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IPac. - 5 de junio de 2012
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Foto: APROMAR
Los científicos Alicia Estevez y Karl Andree, del subprograma Cultivos Acuícolas del IRTA, adscrito al
Departamento de Agricultura de la Generalitat de Catalunya, en colaboración con Daniel García e Ian Johnston
del Laboratorio de Fisiología y Genómica Evolucionaria de la Universidad escocesa de St. Andrews, han
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conseguido secuenciar el transcriptoma del músculo de la dorada (Sparus aurata). Estos resultados, que han sido
publicados en la revista BMC Genomics, destacan desde el IRTA, “juegan un papel fundamental en la mejora
genética y cría comercial de una de las principales especies de producción en acuicultura del Mediterráneo”.
Teniendo en cuenta que el transcriptoma es el conjunto de todas las moléculas que forman el ácido ribonucleico
mensajero (ARNm), responsable de codificar la información genética contenida en el ADN necesaria para
producir los diferentes tipos celulares que componen un organismo adulto. Y partiendo de la base de que, a
diferencia del genoma -que reúne todo el material genético común a cada una de las células-, el transcriptoma
contiene la información de aquellos genes que se expresan de forma activa en función de las condiciones
ambientales externas, dando lugar a las proteínas que confieren a las células su carácter individual (proteoma);
así como que en el ámbito de la investigación animal, su identificación es clave para la comprensión de las bases
genéticas y moleculares de los ejemplares criados en explotaciones de producción intensiva -ya que permite
mejorar factores relacionados con el crecimiento del animal-, “la secuenciación del transcriptoma del músculo de
la dorada representa un avance importante en la información genética hasta ahora disponible sobre este pez”.
En particular, explican desde el IRTA, la investigación ha permitido identificar factores de transcripción (genes
que se activan para producir proteínas celulares), moléculas de señalización (que modulan la expresión de los
genes) y proteínas estructurales necesarias para el desarrollo (miogénesis) y crecimiento del tejido muscular del
animal. Para ello, añaden, los científicos han comparado el transcriptoma del músculo de ejemplares adultos (con
un peso de 2 kg) y de juveniles (90 g), bajo distintas condiciones nutricionales; “lo que ha permitido establecer
que el estado fisiológico de la dorada afecta directamente la expresión de sus genes, por lo que ésta dependerá
del estado nutricional y de la edad del animal”. En ese sentido, y en particular, a través de este estudio, indica la
investigadora del IRTA, Alicia Estévez, “se ha podido secuenciar varios miles de genes, que ayudarán a entender
mejor la biología de la dorada y, en particular, el desarrollo de su tejido muscular esquelético”.
Los resultados, por tanto, abren nuevas vías a la implementación de programas de mejora genética para cultivos
acuícolas, a fin de conseguir un producto final de mayor calidad que el actual. “Pese a que esta práctica está
ampliamente difundida en el ámbito de la ganadería, es la primera vez que se detectan dichos marcadores
genéticos para la selección de peces”, apunta Estevez. Así, y dado que
la reproducción del transcriptoma ha permitido identificar grupos de microsatélites (secuencias variables de
ADN) y establecer la relación entre las variables genéticas y los caracteres de interés comercial para la
producción de esta especie en instalaciones de acuicultura, “en este caso y tal como ocurre en las explotaciones
intensivas de producción porcina, avícola o bovina, el hallazgo permitirá seleccionar ejemplares de dorada con
mayor crecimiento, mejor textura de la carne y menor grasa intramuscular, lo que supone mejoras evidentes para
el sector acuícola”, concluyen.
Estos resultados se han obtenido en el marco del proyecto europeo LifeCycle del Séptimo Programa Marco.
Bibliografía: “Fast skeletal muscle transcriptome of the Gilthead sea bream (Sparus aurata) determined by
next generation sequencing”, Garcia, D., Estevez, A., Andree, K. and Johnston, I.A. BMC Genomics 2012,
13:181 (doi:10.1186/1471-2164-13-181).
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