y barofilia
764
Información
adicional
Vida microbiana en las profundidades
de la Tierra 758
Capítulo
24
Ciclos de los nutrientes,
biorremediación
y simbiosis
CICLOS DEL CARBONO
Y DEL OXIGENO
769
Métodos de ecología
microbiana
720
Enriquecimiento y aislamiento
Aislamiento en cultivo axénico
MEDICiÓN DE LAS ACTIVIDADES
MICROBIANAS EN LA NATURALEZA
PRINCIPIOS DE ECOLOGIA
MICROBIANA 745
PROCESOS DE QUIMIOORGANOTROFIA
AEROBIA 709
El oxígeno molecular como reactivo en los
procesos bioquímicos
709
Oxidación aerobia de los hidrocarburos
710
Métodos generales de tinción
727
FISH 730
Relacionar genes específicos con organismos
específicos mediante PCR 732
Genómica medioambiental
735
Capítulo 23
690
Respiración anaerobia: principios
generales
690
Reducción del nitrato y desnitrificación
691
Reducción del sulfato y azufre 693
Acetogenesis
696
Metanogenesis
698
Reducción de protones
702
Otros acepto res de electrones
703
Oxidación anóxica de hidrocarburos asociada
a la respiración anaerobia
706
Capítulo 22
22.1
22.2
22.8
23.1
32.2
678
RESPIRACiÓN ANAEROBIA
22.7
ANÁLISIS DE LAS COMUNIDADES
MICROBIANAS BASADOS EN TÉCNICAS
INDEPENDIENTES DE CULTIVO 727
24.1
24.2
11
24.3
24.4
24.5
11I
24.6
El ciclo del carbono
Sintrofismo
769
y metanogenesis
771
CICLOS DEL NITRÓGENO, DEL AZUFRE
Y DEL HIERRO 774
El ciclo del nitrógeno
774
El ciclo del azufre 775
El ciclo del hierro 777
BIORREMEDICIÓN MICROBIANA
Lixiviación microbiana
minerales
781
de las menas
780
768
xxx
Contenido
24.7
Transformación del mercurio y otros
metales pesados
783
24.8
24.9
Biodegradación
Biodegradación
IV
Capítulo 26
I
del petróleo
785
de los xenobióticos
786
SIMBIOSIS ENTRE ANIMALES
Y MICROORGANISMOS
789
24.10
24.11
El rumen y los rumiantes
Ecosistemas microbianos
hidrotermales
793
24.12
Simbiosis entre el calamar y Aliivibrio
V
24.13
24.14
24.15
26.1
26.2
26.3
26.4
26.5
789
de las fuentes
26.6
796
SIMBIOSIS ENTRE PLANTAS
Y MICROORGANISMOS
798
Líquenes y micorrizas
11
26.7
798
26.8
Tumoración por Agrobacterium
801
La simbiosis en los nódulos radicales
de las leguminosas
803
26.9
26.10
MICROBIOLOGíA APLICADA
Capítulo 25
Microbiología industrial
Los microorganismos industriales
y sus productos
812
25.2
25.3
Metabolitos primarios y secundarios
Características de las fermentaciones
a gran escala 814
Escalado de las fermentaciones
industriales
816
25.4
11
PRODUCTOS
SANITARIA
La producción industrial de penicilinas
y tetraciclinas
821
Las vitaminas y los aminoácidos
823
Los esteroides y otras biotransformaciones
Las enzimas como productos industriales
11I
25.10
25.11
25.12
25.13
25.14
25.15
PRODUCTOS PARA LA INDUSTRIA
ALIMENTAR lA 829
El vino
27.1
27.2
27.3
11
PARA LA INDUSTRIA
818
25.6
El ácido cítrico y otros compuestos
orgánicos
837
La levadura como agente de fermentación
y como suplemento alimenticio
838
Las setas como fuente de alimento
839
Información
adicional
Elaboración de cerveza casera
834
ORGANISMOS
TRANSGÉNICOS
854
Modificación genética de rutas metabólicas
en bacterias
854
Modificación genética de animales
855
Terapia génica en seres humanos
858
Plantas transgénicas en la agricultura
860
Información
adicional
La biología sintética y la fotografía
bacteriana 856
CONTROL F(SICO ANTIMICROBIANO
Esterilización
Esterilización
Esterilización
CONTROL QUiMICO ANTIMICROBIANO
27.5
Agentes antimicrobianos
externo
875
27.6
27.7
27.8
27.9
IV
27.10
27.11
V
27.12
27.13
866
por calor 866
por radiación
869
por filtración
871
Control químico del crecimiento
microbiano
873
11I
825
826
Control del crecimiento
microbiano
865
27.4
829
Elaboración de cerveza, bebidas destiladas
y alcohol genérico
832
El vinagre 836
DE LA INGENIERiA
844
Principios básicos de la biotecnología
844
Expresión de genes de mamíferos
en bacterias
844
Producción de hormonas
848
Otros productos y proteínas de mamíferos
849
Obtención de vacunas mediante ingeniería
genética
850
La prospección de genes 853
Capítulo 27
I
Aislamiento y caracterización
de antibióticos
818
843
AGENTES ANTIMICROBIANOS
y PATOGENICIDAD
813
25.5
25.7
25.8
25.9
PRODUCTOS
GENÉTICA
811
LOS MICROORGANISMOS
INDUSTRIALES
y LA FORMACiÓN
DE PRODUCTOS
812
25.1
Biotecnología
873
químicos para uso
AGENTES ANTIMICROBIANOS
IN VIVO 878
UTILIZADOS
Antimicrobianos sintéticos
880
Antimicrobianos naturales: los antibióticos
882
Antibióticos 13-1actámicos: las penicilinas
y las cefalosporinas
883
Antibióticos producidos por procariotas
885
CONTROL DE VIRUS Y DE PATÓGENOS
EUCARIÓTICOS 887
Los antivíricos
Los antifúngicos
887
890
RESISTENCIA
A LOS ANTIMICROBIANOS
y DESCUBRIMIENTO
DE NUEVOS
ANTIMICROBIANOS
891
Resistencia
a los antimicrobianos
Búsqueda de nuevos antimicrobianos
Información
892
896
adicional
Cómo prevenir la resistencia a los fármacos
antimicrobianos
878
Contenido
Capítulo 28
Interacciones
IV
de los
29.9
29.10
29.11
microorganismos con la especie
humana
902
\. I
INTERACCIONES BENEFICIOSAS DE
MICROORGANISMOS CON SERES
HUMANOS 903
28.1
Principios básicos de las interacciones de
microorganismos con la especie humana
903
Microbiota normal de la piel 905
Microbiota normal de la cavidad bucal 906
Microbiota normal del tracto
gastrotrointestinal
909
Microbiota normal de otras regiones
del cuerpo 912
28.2
28.3
28.4
28.5
11
28.6
28.7
28.8
I 111
28.9
28.10
28.11
28.12
INTERACCIONES DAÑINAS DE
MICROORGANISMOS CON SERES
HUMANOS 915
Entrada del patógeno en el hospedador
Colonización y crecimiento
918
Virulencia
918
FACTORES DE VIRULENCIA
Y TOXINAS 922
.
IV
FACTORES DEL HOSPEDADOR
EN LA INFECCiÓN 929
28.13
Factores de riesgo de infección
en el hospedador
929
Resistencia innata a la infección
28.14
Información
Los probióticos
931
11I
y antígenos
de antígenos
adaptativa
adaptativa
946
a los linfocitos
INMUNIDAD Y PREVENCiÓN DE
LAS ENFERMEDADES INFECCIOSAS
Inmunidad
Inmunidad
LlNFOCITOS T 951
29.7
Células T citotóxicas y células asesinas
naturales
951
29.8
Células T cooperadoras:
respuesta inmunitaria
activavión de la
952
natural
969
artificial e inmunización
Nuevas estrategias
11I
31.5
31.6
IV
V
948
31.8
31.9
31.10
969
970
973
de inmunización
ENFERMEDADES DE LA RESPUESTA
INMUNITARIA 974
Alergia, hipersensibilidad
yautoinmunidad
976
Superantígenos
979
Información
adicional
La promesa de nuevas vacunas
Inmunología
974
982
molecular
E INMUNIDAD
983
Inmunidad adaptativa y la superfamilia
de las inmunoglobulinas
986
31.7
T
y células T 966
y anticuerpos
968
31.2
31.3
31.4
936
966
Inmunidad innata y reconocimiento
de estructuras
983
11
Células y órganos del sistema inmunitario
936
Respuesta inmunitaria innata
939
Inflamación, fiebre, y choque séptico 943
Respuesta inmunitaria adaptativa
944
Inmunógenos
Presentación
Inmunidad
Inmunidad
RECEPTORES
11 I ANTiGENOS
y PRESENTACiÓN
DE ANTiGENOS
946
29.5
29.6
innata
31.1
INMUNOLOGíA
GENERALIDADES DE INMUNOLOGiA
La inmunidad en la defensa
delhospedador
y en la enfermedad 964
Inmunidad
Capítulo 31
Capítulo 29 Principios esenciales
de inmunología 935
29.1
29.2
29.3
29.4
30.4
30.5
30.6
30.8
..
I
30.1
30.2
30.3
30.7
adicional
912
957
y destrucción
INMUNIDAD Y DEFENSA DEL
HOSPEDADOR
965
11I
Factores de virulencia
922
Las exotoxinas
922
Las enterotoxinas
926
Las endotoxinas
928
953
Anticuerpos
953
Producción de anticuerpos
Complemento, anticuerpos,
del patógeno
959
Capítulo 30
11
915
ANTICUERPOS
XXXI
EL COMPLEJO PRINCIPAL DE
HISTOCOMPATIBILlDAD
987
Estructura de las proteínas MHC 988
Polimorfismos MHC y unión del antígeno
ANTICUERPOS
990
Proteínas anticuerpo y unión al antígeno
Genes de anticuerpos y diversidad
991
RECEPTORES
989
DE CÉLULAS T 993
Receptores de células T: proteínas,
y diversidad
993
genes,
SEÑALES MOLECULARES EN LA
INMUNIDAD 994
Selección donal y tolerancia
995
Activación de células T y B 997
Citocinas y quimiocinas
999
Información
adicional
Receptores ToIIde Drosophila: una respuesta
antigua a la infección 984
990
XXXII Contenido
DIAGNÓSTICOY SEGUIMIENTO
DE LAS ENFERMEDADES
INFECCIOSAS
ENFERMEDADES
MICROBIANAS
Capítulo 34 Enfermedades microbianas
Capítulo 32
Microbiología e inmunología
diagnósticas
1003
MÉTODOS DIAGNÓSTICOS
DEL CULTIVO 1004
32.1
32.2
32.3
32.4
11
32.5
32.6
32.7
32.8
32.9
32.10
32.11
11I
32.12
Capítulo
I
33.1
33.2
33.3
33.4
33.5
11
33.6
33.7
11I
33.8
33.9
33.10
33.11
33.12
transmitidas de persona
a persona 1075
DEPENDIENTES
Aislamiento de patógenos de muestras
clínicas
1004
34.1
34.2
34.3
Métodos de identificación dependientes
de cultivo 1010
Pruebas de sensibilidad a agentes
antimicrobianos
1013
34.4
34.5
Seguridad en el laboratorio
de microbiología
1016
34.6
INMUNOLOGfA y MÉTODOS DE
DIAGNÓSTICO CLlNICO 1018
34.7
34.7
Inmunoensayos para las enfermedades
infecciosas
1018
Anticuerpos policlonales y monoclonales
1020
Reacciones antígeno-anticuerpo
in vitro:
serología
1021
Aglutinación
1024
Anticuerpos fluorescentes 1025
Ensayo de inmunoadsorbente
unido a enzima
y radioinmunoensayo
1028
Procedimientos de inmunoblot
1033
MÉTODOS
DIAGNÓSTICOS
EN ACIDOS NUCLEICOS
Sondas
33
de ácidos
nucleicos
Epidemiología
34.8
Neisseria meningitidis, meningitis
y meningococemia
1086
Virus e infecciones respiratorias
Resfriados
1090
Gripe 1091
1087
TRANSMISiÓN DE ENFEMEDADES
POR CONTACTO DIRECTO 1094
34.10
34.11
34.12
Staphylococcus
1094
Helicobacter pylori y úlceras gástricas
Virus de la hepatitis
1097
11I
34.13
34.14
y PCR
34.15
1035
Patógenos transmitidos por el aire 1076
Enfermedades estreptocócicas
1077
Corynebacterium y difteria
1080
Bordetella y tosferina
1082
Mycobacterium. Tuberculosis y enfermedad
de Hansen
1083
11
BASADOS
1035
1096
ENFERMEDADES DE TRANSMISiÓN
SEXUAL 1100
Gonorrea y sífilis 1101
Chlamydia, herpes, tricomoniasis y virus
del papiloma humano
1103
Síndrome de la inmunodeficiencia
adquirida:
SIDA y VIH 1106
1041
PRINCIPIOS DE EPIDEMIOLOGiA
Capítulo 35
1042
La ciencia de la epidemiología
1042
Vocabulario de la epidemiología
1043
Reservorios de enfermedades y epidemias
Transmisión de las enfermedades
infecciosas
1048
La comunidad de hospedadores
1050
EPIDEMIAS ACTUALES
TRANSMISiÓN DE ENFERMEDADES
POR EL AIRE 1076
35.1
35.2
11
La pandemia de SIDA 1052
Infecciones hospitalarias
1054
EPIDEMIOLOGiA y SALUD PÚBLICA
ENFERMEDADES
TRANSMITIDAS
ANIMALES
1118
1045
1052
1055
Medidas de salud pública para el control
de enfermedades
1055
Consideraciones sobre la salud global 1059
Enfermedades infecciosas emergentes
y reemergentes
1061
Guerra biológica y armas biológicas 1067
Carbunco como arma biológica 1070
Información
adicional
SARS como modelo de éxito
epidemiológico
1068
Enfermedades transmitidas por
vectores y por microorganismos
del suelo 1117
35.3
35.4
35.5
35.6
35.7
11I
35.8
35.9
Rabia
POR
1118
Síndromes
por Hantavirus
1120
ENFERMEDADES TRANSMITIDAS POR
ARTRÓPODOS
1122
Enfermedades producidas por rickettsias
Enfermedad de Lyme 1126
Malaria
1129
Virus del Nilo occidental
1132
Peste 1134
1122
ENFERMEDADES TRANSMITIDAS A PARTIR
DEL SUELO 1136
Enfermedades fúngicas
Tétanos
1139
1136
Información
adicional
Patógenos especiales y fiebres hemorrágicas
víricas 1122
Contenido
Capítulo 36 Tratamiento de aguas residuales,
potabilización de aguas
y enfermedades microbianas
transmitidas por el agua 1142
.
I
36.1
36.2
36.3
11
MICROBIOLOGIA DE LAS AGUAS
RESIDUALES y POTABILlZACIÓN
DEL AGUA 1143
Salud pública y calidad del agua 1143
Tratamiento de aguas residuales
y contaminadas
1145
Potabilización de agua para consumo
humano
1149
ENFERMEDADES MICROBIANAS
TRANSMITIDAS POR EL AGUA 1151
36.4
36.5
Fuentes de infección por el agua
Cólera 1152
36.6
36.7
Giardiasis y criptosporidiosis
1154
Legionelosis (enfermedad de los
legionarios)
1156
Fiebres tifoideas y otras enfermedades
transmitidas por el agua 1157
36.8
1151
Capítulo 37 Conservación de los alimentos
y enfermedades infecciosas
transmitidas por los
alimentos 1161
CONSERVACiÓN DE LOS ALIMENTOS
Y CRECIMIENTO MICROBIANO 1162
37.1
Crecimiento microbiano y alteraciones
de los alimentos
1162
37.2
37.3
11
37.4
37.5
37.6
11I
37.7
37.8
37.9
37.10
37.11
Conservación de los alimentos
Alimentos fermentados
1166
XXXIII
1163
DETECCiÓN DE MICROORGANISMOS
E INTOXICACiÓN ALlMENTARIA 1168
Enfermedades transmitidas por los alimentos
y detección de microorganismos
1168
Intoxicación alimentaria por
estafilococos
1170
Intoxicación
alimenticia
por clostridios
INFECCIONES ALlMENTARIAS
Salmonelosis
1171
1173
1173
Cepas patógenas de Escherichia coli 1175
Campylobacter
1177
Listeriosis
1178
Otras enfermedades infecciosas transmitidas
por alimentos
1179
Información
adicional
Espinacas y Escherichia coli 0157:H7 1176
Apéndice 1
Cálculos de energía en bioenergética microbiana 1183
Apéndice 2
Manual de Bergey de bacteriología sistemática,
segunda edición 1189
Glosario
1197
Créditos de las fotografías
índice analítico
1219
1217