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Agosto 22, 2013
Nombre del paciente: JOHAN CASTAÑO SALAZAR
Fecha de nacimiento: Septiembre 29, 1996
Código de la muestra: 2013.0685
Código GMC EM 594
Examen: ANALISIS ELANE, LPIN2, MEFV, MVK, NLRP3, PSTPIP1, TNFRSF1A
Diagnóstico clínico: Eritematosis persistente, síndrome autoinflamatorio, artralgia y
miocarditis.
Antecedentes Genéticos: El síndrome febril periódico hereditario incluye la fiebre familiar
mediterránea causada por variantes en el gen MEFV, Síndrome Hiper-IgD causado por
variantes en el gen MVK, la fiebre hiberniana familiar (TRAPS) causada por variantes en el gen
TNFRSF1A, la neutropenia cíclica y neutropenia congénita severa causada por variantes en el
gen ELANE (ELA2), síndrome Majeed causado por variantes en el gen LPIN2, el Síndrome
Muckle-Wells (MWS), síndrome autoinflamatorio familiar inducido por frío (FCAS) y la
enfermedad inflamatoria multisistémica de inicio neonatal (NOMID) causados por variantes en
el gen NLRP3 (CIAS1) y la artritis piogénica estéril, pioderma gangrenoso y síndrome acné
(PAPA) causados por variantes en el gen PSTPIP1 (CIAS1).
Métodos: Este estudio fue realizado por secuenciación de nueva generación utilizando una
plataforma Illumina de todas las regiones codificantes (78 exones) y sitios de splice de los
siguientes genes conocidos como asociados con síndrome periódico febril:
• MEFV, exons 1-10, ref seq NM_00243.1
• MVK, exons 2-11, ref seq NM_000431.2
• TNFRSF1A, exons 1-10, ref seq NM_001065.2
• ELANE (ELA2), exons 1-5, ref seq NM_001972.1
• LPIN2, exons 2-20, ref seq NM_014646.2
• NLRP3 (CIAS1), exons 1-9, ref seq NM_004895.4
• PSTPIP1, exons 1-15, ref seq NM_003978
La sensibilidad analítica de este estudio es de cerca del 100% para detectar variantes de
substitución (variantes de cambio de sentido o sin sentido) en la secuencia analizada. Sin
embargo comparada con secuenciación dideoxy, este estudio tiene una sensibilidad reducida
para detectar pequeñas inserciones y deleciones de más de 5pb. Al igual que las pruebas de
secuenciación tradicional, este estudio tiene muy poca sensibilidad para detectar grandes
deleciones, inserciones y otros cambios de número de copias.
Genética Molecular de Colombia Ltda.
ESTUDIOS DE ADN-CARIOTIPOS-PRUEBAS DE PATERNIDAD-CONSULTA ESPECIALIZADA
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Resultados:
Se identificó una variante heterocigota patogénica NLRP3:c.1711G>A en el exón 3 del gen
NLRP3.
Esta sustitución es una variante de cambio de sentido que se ha predicho lleva a la sustitución
de una glicina por una arginina (NLRP3:p.Gly571Arg). Ésta variante es conocida y se ha descrito
previamente en otros pacientes asociada al Síndrome Muckle-Wells (Dode et al. Am J Hum
Genet 7: 1498, 2002; Hawkins et al. Arthritis and Rheumatism 50: 2708, 2004). Sin embargo,
en Dode et al., la variante se ha presentado en madres sanas de individuos afectados
sugiriendo que esta variante presenta una penetrancia incompleta. Ésta variante no se
encuentra listada en la base de datos de variantes del exoma NHLBI (~13000 alelos).
Predicciones In silico: SIFT: deletérea, Mutation Taster: causante de enfermedad. La variante se
encuentra clasificada como una variante patogénica de acuerdo a los criterios de
MutaDATABASE.
Recomendaciones:
1. El hallazgo de una variante heterocigota patogénica en el gen NLRP3 es compatible con un
diagnóstico clínico de Síndrome de Muckle-Wells.
2. El análisis de los padres podría proveer el origen de novo de la variante.
Comentarios: Los resultados fueron sub-contratados contando con un consentimiento informado y
aprobación aceptados y firmados por el paciente o su representante. Las muestras se enviaron
correctamente identificadas y bajo un sistema de cadena de custodia. Los resultados fueron firmados
por los doctores Patrick Willems, MD, PhD y Kristel De Boulle.
Cordial Saludo,
CARLOS M. RESTREPO, MD, PhD.
Genética Humana.
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