Download Semana 2. Ejercicios modelos resueltos

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Transcript
BIOINFORMÁTICA
BAC – Spinoza 2014
BIOTECNOLOGÍA
BASES DE DATOS
EJERCITACIÓN
NCBI
BASES DE DATOS
EJERCICIO 1
PubMed
La Fenilcetonuria es una enfermedad metabólica causada por la
deficiencia de la enzima Fenilalanina hidroxilasa (PAH). En 1985, Kwok et
al. lograron generar un cADN de este gen (el cADN es un ADN que se
sintetiza a partir del ARNm del gen, mediante técnicas moleculares) y
publicaron su hallazgo en la revista Biochemistry.
Actividad: Encuentre el Abstract del artículo a partir de la referencia:
Biochemistry. 1985 Jan 29;24(3):556-61.
BASES DE DATOS
BASES DE DATOS
BASES DE DATOS

Desde el Abstract en PubMed haga clic en el vínculo
Links, que se encuentra arriba a la derecha, justo al
lado de Related articles, en la misma línea que la
referencia del artículo. De ahí seleccione
Nucleotide.
BASES DE DATOS
BASES DE DATOS
Responda:

¿A qué organismo pertenece?

¿Quiénes son los autores de los trabajos?

¿Cuál es el número de referencia en Pubmed?
BASES DE DATOS
EJERCICIO 2
GenBank
Actividad: Desde GenBank acceda
a la secuencia X01714.
BASES DE DATOS
BASES DE DATOS
BASES DE DATOS
Responda:
 ¿A qué tipo de molécula corresponde?


¿Cuántos nucleótidos contiene?
¿En qué fecha se modificó el registro por última
vez?

¿De qué organismo procede?
BASES DE DATOS
EJERCICIO 3
BLAST
Actividad: Ingresar la siguiente secuencia en BLAST.
ATGGCGTCGAAGGAGGAGGTGGCCGTGGAGACGGTGGAGGGCGGAG
CGGCGGCGGCGAAGGCGCCGTACTGGACCCGCCGCCGGCGCCGCTG
CTGGACACGAGCGAGCTGGGTAAGTGGTCGCTGTACCGTGCCCTCAT
CGCGGAGTTCATGGCGACGCTCATCTTCCTCTACGTGAGCATCGCCAC
CGTGATCGGGTACAAGAACCAGAGGGCCACCGTCGACGCGTGCACCG
GCGTCGGCTACCTCGGCGTGGCGTGGTCGTTCGGTGCCACCATAT
TCGTCCTCGTCTACTGCACCGGCGGCGTCTCCGGCGGGCACATCAACC
CGGCGGTGACGCTGGGCCTCTTCTTCGGGCGGAAGCTGTCGCTCGTC
CGCACCGTGCTGTACGTCGTGGCGCAGTGCCTCGGCGCCATCGCC
GGCGCCGGCATCGTCGGCACGTTCATCCTCGTCTACACCGTCTTCTCC
GCCACCGACCCCAAGCGCACCGCCCGCGACTCCTTCATCCCCGTACTC
GTGCCGCTGCCGATCGGGTTCGCGGTGTTCGTCGTGCACCTGGC
GACGATTCCGATCACCGGCACGGGCATCAACCCGGCGAGGAGCCTCG
GCGCCGCCGTGCTGTACAACCAGCACGCAGCTTGGAAAGACCACTGGA
TCTTCTGGGTGGGGCCGGTGATCGGGGCGTTCTTGGCGGCGGCGT
ACCACAAGCTGGTGCTGCGCGGCGAGGCCGCCAAGGCGCTCAGCTCG
TTCAGGAGCACCAGCGTGACGGCGTGA
BASES DE DATOS
BASES DE DATOS
BASES DE DATOS
BASES DE DATOS
Responda:

¿Qué organismos comparten dicha secuencia?