Download Nomenclatura y Taxonomía de Procariontes

UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS
(Universidad del Perú, Decana de América)
FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS
ESCUELA ACADÉMICO PROFESIONAL DE MICROBIOLOGÍA Y PARASITOLOGÍA
DEPARTAMENTO ACADEMICO DE MICROBIOLOGÍA Y PARASITOLOGÍA
SYLLABUS
Semestre Académico: 2015-I
I. DATOS GENERALES
1.1. Nombre del Curso
1.2. Código del Curso
1.3. Número de créditos
1.4. Duración del Curso
1.5. Año de Estudios
1.6. Número de Horas
1.6.1. Teoría
1.6.2. Práctica
1.7. Pre Requisito
1.8. Profesora Responsable
1.8.1. Profesores de Teoría
: Nomenclatura y Taxonomía de Procariontes
: BO3172
:2
: 17 semanas
: 5to Electivo
:2
:0
: Evolución y sistemática, Bacteriología.
: Mg. Débora Alvarado Iparraguirre Prof. Principal DE
: Mg. Débora Alvarado Iparraguirre
1.8.2. Profesores de Práctica: Ninguno
1.8.3. Profesores Invitados
: Bach. Joe Hermosilla Jara
1.8.4. Asistentes de laboratorio: Ninguno
1.9. Horarios y ambientes
1.9.1. Teoría
: Jueves de 18-20h / Aula 409 y Sala de informática
II. SUMILLA
El curso permitirá al alumno revisar las bases de la taxonomía y sistemática de procariontes y
los códigos internacionales de nomenclatura. Se discutirán los criterios actuales utilizados para
la nominación y ubicación de las bacterias y arqueas dentro de las taxas.
III. OBJETIVOS GENERALES Y ESPECIFICOS
3.1. Objetivo general
 Comprender y analizar los principios que rigen la taxonomía y nomenclatura de
procariontes
3.2. Objetivos específicos
 Comprender los conceptos que sostienen la taxonomía y sistemática de procariontes.
 Comprender y utilizar el Codigo de nomenclatura de procariontes.
 Analizar los criterios utilizados en la actualidad para la nominación y la taxonomía de
bacterias y arqueas.
IV. EVALUACION
Se aplicará un sistema de evaluación permanente en el que se considerará el desempeño del
estudiante en actividades de discusión en seminarios de forma individual y dentro de grupos de
trabajo así como evaluaciones teóricas individuales para establecer el nivel de cumplimento de
los objetivos del curso.
4.1. Promedio final:
Se calculará sobre la base de los promedios parciales con los coeficientes que se indican a
continuación.
4.2. Promedios parciales:
Evaluación teórica escrita (2, ev. individual)
Seminarios (2, evaluación individual y grupal)
Estudio de casos y ejercicios (2, evaluación individual)
COEFICIENTE
0.5
0.3
0.2
Se podrá sustituir una de las evaluaciones teóricas del curso.
V. METODOLOGÍA
La enseñanza-aprendizaje del curso de Nomenclatura y Taxonomía de Procariontes
comprenderá:
1. Clases expositivas.
2. Seminarios y la resolución de ejercicios.
3. Taller informático.
4. Evaluación permanente.
5. Asesoramiento
en
línea
a
través del
Aula
virtual
de
la
UNMSM
http://biblioteca.unmsm.edu.pe/aulavirtual/ y el correo: [email protected];
[email protected]
VI. PROGRAMACIÓN
CLASE TIPO
SEMANA 1
T1
SEMANA 2
T2
SEMANA 3
T3
SEMANA 4
T4
SEMANA 5
T5
SEMANA 6
TI
TEMA
PROFESOR
Organización del curso.
Historia de la sistemática bacteriana: Desde los inicios
de la taxonomía de bacterias hasta el estudio
genealógico de los procariontes no cultivados.
D.Alvarado
Revisión de conceptos. Taxonomía, clasificación,
nomenclatura e identificación.
Sistemática de los procariontes. El Manual de Bergey.
D.Alvarado
El concepto de especie en procariontes
Impacto de la hibridación DNA.DNA en el concepto de
especie.
D.Alvarado
Sistemas de clasificación.
Jerarquías taxonómicas.
D.Alvarado
Caracteres utilizados en taxonomía de procariontes.
Taxonomía polifásica.
D.Alvarado
Recursos web en taxonomía y nomenclatura de
procariontes. Ejercicios.
D.Alvarado
SEMANA 7
Sem1 Tema: “Reconciliando la sistemática microbiana y la
D.Alvarado
genómica”.
J.Hermosilla
SEMANA 8
EV1
PRIMERA EVALUACIÓN Examen escrito
D. Alvarado
SEMANA 9
T6
SEMANA10
T7
SEMANA 11
T8
SEMANA 12
EC1
SEMANA 13
T9
Nomenclatura de procariontes. Aspectos históricos y
conceptos.
D.Alvarado
Código internacional de nomenclatura de bacterias.
D. Alvarado
Nominación de un nuevo microorganismo:
Consideraciones ortográficas.
D.Alvarado
Problemas frecuentes en la nominación de
microorganismos procariontes.
D.Alvarado
El código filogenético.
Código de barras en la identificación de bacterias:
Estudio de caso.
D. Alvarado
SEMANA 14
Sem2 Revisión de artículos para discusión.
SEMANA 15
Sem3 Revisión de artículos para discusión.
D.Alvarado
J.Hermosilla
D.Alvarado
J.Hermosilla
SEMANA 16
EV2
SEGUNDA EVALUACIÓN. Examen escrito.
D. Alvarado
SEMANA 17
EV3
SUSTITUTORIO DEL EXAMEN ESCRITO.
D. Alvarado
T, Teoría; Sem, Seminario; EV, Evaluación; TI, Taller informático; EC, Estudio de casos.
VII. BIBLIOGRAFÍA (textos, revistas y páginas web)
7.1 Material de consulta
Erko Stckebrandt. Molecular identification, systematics, and population structure of prokaryotes.
Berlin: Springer, 2006.
AAM. Reconciling microbial systematics & genomics.American Academy of Microbiology. 2006.
http://academy.asm.org/images/stories/documents/reconcilingmicrobialsystematicsandgenomic
sfull.pdf
International Code of Nomenclature of Bacteria Rev. 1990
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK8817/
Truper, HG. & Euzeby, J P. International Code of Nomenclature of Prokaryotes. Appendix 9:
Orthography.
IJSEM
vol.
59
no.
8 2107-2113.
2009.
http://ijs.sgmjournals.org/content/59/8/2107.full.pdf+html
7.2 Direcciones web de interés.
List of prokaryotics names with standing in nomenclature http://www.bacterio.net/
NCBI Taxonomy. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy.
Leibniz Institute DSMZ http://www.dsmz.de/
Bergey Manual Trust http://www.bergeys.org/
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology http://ijs.sgmjournals.org/
International Committee on Systematics of Prokaryotes http://icsp.org/