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Resistencia Bacteriana en el Ecuador Simposio interdisciplinar de investigación, Postgrados y vinculación con la comunidad Iliana Alcocer Negrete, Dra. Pontificia Universidad Católica del Ecuador Escuela de Ciencias Biológicas Laboratorio de Microbiología Laboratorio de Microbiología Escuela de Ciencias Biológicas Año 2004 Laboratorio de Microbiología Escuela de Ciencias Biológicas Interdisciplinaridad ESCUELA DE CIENCIAS BIOLÓGICAS FACULTAD DE MEDICINA Iliana Alcocer Jeannete Zurita Año 2009 Confianza Apoyo mutuo Grupos de trabajo Apoyo de la PUCE Laboratorio de Microbiología Escuela de Ciencias Biológicas Biología Bioanálisis Biología Biología Medicina Biología Laboratorio de Microbiología Escuela de Ciencias Biológicas Chef DRIII System Para análisis de clonalidad bacteriana por electroforesis de campo pulsado 1. PUCE 2. San Francisco 3. INH Laboratorio de Microbiología Escuela de Ciencias Biológicas Sistema de fotodocumentación Molecular Imager Gel Doc XR+ BioRad Laboratorio de Microbiología Escuela de Ciencias Biológicas Laboratorio de Microbiología Escuela de Ciencias Biológicas Laboratorio de Microbiología Escuela de Ciencias Biológicas Laboratorio de Microbiología Escuela de Ciencias Biológicas Antimicrobianos • Los antimicrobianos son compuestos relativamente sencillos, producidos por bacterias u hongos que atacan específicamente a las bacterias. • Tienen capacidad, en baja concentración, de inhibir el crecimiento bacteriano • Pueden ser naturales, sintéticos o semisintéticos. Antimicrobianos 1940 Alexander Fleming, 1928 Desde el descubrimiento de la penicilina, se han descubierto una docena de nuevos tipos de antimicrobianos y optimizado o sintetizado cerca de una centena. Resistencia bacteriana Cepas resistentes raras Exposición a antimicrobianos Cepas resistentes predominantes Resistencia Introducción en la terapia Aislamiento de cepas resistentes Capacidad adaptativa de las células bacterianas Alta tasa de diseminación por transferencia horizontal de genes de resistencia Resistencia bacteriana Patógeno Resistente Patógeno Prevención de la transmisión Prevención de la infección Infección Resistencia a los antimicrobianos Diagnóstico y tratamiento eficaces Uso acertado Uso de antimicrobianos Preocupación mundial • Resistencia a betalactámicos: BLEEs –AMP-C –Carbapenemes – • Resistencia a quinolonas • Resistencia a aminoglucósidos Diseminación de la Resistencia bacteriana Beta lactamasas de espectro extendido BLEE Enzimas capaces de conferir a la bacteria resistencia a penicilinas, cefalosporinas de primera, segunda, tercera e inclusive cuarta generación y a los monobactámicos como el aztreonam, pero no a cefamicinas ni carbapenémicos Diseminación de la Resistencia bacteriana Enzimas modificadoras de aminoglucósidos EMAs 1. acetiltransferasa (AAC), 2. fosfatidil transferasa (APH) y 3. adenil transferasa (ANT o AAD). Resistencia Adquirida Klebsiella pneumoniae Serratia marcenses Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas Klebsiella aeruginosa pneumoniae AMIKACINA GENTAMICINA ESTREPTOMICINA TOBRAMICINA IMIPENEM MEROPENEM IMIPENEM MEROPENEM Carbapenemasas Metalo-b-lactamasas Tipo Serin-β-lactamasas (Residuo de Serina en el sitio activo) Clase A Clase A SME NMC SFC KPC GES IMI E. cloacae S. marcenscens K. pneumoniae P. aeruginosa (Cationes divalentes tipo Zinc) Clase D OXA Acinetobacter baumannii Clase B IMP VIM SPM GIM SIM NDH Acinetobacter baumannii S. marcescens P. aeruginosa Especies patógenas: Klebsiella pneumoniae - Infecciones de tracto respiratiorio - Infección de vías urinarias - Sistema nevioso osteoraticular - Sepsis Especies patógenas: Escherichia coli - Infección de vías urinarias - Sepsis - Meningitis - Enfermedad diarreica Especies patógenas: Serratia marcescens - Infecciones de tejidos - Sepsis Especies patógenas: Pseudomonas aeruginosa - patógeno oportunista principalmente en ambientes hospitalarios Materiales y métodos Hospitales participantes de la REDNARBEC y laboratorios interesados 12. Vicente de Paúl 13. IESS Ibarra 14. Centro Médico Ibarra 15. Rodríguez Zambrano 16. Icaza Bustamente 17. Guayaquil 18. Roberto Gilbert 19. Luis Vernaza 20. De infectología 21. Alcívar 1. Carlos Andrade Marín 2. De las Fuerzas Armadas 3. De la Policía 4. Baca Ortiz 5. Enrique Garcés 6. Solca Quito 7. Vozandes Quito 22. Patronato San José 23. Clínica la Merced 24. Clínica Guadalupe 8. Vozandes Shell 9. Homero Castañer 10. Solca Cuenca 11. Clínica Santa Ana 25. Clínica del Río Cuenca Población bacteriana •2792 bacterias de origen clínico – – – – – – – – – – Escherichia coli Klebsiella pneumoniae Serratia marcescens Enterobacter cloacae Enterobacter aerogenes Proteus mirabilis Citrobacter freundii Staphylococcus aureus Pseudomonas aeruginosa Shigella spp. IIdentificación genotípica Identificación de genes de resistencia y determinantes genéticos relacionados en aislados entéricos de la Colección Bacteriana Quito Católica CB-QCA Identificación de genes por PCR Secuenciamiento DETECCIÓN DE GENES POR PCR Y SECUENCIAMIENTO BLEE: blaSHV, blaTEM, blaPER, blaCTX-M y AmpC CARBAPENEMASAS: blaKPC, blaGES, blaVIM, blaIMP blaSPM EMAs: aac(3)-IIa, aac(6’)-Ib, ant(2”)-Ia,, Resistencia a quinolonas: qnr IntI y RV de integrones clase I Diseño de primer y padronización para detección de genes María Fernanda Yauri David Ortega Pedro Barba Genotipaje de la resistencia a antibióticos en aislados clínicos de Klebsiella pneumoniae productores de βlactamasas de espectro extendido (BLEE) David Ortega Paredes Confirmación fenotípica de producción de β-lactamasas de espectro extendido (BLEE) • Prueba confirmatoria de producción de BLEE: Positivo aumento < 5 mm en el halo de inhibición de cefalosporina de tercera generación / clavulanato Detección de genes en Klebsiella pneumoniae 100.0 •blaSHV cromosómico •Componente de ADN cromosómico en ADN plasmidial 0.0 Detección de genes en Klebsiella pneumoniae Primer lugar en la categoría pregrado universidades el área Ciencias de la Salud y el Segundo lugar dentro de todas las áreas en la categoría Pregrado Universidades en la IX Feria Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación (FENACYT 2008) Búsqueda de BLEE y carbapenemasas en enterobacterias Diana Muñoz Gabriela Yépez Ana María Gómez Castañier en Azogues Enrique Garcés 232 Pablo Arturo Suárez 124 De La Policía Nacional 233 Gineco-Obstétrico Isidro Ayora Vozandes De Niños Baca Ortiz Solón Espinosa, Solca Quito General De Las Fuerzas Armadas No.1 400 Carlos Andrade Marín Número de aislados Bacterias entéricas de origen clínico 1200 1075 1000 800 600 382 301 200 212 107 69 0 5 Comunitarias 60 Hospitalarias 49 50 49 40 33 34 34 30 20 19 17 16 11 10 7 15 13 9 8 5 2 4 1 0 12,1 / 2693/325 Enrique Garcés Pablo Arturo Suárez De La Policía Nacional Gineco-Obstétrico Isidro Ayora Vozandes 19,4 De Niños Baca Ortiz 18,9 Solón Espinosa, Solca Quito 20,0 General De Las Fuerzas Armadas No.1 Carlos Andrade Marín Porcentaje Porcentaje de BLEE en bacterias entéricas 25,0 23,2 18,9 17,3 15,0 15,1 13,1 10,0 6,3 5,0 3,0 0,0 738 pb Control negativo Tercer caso Cuenca Segundo caso Guayaquil Primer caso Azogues Control positivo Identificación molecular de KPC Pseudomonas aeruginosa RESISTENCIA A CARBAPENEMES 37% 48/12 9 Aislados Resistentes a Carbapenemes RESISTENCIA A AMINOGLUCÓSIDOS 61% 78/129 Aislados Resistentes a Aminoglucósidos Identificación de blaGES en aislados de Pseudomonas aeruginosa 31% (44/129) Identificación de blaKPC en aislados de Pseudomonas aeruginosa 5,4% (7/129) Identificación de blaVIM y blaIMP en aislados de Pseudomonas aeruginosa INTEGRONES 3,1% 22,5% (29/129) blaVIM 7,8%(10/129) blaIMP Amplificación de genes EMAs en Pseudomonas aeruginosa 27/129 (20,9%) 21/129 (16,3%) 13/129 (10,1%) 6/129 (4,7%) Integrones Clase I Total Aislados Presentan Integrón Clase I Porcentaje 129 79 61,2% % genes productores de carbapenemasas presentes Integrones Clase I 21,7% Búsqueda de carbapenemasas en enterobacterias Camila Cilveti Andrea León Nathaly Espinel Identificación molecular de BLEE TEM 862pb 858pb 585pb SHV CTX-M Identificación molecular de carbapenemasas: serin-beta-lactamasas blaKPC blaGES 864 pb 738 pb A Identificación molecular de carbapenemasas: metalo-beta-lactamasas blaVIM A blaIMP Número de aislamientos entéricos positivos para los genes de análisis Número de aislamientos 300 281 Total Hospitalarios 250 Total Comunitarios 200 162 150 125 100 101 98 51 50 9 0 0 Total blaCTX blaTEM 27 16 blaSHV 0 blaPER 0 bla KPC 5 0 bla GES 1 0 bla IMP 4 0 bla VIM Total blaCTX blaTEM blaSHV blaPER blaKPC blaGES blaIMP blaVIM Casos con blaKPCn Quito 6 7 8 10 14-22 11 Guayaquil 2 9 12 Azogues 1 3 13 4 5 Cuenca Klebsiella pneumoniae Serratia marcescens Klebsiella oxytoca Enterobacter aerogens Enterobacter cloacae Genotipificación de KPC por campo pulsado Casos con blaGESn 8 Quito 11 14 15 Cuenca Klebsiella pneumoniae Klebsiella oxytoca Casos con blaIMPn Quito Cuenca Serratia marcescens Casos con blaVIMn Quito 16 19 17 Cuenca Klebsiella pneumoniae Morganella morganii Serratia marcescens Conclusiones CONCLUSIONES • Dentro de la población de estudio se encontró alta resistencia a betalactámicos, aminoglucósidos y carbapenemes y no registraron resistencia a polimixina B, colistina, tigeciclina ni fosfomicina. • Los resultados confirman que en nuestro medio hay una evidente asociación entre producción de BLEE y resistencia a otras familias de antibióticos, en especial quinolonas, aminoglicósidos y carbapenemes. • Existe una relación entre la presencia de plásmidos y de integrones con la alta resistencia antimicrobiana.