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CLADISTICA
metodología de reconstrucción filogenética, basada en
un tipo especial de similitud
LAS SINAPOMORFÍAS
o caracteres derivados compartidos por un grupo de
organismos
es decir caracteres que se han modificado respecto de
cómo los encontramos en ancestros más lejanos
Un ejemplo: las medusas, las estrellas de mar y los humanos
¿Quiénes están más cercanamente emparentados?
¿POR QUÉ ES MEJOR AGRUPAR POR SINAPOMORFÍAS?
 permite hacer clasificaciones que reflejen mejor la
historia evolutiva y tengan un mayor valor predictivo
 permite hacer inferencias de cómo funciona la
evolución, al mostrar cómo un carácter se ha
modificado a lo largo de la historia
 permite hacer estudios de adaptación
ALGUNAS SUPOSICIONES
1) todo grupo de organismos está relacionado por
descendencia de un ancestro común
2) existe un patrón de bifurcación en la formación de
las ramas del árbol (cladogénesis)
3) ocurren cambios en los caracteres a lo largo de la
historia evolutiva
4) los caracteres cambian de manera independiente
5) el mejor árbol es aquel que postula el menor
número de pasos para explicar los cambios en los
caracteres (criterio de parsimonia)
¿CÓMO CONSTRUÍR UN CLADOGRAMA?
1) elección del INGROUP, es decir el grupo de
organismos cuyas relaciones se quieren determinar
Australopithecus afarensis
Homo habilis
Homo sapiens neanderthalensis
Australopithecus africanus
Homo heidelbergensis
Homo sapiens sapiens
2) determinación de los caracteres que se van a utilizar
Secuencias de ADN
Secuencias de proteínas
Caracteres morfológicos
Caracteres embriológicos
Caracteres comportamentales
Caracteres ecológicos
3) determinación de los estados posibles para cada
carácter y codificación de los mismos
Binarios: dos estados posibles. Ej: presencia/ausencia
Multiestado: más de dos estados posibles. Ej: A, T, C, G
No ordenados: cualquier estado puede transformarse
directamente en otro.
1
2
3
4
Ordenados: se pueden determinar los estados intermedios.
1
2
3
4)elección de un OUTGROUP o varios, que permitan dar
polaridad a los caracteres al enraizar el árbol
Pan
Gorilla
H.habilis
Pan
A. afarensis
A. africanus
H.s. sapiens
Gorilla
5)construcción de una matriz de caracteres
A. africanus
H. habilis
A. afarensis
H. heidelbergensis
H. s. neanderthalensis
H. s. sapiens
Gorilla
Pan
carácter 1 carácter 2
0
1
1
1
1
1
1
1
1
2
1
2
0
1
0
0
carácter 3 carácter 4
2
1
2
1
2
2
2
2
2
2
2
3
1
1
1
0
6) elección del tipo de parsimonia que se va a utilizar
(criterio de “optimality”)
Parsimonia de Fitch
Parsimonia de Wagner
Parsimonia de Dollo
Parsimonia de Carmin y Sokal
Parsimonia de transversiones
Parsimonia generalizada
7) búsqueda del/los árbol/es más corto/s mediante
algoritmos exactos o heurísticos
H. sapiens sapiens
H. s. neanderthalensis
H. heidelbergensis
H. habilis
A. africanus
A. afarensis
Pan
Gorilla
HOMO
HOMÍNIDOS
8) aplicación de índices y métodos de remuestreo que den
soporte a los grupos establecidos por el/los árboles
Índice de consistencia
Índice de retención
Decisividad
Bremer support
Bootstrap
Jacknife
Búsquedas exhautivas
Algoritmos exactos
Métodos de
branch-and-bound
Búsqueda
As is
de árboles
Stepwise
addition
Closest
Métodos heurísticos
NNI
Branch
swapping
SPR
TBR
Branch swapping