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Conceptos de especie, subespecie y raza. Biodiversidad de las poblaciones actuales de Homo sapiens GERMAN MANRIQUEZ. PROGRAMA DE GENETICA HUMANA. ICBM. 0. Introducción 1. Antecedentes históricos del problema 2. Especie, subespecie y razas: el problema de la clasificación del ser humano 3. Polimorfismo de las poblaciones humanas: sistema AB0 4. La variación polimórfica del DNA y su uso en Medicina 0. Referencias de interés: textos y sitios web Nature, (6822) 409: 813-958 (15 February 2001) http:/snp.cshl.org http://pga.gs.washington.edu/finished_genes.html 1. Antecedentes históricos del problema François Bernier's Nouvelle division de la terre par les différents espèces ou races qui l'habitent, 1684. Johann Blumenbach (1775) De generis humani varietate nativa, Göttingen. Razas: Immanuel Kant, 1754. Antropología práctica. Caucásica (blanca) Mongólica (amarilla) Malaya (café) Negra Americana (roja) Felix von Luschan, 1897, Escala de pigmentación de la piel en humanos rateros de tiendas timadores Julien, 1896. IV Congreso Internacional de Antropología Criminal “Estas observaciones muestran admirablement que la morfología de la prostituta es aún más anormal que la del criminal, sobre todo por las anomalías atávicas, puesto que el pie prensil constituye un atavimso”. C. Lombroso ladrones de bolsos mediante tirón asesinos alemanes ladrones nocturnos quiebras fraudulentas 2. Definición de los conceptos de especie, subespecie y raza en Biología clase orden familia genero especie subespecie? raza? población individuo DEFINICIONES DEL CONCEPTO DE ESPECIE DESDE DISTINTOS ENFOQUES EN BIOLOGIA Cracraft, 2000 DEFINICIONES DE ESPECIE Horai et al, 1992. mtDNA Kin & Takenaka 1996. Sry Huxley, 1863 Goodman et al, 1996. Beta-globinas Especie: comunidad más grande e incluyente de individuos que comparten un acervo genético común (Dobzhansky, 1950) RAZA Definición esencialista, Hooton (1926) ”División mayor de la humanidad caracterizada como grupo por compartir determinada combinación de atributos, derivados de un ancestro en común, y que conforman un trasfondo físico laxo, generalmente atenuado por las variaciones individuales” Definición taxonómica, Mayr (1969) ”Conjunto de poblaciones de una misma especie, fenotípicamente similares, que habitan una parte del rango de distribución d ela especie, y difieren taxonómicamente de otras poblaciones de la misma especie” Definición poblacional, Dobzhansky (1970) ”Poblaciones mendelianas compuestas de individuos que difieren genéticamente entre sí” Definición evolutiva, Templeton (1998) ”Una subespecie (o raza) es un linaje evolutivo particular dentro de una especie. La diferenciación genética entre subespecies (razas) se debe a barreras que impiden el intercambio de genes, que han persisitido por largos períodos de tiempo. Poseen continuidad histórica, además de la diferenciación genética actualmente observada” Definición genética Lewontin, et al (2002): Una raza geográfica es una población local fenotípicamente diferenciada dentro de una misma especie, capaz de intercambiar genes con otras razas de la misma especie. Debido a que prácticamente todas las poblaciones geográficas difieren unas de otras en la frecuencia de algunos de sus genes, el concepto de raza no operacionalmente de gran utilidad en Biología ¿Raza? 3. Biodiversidad de las poblaciones actuales de Homo sapiens Rol de las migraciones como factor evolutivo que aumenta la variación intra e interpoblacional de los grupos humanos durante la historia reciente y antigua Rol de los factores sociales y culturales en la distribución de las frecuencias alélicas en la población chilena 0.9 0.8 0.7 0.6 0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 0 alto medio-alto medio grupo 0 (sistema AB0) medio-bajo bajo alelo d (sistema Rh) Valenzuela, CY. 1984. Marco de referencia sociogenético para los estudios de Salud Pública en Chile, Rev. Chil. Pediatría 55: 123-127 Polimorfismo de las poblaciones humanas: color de la piel. “Polimorfismo: condición en la que un gen mutante es frecuente y puede ser transitorio o estable” Cavalli-Sforza Distribución de la pigmentación de la piel en humanos Variación intrapoblacional versus variación interpoblacional Distribución de la pigmentación del cabello en Australia… (castaño oscuro) ...y en el Reino Unido (colorines) Variaciones explicadas por el sexo y poligenes heredados de los padres: estatura Variaciones explicadas por adaptación fisiológica al hábitat: altitud y cantidad de eritrocitos de largo plazo años estacional meses 4000 mts. 0 mts. de corto plazo días horas segundos Variaciones explicadas por adaptación fisiológica al hábitat: relación superficie/ masa corporal Variación intrapoblacional versus variación interpoblacional Polimorfismo de las poblaciones humanas: sistema AB0 “Polimorfismo: condición en la que un gen mutante es frecuente y puede ser transitorio o estable” Cavalli-Sforza Karl Landsteiner SOTO-HEIM P (1987) Evolución de deformaciones intencionales, tocados y prácticas funerarias en la prehistoria de Arica, Chile. Chungará 19: 129-213 Manríquez & Llop, 2004 Variación polimórfica del DNA y su uso en Medicina Clasificación según función de los productos génicos (N= 923 genes) Jimenez-Sanchez, G, et al. 2001. Human Disease Genes, Nature 409: 853-55 Características de la enfermedad según la función de la proteína codificada enzimas chaperonas receptores factores de transcripción Polimorfismo de nucleótidos únicos (Single nucleotide polymorphism, SNPs) Estudios de asociación: prevalencia de marcador polimórfico en individuos sanos y afectados. Métodos directo e indirecto Variantes funcionales más comunes asociadas con una enfermedad en particular Regiones asociadas con susceptibilidad, según desequilibrio de ligamiento (incluye secuencias codificantes y no codificantes). Cada variante disfuncional se hereda junto con sus secuencias flanqueadoras A nivel poblacional, cada gen humano expresa un número limitado de combinaciones SNP Frecuencia promedio de polimorfismo de nucleótidos únicos en poblaciones humanas (37.427 SNPs, R2= 0.9936) 0.803 Frecuencia 0.735 0.683 afro-americana caucasoide asiatica Ejemplos de genes para enfermedades del ser humano detectados mediante estudios de asociación (*SNP) ALELO Factor V ENFERMEDAD REFERENCIA Trombosis venosa Voorberg, J et al, 1994. Lancet 343: 1535 Promotor para insulina Diabetes tipo I Bennett, ST et al. 1995. Nature Genet. 9: 284 CCR5* Receptor quimocina, resistencia SIDA Smith, MW et al . 1997. Science 277: 959 ApoE4* (apolipoproteína) Mal de Alzheimer, Glaucoma primario Strittmatter, WJ & AD Roses, 1996. Annu. Rev. Neurosci. 19: 53; Copin et al. 2002 Am. J. Hum. Genet. 70: 1575 TNFR* (Receptor) Necrosis tumoral Bridges, SL et al. 2002. Arthritis & Rheumatism 46: 2045 SQSTM1/p62* (Unión a ubiquitina) Mal de Paget (disfunción metabolismo osteoclastos) Laurin, N et al. 2002. Am. J. Hum. Genet. 70: 1582 Bridges, SL et al. 2002. Single-nucleotide polymorphisms in tumor necrosis factor receptor genes: definition of novel haplotypes and racial/ethnic differences Arthritis & Rheumatism 46: 2045 Afro-americanos con artritis reumatoidea (AR) (N= 108) Afro-americanos sanos (N= 62) Caucasoides sanos (N= 59) TNFRSF1B SNP 196 T/G, cambio Met - Arg, susceptibilidad a AR familiar en Caucasoides (gen codifica para receptores tipo II) Diferencias significativas entre caucasoides sanos y afro-americanos sanos para las 3 regiones flanqueadoras del gen: -609 G/T (.13 vs .42) -580 A/G (.49 vs 0) -383 A/C (.14 vs 0) Laurin, N et al. 2002. Recurrent Mutation of the Gene Encoding sequestome 1 (SQSTM1/p62) in Paget Disease of Bone Am. J. Hum. Genet. 70: 1582 PDB aumento focal y desorganizado del metabolismo de recambio de mterial óseo (locus PDB3 en cromosoma 5q35) 24 familias franco-canadienses y 291 individuos control Se estudió región de 300 kb, con gen codificante para proteína de unión a ubiquitina (sequestoma 1) Hallazgo de mutación recurrente en el dominio asociado a ubiquitina (UBA) en posiciones 394-440. Esta mutación está ausente en 291 individuos controles Dos eventos mutacionales independientes, que ocurren en la misma posición del gen, causan una alta proporción de pacientes con PDB en población franco-canadiense