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XIX Verano de la Investigación Científica y Tecnológica del Pacífico
VERIFICACIÓN DE LA PRESENCIA DE MUTACIONES EN LOS GENES ANK
(AT3G09550) Y L7TR (AT3G09570) EN LA MUTANTE nhr1 DE Arabidopsis thaliana
Kenia Nelina García Sedano. Universidad de occidente campus Guasave. [email protected].
Asesor: Dr. Francisco Roberto Quiroz Figueroa. CIIDIR Unidad Sinaloa, Instituto politécnico Nacional,
[email protected]
PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA
El estrés abiótico es uno de los principales factores que afectan el crecimiento y la
productividad agrícola a nivel mundial. La mutante NHR1 de A. thaliana presenta
sensibilidad a ABA, sensibilidad salina, tolerancia a sequía y mayor longevidad. Hasta la
fecha, se conoce el locus NHR1, en esta zona se localizan 15 genes algunos de estos
con más de un transcrito. Varios trabajo se han publicados concernientes a la
caracterización de la mutante, sin embargo se desconoce el gen que confiere el fenotipo
mutante.
El análisis de su secuencia en la mutante nhr1, muestra que el gen L7TR tiene dos
mutaciones en la región promotora, la primera mutación en dirección 5’-3’, es un cambio
de base de una guanina (G) por una adenina (A) y la segunda mutación es una deleción
de una A y posiblemente otra mutación en la parte promotora del gen ANKIRINA. Esta
mutaciones fueron detectadas cuando se compararon los amplicones de estos genes
con la secuencia liberada (TAIR), en los últimos años se han detectado errores en la
secuenciación, por lo que en este proyecto se resecuenciarán las tres regiones en los
genotipos silvestre y mutante.
METODOLOGÍA
Como primer paso, se diseñaron oligonucleótidos específicos para los amplicones
localizados en los genes ANKIRINA y L7TR. Se realizó la extracción de ADN de
genotipos Col-0, nhr1 y nhr2 de dos semanas de edad por el método CTAB y se verificó
la calidad de la extracción mediante la cuantificación de absorbancia en
espectrofotómetro y gel. Posteriormente se realizaron los PCR para su posterior
secuenciación.
CONCLUSIONES GENERALES
Hasta este momento se han amplificado los tres amplicones en los tres genotipos, en las
semanas posteriores se purificaran los productos y secuenciaran.
© Programa Interinstitucional para el Fortalecimiento de la Investigación y el Posgrado del Pacífico
Agosto 2014