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Esbozo de la técnica de inmunoprecipitación de cromatina (ChIP). Este método permite la localización precisa de una proteína particular (o proteína modificada si se dispone de un anticuerpo apropiado; p. ej., histonas fosforiladas o acetiladas, factores de transcripción, etc.) o un elemento de secuencia particular en células vivas. Dependiendo del método usado para analizar el DNA inmunopurificado, puede obtenerse información cuantitativa o semicuantitativa, en un ámbito de resolución cercano a nucleótido. La ocupación de proteína-DNA puede calificarse en el ámbito de genoma de dos maneras. En primer lugar, mediante ChIP-chip, un método en el que se usa una lectura de salida de hibridación. En el ChIP-chip, el DNA genómico total es marcado con un fluoróforo particular, y el DNA inmunopurificado es marcado con un fluoróforo distinto desde el punto de vista espectral. Estos DNA De: Genética molecular, DNA recombinante y tecnología genómica, Harper. Bioquímica ilustrada, 29a edición marcados de manera diferencial se mezclan e hibridan a “chips” de microarreglo (laminillas de microscopio) que contienen fragmentos de DNA Murray RK, Bender DA, Botham KM, Kennelly VW, Weil P. Bioquímica ilustrada, 29a edición; 2013 específicos, Citación: o más comúnmente ahora, oligonucleótido sintético dePJ, 50Rodwell a 70 nucleótidos deHarper. largo. Estos oligonucleótidos específicos paraEn: el gen son http://mhmedical.com/ Recuperado: June 06, 2017 depositados y fijados de manera covalente en coordenadas predeterminadas conocidas X,Y sobre la laminilla. Los DNA marcados se hibridan, las McGraw-Hill Education. rights reserved laminillas seCopyright lavan, y © la 2017 hibridación para cada sondaAllde oligonucleótido específica para el gen se califica usando examen con láser diferencial y fotodetección sensible a resolución de micrómetro. Las intensidades de señal de hibridación se cuantifican, y la proporción de señales de DNA IP/DNA
