Download Genética de poblaciones de maíz

Genética de poblaciones de
maíz
Implicaciones para la detección y dispersión de
transgenes
Joost van Heerwaarden
Laboratorio de genética y evolución
Instituto de Ecologia
UNAM
El reto:
El reto:
Detectar un elemento raro en muestras tomadas del campo
El reto:
Detectar un elemento raro en muestras tomadas del campo
No es lo mismo un transgénico a un contaminante...
El reto:
Detectar un elemento raro en muestras tomadas del campo
No es lo mismo un transgénico a un contaminante...
Tiene vida propia...
➨
Genética de poblaciones
Reproducción
Deriva
Extinción
Flujo génico (polen + semilla)
?
?
?
?
?
?
?
?
?
?
?
?
No hablaremos de representatividad...
No hablaremos de representatividad...
Pero de la probabilidad de detección
Pd =1-
S
(1-p)
S
p = 1/N
Es una bolsa de semilla un buen modelo?
?
No
Cada mazorca rinde ~500 semillas
de la misma madre.....
S ??
Entra la genética...
Entra la genética...
•
De S individuos a 2S alelos
Entra la genética...
•
De S individuos a 2S alelos
• p ahora es la frecuencia alelica
Tamaño efectivo?
Tamaño efectivo?
2S ➡ 2Ne ?
p(1-p)
2Ne =
=
σp
1
1
1
+ n
8nnff 2nmm
2Ne = min. 8nf << 2S
σp
0.00
0.05
0.10
0.15
p
2
(1-p)
♀
2 p(1-p)
p2
2S ➡ 2nf + n (alelos unicos)
2S ➡ 2nf + n (alelos unicos)
⬇
min. n = S >> 8nf
Polinización libre?... n = n?
Alelos unicos
Pollination
Numero de semillas
Una bolsa?
a
1-
b
S
(1-pa)
c
S
)
d
S
)
k
S
)
(1-pb (1-pc (1-pd
Pd = 1-
S
k
(1-p)
???
S
...(1-pk)
1 .0
0.8
0.6
0.2
0.4
Pd
0.0
a
0.1
0.2
k
0.3
0.5
6000
8000
0.4
2000
4000
Count
6000
4000
2000
0.000
0.005
0.010
0.015
0.020
0.025
c
0
b
0
Count
8000
0.0
0.030
p
Pd = 1-
0.000
0.005
0.010
0.015
0.020
p
S
k
((1-p) ψ)
0.025
0.030
Neutro
+Selección
Neutro
+Selección
7 años
50 años
Histogram of P
0e+00
4e+04
Frequency
4e+04
0e+00
Frequency
8e+04
8e+04
Histogram of P
0.000
0.005
0.010
P
0.015
0.020
0.000
0.005
0.010
P
0.015
0.020
Conclusiones:
Conclusiones:
• La genética de poblaciones afecta la probabilidad de detección
Conclusiones:
• La genética de poblaciones afecta la probabilidad de detección
•
Hay que considerar la contribución desigual de allelos
Conclusiones:
• La genética de poblaciones afecta la probabilidad de detección
•
Hay que considerar la contribución desigual de allelos
•
Los efectos de polinización restringida son (probablemente)
limitados con <20 granos por mazorca
Conclusiones:
• La genética de poblaciones afecta la probabilidad de detección
•
•
Hay que considerar la contribución desigual de allelos
•
Los efectos de polinización restringida son (probablemente)
limitados con <20 granos por mazorca
La distribución agregada de transgenes es un factor importante
Conclusiones:
• La genética de poblaciones afecta la probabilidad de detección
•
Hay que considerar la contribución desigual de allelos
•
Los efectos de polinización restringida son (probablemente)
limitados con <20 granos por mazorca
•
La distribución agregada de transgenes es un factor importante
•
Modelos nos sirven para evaluar hipotesis sobre
dispersion y detección