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Carmen Avilés Ramírez Grupo MERAGEM MASTER EN ZOOTECNIA Y GESTION SOSTENIBLE: GANADERIA ECOLOGICA E INTEGRADA 3 de mayo de 2011 Información fenotípica Informaciónfenotípica VALORGENÉTICO Información genealógica Informacióngenealógica Selección tradicional responsable de las mejoras en g la p productividad q que se han conseguido en las últimas décadas • Caracteres difíciles de cuantificar • Subjetivos y mercado-dependientes • Determinación costosa • Técnicas destructivas (determinación postmortem) • Limitados a un sexo: producción de leche en bovino Herramienta barata sistemática objetiva precoz flexible Soluciónqueofrecelagenéticaactual: SelecciónAsistidaporMarcadores(MAS) Marcadores moleculares: fragmentos identificables de ADN, localizados en posiciones específicas del genoma, y transmitidos por las leyes clásicas de la herencia de una generación a la siguiente 1. Seleccióndeanimalescongenotipodeseableymejores valores genéticos (clásicos) valoresgenéticos(clásicos) 2 2. Valoracióngenética= Valoración genética = valoracióntradicional+valoraciónmolecular Precocidad Midenelpotencial,noel resultadofinal Noexigesacrificio No exige sacrificio Salvaelproblemade Efectodelgendependede correlacionesnegativas g laraza entrecaracteresdeinterés Resultadosamáscorto plazo ControlaCARACTERES CUANTITATIVOS GENÓMICA es el conjunto de ciencias y técnicas dedicadas al estudio integral del funcionamiento, funcionamiento el contenido, contenido la evolución y el origen de los genomas (totalidad de información genética que posee un organismo en particular) La secuenciación de un genoma genera información sobre todos los genes presentes en un genoma Distintas características de los genes como posición en el ggenoma,, conservación de los ggenes observada entre distintas especies y predicciones de la estructura de las proteínas o el ARN ahí codificados p permiten inferir la función de algunos g de los genes estudiados Paso 1: 95º 10’ Paso 2: Paso 3: Paso 4: 72º 95º 1’ 65º 40’’ 1’30’’ X35 Tampón MgCl2 Primer F Primer R dNTPs Taq Pol H2O mQ DNA muestra Paso 5: 72º 10’ 4º Un marcador molecular es un segmento de ADN con una ubicación física identificable en un cromosoma y cuya herencia se puede rastrear RFLP (Polimorfismo en la longitud de fragmentos de restricción): se refiere a secuencias específicas de nucleótidos en el ADN que son reconocidas y cortadas por las enzimas de restricción y que varían entre individuos AFLP (Amplified fragment length polymorphism): está basado en la segmenteción del ADN genómico mediante enzimas de restricción y en la subsecuente amplificación de algunos de esos fragmentos mediante PCR RAPD (Random amplification of polymorphic DNA): el polimorfismo que se observa entre distintos individuos consiste en la presencia o ausencia de fragmentos de ADN amplificado. Los fragmentos amplificados no suelen corresponder a ADN ligado a algún carácter, sino redundante, y que no da información sobre el número de copias que el ADN genómico contiene de la secuencia amplificada VNTR (Variable number tandem repeat): regiones del ADN que contienen una secuencia breve de nucleótidos que se repite en tándem muchas veces. Dos clases: Mi i télit (de Minisatélites (d 8 a 25 nt) t) y Microsatélites (de 2 a 7 nt) SNP (Single nucleotide polymorphism): polimorfismos de un solo nucleótido es una variación en la secuencia de ADN que afecta a una sola base TL......NoportadorBLAD TL No portador BLAD BL.....PortadorBLAD TD.....NoportadorDUMPS DP.....PortadordeDUMPS TV.....LibredeCVM CV....PortadordeCVM BD.....PortadordeBulldog TG.....NoportadordeBulldog MF MF.....PortadordePiedeMula Portador de Pie de Mula TM.....NoportadordePiede Mula F Fuente:CatálogodesementalesCONAFE,Julio2010 C ál d l CONAFE J li 2010 Rendimientodelacanal Conformacióndelacanal Pesodelacanal Porcentajedemúsculo Elsistemadeclasificacióndecanalesbovinasserealizaenfuncióndelos El sistema de clasificación de canales bovinas se realiza en función de los siguientescriterios: 1 Lacategoríadelacanal(categoríasA,B,C,D,E,VyZ) 1 La categoría de la canal (categorías A B C D E V y Z) 2 Elestadodeengrasamiento ( 1,2,3,4,5+) 3 Laconformación(Superior– SEUROP Mediocre) 4 Elcolordelagrasaydelacanal(Blanca– l l d l d l l( l 12345 Amarilla) ill ) (Rosaclaro 12345 Rojooscuro) Gen de la sensibilidad al halotano Depende del gen que codifica al receptor de la rianodina (canal liberador de calcio) Regulación inapropiada del flujo de iones Ca2+ a través de la membrana del retículo sarcoplásmico. Se producen fuertes caídas en el pH postmortem en los individuos susceptibles que les llevan a acumular ácido láctico y CO2 en el músculo, esta acidosis puede producir la muerte Hipertermia maligna (PSS): contracciones musculares, elevación de la tª, cianosis en piel, acidosis extrema, colapso Se desencadena a partir de situaciones estresantes (transporte, (transporte confinamiento, vacunaciones…) así como tras una anestesia con halotano (test del halotano) Carnes PSE (pálidas, blandas y exudativas) El test del halotano se ha usado durante mucho tiempo para detectar a los portadores recesivos del alelo n Los individuos con genotipo nn poseen en relación a aquellos con genotipo NN mayor contenido magro y un área de lomo superior, mayor eficiencia de transformación, transformación peor comportamiento maternal y un mayor deterioro en la calidad de la carne Industria productora de carne de cerdo => animales magros Frecuencia del alelo n : Razas especializadas como Pietrain y las líneas alemana y belga de la raza Landrace (en comparación con otras líneas Landrace) Frecuencia del alelo n : Razas como Large White y Duroc Gen RYR1 (HAL): Se localiza en el cromosoma 6 (BTA6) Nº acceso del GenBank 396718, la mutación responsable es una transición C>T que se produce en el nucleótido 1843 del gen Sustitución en la posición 615 del polipéptido de una arginina por citosina => asociado d all alelo l l n que en homocigosis da lugar al PSS p ) Gen RN ((Rendement Napole) Se llama así por un método laboratorial utilizado para predecir rendimientos en jamones curados y cocidos El gen RN afecta al contenido de glucógeno. La mutación consiste en una variación en la cadena de DNA que codifica a la subnunidad gamma3 del la AMPK AMPK (AMP protein kinasa activada) tiene un papel f d fundamental l en la l regulación l ó d l metabolimo del b l energético en células eucariotas y se activa por un aumento t en ell ratio ti AMP/ATP. AMP/ATP AMPK activada ti d inhibe i hib la l síntesis de glucógeno y estimula la glucogenolisis El alto contenido en gglucógeno g de los p portadores del alelo RN hace que la composición de química de la carne se vea afectada así como sus características tecnológicas. Los portadores del alelo RN poseen menor contenido de proteína, pH final más bajo, menor capacidad de retención de agua y rendimiento en el procesado y mayores valores de reflectancia Las diferencias vinculadas el gen RN dependen de dos alelos identificados en el gen PRKAG3 que se localiza en el SSC15: 199V 199V–200R 200R (rn+) y 199V–200Q (RN) El alelo rn+ está asociado a bajos niveles de glucógeno, lactato y a un nivel de pH final más alto en relación al alelo RN. Los bajos j niveles de p pH final y de contenido p proteíco han determinado bajos rendimientos en la producción de jamones pero una carne más tierna y jugosa El síndrome de la hipertrofia muscular aparece en varias razas europeas con diferente frecuencia de presentación. Está vinculado al gen de la miostatina que posee un polimorfismo muy elevado, éste consiste en variaciones nucleotídicas de distinto nivel cuyo resultado es la falta de expresión del gen y la consigueinte aparición del síndrome No en todas las razas ni en todos los individuos de una misma raza aparece con la misma intensidad (diferencias en la presión de selección para evitar por ejemplo, distocias) Siete mutaciones disruptivas d encontradas d en características í d de raza comprenden los fenotipos más extremos
