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Las enzimas de restricción reciben su nombre de la bacteria de la que fueron aisladas por ejemplo: EcoRI de Escherichia coli, BamHI de Bacillus amyloliquefaciens. Las tres primeras letras en el nombre de la enzima, corresponden la primera al genero (E) y las otras dos a la especie (co). Éstas pueden ir seguidas por la designación de una cepa ( R) y un número romano (I) para indicar el orden del descubrimiento. El tipo más común de enzimas de restricción (tipo II) usado en la tecnología del DNA recombinante proviene de bacterias y no requiere fuente de energía para el clivaje del puente. Requiere en cambio iones Mg++ para la unión específica al DNA y posterior clivaje. Otras enzimas de restricción clivan palíndromos de DNA de 4 o 6 pb. Algunas otras enzimas de restricción clivan una secuencia única. Estas enzimas que reconocen la misma secuencia se llaman ISOCHIZOMERS. Las enzimas de restricción cortan dejando extremos cohesivos o romos. Los extremos cohesivos o adherentes son generados cuando la enzima corta las dos hebras asimétricamente, dejando los extremos de cada hebra de simple cadena complementarias entre sí. Los extremos cohesivos o adherentes son particularmente útiles en la construcción de moléculas de ADN híbridas o quiméricas. Por otro lado, los extremos romos son generados DEFINICION: Las enzimas de restricción o endonucleasas de restricción son enzimas que cortan los enlaces fosfodiéster de la doble hebra de DNA a partir de una secuencia especifica que reconocen, y ese punto donde la enzima encuentra la secuencia de nucleótidos se conoce como sitio de restricción. Las enzimas (ó endonucleasas) de restricción son unas proteínas con acción catalítica que tienen la propiedad de reconocer secuencias cortas, de unos cuatro ó seis pares de bases en el ADN de doble hebra, y cortar en todos los puntos donde se encuentre dicha secuencia. Este lugar de corte se denomina diana de restricción. Cada enzima de restricción tiene una diana particular en el ADN. sobre como actúa una enzima de restricción para clonar un fragmento de ADN La rotura del DNA produce una serie de características de fragmentos y estos se pueden ligar a otros DNA, como el vector de clonación Cada enzima de restricción reconoce una secuencia nucleotídica específica en donde corta el DNA. Según el ataque, la enzima puede hacer un corte que genere extremos romos ó bien cohesivos. Las enzimas de restricción cortan dejando extremos cohesivos o romos. Los extremos cohesivos son generados cuando la enzima corta las dos hebras asimétricamente, dejando los extremos de cada hebra de simple cadena complementaria entre sí. Por otro lado, los extremos romos son generados cuando la enzima corta las dos hebras por el mismo lugar, generando dos extremos doble cadena. 1. Tipo I y Tipo III: a. Tienen actividad de restricción (cortan) y modificación (metilan). b. Cortan a cierta distancia de la secuencia de reconocimiento, las Tipo I cortan lejos de la secuencia de reconocimiento, ya sea río arriba o río abajo. Las Tipo III cortan de 5-8 bases antes o despúes de la secuencia que reconocen. c. Necesitan ATP para moverse a través de la molécula de DNA, desde el lugar de reconocimiento hasta el sitio del corte. 2. Tipo II: a. Sólo tienen actividad de restricción. b. Cortan de manera consistente y predecible dentro de la secuencia que reconocen. c. Sólo requieren Mg++ como cofactor. d. No necesitan ATP.