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Secuenciado por primera vez el transcriptoma del músculo de la dorada
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10 Junio 2012
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Secuenciado por primera vez el transcriptoma del músculo de
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BARCELONA, España.- Científicos de la Universidad de St. Andrews (Escocia) y del Institut de Recerca i Tecnologia
Agroalimentàries (IRTA) acaban de difundir los primeros datos relativos al transcriptoma del músculo de la dorada
(Sparus aurata). Estos resultados, publicados en la revista BMC Genomics, juegan un papel fundamental en la
mejora genética y cría comercial de una de las especies de producción en acuicultura del Mediterráneo.
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Los científicos Alicia Estevez y Karl Andree, del subprograma Cultivos Acuícolas del IRTA, adscrito al Departamento
de Agricultura de la Generalitat de Catalunya, en colaboración con Daniel García e Ian Johnston del Laboratorio de
Fisiología y Genómica Evolucionaria de la Universidad escocesa de St. Andrews, han conseguido secuenciar el
transcriptoma del músculo de la dorada (Sparus aurata).
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El transcriptoma es el conjunto de todas las moléculas que forman el ácido ribonucleico mensajero (ARNm),
responsable de codificar la información genética contenida en el ADN necesaria para producir los diferentes tipos
celulares que componen un organismo adulto. A diferencia del genoma, que reúne todo el material genético común a
cada una de las células, el transcriptoma contiene la información de aquellos genes que se expresan de forma activa
en función de las condiciones ambientales externas, dando lugar a las proteínas
que confieren a las células su carácter individual (proteoma). En el ámbito de la investigación animal, su
identificación es clave para la comprensión de las bases genéticas y moleculares de los ejemplares criados en
explotaciones de producción intensiva, ya que permite mejorar factores relacionados con el crecimiento del animal.
Así pues, la secuenciación del transcriptoma del músculo de la dorada representa un avance importante en la
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Secuenciado por primera vez el transcriptoma del músculo de la dorada
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información genética hasta ahora disponible sobre este pez. En particular, la investigación ha permitido identificar
factores de transcripción (genes que se activan para producir proteínas celulares), moléculas de señalización (que
modulan la expresión de los genes) y proteínas estructurales necesarias para el desarrollo (miogénesis) y
crecimiento del tejido muscular del animal.
Para ello, los científicos han comparado el transcriptoma del músculo de ejemplares adultos (con un peso de 2 kg) y
de juveniles (90 g), bajo distintas condiciones nutricionales. Esto ha permitido establecer que el estado fisiológico de
la dorada afecta directamente la expresión de sus genes, por lo que ésta dependerá del estado nutricional y de la
edad del animal. A través de este estudio, “hemos podido secuenciar varios miles de genes, que ayudarán a
entender mejor la biología de la dorada y, en particular, el desarrollo de su tejido muscular esquelético” afirma la Dra.
Alicia Estevez del IRTA.
Los resultados, obtenidos en el marco del proyecto europeo LifeCycle del Séptimo Programa Marco, abren nuevas
vías a la implementación de programas de mejora genética para cultivos acuícolas, a fin de conseguir un producto
final de mayor calidad que el actual. “Pese a que esta práctica está ampliamente difundida en el ámbito de la
ganadería, es la primera vez que se detectan dichos marcadores genéticos para la selección de peces”, apunta
Estevez.
La reproducción del transcriptoma ha permitido, por tanto, identificar grupos de microsatélites (secuencias variables
de ADN) y así establecer la relación entre las variables genéticas y los caracteres de interés comercial para la
producción de esta especie en instalaciones de acuicultura. Por esa razón, tal como ocurre en las explotaciones
intensivas de producción porcina, avícola y bovina entre otras, el hallazgo permitirá seleccionar ejemplares de
dorada con mayor crecimiento, mejor textura de la carne y menor grasa intramuscular, lo que supone mejoras
evidentes para el sector acuícola.
Referencia:
“Fast skeletal muscle transcriptome of the Gilthead sea bream (Sparus aurata) determined by next generation
sequencing”, Garcia, D., Estevez, A., Andree, K. and Johnston, I.A. BMC Genomics 2012, 13:181
(doi:10.1186/1471-2164-13-181).
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