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Curriculum vitae
Nombre: JOSEP QUER SIVILA
Fecha: 17/11/2015
1
DATOS PERSONALES
Apellidos: QUER SIVILA
Nombre: JOSEP
DNI: 30330014Z
Fecha de nacimiento : 09/05/1963
Sexo: V
DIRECCIÓN PARTICULAR: C/ Caballero 80. 5,1
CIUDAD: BARCELONA
CODIGO POSTAL: 08029
TELÉFONO/S: 934894028
669397214
FORMACIÓN ACADÉMICA
LICENCIATURA/INGENIERIA
Biología
CENTRO
FECHA
Universidad de Barcelona (UB)
DOCTORADO
Biología
1981-86
CENTRO
FECHA
Universidad Autónoma Barcelona. UAB. Premio
1994
Extraordinario de tesis.
SITUACIÓN PROFESIONAL ACTUAL
Organismo: Universidad Autónoma Barcelona. UD Vall d’Hebron
Facultad, Escuela o Instituto: Hospital Universitari Vall d’Hebron. Institut de Recerca (IR-HUVH)
Depto./Secc./Unidad estr.: Departamento Medicina Interna. Hepatología. Laboratorio Malalties
Hepàtiques
Dirección postal: Pg. Vall d’Hebron 119-129. 08035. BARCELONA
Teléfono (indicar prefijo, número y extensión): 934894028 / 4034 / 669397214
Fax: 934894032
Correo electrónico: [email protected]
Especialización (Códigos UNESCO): 2420
Categoria profesional: Profesor Investigador
Situación administrativa
Plantilla
Contratado
Otras situaciones especificar:
Dedicación
Fecha de inicio: 2004
Interino
Becario
A tiempo completo
A tiempo parcial
LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN
Breve descripción, por medio de palabras claves, de la especialización y líneas de investigación
actuales.
Especialización: Biología molecular, Quasispecies, Cultivo de virus en línea celular estable. Evolución
de virus. Secuenciación masiva.
Líneas de investigación: Hepatitis virales . Virus de la Hepatitis C.
2
ACTIVIDADES ANTERIORES DE CARÁCTER CIENTÍFICO PROFESIONAL
Puesto
Profesor Asociado de
Bioquímica y Fisiología Animal
Becario predoctoral,
Med.Interna
Estancia postdoctoral en el
extranjero. Becario postdoctoral
Institución
Fechas
Universidad de Barcelona . UB
1988-89
Hospital Universitario Vall d’Hebron
1989-94
MEC SUBPROGRAMA GENERAL en el EXTRANJERO
Ref. EX94 39330014 Resolución 1.8.1994.
1995-96
Becario postdoctoral
Fundación VHIR-HUVH
1997-99
Contrato postdoctoral
Fundación VHIR-HUVH
2000-2002
Contrato postdoctoral
Universidad Autónoma Barcelona. UAB
2003-2004
Profesor Asociado
Contrato indefinido.
Investigador senior
Acreditado como Investigador
postdoctoral contratado
Ciberehd.
Facultad Medicina. Universidad Autónoma de
Barcelona. UAB. Unidad Docente HUVH
Ciber enfermedades Hepáticas y digestivas
(CiberEHD).
CiberEHD. Instituto de Salud Carlos III
2004-actualidad
2007-actualidad
2010
Idiomas (R = regular, B = bien, C = correctamente)
Idioma
Habla
Lee
Escribe
Inglés
B
B
B
Francés
R
R
R
Castellano
C
C
C
Catalán
C
C
C
3
Participación en Proyectos de I+D financiados en Convocatorias públicas.
(nacionales y/o internacionales)
Título del proyecto:
Entidad financiadora:
Entidades participantes:
Duración, desde:
hasta:
Investigador responsable:
Número de investigadores participantes:
Cuantía de la subvención:
TITULO DEL PROYECTO: Estudio de la estructura en quasispecies del Virus de la Hepatitis C
en diferentes situaciones clínicas. Efectos sobre la persistencia de la infección.
ENTIDAD FINANCIADORA: CICYT. SAF 92-0549.
DURACIÓN 1992-94.
CUANTÍA: 6.600.000 Pts
IP. J.I.Esteban.
TITULO DEL PROYECTO: Detección del RNA del VHC en muestras de tejido hepático por PCR.
Estudi en distintos grupos clínicos de pacientes y comparación de las secuencias virales
intrahepáticas con las séricas.
ENTIDAD FINANCIADORA: FISS 93/0656.
DURACIÓN: 1993-94.
CUANTÍA: 6.900.000 Pts
IP J.Genescà.
TITULO DEL PROYECTO: Análisis de la correlación de la población viral y la respuesta al
tratamiento antiviral con Interferón alfa en pacientes con hepatitis C crónica. Determinación
de parámetros predictivos de respuesta al tratamiento.
ENTIDAD FINANCIADORA: FISS. 94/1682.
DURACIÓN: 1994-95.
IP J.Guàrdia.
TITULO DEL PROYECTO: Establecimiento de un sistema de cultivo de alto rendimiento para el
virus de la hepatitis C (HCV).
ENTIDAD FINANCIADORA: FISS 97/2039
DURACION DESDE: 1997
HASTA: 1999
CUANTÍA: : 7.800.000 Pts.
IP R.Esteban.
TITULO DEL PROYECTO: Cultivo del virus de la hepatitis C (HCV) en células BHK-21 y Daudi.
ENTIDAD FINANCIADORA: FISS 00/0902
DURACION DESDE: 2000
HASTA: 2002
CUANTÍA: 15.800.000 Pts.
IP J.Guàrdia
4
TITULO DEL PROYECTO: Evaluación prospectiva de la respuesta linfocitaria T CD4+ específica
para el virus de la hepatitis C (VHC) en receptores de trasplante hepático VHC positivo.
Reconstitución de la respuesta inmune específica.
ENTIDAD FINANCIADORA: Marató TV3 002010
DURACION DESDE: 2001
HASTA: 2003
CUANTÍA: 9.715.000Pts.
IP J.I. Esteban
TITULO DEL PROYECTO: Dynamically individualized treatment of hepatitis C infection and
correlates of viral/host dynamics (DITTO-HCV)
ENTIDAD FINANCIADORA: European Commission (V Programa Marco)
DURACION DESDE: 2001
HASTA: 2003
Responsable: J.I.Esteban
TITULO DEL PROYECTO: Efecto de la variabilidad genética en la región NS3 del virus de la
Hepatitis C (VHC) sobre maduración y presentación de proteínas recombinantes aislado
específicas de células dendríticas autólogas.
ENTIDAD FINANCIADORA: MCyT SAF2003-08724
DURACION DESDE:2003
HASTA: 2005
CUANTÍA:140.000€
IP J.Guàrdia
TITULO DEL PROYECTO: Investigación de la tolerancia periférica a proteínas no estructurales
como causa de la persistencia del virus de la hepatitis C (VHC)
ENTIDAD FINANCIADORA: FIS PI030274
DURACION DESDE:2004
HASTA: 2006
CUANTÍA: 140.000€
IP Juan Ignacio Esteban Mur
Carles Margarit Creixell
Josep Quer Sivila
Joan Cos Trullas
Silvia Sauleda Oliveras
Pedro Murillo Aranda
Monica Tejeda Lorenzo
TITULO DEL PROYECTO: Breaking down peripheral tolerance to nonstructural 3 protein of
the hepatitis c virus for development of immunotherapy for hcv infection and prevention of
hepatocellular carcinoma
ENTIDAD FINANCIADORA: Marató TV3 052310
DURACION DESDE: 2005
HASTA: 2008
CUANTÍA: 165.000€
IP Juan Ignacio Esteban Mur
Jaume Guardia Masso
Carles Margarit Creixell
5
Josep Quer Sivila
Joan Cos Trullas
Silvia Sauleda Oliveras
Laura Ocaña Safont
Lluís Castells Fuste
TITULO DEL PROYECTO: Selección y expansión de linfocitos T CD4+ NS3-específicos de
pacientes infectados por Virus de la hepatitis C (VHC)
ENTIDAD FINANCIADORA: SAF2006-03681
DURACION DESDE: 2006
HASTA: 2008
CUANTÍA:90.750€
IP Jaume Guardia Masso
Juan Ignacio Esteban Mur
Josep Quer Sivila
Lluís Castells Fuste
Itxarone Bilbao Aguirre
Joan Cos Trullas
Laura Ocaña Safont
TITULO DEL PROYECTO: Selección y expansión de linfocitos T CD4+ NS3-específicos de
pacientes coinfectados por VIH y VHC. Caracterización del estado de anergia en la infección
crónica y restauración funcional para su empleo en inmunoterapia adaptativa para la
prevención y/o tratamiento de la recurrencia postrasplante
ENTIDAD FINANCIADORA: FIPSE 2006 36623/06
DURACIÓN: 2006-2009
IP Juan Ignacio Esteban Mur
Manuel Crespo Casal
Silvia Sauleda Oliveras
Josep Quer Sivila
Maria Piron
Marta Bes Majo
Laura Ocaña Safont
Maria Dolores Cubero Leon
Lluís Castells Fuste
Itxarone Bilbao Aguirre
Isabel Ruíz Camps
Jaume Guardia Masso
TITULO DEL PROYECTO: Selección y expansión de linfocitos CD4+ NS3-específicos de
pacientes VHC. Caracterización del estado de anergia en cronicidad y restauración funcional
para empleo en inmunoterapia adaptativa para prevención y tratamiento de la recurrencia
postrasplante.
6
ENTIDAD FINANCIADORA: FISS PI061244
DURACION DESDE: 18Oct. 2006
HASTA: 2008
CUANTÍA: 113.740€
IP Josep Quer Sivila
Jaume Guardia Masso
Juan Ignacio Esteban Mur
Lluís Castells Fuste
Itxarone Bilbao Aguirre
Helena Allende Monclus
Maria Dolores Cubero Leon
Laura Ocaña Safont
TITULO DEL PROYECTO: Estudio dinamico de quasispecies de vhc por pirosecuenciación en
fase aguda y cronica durante tratamiento antiviral
ENTIDAD FINANCIADORA: MICINN. SAF2009-10403.
DURACION DESDE: 1/1/2010-31/12/2012.
CUANTÍA: 121000€.
IP Josep Quer Sivila
Jaume Guardia Masso
Helena Allende Monclus
Itxarone Bilbao Aguirre
Lluís Castells Fuste
Lluis Viladomiu Cata
Maria Dolores Cubero Leon
Melanie Schaper Segalen
TITULO DEL PROYECTO: Aplicación de la tecnología de secuenciación masiva para optimizar
el coste-efectividad del tratamiento de la hepatitis C (VHC) en la era de los inhibidores de
acción directa (DAAs).
ENTIDAD FINANCIADORA: FIS. PI13/00456.
DURACIÓN 2014-2016.
CUANTÍA: 192.692,50€
IP. Juan ignacio Esteban.
Lluís Castells Fuste
Josep Quer Sivila
Cristina Dopazo Taboada
Damir Garcia Cehic
Lluis Viladomiu Cata
7
Publicaciones o Documentos Científico-Técnicos
( CLAVE: L = libro completo, CL = capítulo de libro, A = artículo, R = “review”, E = editor,
S = Documento Científico-Técnico restringido. )
Autores (p.o. de firma):
Título:
Ref.
revista :
Clave:
Volumen:
Editorial (si libro):
Lugar de publicación:
Libro
Páginas, inicial:
final:
Fecha:
1. Perales C, Quer J, Gregori J, Esteban JI, Domingo E. Resistance of Hepatitis C virus to inhibitors:
Complexity and clinical implications. Viruses. 2015 Nov 6;7(11):5746-5766. Review. PMID:
26561827 Open access.
2. Perez-del-Pulgar S, Gregori J, Rodriguez-Frias F, Gonzalez P, Garcia-Cehic D, Ramírez S, Casillas R,
Domingo E, Esteban JI, Forns X, Quer J. Quasispecies dynamics in hepatitis C liver transplant
recipients receiving grafts from hepatitis C infected donors. J.Gen.Virol. 2015. Accepted under
minor reviews. JGV-D-15-00472. C2D4 IF=3.183
3. Quer J, Gregori J, Rodríguez-Frias F, Buti M, Madejon A, Perez del Pulgar S, Garcia-Cehic D,
Casillas R, Blasi M, Homs M, Tabernero D, Alvarez-Tejado M, Muñoz JM, Cubero M, Caballero A,
delCampo JA, Domingo E, Belmonte I, Nieto L, Lens S., Muñoz-de-Rueda P., Sanz-Cameno P,
Sauleda S., Bes M., Gómez J, Briones C., Perales C., Sheldon J., Castells, Ll., Viladomiu Ll.,
Salmeron J., Ruiz-Extremera A., Quiles-Pérez R., Moreno R., López-Rodríguez R., Allende H.,
Rómero-Gómez M., Guardia J, Esteban R., Garcia-Samaniego J, Forns X, Esteban JI. "Highresolution Hepatitis C virus (HCV) subtyping, using massive sequencing and phylogeny, optimal
alternative to current methods". J.Clin. Microbiol. 2015. Jan;53(1):219-26. doi:
10.1128/JCM.02093-14. Epub 2014 Nov 5. IF=4.232.
4. Sheldon J, Beach NM, Moreno E, Gallego I, Piñeiro D, Martínez-Salas E, Gregori J, Quer J, Esteban
JI, Rice CM, Domingo E, Perales C. Increased replicative fitness can lead to decreased drug
sensitivity of hepatitis C virus. J Virol. 2014 Oct;88(20):12098-111. PMID: 25122776. C1D2.
IF=4.648.
5. Quiles-Pérez R, Muñoz-de-Rueda P, Maldonado AM, Martín-Álvarez A, Quer J, Salmerón J. Effects
of ribavirin monotherapy on the viral population in patients with chronic hepatitis C genotype 1:
Direct sequencing and pyrosequencing of the HCV regions. J Med Virol. 2014 Nov;86(11):188697. doi: 10.1002/jmv.24035 PMID: 25091333 IF=2.217
6. Homs M, Caballero A, Gregori J, Tabernero D, Quer J, Nieto L, Esteban R, Buti M, Rodriguez-Frias
F. Clinical application of stimating hepatitis B irus quasispecies complexity by massive
sequencing: Correlation between natural evolution and on-treatment evolution. PloS One 2014.
8
Nov 13;9(11):e112306. doi: 10.1371/journal.pone.0112306. eCollection 2014. PMID: 25393280.
IF= 3.534.
7. Riveiro-Barciela M, Buti M, Homs M, Campos-Varela I, Cantarell C, Crespo M, Castells Ll,
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infection are risk factors associated with Hepatitis E virus infection. PLoS One. 2014 Jul
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3.534.
8. Riveiro-Barciela M, Mínguez B, Gironés R, Rodriguez-Frías F, Quer J, Buti M. Phylogenetic
Demonstration of Hepatitis E Infection Transmitted by Pork Meat Ingestion. J Clin Gastroenterol.
2015 Feb;49(2):165-8. doi: 10.109 PMID: 24637729. IF=3.186
9. Gregori J, Salicrú M, Domingo E, Sanchez A, Esteban JI, Rodríguez-Frías F, Quer J. Inference with
viral quasispecies diversity indices: clonal and NGS approaches. Bioinformatics. 2014; 30(8):11041111. doi:10.1093/bioinformatics/btt768. PMID:24389655. IF=5.323 PMID:24389655. IF=5.323
10. Gregori J, Esteban JI, Cubero M, Garcia-Cehic D, Perales D, Casillas R, Alvarez-Tejado M,
Rodríguez-Frías F, Guardia J, Domingo E and Quer J. Ultra-deep pyrosequencing (UDPS) data
treatment to study amplicon HCV minor variants. PLoS One. 2013. Dec 31; 8(12): e83361. doi:
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11. Cubero M, Gregori J, Esteban JI, García-Cehic D, Bes M, Perales C, Domingo E, Rodríguez-Frías F,
Sauleda S, Sanchez A, Ortega I, Esteban R, Guardia J, Quer J. Variability in the C-terminal NS3helicase domain of HCV may be involved in HCV spontaneous recovery or chronicity. Liver Int.
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12. Ortega-Prieto AM, Sheldon J, Grande-Pérez A, Tejero H, Gregori J, Quer J, Esteban
JI, Domingo E,Perales C. Extinction of hepatitis C virus by ribavirin in hepatoma cells involves
lethal mutagenesis. PLoS One. 2013 Aug 16;8(8):e71039. doi: 10.1371/ journal.pone.0071039.
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13. Ramírez Cl, Josep Gregori, Maria Buti, David Tabernero, Sílvia Camós, Rosario Casillas, Josep
Quer, Rafael Esteban, Maria Homs, Francisco Rodriguez-Frías. A comparative study of ultra-deep
pyrosequencing and cloning to quantitatively analyze the viral quasispecies using hepatitis B
Virus infection as a model. Antiviral Research. 2013;98(2):273-283. IF=3.434
14. Olivar R, Ana Luque, Mar Naranjo-Gómez, Josep Quer, Pablo García de Frutos, Francesc E.
Borràs, Santiago Rodriguez de Córdoba, Anna M. Blom, Josep M. Aran. The minor isoform α7β0of
the soluble complement inhibitor C4BP induces a semi-mature, anti-inflammatory state in
dendritic cells. J.Immunol. 2013;190: accepted. IF:5.788 C1D2.
15. Perales C, Beach NM, Gallego I, Soria ME, Quer J, Esteban JI, Rice C, Domingo E, Sheldon J.
Response of hepatitis C virus to long-term passage in the presence of alpha interferon: multiple
mutations and a common phenotype. J Virol. 2013 Jul;87(13):7593-607. doi: 10.1128/JVI.0282412. Epub 2013 May 1.PMID: 23637397 IF: 5,076
16. Carnero E, Díez J, Fortes P, Gastaminza P, Majano P, Martínez MA, Pérez-del-Pulgar S, Quer J,
López-Labrador FX; Grupo de Estudio de Hepatitis Víricas de la Sociedad Española de Virología.
[Meeting Report: 20 years after the First International Symposium on hepatitis C virus and
9
related
viruses].
Gastroenterol
Hepatol.
2013
10.1016/j.gastrohep.2013.06.001. Epub 2013 Sep 5. Spanish.
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doi:
17. Homs M, Maria Buti, David Tabernero, Josep Quer, Alex Sanchez, Noelia Corral, Rafael Esteban,
Francisco Rodriguez-Frias. Quasispecies dynamics in main core epitopes of hepatitis B virus by
ultra-deep-pyrosequencing. WJG World J Gastroenterol 2012 November 14; 18(42): 0000-0000
ISSN 1007-9327 (print) ISSN 2219-2840 (online) © 2012 Baishideng. All rights reserved.
doi:10.3748/wjg.v18.i42.0000
18. del Pino N, Oubiña J, Esteban JI, Buti M, Rodríguez-Frías F, Jardi R, Otero T, Cubero M, Gregori J,
Guàrdia J, Esteban R and Quer J. Molecular epidemiology study and origin of HCV in random
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19. Rodriguez-Frias F., Tabernero D., Quer J., Esteban JI., Ortega I., Cubero M., Jardi R., Sánchez A.,
Ferrer C., Mosquera JL., Schaper M., Homs M., Garcia-Cehic D., Domingo E., Guardia J., Buti M.,
Esteban R. Ultra-deep pyrosequencing (UDPS) detects highly invariant positions in the hepatitis
B virus (HBV) genome and the linkage of resistance mutations in the same genome. PLoS One.
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20. Bes M, Vargas V, Piron M, Casamitjana N, Esteban JI, Vilanova N, Pinacho A, Quer J, Puig L,
Guardia J, Sauleda S. T cell responses and viral variability in blood donation candidates with
occult hepatitis B infection. J Hepatol. 2012, 56(4):765-774 PMID:22173156. IF: 9.334. C1D1
21. Bes M., Sauleda S., Casamitjana N, Piron M, Campos.Varela I., Quer J., Cubero M., Puig Ll.,
Guardia J., Esteban JI. Reversal of non-structural protein 3-specific CD4+ T cell dysfunction in
patients with persistent Hepatitis C virus infection. J.Viral Hep. 2012, 19(4):283-294
PMID:22404727. IF:3.502 C2D3.
22. Bes M, Sauleda S, Campos-Varela I, Rodriguez-Frias F, Casamitjana N, Homs M, Piron M, Quer J,
Tabernero D, Guardia J, Puig L, Esteban JI. IL28B genetic variation and hepatitis C virus-specific
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23. Homs M, Jardi R, Buti M, Schaper M, Tabernero D, Fernandez-Fernandez P, Quer J, Esteban R,
Rodriguez-Frias F. Hepatitis B virus core region variability: Effect of antiviral treatments on
main epitopic regions. Antiviral Therapy, 2011; 16:37-49. IF 3.774 C1D2
24. Van den Eynde E, Quer J, Cubero M, Curran A, Homs M, Garcia-Cehic D, Falco V, Ribera E,
Esteban JI, Pahissa A, Crespo M. Abacavir co-administration does not interfere with the
suppressive activity of Ribavirin in an HCV-replicon system. Antiviral Therapy, 2011;16(6):887893. IF 3.774 C1D2
25. Homs M, Buti M, Quer J, Jardí R, Schaper M, Tabernero D, Ortega I, Sanchez A, Esteban R,
Rodriguez-Frias F. Ultra-deep pyrosequencing analysis of the hepatitis B virus preCore region
and main catalytic motif of the viral polymerase in the same viral genome. Nucleic Acids
Research 2011; Oct;39(19):8457-8471 . IF 7.479 C1D1
26. Quer J, Buti M, Cubero M, Guardia J, Esteban R, Esteban JI. New strategies for the treatment of
hepatitis C virus infection and implications of resistance to new direct-acting antiviral agents.
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10
27. Schaper M, Rodriguez-Frias F, Jardi R, Tabernero D, Homs M, Ruiz G, Quer J, Esteban R, Buti M.
Quantitative longitudinal evaluations of hepatitis delta virus RNA and hepatitis B virus DNA
shows a dynamic, complex replicative profile in chronic hepatitis B and D. Journal of
Hepatology 2010;52(5):658-664. IF: 9.334. C1D1
28. Fernández-Fernandez A., Rosales C., Lopez-Nieva P., Graña O., Ballestar E., Ropero S., Espada
J., Almeida S, Lujambio A., Fraga M.F., Pino I., Javierre B., Acquadro F., Steenbergen R., Meijer
C.J., Pineau P., Dejean A., Quer J., Buti M., Esteban J.I., Allende H., Rodriguez-Frias F., Lloveras
B., Castellsague X., Minarovits J., Capello D., Gaidano G., Cruz Cigudosa J., Gomez-Lopez G.,
Pisano D.G., Valencia A., Piris M.A., Bosch F.X., Cahir-McFarland E., Kieff E. & Esteller M. The
DNA Methylomes of Double-Stranded DNA Viruses Associated with Human Cancer. GENOME
RESEARCH 2009; 19(3):438-451. IF: 13.588. C1D1.
29. Bes M, Esteban JI, Casamitjana N, Piron M, Quer J, Cubero M, Puig Ll, Guàrdia J, Sauleda S.
HCV-specific T cell responses among RIBA-3 indeterminate blood donors: a confirmatory
evidence of HCV exposure. Transfusion, 2009;49(7):1296-305. IF: 3.300. C2D3
30. Cubero M., Esteban J.I., Otero T., Sauleda S., Bes M., Esteban R., Guardia J., Quer J. Naturally
occurring NS3 protease-inhibitor resistant-mutant A156T in the liver of an untreated chronic
hepatitis C patient. Virology 2008; 370 (2):237-245. IF:3.305 C2D4
31. Esteban J.I., Sauleda S., Quer J. The changing epidemiology of hepatitis C virus infection in
Europe. Journal of Hepatology; 2008; 48(1):148-162. IF: 9.334. C1D1
32. Quer J., Esteban J.I., Sauleda S. Prevalence of hepatitis C in Romania: Different from European
rates? J.Hepatol. 2008; 49:663 IF: 9.334. C1D1
33. Quer J., Esteban J.I., Sánchez J.M., Otero T., Rius C., Coll M., Cubero M., Moreno G., González
A., Vaque J., Esteban R., Campins M., Pañella H., Guardia J., Martell M. Nosocomial
transmission of HCV during contrast-enhanced computed tomography scanning. European
Journal of Gastroenterology & Hepatology 2008; 20(1):73-78. IF:1.598. C2D6
34. Diaz O., Cubero M., Trabaud M.A., Quer J., Icard V., Esteban J.I., Lotteau V., André P.
Transmission of low density hepatitis C viral particles during sexually transmitted acute
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35. Pañella H., Rius C., Caylà J.A., Molinero E., Villalbí J.R., Bory F., Bruguera J., Castells X., Garcés
J.M., Iniesta C., Nobel H.K., Pi-Sunyer T., Solà R., Varela J., Bruguera M., Feliu A., Forns X.,
Campins M., Martell M., Esteban J.I., Quer J., Sánchez J.M. Transmission of hepatitis C virus
during computed tomography scanning with contrast. Emerging Infectious Diseases 2008;
14(2): 333-336 IF:6.859 C1D1
36. Crespo M, Sauleda S, Esteban JI, Juarez A, Ribera E, Andreu AL, Falco V, Quer J, Ocaña I, Ruiz I,
Buti M, Pahissa A, Esteban R, Guardia J.Peginterferon alpha-2b plus ribavirin vs interferon
alpha-2b plus ribavirin for chronic hepatitis C in HIV-coinfected patients. J Viral Hepat. 2007
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37. Zabaleta A, Arribillaga L, Llopiz D, Dotor J, Lasarte JJ, Prieto J, Borrás-Cuesta F, Esteban JI, Quer
J, Vayreda F, Sarobe P.Induction of potent and long-lasting CD4 and CD8 T-cell responses
11
against hepatitis C virus by immunization with viral antigens plus poly(I:C) and anti-CD40.
Antiviral Res. 2007 Apr;74(1):25-35. IF:4.439 C1D2
38. Quer, J; Esteban, JI; Cos, J; Sauleda S; Ocaña L; Martell M; Otero T; Cubero M; Palou E; Murillo,
P;; Esteban, R; Guardia, J. Effect of bottlenecking on evolution of the nonstructural protein 3
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Open prospective efficacy trial of anti-hcv screening of blood-donors to prevent transfusionassociated hepatitis
HEPATOLOGY 1991;14:A94
20
Participación en contratos de I+D de especial relevancia con Empresas y/o Administraciones
(nacionales y/o internacionales)
Título del contrato/proyecto:
Tipo de contrato:
Empresa/Administración financiadora:
Entidades participantes:
Duración, desde:
hasta:
Investigador responsable:
Número de investigadores participantes:
PRECIO TOTAL DEL PROYECTO:
Estudios de quasiespecies de los virus de la hepatitis B y C (VHB y VHC) y de polimorfismos
genómicos asociados a la respuesta al tratamiento antiviral por pirosecuenciación.
Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI). Ref. IDI-20110115
Empresas y Centros en consorcio: Roche, ABL, Ciberehd, VHIR-HUVH.
Inicio: 01/03/2010
Final: 30/04/2013
2010-2013 (3M€). 294525€/428275€/364645€/72769€ = 1160214 + 90kits GS-FLX.
Objeto de proyecto: CONVENIO
Colaboraciones en este proyecto:
Dr. Esteban Domingo (Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” (CBMSO).
Universidad Autónoma de Madrid)
Drs. Rafael Esteban y Maria Buti (Hospital Universitari Vall d´Hebron, Barcelona)
Dr. Xavier Forns (Hospital Clínic i Provincial, Barcelona)
Dr. Javier Garcia-Samaniego (Hospital Carlos III, Madrid)
Dr. Jordi Gómez Castilla (Instituto de Parasitología y Biomedicina “Lopez-.Neyra”,
CSIC, Granada)
Dr. Manuel Romero Gómez (Hospital Universitario de Valme, Sevilla)
Dr. Francisco Javier Salmerón (Hospital Universitario San Cecilio de Granada)
Dr. Ricardo Moreno (Hospital Universitario de La Princesa de Madrid)
Proyecto en colaboración con Hepatitis Virus Laboratory Immunology Section Department of
Transfusion Medicine Clinical Center the National Institutes of Health (Drs. H.J.Alter &
H.W.K.Shih) "Concentración y purificación del Virus de la Hepatitis C a partir de plasma
humano".
Financiación Banco Bilbao Vizcaya (BBV) (6.500.000 Pts)
Beca de Investigación de la División Médica del Banc Català de Crèdit
"Disseny i construcció d´una ribozima del tipus "hairpin" per a la degradació de la regió 5' no
traduida del Virus de l´Hepatitis C. Assaig de l´activitat "in vitro" i en cultiu.
Banc Català de Crèdit (3.000.000 Pts).
Proyecto HEPCOM (28.000$).
Trasferencia de tecnología a GRIFOLS LABORATORIOS (1.500.000Pts).
21
Seguimiento de pacientes hemofílicos HIV+, HCV+ tratados con IFN y Ribavirina. Asociación de
hemofilia. (2.400.000 Pts).
22
1
Patentes y Modelos de utilidad
Inventores (p.o. de firma): JOSEP QUER SIVILA, FRANCISCO RODRÍGUEZ-FRIAS y JOSEP GREGORI i FONT
Título: Primers and methods for detecting Human Hepatitis C Virus (HCV) variants in an isolated sample
N. de solicitud: EP13382278
País de prioridad: ESPAÑA
Entidad titular: VHIR, CIBEREHD, ROCHE
Países a los que se ha extendido: EU
Empresa/s que la están explotando: ROCHE, ABL
Fecha de prioridad: 05Julio2013
Nota: Si necesita más casos, añádalos utilizando las funciones de copiar y pegar con el 2º caso.
23
Inventores (p.o. de firma):
Título:
N. de solicitud:
País de prioridad:
Entidad titular:
Países a los que se ha extendido:
Empresa/s que la están explotando:
Fecha de prioridad:
2
Estancias en Centros extranjeros
(estancias continuadas superiores a un mes)
CLAVE: D = doctorado, P = postdoctoral, I = invitado, C = contratado, O = otras (especificar).
Centro: UNIVERSITY OF CALIFORNIA AT SAN DIEGO (UCSD)
Localidad: La Jolla País USA
Fecha: 1995-1996
Duración (semanas):
SAN DIEGO. CA
52
Tema: EVOLUCION VIRAL y CULTIVO DE VIRUS EN LINEA CELULAR ESTABLE.
BECARIO POSTDOCTORAL DEL MEC SUBPROGRAMA GENERAL en el EXTRANJERO
Ref. EX94 39330014 Resolución 1.8.1994.
Clave: P
Nota: Si necesita más casos, añádalos utilizando las funciones de copiar y pegar con el 2º caso.
24
Centro: UNIVERSITY OF CALIFORNIA AT SAN DIEGO (UCSD)
Localidad: La Jolla País USA
Fecha: 1996
Duración (semanas):
SAN DIEGO. CA
12
Tema: EVOLUCION VIRAL y CULTIVO DE VIRUS EN LINEA CELULAR ESTABLE.
Clave: INVITACIÓN PERSONAL DR. J.J.HOLLAND
ESTANCIA POSTDOCTORAL
3
Contribuciones a Congresos
Autores:
Título:
Tipo de participación:
Congreso:
Publicación:
Lugar celebración:
Fecha:
American Society fot Virology 16th Annual meeting. Bozeman. Montana.USA.
I.S.Novella, C.Hershey, C.H.Lee, J.Quer, S.F.Elena, A.Moya, E.Domingo, J.J.Holland
Evolution of RNA virus populations in changing fitness landscapes.
Juliol 19-23, 1997.
2nd European meeting on diagnostic PCR. Den Haag. Holanda
H.J. Reesink, S.Sauleda, J.Quer, M.Martell, M.Bove, J.M.Hernández, J.I.Esteban, R.Esteban, J.Guardia
HGV RNA quantitative method by real time RT/PCR
Octubre 1997.
XXII Congreso De La Asociación Española Para El Estudio Del Hígado. Madrid.
F. Rodriguez-frias, M. Buti. R. Jardi, V. Vargas, M. Cotrina, J.Quer, R. Esteban And J. Guardia.
Accumulation Of Hepatitis B Virus Surface Antigen Mutations In Patients With Hepatitis B Cirrhosis
Before And After Liver Transplantation.
Febrer, 1997.
49th Annual Meeting of the American Association for the Study of the Liver (AASLD). Chicago, USA.
S Sauleda, JI Esteban, B Dragon, M Bove, J Carbonell, S Biosca, M Martell, J Quer, R Esteban, J
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Novembre de 1998.
33rd Annual Meeting of the European Association for the study of the liver. Lisboa (Portugal).
F Rodríguez-Frias, M Buti, R Jardí, V Vargas, M Cotrina, J Quer, R Esteban, J Guardia
Genetic Alterations in the S gene of hepatitis B virus in patients with acute hepatitis B, chronic
hepatitis B, and hepatitis B cirrhosis before and after liver traplantation
Abril 15-18, 1998.
VIII Congreso Nacional de Virología. Barcelona
Nota: Si necesita más casos, añádalos utilizando las funciones de copiar y pegar con el 2º caso.
25
III Jornada de Virologia de Catalunya
J.Quer, P.Murillo, J.Cos, J.I.Esteban, R.Esteban, J.Guàrdia.
Dependencia de pH para la unión del virus de la hepatitis C (VHC) a la línea celular Daudí (línea
humana de células B).
12-15 Octubre 2003.
11th International symposium on Hepatitis C & related viruses. Heidelberg. Germany
L.Ocaña, J.Cos, J.Quer, J.I.Esteban, F.E.Borràs, M.Tejada, J.Guardia, LL.Massuet and C.Margarit
FK506 down-regulated maturation of dendritic cells (DCs) pulsed with a nonstructural protein
October 3rd – 7th 2004
The 3rd international congress of immunosuppression. San Diego, CA, USA.
J.Cos, L.Ocaña, J.Quer, I.Bilbao, J.I.Esteban, F.E.Borràs, M.Tejeda, J.Guardia, Ll.Massuet and
C.Margarit. FK506 down-regulated maturation of dendritic cells pulsed with a nonstructural protein
(NS3) of hepatitis C virus
December 8th – 11th, 2004
8º Congrés de la Societat Catalana de Trasplantament.
J.Cos, L.Ocaña, J.Quer, I.Bilbao, J.I.Esteban, F.E.Borràs, M.Tejeda, J.Guardia, Ll.Massuet and C.Margarit
FK506 down-regulated maturation of dendritic cells pulsed with a nonstructural protein (NS3) of
hepatitis C virus
6-9 de Febrer de 2005.
Barcelona
J.Cos, L.Ocaña, J.Quer, I.Bilbao, E.Palou, R.Parra, Ll.Masuet, C.Margarit
La respuesta celular in vitro como modelo predictivo de la evolución de los pacientes VHC+ sometidos
a trasplante hepático.
6-9 de Febrer de 2005.
Barcelona
XIII Congreso Argentino de Hepatologia. Buenos Aires. Argentina
N DelPino, R Jardí, J Quer
Transmisión vertical y estudio filogenético del virus de la hepatitis © en un grupo familiar
Juny 2005.
12th International symposium on Hepatitis C & related viruses. Montreal. Canada
J.Quer, J.Cos, S.Sauleda, L.Ocaña, P.Murillo. M. Martell, T. Otero, J.I. Esteban, R. Esteban, J. Guàrdia
Evolution of the gene encoding the complete nonstructural 3 protein (NS3) of hepatitis C virus (HCV)
during chronic infection and after transmission to a new host
2-6 d’Octubre de 2005.
VIII International symposium on viral hepatitis. Barcelona 2006
M.Bes, S.Sauleda, M.Cubero, L.Ocaña, J.Quer, J.I.Esteban
Immune response to HCV
XVI Congrés de la Societat Catalana de Digestologia. Girona. 1-3 Febrer 2007
Bes M, Sauleda S, Quer J,Cubero M, Guardia J, Puig Ll, Esteban R, Esteban JI
Captura, expansió i restauració funcional de cèl·lules CD4 específiques per a NS3 del VHC en un
pacient amb infecció persistent
26
Quer J, Esteban JI, Sánchez JM, Otero T, Rius C, Coll M, Cubero M, Moreno G, Gonzalez A, Vaque J,
Esteban R, Campins M, Pañella H, Guardia J, Martell M
Transmissió nossocomial del virus de l’hepatitis c (vhc) durant tac amb contrast
XXXII Congreso de la Asociación Española para el estudio del Hígado (AEEH). Madrid. 21-23 Febrero
2007
Bes M, Sauleda S, Quer J,Cubero M, Guardia J, Puig Ll, Esteban R, Esteban JI
Captura, expansión y restauración fenotípica y funcional de células CD4 específicas para NS3 del VHC
en un paciente con infección persistente
Zabaleta A, Arribillaga L, Llopiz D, Dotor J, Lasarte JJ, Prieto J, Borrás-Cuesta F, Esteban JI, Quer J,
Vayreda F, Sarobe P
La inmunización con la proteína NS3 y agentes inmunopotenciadores induce respuestas T CD4 y CD8
frente al virus de la hepatitis C
42th Annual meeting of the European Association for the study of the liver (EASL). Barcelona 11-15
Abril 2007
Zabaleta A, Arribillaga L, Llopiz D, Dotor J, Lasarte JJ, Prieto J, Borrás-Cuesta F, Esteban JI, Quer J,
Vayreda F, Sarobe P
Induction of potent and long lasting CD4 and CD8 T-cell responses against hepatitis C virus by
immunization with viral antigens plus poly (I:C) and anti-CD40
Diaz O., Quer J, Icard V, Cubero M, Scholtes C, Esteban JI, Lotteau V, Andre P
Hepatitis C virus low density particles can be sexually transmitted
58th Annual Meeting of the American Association for the Study of Liver Diseases. 2-6Noviembre
2007. BOSTON. CA.USA
Bes M, Sauleda S, Quer J,Cubero M, Guardia J, Puig Ll, Esteban R, Esteban JI
Selection, expansion and functional restoration of NS3-specific CD4 Tcells from HCV-infected patients
VII Jornada de Virologia. Societat Catalana Biologia.
Cubero M, Esteban JI, Otero T, Sauleda S, Bes M, Esteban R, Guardia J, Quer J
Presència del virus mutant A156T resistent a inhibidors de la proteasa NS3 del virus de l’hepatitis c
en un pacient crònic no tractat.
Barcelona 5 Novembre 2007.
Presentació oral
XXXIII Congreso de la Asociación Española para el estudio del Hígado (AEEH). Madrid. 20-22
Febrero 2008
Cubero M, Esteban JI, Otero T, Sauleda S, Bes M, Esteban R, Guardia J, Quer J “Presencia de mutantes
resistentes a inhibidores de la proteasa del VHC en ausencia de tratamiento”.
Presentación Oral
42th Annual meeting of the European Association for the study of the liver (EASL). Milan. 23-27
Abril 2008
Cubero M, Esteban JI, Otero T, Sauleda S, Bes M, Esteban R, Guardia J, Quer J
“Naturally occurring NS3-protease-inhibitor resistant mutant A156T in the liver of an untreated
chronic hepatitis C patient”
Poster
27
30th anniversary VIII Jornada de Virología SCB. Barcelona.17-18 Noviembre 2008
Rodriguez-Frias F, Cubero M, Esteban JI, Tabernero D, Ortega I, Sánchez A, Mosquera JL, Schaper M,
Homs M, Sauleda S, Bes M, Buti M, Esteban R, Jardi R, Guardia J, Quer J.
“Detection of clinically relevant minority HBV and HCV antiviral resistant mutants in chronic patients
before treatment by ultra-deep pyrosequencing”
Póster
XXXIII Congreso de la Asociación Española para el estudio del Hígado (AEEH).Madrid. 20-22 Febrero
2008
cubero M, Esteban JI, Otero T, Sauleda S, Bes M, Esteban R, Guardia J, Quer J
Presencia de mutantes resistentes a inhibidores de la proteasa del VHC en ausencia de tratamiento.
Presentació Oral
42th Annual meeting of the European Association for the study of the liver (EASL). Milan. 23-27
Abril 2008
Cubero M, Esteban JI, Otero T, Sauleda S, Bes M, Esteban R, Guardia J, Quer J
Naturally occurring NS3-protease-inhibitor resistant mutant A156T in the liver of an untreated
chronic hepatitis C patient
XVIII Congrés de la Societat Catalana de Digestologia. Girona. 29-31 Enero 2009
Cubero M, Esteban JI, Sauleda S, Bes M, Ortega I, Mosquera JL, Sánchez Álex, Esteban R, Guardia J,
Quer J
“Detección de mutantes de resistencia a inhibidores de la región proteasa ns3 del vrus de la hepatitis
c (vhc) en pacientes crónicos no tratados mediante pirosecuenciación”
Presentación Oral
XXXIV Congreso de la Asociación Española para el estudio del Hígado (AEEH). Madrid. 25-27
Febrero 2009
Cubero M, Esteban JI, Sauleda S, Bes M, Ortega I, Mosquera JL, Sánchez Álex, Esteban R, Guardia J,
Quer J
“Detección de mutantes de resistencia a inhibidores de la región proteasa ns3 del vrus de la hepatitis
c (vhc) en pacientes crónicos no tratados mediante pirosecuenciación”
Presentación Oral
XI Congreso Nacional de la Sociedad Española de Virología. 29 Mayo- 1 Junio 2011. Granada.
Maria Cubero, Damir Garcia-Cehic, Juan I. Esteban, Francisco Rodriguez-Frias, Israel Ortega, Esteban
Domingo, Silvia Sauleda, Marta Bes, Alex Sanchez, Rafael Esteban, Jaume Guàrdia, Josep Quer
Estudio de factores virales y del huésped determinantes en la evolución de la infección por vhc hacia
cronicidad o curación mediante secuenciación masiva 454/roche
Poster
60th Annual Meeting of the American-Association-for-the-Study-of-Liver- (AASLD). OCT 30-NOV 03,
2009 Boston, MA
Rodriguez-Frias F, Tabernero D, Buti M, et al. Evolution of hepatitis b virus quasispecie in serum
samples by ultra-deep pyrosequencing analysis of a patient with chb sequentially treated with
different nucleos(t)ide analogues
28
Source: HEPATOLOGY Volume: 50 Issue: 4 Pages: 517A-517A Supplement: Suppl. S Meeting
Abstract: 447 Published: OCT 2009
45th Annual Meeting of the European-Association-for-the-Study-of-Liver- (EASL). APR 14-18, 2010
Vienna, AUSTRIA
Rodriguez-Frias F, Tabernero D, Quer J, et al. Ultra-deep pyrosequencing as a tool for the analysis of
hepatitis b virus quasispecies evolution: study of a patient sequentially treated with nucleoside and
nucleotide analogues
Source: JOURNAL OF HEPATOLOGY Volume: 52 Pages: S241-S241 Supplement: Suppl. 1
Published: 2010
61st Annual Meeting of the American Association for the Study of Liver Diseases (AASLD).
29 Octubre-2Noviembre 2010. BOSTON. CA.USA
Maria Cubero, Damir Garcia-Cehic, Juan I. Esteban, Francisco Rodriguez-Frías, Israel Ortega,
Esteban Domingo, Silvia Sauleda, Marta Bes, Alex Sanchez, Rafael Esteban, Jaime Guardia, Josep
Quer
“Study of bottlenecking transmission of HCV during sexually-transmitted acute resolving infection
using ultra-deep pyrosequencing (UDPS) 454/Roche platform”
Póster
Marta Bes, Silvia Sauleda, Angie Rico, Isabel Campos-Varela, Maria Prion, Natalia Casamitjana, Josep
Quer, Maria Cubero, Jaume Guardia, Lluís Puig, Rafael Esteban, Juan Ignacio Esteban
Expansion and functional restoration of NS3-specific CD4+ T cells in patients with persistent Hepatitis
C virus infection
Póster
Maria Homs, Maria Buti, Rosend Jardí, David Tabernero, Melanie Schaper, Josep Quer, Israel Ortega,
Alejandro Artacho, Pilar Fernandez-Fernandez, Rafael Esteban, Francisco Rodríguez-Frías.
Analysis of hepatitis B virus precore/core and polymerase regions in the same viral genome by massive
sequencing
Póster
46th Annual meeting of the European Association for the study of the liver (EASL)
30 Marzo-3 Abril 2011 Berlin. Alemania.
Maria Cubero, Damir Garcia-Cehic, Juan I. Esteban, Francisco Rodriguez-Frías, Israel Ortega, Esteban
Domingo, Silvia Sauleda, Marta Bes, Alex Sanchez, Rafael Esteban, Jaime Guardia, Josep Quer
“Quasispecies homogenization and IL-28B genotype may favour self-resolving infection after HCV
bottlenecking transmission”
Póster
Maria Homs, Maria Buti, Rosend Jardí, David Tabernero, Melanie Schaper, Josep Quer, Israel Ortega,
Rafael Esteban, Francisco Rodríguez-Frías.
“Ultra-deep pyrosequencing of the hepatitis B virus precore region”
Póster
Marta Bes, Maria Piron, A. Oliveira, Angie Rico, Natalia Casamitjana, Juan Ignacio Esteban, Josep
Quer, Lluís Puig 1,2, Jaume Guardia, Victor Vargas, Silvia Sauleda
Genetic variability in HBV immunodominant epitopes in patients with occult hepatitis B infection and
genotype D
29
Póster
62st Annual Meeting of the American Association for the Study of Liver Diseases (AASLD)
2011. San Francisco. CA. USA
Marta Bes et al. Analysis of the basic core promoter, precore, and core regions of hepatitis B virus by
ultra-deep pyrosequencing shows high variability in TATA boxes and main epitopic regions
(ID # 1117979)
XI Jornada de Virologia.
Josep Quer
Oral
Societat Catalana de Biologia.
Barcelona 12 Diciembre 2011.
VI Congreso Nacional de Laboratorio Clínico (SEQC)
C.Ramírez, M.Homs, J.Gregori, D.Tabernero, M.Mosquera, S.Camos, J.Quer, M.Buti, F.Rodríguez-Frías
Validación de la secuenciación masiva “ultra-deep pyrosequencing” como método alternativo a la
clonación para el estudio cuantitativo de la composición de la cuasispecies del virus de la hepatitis B
Barcelona 23-25 Octubre 2012
63rd Annual Meeting of the American Association for the Study of Liver Diseases (AASLD). November
9-13, 2012. Boston, Massachusetts, USA
Analysis of co-selection of immune escape and treatment- resistant variants in hepatitis b virus
quasispecies by ultra-deep pyrosequencing in lamivudine-treated patients (id # 1419086),
Ultra-deep pyrosequencing a valid and reproducible technique for quantitative study of viral
quasispecies composition (id # 1422209),
Does ITPA genotype predict anemia in patients treated with triple therapy? (id # 1422060),
Analysis of co-selection of immune escape and treatment- resistant variants in hepatitis b virus
quasispecies by ultra-deep pyrosequencing in lamivudine-treated patients (id # 1419086),
Ultra-deep pyrosequencing and shannon entropy to analyze the effect of natural evolution and
treatment resistance on mutations in the hepatitis b virus quasispecies (id # 1421414)
47th annual meeting of the European Association for the Study of the Liver (EASL). April 18 - 22,
2012. Barcelona
Julie Sheldon1, Isabel Gallego1, Mª Eugenia Soria1, Josep Quer2,3, Juan I. Esteban2,3, Esteban
Domingo1,2 and Celia Perales1,2
Hepatitis C virus mutants with decreased sensitivity to IFN-α in vitro: implications for treatment
failure
VI CONGRESO NACIONAL del LABORATIOR CLINICO. 23-25 Octubre 2012. Barcelona
POSTER:
C.Ramírez Serra, M.Homs, J.Gregori, D.Tabernero, S.Camós, J.Quer, M.Buti and F-Rodríguez-Frías
Validación de la secuenciación masiva "ultra-deep pyrosequencing" como método alternativo a la
clonación para el estudio cuantitativo de la composición de la quasispecies del virus de la Hepatitis B.
30
XXXVIII CONGRESO NACIONAL DE LA ASOCIACION ESPAÑOLA PARA EL ESTUDIO DEL HIGADO
(AEEH). 20-22 Febrero 2013, Madrid.
ORAL:
Sofia Pérez del Pulgar*, Josep Gregori*, Patricia González, Damir Garcia-Cehic, Santseharay Ramírez,
Maria Cubero, Juan I.Esteban Mur, Xavier Forns, Josep Quer
Estudio de la superinfección por el virus de la hepatitis C después del trasplante hepático por
secuenciación masiva” (ID 114).
POSTERS:
D.Tabernero, F.Rosdríguez-Frías, R.Casillas, J.Gregori, M.Homs, J.Quer, M.Mosquera, S.Camós,
C.Ramírez, R.Esteban, M.Buti
Dinámica de la complejidad de la quasispecies del virus de la Hepatitis B en la región solapada
superficie-polimerasa durante el tratamiento con análogos de nucleós(t)idos.
M.Homs, J.Gregori, J.Quer, D.Tabernero, S.Camós, R.Esteban, M.Buti, F.Rosdríguez-Frías
Evolución natural de la quasispecies del virus de la HBV y cambios producidos por el tratamiento
antiviral oral analizados por secuenciación masiva y valorados mediante la entropía de la población
viral
48th annual meeting of the European Association for the Study of the Liver (EASL). April 24 - 28,
2013. Amsterdam, The Netherlands
Sofia Perez-del-Pulgar*, Josep Gregori*, Patricia Gonzalez, Damir Garcia-Cehic, Santseharay Ramirez,
Maria Cubero, Juan Ignacio Esteban, Xavier Forns, Josep Quer
Study of hepatitis C virus superinfection after liver transplantation by ultra-deep pyrosequencing.
D.Tabernero, F.Rodríguez-Frías, R.Casillas, J.Gregori, M.Homs, J.Quer, M.Mosquera, S.Camós,
C.Ramírez, R.Esteban, M.Buti
Dynamic complexity of HBV quasispecies in a surface-polymerase overlapping region during
treatment with nucleois(t)ide analogs
INTERNATIONAL WORKSHOP HIV & HEPATITIS VIRUS. Drug resistance and curative strategies. June
4-8, 2013. Toronto. Canada.
D.González, M.Barralon, C.Fernández, X.Forns, M.Buti, JI.Esteban, J.Quer, JL.Calleja, C.Sayada,
R.Boulme
HepatiC, The Viral hepatitis C patients managment application & database
XII CONGRESO NACIONAL DE VIROLOGÍA de la SOCIEDAD ESPAÑOLA DE VIROLOGÍA. 9-12 Junio 2013.
BURGOS
ORALS
Josep Gregori, Sofia Perez-del-Pulgar, Francisco Rodríguez-Frías, Patricia Gonzalez, Damir Garcia-Cehic,
Maria Homs, David Tabernero, Santseharay Ramirez, Maria Cubero, Juan Ignacio Esteban, Xavier Forns,
Josep Quer.
Ultra-deep pyrosequencing to study hepatitis C virus superinfection after liver transplantation and HBV
complexity under antiviral treatment
Ana Mª Ortega Prieto*, Julie Sheldon, Ana Grande, Pérez, Héctor Tejero, Josep Gregori, Josep Quer,
Juan I Esteban, Esteban Domingo, Celia Perales
31
Lethal mutagenesis is involved in hepatitis C virus extinction by ribavirin in cell
culture.
Ana Doménech, Laura Benítez, Mar Blanco, Mª Teresa Cutuli, Ricardo Flores, Juan García-Costa, Josep
Quer, Javier Romero, Antonio Talavera, Esperanza Gómez Lucía.
Viropolis: The game for self-evaluation and learning Virology
POSTERS
Josep Gregori, Sofía Pérez del Pulgar, Patricia González, Damir García Cehic, Santseharay Ramirez,
María Cubero León, Juan I. Esteban, Xavier Forns, Josep Quer
Study of hepatitis C virus superinfection after liver transplantation by ultra-deep pyrosequencing
María Homs, Josep Gregori, Josep Quer, David Tabernero, Silvia Camós, Rafael Esteban, María Buti,
Francisco Rodríguez Frías
Natural evolution of the hepatitis B virus quasispecies and oral antiviral treatment-induced changes
analyzed by massive sequencing and evaluated by the entropy of the viral population
David Tabernero, Francisco Rodríguez-Frías, Rosario Casillas, Josep Gregori, Maria Homs, Josep Quer,
Marta Mosquera, Sílvia Camós, Clara Ramírez, Rafael Esteban, Maria Buti
Dynamic complexity of hepatitis B virus quasispecies in a surface / polymerase overlapping region
during treatment with nucleoside / nucleotide analog
64th ANNUAL MEETING OF THE AMERICAN ASSOCIATION FOR THE STUDY OF LIVER DISEASES
(AASLD). November 1-5, 2013. Washington, DC. USA
Sílvia Camós, Francisco Rodriguez-Frias, Irene Belmonte, Maria Homs, David Tabernero, Andrea
Caballero, María Cuaresma, Amparo Escudero, Felicidad Rodriguez, María Teresa Ferrer, Miguel Angel
Serra, Juan Manuel Pascasio, Josep Quer, Rafael Esteban, Maria Buti,
ITPA genotyping before triple therapy enables identification of chronic hepatitis C patients with a
higher risk of developing early severe anemia when on therapy
TITLE: HEPATITIS B VIRUS SURFACE IMMUNE ESCAPE VARIANTS BY ULTRA-DEEP
PYROSEQUENCING AND VARIATIONS DURING TREATMENT WITH NUCLEOSIDE ANALOGS
AUTHORS (FIRST NAME, LAST NAME): David Tabernero1, 2, Francisco Rodriguez-Frias1, 2, Rosario
Casillas3, Josep Gregori3, 4, Irene Belmonte2, Maria Homs1, 2, Maria Blasi1, 2, Josep Quer1, 3,
Leonardo Nieto5,
Silvia Camos2, Andrea Caballero2, Carolina Gonzalez2, Rafael Esteban1, 3, Maria Buti1, 3
TITLE: Reapparence of HBV DNA with changes in HBV genome after stopping tenofovir in HBeAgnegative
patients with complete suppression of HBV DNA for more than 7 years
AUTHORS (FIRST NAME, LAST NAME): Maria Buti1, 2, David Tabernero1, 3, Francisco Rodriguez-Frias1,
3,
Rosario Casillas2, Josep Gregori2, 4, Carolina Gonzalez3, Irene Belmonte3, Maria Homs1, 3, Maria
Blasi1, 3,
Josep Quer1, 2, Leonardo Nieto5, Silvia Camos3, Andrea Caballero3, Rafael Esteban1, 2
TITLE: Dynamic Study of Hepatitis B Virus (HBV) Quasispecies in X Gene/Basal Core Promoter/preCore
32
Region by Ultradeep Pyrosequencing (UDPS) Technology: High Rates of Deletions, De Novo Stop
Codons,
and Viral Genotype Mixtures
AUTHORS (FIRST NAME, LAST NAME): Josep Gregori1, 2, Andrea Caballero3, David Tabernero3, 4,
Maria
Homs3, 4, Maria Blasi3, 4, Rosario Casillas2, Josep Quer2, 4, Leonardo Nieto5, Xose Costa-Alcaide6,
Rafael
Esteban2, 4, Maria Buti2, 4, Francisco Rodriguez-Frias3, 4
EASL MONOTHEMATIC CONFERENCE: Translational Research in Chronic Viral Hepatitis - Bridging
Basic Science and Clinical Research. November 29-30, 2013. Lyon. France
REDETECTION OF HBV-DNA AFTER STOPPING TENOFOVIR IN CHRONIC HEPATITIS B PATIENTS WITH 7
YEARS OF COMPLETE HBV-DNA SUPPRESSION
Maria Buti 1, 2,*, David Tabernero 1, 3, Francisco Rodríguez-Frías 1, 3, Rosario Casillas 2, Josep Gregori
2, 4, Carolina
González 3, Irene Belmonte 3, Maria Homs 1, 3, Maria Blasi 1, 3, Josep Quer 1, 2, Leonardo Nieto 5,
Silvia Camós 3, Andrea
Caballero 3, Rafael Esteban 1, 2
Analysis of HBV quasispecies in X gene and precore region by deep sequencing shows the presence of
genome deletions, genotype mixture and specific patterns of complexity.
M.Homs, A.Caballero, J.Gregori, D.Tabernero, M.Blasi, R.Casillas, J.Quer, L.Nieto, R.Esteban, M.Buti and
F.Rodríguez-Frías
XII CONGRESO PERUANO Y XVII CONGRESO LATINOAMERICANO DE FITOPATOLOGIA. Lambayeque 15Octubre 2013. PERU
Virópolis: UN juego para aprender más sobre virologia
E.Gómez-Lucia, L.Benítez, M.Blanco, MT.Cutuli. A.Domenech, R.Flores, J.García-Costa, J.Quer,
J.Romero, A.Talavera
XXXIX CONGRESO ANUAL DE LA ASOCIACION ESPAÑOLA PARA EL ESTUDIO DEL HIGADO (AEEH)
Madrid, 18-21 Febrero 2014.
ORAL Jueves 20 Febrero 2014
HEPATITIS B TRAS LA INTERRUPCIÓN DE TENOFOVIR EN PACIENTES HBEAG NEGATIVOS CON 7 AÑOS DE
SUPRESIÓN COMPLETA DE LA REPLICACIÓN VIRAL.
María Buti(1,2) | David Tabernero(1,3) | Francisco Rodríguez-Frías(1,3) | Rosario Casillas(2) | Josep
Gregori(4,2) | Carolina González(3) | Irene Belmonte(3) | María Homs(1,3) | María Blasi(1,3) | Josep
Quer(1,2) | Leonardo Nieto(5) | Silvia Camós(3) | Andrea Caballero(3) | Rafael Esteban(1,2).
Póster nº 85
SUBTIPADO DE ALTA RESOLUCIÓN DEL VIRUS DE LA HEPATITIS C (VHC) MEDIANTE SECUENCIACIÓN
MASIVA Y FILOGENIA.
Josep Quer(1,2,3) | Josep Gregori(1,4) | Francisco Rodríguez-Frías(1,2,3) | María Buti(1,2,3) | Antonio
Madejón(1,5) | Sofía Pérez del Pulgar(1,6) | Damir García-Cehic(1,2) | Rosario Casillas(2) | María
Blasi(2) | María Homs(1,2) | David Tabernero(1,2) | Miguel Álvarez-Tejado(4) | José Manuel Muñoz(4)
| María Cubero(1,2) | Rafael Esteban(1,2,3) | Jaume Guardia(1,2,3) | Javier García-Samaniego(1,5) |
Xavier Forns(1,6) | Juan Ignacio Esteban(1,2,3) | CIBERehd Viral Hepatitis group(7).
33
Póster nº 95
DINÁMICA DE LA COMPLEJIDAD DE CUASIESPECIES Y PRINCIPALES MOTIVOS REGULADORES DEL VIRUS
DE LA HEPATITIS B (VHB) EN LA REGIÓN X/PROMOTOR BÁSICO DEL CORE/PRECORE ANALIZADA
MEDIANTE SECUENCIACIÓN MASIVA (UDPS-ULTRADEEP PYROSEQUENCING).
Andrea Caballero(1,2) | Josep Gregori(2) | María Homs(3,1) | David Tabernero(3,1) | María Blasi(3) |
Rosario Casillas(2) | Josep Quer(3,2) | Leonardo Nieto(4) | Henar Valbuena(1) | Rafael Esteban(3,5) |
María Buti(3,5) | Francisco Rodríguez-Frías(3,1,4).
Póster nº 96
ESTUDIO DINÁMICO DE CUASIESPECIES DEL VIRUS DE LA HEPATITIS B (VHB) EN LA REGIÓN DEL GEN X,
PROMOTOR BÁSICO DEL CORE (PBC) Y PRECORE (PC) MEDIANTE ULTRADEEP PYROSEQUENCING
(UDPS): ALTAS TASAS DE DELECIONES Y CODONES STOP DE NOVO.
Josep Gregori(1) | Andrea Caballero(2,1) | María Homs(3,2) | David Tabernero(3,2) | María Blasi(3) |
Rosario Casillas(1) | Josep Quer(3,1) | Leonardo Nieto(4) | Henar Valbuena(2) | Rafael Esteban(3,5) |
María Buti(3,5) | Francisco Rodríguez-Frías(3,2,4).
Póster nº 97
ESTUDIO DINÁMICO DEL GENOTIPO DEL VIRUS DE LA HEPATITIS B (VHB) MEDIANTE SECUENCIACIÓN
MASIVA (UDPS-ULTRADEEP PYROSEQUENCING): PRESENCIA SIGNIFICATIVA DE GENOTIPOS
RECOMBINANTES, ¿ES CORRECTA LA ACTUAL CLASIFICACIÓN GENOTÍPICA DEL VHB?
Andrea Caballero(1,2) | Josep Gregori(2) | María Homs(3,1) | David Tabernero(3,1) | María Blasi(3) |
Rosario Casillas(2) | Josep Quer(3,2) | Leonardo Nieto(4) | Henar Valbuena(1) | Rafael Esteban(3,5) |
María Buti(3,5) | Francisco Rodríguez-Frías(3,1,4).
Póster nº 118
EFECTOS DE LA RBV EN MONOTERAPIA SOBRE LA POBLACIÓN VIRAL EN PACIENTES CON HEPATITIS
CRÓNICA C (HCC) GENOTIPO 1: ANÁLISIS POR SECUENCIACIÓN DIRECTA Y PIROSECUENCIACIÓN DE LAS
REGIONES VIRALES.
Rosa Quiles Pérez(1,2) | Paloma Muñoz de Rueda(1,2) | Alicia Martín Lagos(2) | Ana Gila(1,2) | Ana
Martín-Alvarez(2) | Esther J Pavon Castillero(2) | Josep Quer(3,4) | Juan Ignacio Esteban(4,5) | Elena
Ruiz Escolano(2) | Sergio Jimenez Ruiz(2) | Angeles Ruiz Extremera(1,6,7,8,9,10) | Javier
Salmerón(1,11,2).
49th ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN ASSOCIATION FOR THE STUDY OF THE LIVER (EASL) THE
INTERNATIONAL CONGRESS 2014 (ILC2014). April 9-13, 2014. London. UK
P657
IN VIVO MUTAGENIC EFFECT OF RIBAVIRIN ON SUBTYPE 3F HEV
QUASISPECIES ISOLATED FROM A PATIENT INFECTED FROM
PORK MEAT
R. Casillas1, F. Rodr´ıguez-Frias2,3, B. M´ınguez1,3, M. Riveiro1,3,
J. Gregori1,4, D. Garcia-Cehic1,3, D. Tabernero2,3, M. Homs2,3,
M. Blasi2,3, A. Caballero2, L. Nieto2, A. Hundesa5, R. Girones5,
M. Buti1,3,6, J. Quer1,3,6.
P1110
HIGH-RESOLUTION HCV SUBTYPING USING MASSIVE
SEQUENCING AND PHYLOGENY, OPTIMAL ALTERNATIVE TO
CURRENT METHODS
J. Quer1,2,3, J. Gregori1,2,4, F. Rodr´ıguez-Frias2,3,5, M. Buti1,2,3,
34
A. Madejon2,6, S. Perez del Pulgar2,7, D. Garcia-Cehic1,2, R. Casillas5,
M. Blasi2,5, M. Homs2,5, D. Tabernero2,5, M. Alvarez-Tejado4,
J.M. Mu˜noz4, M. Cubero1,2, A. Caballero5, R. Esteban1,2,3,
J. Guardia1,2,3, J. Garcia-Samaniego2,6, X. Forns2,7, J.I. Esteban1,2,3
XVIII CONGRESO NACIONAL DE LA SOCIEDAD ESPAÑOLA DE ENFERMEDADES INFECCIOSAS Y
MICROBIOLOGIA CLÍNICA (SEIMC). 9-11 Abril 2014. Valencia
Subtipado por filogénesis mediante técnica de secuenciación masiva de pacientes co-infectados por
VIH-VHC”
L. Nieto Aponte, M. Crespo, J. Quer, A. Caballero, D. Tabernero, J. Gregori,
R. Casillas, T. Pumarola Suñe, F. Rodriguez-Frias
BEST ORAL COMMUNICATION AWARD
30th ANNUAL CLINICAL VIROLOGY SYMPOSIUM April 27-30, 2014. Daytona Beach, FL. USA
Poster1140 HEPATITIS C VIRUS HIGH RESOLUTION SUBTYPING USING NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS)
DATA
Dimitri Gonzalez1, Josep Gregori2, Olga Fernando1, Chalom Sayada3, Ronan Boulme3, Matthieu
Barralon3, Josep Quer Sivila4, Francisco Rodriguez Frias4
Poster1139 INTRODUCING SOFTWARE REGISTRIES IN THE GENERAL MANAGEMENT OF HEPATITIS C PATIENTS
Dimitri Gonzalez1, Carlos Fernández-Carrillo2, Matthieu Barralon3, Maria Buti Ferret4, Juan Ignacio
Esteban Mur4, Josep Quer Sivila4, Ronan Boulme3, Xavier Forns2, Chalom Sayada3, and Jose Luis
Calleja5
65th ANNUAL MEETING OF THE AMERICAN ASSOCIATION FOR THE STUDY OF LIVER DISEASES
(AASLD). November 7-11, 2014. Boston, MA. USA
Poster 1723
HBV genotype study by ultradeep pyrosequencing reveals complex mixtures and intergenotype
recombination
Andrea Caballero, Josep Gregori, Maria Homs, David Tabernero, Maria Blasi, Rosario Casillas, Josep
Quer, Leonardo Nieto, Henar Valbuena, Rafael esteban, Maria Buti, Francisco Rodriguez-Frias
21st INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON HEPATITIS C AND RELATED VIRUSES, September 7-11, 2014,
Banff, AB, Canada.
Study of Hepatitis C virus superinfection after liver transplantation by ultra-deep pyrosequencing.
Sofia Perez-del-Pulgar, Josep Gregori, Patricia González, Damir García-Cehic, Santseharay Ramírez,
Maria Cubero, Juan I.Esteban, Xavier Forns, Josep Quer
XXXVII CONGRESO DE LA SOCIEDAD ESPAÑOLA DE BIOQUIMICA Y BIOLOGIA MOLECULAR (SEBBM).
9-12 Septiembre 2014. Granada, Spain.
Cambios en el reclutamiento de la subunidad ribosomal 40S por poblaciones de RNA del virus de la
hepatitis C de heterogeneidad genética creciente
35
Samuel Prieto-Vega, Sunnie Thompson, Celia Perales, Josep Quer, Juan Ignacio Esteban, Esteban
Domingo, Jordi Gómez
I Jornadas INNOVET Facultad de Veterinaria UCM. 4 Febrero 2014. Madrid, Spain.
Virópolis: un juego para aprender más sobre virología
E.Gómez-Lucia, L.Benítez, M.Blanco, MT.Cutuli. A.Domenech, R.Flores, J.García-Costa, J.Quer,
J.Romero, A.Talavera
HepHIV 2014 Conference. HIV and Viral Hepatitis: Challenges of Timely Testing and Care. October 57, 2014. Barcelona.
Poster PS3/04
Increase of Sexually Transmitted Hepatitis C Virus in HIV+ Men who Have Sex with Men in Barcelona,
Spain. A Problem Linked to HIV Infection?
S.Manzanares-Laya, P.García de Olalla, C.Garriga, J.Quer, P.Gorrindo, S.Gómez, F.Rodriguez-Frias,
V.Plasencia, D.Garcia-Cehic, J.Gregori, R.Solá, M.J.Barbera, J.I.Esteban, J.A.Cayla
XII BCN VIROLOGY MEETING. SOCIETAT CATALANA DE VIROLOGIA. November 7, 2014. Barcelona
Oral presentation
High-resolution Hepatitis C virus (HCV) subtyping, using massive sequencing and phylogeny
J.Quer
40 CONGRESO ANUAL DE LA ASOCIACION ESPAÑOLA PARA EL ESTUDIO DEL HIGADO (AEEH)
(ANIVERSARIO).
24-27 Febrero 2015. Madrid
Oral
Análisis de la evolución genética del VHC por secuenciación masiva en pacientes que desarrollan una
hepatitis colestásica después del trasplante hepàtico
Martina Gambato, Josep Gregori, Josep Quer, Noelia Caro-Pérez, Patricia González, Damir Garcia-Cehic, Juan I.
Esteban, Gonzalo Crespo, Miquel Navasa, Xavier Forns, Sofía Pérez-del-Pulgar
Oral
La cuantificación de genomas codificantes de las dos formas de antígeno delta podría evidenciar la capacidad
replicativa del virus de la hepatitis delta
Maria Homs, Maria Blasi, Alicia Ruíz, David Tabernero, Pilar Reimundo, Josep Quer, Rosario Casillas, Josep
Gregori, Mar Riveiro-Barciela, Leonardo Nieto, Rafael Esteban, Maria Buti, Francisco Rodríguez-Frias.
Poster
Análisis filogenético de un brote epidémico de hepatitis aguda C en pacientes infectados por el VIH
por secuenciación masiva
Noelia Caro-Pérez, María Martínez-Rebollar, Josep Gregori, Josep Quer, Patricia González, Martina
Gambato, Hannah Visser, Juan I. Esteban, Josep Mallolas, Xavier Forns, Montse Laguno, Sofía Pérezdel-Pulgar
50th ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN ASSOCIATION FOR THE STUDY OF THE LIVER (EASL) THE
INTERNATIONAL CONGRESS 2014 (ILC2014). April 22-26, 2015. Vienna. Austria
YI P0555
Insertions and/or deletions in the main regulatory region of hepatitis B virus suggest multicoding of the
X protein
36
Andrea Caballero, Josep Gregori, Maria Buti, David Tabernero, Josep Quer, Maria Blasi, Francisco
Rodriguez-Algarra, Rosario Casillas, Carolina González, Irene Belmonte, Leonardo Nieto, Xose Costa,
Rafael esteban, Maria Homs, Francisco Rodriguez-Frias
YI P0704
Deep-sequencing analysis demonstrates the persistence of the pre-transplant HCV dominant variant
within a more homogeneous quasispecies after liver transplantation in cholestatic hepatitis C
patients
Martina Gambato, Josep Gregori, Josep Quer, Noelia Caro-Pérez, Patricia González, Damir Garcia-Cehic, Juan I.
Esteban, Gonzalo Crespo, Miquel Navasa, Xavier Forns, Sofía Pérez-del-Pulgar
YI P1287 Top 10%
Phylogenetic analysis of the epidemic outbreak of acute hepatitis C in HIV-infected patients by
massive sequencing
Noelia Caro-Pérez, María Martínez-Rebollar, Josep Gregori, Josep Quer, Patricia González, Martina
Gambato, Hannah Visser, Juan I. Esteban, Josep Mallolas, Xavier Forns, Sofía Pérez-del-Pulgar,
Montse Laguno.
XIII CONGRESO NACIONAL DE VIROLOGIA. SOCIEDAD ESPAÑOLA DE VIROLOGIA. 7-10 Junio 2015.
MADRID
P07
Vir(TU)al Epidemic: A game about viruses for smartphones
E.Gómez-Lucia, L.Benítez, M.Blanco, MT.Cutuli. A.Domenech, R.Flores, J.Quer, J.Romero, R.Añez
PO 15
Quantification of genomes encoding large and short forms of hepatitis delta antigen to explore the
replciation capacity of hepatitis delta virus
Maria Homs, Maria Blasi, Alicia Ruíz, David Tabernero, Pilar Reimundo, Josep Quer, Rosario Casillas, Josep
Gregori, Mar Riveiro-Barciela, Leonardo Nieto, Rafael Esteban, Maria Buti, Francisco Rodríguez-Frias.
PO 131
Insertions and/or deletions in the main regulatory region of hepatitis B virus suggest multicoding of the
X protein
Andrea Caballero, Josep Gregori, Maria Buti, David Tabernero, Josep Quer, Maria Blasi, Francisco
Rodriguez-Algarra, Rosario Casillas, Carolina González, Irene Belmonte, Leonardo Nieto, Rafael
esteban, Maria Homs, Francisco Rodriguez-Frias
PO 145
Phylogenetic analysis of the epidemic outbreak of acute hepatitis C in HIV-infected patients by
massive sequencing
Noelia Caro-Pérez, María Martínez-Rebollar, Josep Gregori, Josep Quer, Patricia González, Martina
Gambato, Hannah Visser, Juan I. Esteban, Josep Mallolas, Xavier Forns, Montse Laguno, Sofía Pérezdel-Pulgar
PO 147
Ultradeep pyrosequencing reveals polymorphisms in the probe-binding site of HCV-3 associated with
indeterminate results by a commercial assay
V.Saludes, J.Quer, J.Gregori, E.Bascuñana, D.Garcia-Cehic, J.I.Esteban, V.Ausina, E.Martro
37
PO 152
The prevalence of hepatitis C virus NS3 Q80K simeprevir resistance mutation in spanish population
analyzed by new real time technology is a useful tool for personalized treatment
Q.Chen, F.Rodriguez-Frias, I.Belmonte, M.Buti, L.Nieto, D.Garcia-Cehic, J.Gregori, R.Esteban, J.I.Esteban,
J.Quer
38
CONFERENCIAS INVITADO
QUER J, Novella IS, Hershey C, Holland JJ
“Periodic interactions between RNA viral populations” Symposium Honoring J.J.Holland.
Novembre 1995. Laguna Beach. California. USA.
QUER J.
“Population dynamics in RNA virus” Plasma/Complex System Seminar .
Conferencia
PHYSICS DEPARTMENT. University of California at San Diego (UCSD). La Jolla, CA. USA.
30 de Octubre 1995. LA JOLLA, CALIFORNIA. USA.
QUER J.
“Dinàmica d´evolució de virus de RNA. Implicacions en tractament i disseny de vacunes”.
Conferència
Seminaris d’Investigació. Centre d’Investigacions en Bioquímica i Biologia Molecular. Hospital
Vall d´Hebron.
1 de Desembre 1997. Barcelona
QUER J.
Neutralitat condicionada en poblacions virals en competició.
Conferència
Societat Catalana de Biologia. Institut d’Estudis Catalans.
17 Novembre 2001. Barcelona
QUER J.
¿Què són els virus?
Conferència magistral. Sala d’actes Ajuntament de Súria.
Gener 2002. Súria. Barcelona.
QUER J.
Els virus com a models per estudiar evolució.
Curs de Doctorat. Seminari. Departament de Genètica. Universitat de Barcelona.
3 Abril 2003. Barcelona
QUER J.
Importància de la RNasa L en el Síndrome de Fatiga Crònica
I Jornada de avances en el Síndrome de Fatiga Crónica
12 Maig 2003. Barcelona
QUER J.
Ponencia
Nuevos antivirales en el tratamiento de la infección por Virus de la Hepatitis C. (STAT-C
=specifically-targeted-antiviral-therapy for HCV)
X Congreso Nacional de Virología. Sociedad Española de Virología
39
21-25 de Junio de 2009. Salamanca
QUER J.
Ultra-deep pyrosequencing (UDPS) to study Hepatitis C and B (HBV-HCV) variability.
6th Workshop on Biomedical Genomics and Proteomics. Societat Catalana Biologia.IEC
11 Diciembre 2009. Barcelona
QUER J., RODRIGUEZ-FRIAS F.
Detección de mutantes minoritarios en población compleja de virus RNA o DNA (VHC, VHB)
mediante ultr-deep pyrosequencing (UDPS) con el sistema GS-FLX de 454/Roche..
Seminario Científico Biomedicina y Genómica. Roche
16 Diciembre 2009. Barcelona
4Th Genome Sequencer FLX User Conference
UDPS utility for management of chronic hepatitis
15-17 Junio 2010. Atenas . Grecia
QUER J.
Light cycler University
Uso de la secuenciación masiva 454 para el estudio de la evolución de la infección por virus
Hepatitis B y C.
28 Junio 2011. Valencia
QUER J.
XI Congreso Nacional. Sociedad Española de Quimioterapia
Simposium. Actualización en el diagnóstico molecular de las ITS.
Secuenciación masiva en el futuro del diagnóstico molecular de las ITS
Hospital Clínico San Carlos
8 octubre 2011. Madrid
QUER J.
III Jornadas Monográficas de la Sociedad Española de Virología.
Formación en VIH-SIDA y virus hepatotropos (VHC_VHB)
4-5 Noviembre de 2011. Toledo.
QUER J.
XXVII Reunión de la Sociedad Andaluza de Microbiologia y Parasitología Clínica (SAMPAC).
Nuevos retos en el uso de la secuenciación masiva para el estudio de virus From 454/Roche
to 4th NEXT GENERATION SEQUENCING.
17 Octubre 2014. Córdoba. Spain
40
QUER J.
Seminario Científico de Roche. Secuenciación, captura de secuencia y PCR a tiempo real:
aplicaciones.
Uso de la secuenciación masiva para el estudio de la infección por el virus de la Hepatitis C
(VHC)
De 454/Roche a 4th NEXT GENERATION SEQUENCING
4-Diciembre 2014. HUVH. Barcelona
QUER J.
Taula Rodona: Seqüenciació Massiva
"Aplicant la seqüenciació massiva al virus de l'Hepatitis C"
Societat Catalana de Malalties Infeccioses i Microbiologia Clinica
24 Abril 2014. Barcelona.
QUER J.
Seminari Servei Microbiologia Curs 2014-15.
Seqüenciació massiva en hepatitis virals.
16 Abril 2015. Departament Microbiologia HUVH. Barcelona
QUER J.
Curso "Actualitzacions en el diagnòstic i l'epidemiologia de les malalties infeccioses "
(09/11082-MD). CREPIMC.
Ús de la seqüenciació massiva per a l’estudi del VHC
25 Febrer 2015. Hospital de la Santa Creu i Sant Pau. UAB. Barcelona.
QUER J.
WorkShop SEDISA. ImpactO del diagnóstico in vitro en el resultado de salud.
Implementación de una solución NGS para la determinación del subtipo viral de VHC y las
resistencias a fármacos.
Personalización de tratamientos para la Hepatitis C e impacto en la eficiencia presupuestaria
Hotel Tryp Atocha. 15 Enero Madrid.
QUER J.
Conferencia FUNDACION DE ESTUDIOS MEDICOS (FEM).
El VIRUS de la HEPATITIS C (VHC)
12 Marzo 2015. MOLINA DE SEGURA (MURCIA)
QUER J.
III FORUM ROCHE. IN VITRO DIAGNOSTICS.
SUBTIPADO DE ALTA RESOLUCIÓN DEL VIRUS de la HEPATITIS C (VHC)
Isla de la Cartuja. 9-10 Abril 2015. Sevilla
QUER J.
41
Seminario Científico Roche. Jornadas de Microbiologia y Virologia Molecular
SUBTIPADO DE ALTA RESOLUCIÓN DEL VIRUS de la HEPATITIS C (VHC)
Torre Iberdrola de Bilbao. 22 Junio 2015. Bilbao (Vizcaya).
QUER J.
IV IVD FORUM
Cost-effective model for HCV diagnosis and disease management.
High-resolution HCV subtyping development on GS-Junior platform
Hotel Camino Real de Polanco. 14-15 Octubre 2015. Ciudad de México. México
QUER J
VIII AULA ABIERTA MULTIDISCIPLINAR. INNOVACION EN HEPATOLOGIA
SUBTIPADO DE ALTA RESOLUCIÓN DEL VIRUS de la HEPATITIS C (VHC)
Palacio de la Magdalena. 25-26 Septiembre 2015. Santander.
QUER J
VII JORNADAS MONOGRÁFICAS DE LAS SOCIEDAD ESPAÑOLA DE VIROLOGIA
PERSONALIZACIÓN DEL TRATAMIENTO CONTRA EL VIRUS de la HEPATITIS C (VHC) USANDO
LA TECNOLOGÍA DE ÚLTIMA GENERACIÓNIÓN
Madrid, 14-15 Diciembre 2015.
QUER J
APERTURA DEL CURSO. SOCIETAT CATALANA DE BIOLOGIA.
SUBTIPAT D’ALTA RESOLUCIÓ DEL VIRUS DE L’HEPATITIS C COM A EINA PER PERSONALITZAR
ELS TRACTAMENTS AMB ELS NOUS ANTIVIRALS D’ACCIÓ DIRECTA.
Institut Català d'Estudis. 23 Novembre de 2015. Barcelona
42
Tesis Doctorales dirigidas
Título:
Doctorando:
Universidad:
Facultad / Escuela:
Fecha:
Directores: Josep Quer Sivila, Itxarone Bilbao
Título del trabajo: PROPUESTA DE UN MODELO EXPERIMENTAL PARA LA
MONITORIZACIÓN DE LA RESPUESTA INMUNITARIA EN PACIENTES SOMETIDOS A
TRASPLANTE HEPÁTICO.
Fecha de lectura (dd/mm/aaaa): 18 Diciembre 2009
Nombre del doctorando: Joan Cos i Trullàs
Institución: Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Medicina.
Calificación: APTO CUM LAUDE
Director: Josep Quer Sivila, Manuel Crespo Casal
Título del trabajo: Tratamiento individualizado de la Hepatitis Crónica C en pacientes con
infección por VIH
Fecha de lectura (dd/mm/aaaa): 17 Junio 2011
Nombre del doctorando: Eva Van den Eynde Otero
Institución: Departament de Medicina. Facultat de Medicina. Universitat Autònoma de
Barcelona
Calificación: APTO CUM LAUDE
Directores: Josep Quer Sivila, Juan Ignacio Esteban
Título del trabajo: Estudio de complejidad y evolución del gen ns3 del virus de la
hepatitis c (vhc) mediante ultra-deep pyrosequencing (udps) en pacientes expuestos al
mismo inóculo viral
Fecha de lectura (dd/mm/aaaa): 14 de Febrero de 2013
Nombre del doctorando: Maria Dolores Cubero León
Institución: Departament de Bioquímica i Biologia Molecular. Universitat Autònoma de
Barcelona.
Calificación: APTO CUM LAUDE
43
Director: Josep Quer Sivila
Título del trabajo: Virus de la Hepatitis C: genotipificación, reacción en cadena de la
polimerasa (PCR)-polimorfismo en el tamaño de los fragmentos de restricción (RFLP)
secuenciación distribución de genotipos en Argentina
Fecha de lectura (dd/mm/aaaa): 2006-2013 en escritura
Nombre del doctorando: Noemí Orlanda del Pino
Institución: Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Buenos Aires. Argentina
44
4
Participación en comités y representaciones internacionales
Título del Comité:
Entidad de la que depende:
Tema:
Fecha:
Título del Comité:
Entidad de la que depende:
Tema:
Fecha:
Nota: Si necesita más casos, añádalos utilizando las funciones de copiar y pegar con el 2º caso.
45
5
Experiencia en organización de actividades de I+D
Organización de congresos, seminarios, jornadas, etc., científicos-tecnológicos
Título: SECRETARIO del COMITÉ ORGANIZADOR DEL XII CONGRESO NACIONAL DE VIROLOGIA
de la SOCIEDAD ESPAÑOLA DE VIROLOGIA (SEV). BURGOS 2013.
Tipo de actividad: CONGRESO NACIONAL
Ambito: ESPAÑA
Fecha: 9-12 de Junio 2013
Título: COORDINADOR SIMPOSIO INTERNACIONAL FUNDACION RAMON ARECES. “CONTROL
O ERRADIACION DE LAS HEPATITIS VIRALS B Y C”. BARCELONA 2013
Tipo de actividad: SIMPOSIUM
Ambito: INTERNACIONAL
INTERNACIONAL
Fecha: 30 y 31 de mayo de 2013
Título: SECRETARIO del COMITÉ ORGANIZADOR DEL XIII CONGRESO NACIONAL DE
VIROLOGIA de la SOCIEDAD ESPAÑOLA DE VIROLOGIA (SEV). MADRID 2014.
Tipo de actividad: CONGRESO NACIONAL
Ambito: ESPAÑA
Fecha: 7-10 de Junio 2014
Título: CURSO DE FORMACION PARA PROFESORES DE SECUNDARIA Y BACHILLERATO.
FUNDACIO CATALUNYA LA PEDRERA.
El virus de la Hepatitis B i C". BARCELONA MAYO-JUNIO 2015.
Tipo de actividad: CURSO. FORMACIÓN
Ambito: ESPAÑA
Fecha: Mayo- Junio 2014
6
Experiencia de gestión de I+D
Gestión de programas, planes y acciones de I+D
Título:
Tipo de actividad:
Fecha:
Nota: Si necesita más casos, añádalos utilizando las funciones de copiar y pegar con el 2º caso.
Nota: Si necesita más casos, añádalos utilizando las funciones de copiar y pegar con el 2º caso.
46
Título:
Tipo de actividad:
Fecha:
7
Otros méritos o aclaraciones que se desee hacer constar
(utilice únicamente el espacio equivalente a una página).
ACREDITACIONES OFICIALES:
- ACREDITACIÓN OFICIAL DE INVESTIGACIÓN: 19 Marzo 2007. AGENCIA PARA LA CALIDAD
DEL SISTEMA UNIVERSITARIO DE CATALUÑA. (AQU Cataluña) GENERALITAT DE CATALUNYA.
Exp. U1445/5277538-48
- ACREDITACION DE INVESTIGADOR del CIBER del INSTITUTO DE SALUD CARLOS III. MADRID.
SPAIN. 18 Febrero 2010.
PARTICIPATION en TRIBUNALES de TESIS:
2000 Secretario Tribunal de Tesis del Dr, Jose M. Bordón Ferreyra. Facultad de Medicina.
Universidad Autónoma de Barcelona.
2003 Miembro Tribunal Tesis Dra. Alma Bracho Lapiedra. Facultad Biologia. Universitat
Valencia. Burjassot.
2009 Vocal Tribunal tesis del Dr. Lluís Aragonès Marimon. Facultad de Biología. Universidad
de Barcelona.
2010 Vocal Tribunal de Tesis de la Dra. Santseharay Ramírez Almeida. 16-Febrero-2010.
Facultad de Medicina-Hospital Clínic. Universidad de Barcelona
Editorial Board: World J.Virology, Case report Hepatology, Liver International.
REVISOR de JOURNALS: Gastroenterology, PLosOne, Journal Virol.Methods., Wordl
J.Gastroenterology, etc.
ANEP (Agencia Nacional de Evaluación y Prospectiva):
EXTERNAL REVIEWER OF NATIONAL PROJECTS: MICINN, FIS, Comunidades Autónomas.
2009: 3 evaluaciones
2010: 4 evaluaciones
Nota: Si necesita más casos, añádalos utilizando las funciones de copiar y pegar con el 2º caso.
47
2011: 6 evaluaciones
2012: 4 evaluaciones
MIEMBRO DE SOCIEDADES CIENTÍFICAS:
TESORERO SOCIEDAD ESPAÑOLA DE VIROLOGIA. SEV. Desde 14 January 2010.
Miembro SOCIEDAD ESPAÑOLA DE VIROLOGÍA (SEV) since 2009.
Miembro EUROPEAN SOCIETY FOR VIROLOGY (ESV) since 2009.
Miembro SOCIEDAD ESPAÑOLA DE BIOLOGIA CELULAR since 1996.
COLEGIADO Nº 3636C. Colegio de Biólogos.
Miembro de la Societat Catalana de Biologia. Nº3187 desde 15 Diciembre 2010
PREMIOS:
Premio ESPECIAL TESIS (PhD). 1995
Premio CIUDAD DE BARCELONA DE INVESTIGACION CIENTÍFICA 1996.
Premio a las Mejores Ideas 2015. Diario Médico.
COLABORACIONES:
CBM-UAM: ESTEBAN DOMINGO.
CIMA de la Universidad de Navarra (Dr. Pablo Sarobe)
INSERM U503 Lyon (Dr. Patrice André)
CNIO Madrid y ICO Bellvitge, Barcelona (Dr. Manel Esteller)
CGMM-IDIBELL. Josep Maria Aran
Dr. Esteban Domingo (Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” (CBMSO). Universidad
Autónoma de Madrid)
Drs. Rafael Esteban y Maria Buti (Hospital Universitari Vall d´Hebron, Barcelona)
Dr. Xavier Forns (Hospital Clínic i Provincial, Barcelona)
Dr. Javier Garcia-Samaniego (Hospital Carlos III, Madrid)
Dr. Jordi Gómez Castilla (Instituto de Parasitología y Biomedicina “Lopez-.Neyra”, CSIC,
Granada)
Dr. Manuel Romero Gómez (Hospital Universitario de Valme, Sevilla)
Dr. Francisco Javier Salmerón (Hospital Universitario San Cecilio de Granada)
Dr. Ricardo Moreno (Hospital Universitario de La Princesa de Madrid)
PARTICIPACIÓN EN MASTERS:
Coordinador Módulo 2 (VHIR) y 10 (UAB). Curso 2014-2015
Master "Translational Biomedical Research ". VHIR-Universitat Autònoma de Barcelona.
Coordinador Módulo 1 (VHIR) y 10 (UAB). Curso 2015-2016
Master "Translational Biomedical Research ". VHIR-Universitat Autònoma de Barcelona.
Participación en Módulo 6 Cursos 2014-15 y 2015-16.
Master "Translational Biomedical Research ". VHIR-Universitat Autònoma de Barcelona.
48
Participación en Módulo 10. Cursos 2012-13 y 2013-14.
Máster de Bioquímica y Biología Molecular. Universidad Autónoma de Barcelona.
Participación Master de Biomedicina: Patologias Infecciosas. Cursos 2012-13 y 2013-14.
Departamento Microbiología. Universidad de Barcelona.
49