Download The Substrate and Inhibitor Properties of Cerebrovascular Disease

Latin American Journal of Pharmacy
(formerly Acta Farmacéutica Bonaerense)
Lat. Am. J. Pharm. 35 (3): 634-6 (2016)
Short communication
Received: November 13, 2015
Revised version: November 16, 2015
Accepted: November 20, 2015
The Substrate and Inhibitor Properties of Cerebrovascular
Disease Treatment Drug Picroside-II
Guo-Jun HE*, Shi-Fu SUN, Qi-Long ZUO, Xiao-Qian GONG,
Yang GAO, Xiao-Peng HUANG & Ya-Jun JI
Department of Neurology, No. 1 Hospital of Yancheng,
Yancheng, Jiangsu 224001, China
SUMMARY. The substrate and inhibitor properties of picroside-II for cytochrome P450 (CYP) 3A4 were
predicted using molecular docking in this study. The chemical formula of picroside-II was obtained from
the research paper, and two-dimensional structure of picroside-II was drawn using ChemDraw software.
The standard bond lengths and angles were used during the drawing process of picroside-II. The crystal
structure of CYP3A4 with the binding of ligand ketoconazole was downloaded from protein data bank.
The structure of ketoconazole was firstly extracted from the binding cavity of CYP3A4, and then picroside-II was docked into the binding cavity. Leu482 exerted high interaction with picroside-II. The proposed metabolic site of picroside-II exhibited 2.1 Å distance with the catalytic center of CYP3A4. Besides
the good substrate property for picroside-II, picroside-II was also demonstrated to be a good inhibitor of
CYP3A4, indicated by the similar distance between picroside-II and ketoconazole towards the catalytic
center of CYP3A4. Our recent study demonstrates the good binding between picroside-II and CYP3A4 as
both substrate and inhibitor, indicating the high possibility for the drug-drug interaction between picroside-II and the substrates or inhibitors of CYP3A4. In conclusion, our recent study furtherly broaden the
database of the substrates and inhibitors of CYP3A4.
RESUMEN. Las propiedades como sustrato e inhibidor de picrósido-II para el citocromo P450 (CYP) 3A4 fueron
predichas en este estudio utilizando acoplamiento molecular. La fórmula química de picrósido-II se obtuvo a partir del trabajo de investigación y la estructura bidimensional del picrósido-II fue dibujado usando el software
ChemDraw. Las longitudes de enlace y ángulos estándar fueron utilizados durante el proceso de dibujo de picrósido-II. La estructura cristalina de CYP3A4 con la unión del ligando ketoconazol fue descargada del banco de
datos de proteínas. La estructura de ketoconazol se extrajo en primer lugar de la cavidad de unión de CYP3A4 y
luego picrósido-II fue atracado en la cavidad de unión. Leu482 ejerce alta interacción con picrósido-II. El sitio
metabólico propuesto de picrósido-II muestra una distancia de 2.1 Å con el centro catalítico de la enzima
CYP3A4. Además de la buena propiedad de sustrato de picrósido-II, también demostró ser un buen inhibidor del
CYP3A4, indicado por la distancia similar entre picrósido -II y ketoconazol hacia el centro catalítico de
CYP3A4. Nuestro estudio demuestra la buena unión entre picrósido-II y CYP3A4 tanto como sustrato e inhibidor, lo que indica la alta posibilidad de la interacción fármaco-fármaco entre picrósido-II y los sustratos o inhibidores de CYP3A4. En conclusión nuestro estudio amplía la base de datos de los sustratos e inhibidores de
CYP3A4.
KEY WORDS: cytochrome P450 (CYP) 3A4, docking, drug-drug interaction, ketoconazole, picroside-II
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ISSN 0326 2383 (printed ed.)
ISSN 2362-3853 (on line ed.)