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Grado Medicina Biología Celular – 1er Curso TEMA 3 METABOLISMO CELULAR 3.1 Papel central de las enzimas como catalizadores biológicos. 3.2 Energía metabólica. Biosíntesis de los componentes celulares. Las células llevan a cabo una gran variedad de reacciones químicas: Degradación de moléculas alimenticias Síntesis de los constituyentes y celulares Tres temas principales: Proteínas como catalizadores biológicos Generación y utilización de la energía metabólica Biosíntesis Bi sí t sis de d los l s principales i i l s constituyentes stit t s celulares l l s 1 3.1 Papel central de las enzimas como catalizadores biológicos. ENZIMAS: catalizadores que incrementan la velocidad de las reacciones químicas dentro de la célula. “Sin catálisis enzimática, la mayoría de las reacciones bioquímicas son tan lentas que no ocurrirían en condiciones de temperatura y presión compatibles con la vida.” Las enzimas aceleran la velocidad de las reacciones bioquímicas más de 1.000.000 de veces. L s células Las él l s contienen ti miles il s de d enzimas i s diferentes. dif t s 2 Dos propiedades fundamentales de las enzimas: 1. Aumentan m la velocidad de las reacciones q químicas m sin ser consumidas o alteradas permanentemente por la reacción 2. Aumentan la velocidad de las reacciones sin alterar el equilibrio químico entre sustratos y productos E S P Diagramas energéticos para reacciones catalizadas y no catalizadas http://www.sinauer.com/cooper5e/animation0301.html 3 Las enzimas deben unirse a los sustratos para formar un complejo enzima-sustrato: ES S+E ES E+P El sustrato se une a una región específica de la enzima denominada: Lugar o sitio activo La mayoría de las reacciones bioquímicas implican interacciones entre dos o más sustratos diferentes http://www.sinauer.com/cooper5e/animation0302.html 4 Modelos de interacción enzima-sustrato Coenzimas Los lugares activos de muchas enzimas ligan otras pequeñas moléculas que participan en la catálisis. Son grupos prostéticos, pequeñas moléculas unidas a proteínas en las que desempeñan papeles cruciales: grupos rup s hemo, hem iones i nes metálicos metálic s (zinc, (zinc hierro), hierr ) moléculas orgánicas de bajo peso molecular. Estas moléculas se denominan COENZIMAS Trabajan j con las enzimas p para aumentar la velocidad de la reacción. No se alteran de forma irreversible por las reacciones en las que participan. Se reciclan y pueden participar en múltiples reacciones enzimáticas. 5 Coenzimas Ejemplo: NAD+, nicotinamín adenín dinucleótido funciona como transportador de electrones en reacciones de óxido-reducción. S 1 + H+ + 2e 2 - + NAD+ S1 oxidado xid d + NADH S2 + NADH NAD+ + S2 reducido 3.2 Energía metabólica. Biosíntesis de los componentes celulares. 6 Una gran parte de las actividades de la célula están dedicadas a obtener energía del entorno y a emplear esa energía para activar reacciones que la necesiten (movimiento, síntesis de macromoléculas, etc). La generación y utilización de energía metabólica es por lo tanto fundamental en toda la biología celular. Termodinámica: ENTALPÍA: calor que se libera o es absorbido durante una reacción química. ENTROPÍA: grado de desorden que resulta de una reacción. ENERGÍA LIBRE DE GIBBS (G): su variación (G) en una reacción combina entalpía y entropía para predecir si una reacción es o no energéticamente favorable. G < 0 energéticamente favorable Supongamos una reacción en la que A se convierte en B A B Si G < 0 , entonces A B Si G > 0 , entonces A B 7 Muchas reacciones biológicas, como la síntesis de macromoléculas, son termodinámicamente desfavorables (G > 0) en condiciones celulares. Para que esas reacciones puedan progresar se necesita una fuente adicional de energía: A C A+C B D G +10kcal/mol G= 10k l/ l G= -20kcal/mol B+D G= -10kcal/mol La reacción combinada es energéticamente favorable y progresará, porque G < 0 ya que es la suma de G de los componentes individuales: +10 + (-20)= -10 kcal/mol. Las enzimas se encargan de llevar a cabo estas reacciones combinadas de una forma coordinada. El adenosín 5’-trifosfato (ATP) actúa como un depósito de energía libre dentro de la célula. Los enlaces entre los fosfatos del ATP son enlaces de alta energía ya que su hidrólisis se acompaña de un descenso grande en la energía libre 8 Glicólisis Fase inicial de la degradación de la glucosa, resultando en dos moléculas de piruvato y una ganancia neta de dos moléculas de ATP. http://www.sinauer.com/cooper5e/animation0303.html También se producen 2 moléculas de coenzima NADH. En condiciones aeróbicas, el NADH dona sus e- a la cadena de transporte de e-. El piruvato se transporta a la mitocondria donde se inicia el ciclo de Krebs. Las moléculas de NADH y FADH2 que se producen transfieren finalmente sus e- a la cadena de transporte electrónico consumiendo O2 y produciendo ATP. Producción de energía a partir de otras moléculas orgánicas Nucleótidos azúcares vía glucolítica Aminoácidos ciclo de Krebs Polisacáridos azúcares libres vía glucolítica Lípidos glicerol y ácidos grasos libres acil-CoA graso acetil CoA ciclo de Krebs Los lípidos son moléculas más eficaces en el almacenamiento d eenergía, ya que están más reducidos que los carbohidratos. Ganancia G i neta t por molécula m lé l de: d : Glucosa, 36-38 ATPs Ácido graso, 130 ATPs Teniendo en cuenta el peso molecular, el rendimiento por gramo de ácido graso es 2,5 veces superior. 9 3.2 Energía metabólica. Biosíntesis de los componentes celulares. CARBOHIDRATOS La glucosa se sintetiza a partir de otras moléculas orgánicas empleando energía en forma de ATP y poder reductor a partir de NADH. Se necesita ATP adicional para producir polisacáridos a partir de azúcares simples. LÍPIDOS Se sintetizan a partir de acetil CoA, que se forma en la degradación de los carbohidratos. PROTEÍNAS Los aminoácidos son sintetizados a partir de intermediarios de la glicólisis y del ciclo de Krebs. Se requiere energía adicional, en forma de ATP y GTP, GTP para formar las proteínas a partir de los aminoácidos. aminoácidos ÁCIDOS NUCLEICOS Los nucleótidos, purinas y pirimidinas, se sintetizan a partir de carbohidratos y aminoácidos. Para su polimerización a ADN y ARN se utilizan nucleósidos trifosfatos como precursores activados. 10