Download Para la adquisición de un scanner, un

ADQUISICIÓN DE UN SCANNER DE MICROARRAYS, HORNO DE
HIBRIDACION, CAMARA DE HIBRIDACION, ROTADOR DE HORNO Y
NANOESPECTRÓMETRO, SOFTWARE ESPECÍFICO Y ORDENADOR
PARA
EL
ESTUDIO
DE
DESEQUILIBRIOS
CROMOSOMICOS
NO
DETECTABLES MEDIANTE EL CARIOTIPO CONVENCIONAL, PARA EL
CENTRO DE BIOQUÍMICA Y GENÉTICA CLINICA
La técnica de microarray-CGH permite identificar ganancias y pérdidas de fragmentos
submicroscópicos a lo largo de todo el genoma, con un poder de resolución 100 veces
superior al cariotipo convencional (del orden de 10-100kb). Para la realización de esta
técnica se requiere la siguiente instrumentación: un nanoespectrofotómetro, cámaras de
hibridación, horno de hibridación y escáner.
ESPECIFICACIONES TÉCNICAS
Nanoespectrofotómetro:
-
Rango de longitud de onda de 200 a 800 nm
-
Medición de volúmenes de 0.5 ul de muestra
-
Límite de detección de 5ng/ul de dsDNA o inferior.
-
Medición , sin dilución, de concentraciones superiores a 10000 ng/ul de
dsDNA
-
Tiempo de medida inferior a 10 seg.
-
Incluido software de control
-
Garantía de 1 año
Cámara y horno de hibridación de microarrays con rotación:
-
Rango de temperatura variable, hasta 70ºC, con precisión de 0,1ºC.
-
Cámaras de hibridación para arrays CGH multiformato de 1x3”
-
Rotador con capacidad para más de 12 cámaras de hibridación de arrays de
1x3”.
1
-
Velocidad de rotación ajustable, con un rango entre 5-20 rpm.
-
Garantía de 2 años
Escáner:
-
Para portamuestras de 1x3” (25 mm x 75 mm), con un grosos entre 0,9 y 1,2
mm.
-
Equipo dispuesto de dos láseres, con óptima lectura de los cromóforos Cy5 y
Cy3.
-
Control automático de la potencia del láser para mantener constante la
emsión de ambos láseres.
-
Sistema automático de enfoque de los láseres en cada uno de los spots.
-
Límite de detección 0,05 cromóforos/micra2.
-
Ajuste de la intensidad de la señal (PMT ajustable de 1 a 100 %)
-
Rango dinámico extendido de al menos 6 órdenes de magnitud.
-
Automuestrador para más de 12 muestras.
-
Resolución seleccionable entre 5 y 10 micras (escalable hasta 2 micras para
arrays de alta densidad).
-
Lector de código de barras integrado.
-
Tiempo de escaneo de un portamuestras: inferior a 8 min. para la lectura de 2
canales a 5 micras de resolución.
-
Capacidad para trabajar con los análisis almacenados en el disco, al tiempo
que se estén adquiriendo nuevos datos.
-
Posibilidad de dividir la señal bicolor del escáner en dos imágenes de un solo
color.
-
Garantía 2 años
Ordenador de estación de control con sistema operativo Windows XP o superior.
-
Microprocesador con doble núcleo Pentium IV 2.0 GHZ o superior.
-
Memoria RAM de al menos 4GB
-
Disco Duro de al menos 60 GB
-
2 puertos USB
-
Pantalla LCD de al menos 19” y 1280X1024 de resolución
2
Software de control del escáner para la lectura del array.
-
Procesamiento
automático
de
las
imágenes
escaneadas
(grillado,
segmentación y extracción de la señal)
-
Versatilidad en la eliminación automática del ruido de fondo.
-
Normalización automática del cromóforo
-
Presentación estadística de los datos que permita valorar la calidad del
ensayo: registro de errores, desviaciones, relaciones señal/ruido, etc.
-
Archivo de registro de informes y de errores surgidos durante el
funcionamiento del equipo.
-
Color y tamaño de picos personalizados.
-
Software suficientemente contrastado en el mercado en cuanto a su validez y
precisión de resultados.
- Licencia para de uso 2 años
Software de interpretación y análisis de los datos obtenidos de la lectura del
array.
-
Acceso instantáneo a los datos más relevantes.
-
Enlace directo a bases de datos de información genética de referencia.
-
Versatilidad en la importación de datos desde distintas plataformas de arrays.
-
Selección automática de las alteraciones relevantes y de más interés, con
filtrado de datos poco relevantes pero con la posibilidad de selección manual
para acceso a todos los datos del análisis
-
Versatilidad en la visión de los datos, pudiendo combinar en una sola imagen
diferentes datos del análisis y distintos niveles de zoom.
-
Control de calidad de los ensayos y registro de los mismos.
-
Informe de las alteraciones recurrentes en nuestros análisis.
3
-
Resultados que sean fácilmente disponibles para otros usos, almacenables
para posteriores análisis y fácilmente exportables.
-
Software suficientemente contrastado en el mercado en cuanto a su validez y
precisión de resultados.
-
Soporte técnico online
Otros: curso de entrenamiento de 2 días en centro de entrenamiento y consultoría in situ
para resolución de dudas valoración de resultados
Murcia a 1 de junio de 2010
Fdo.: Asunción Fernández Sánchez
Directora del Centro de Bioquímica y Genética Clínica
4