Download Utilización de la biotecnología para mejorar el estado

IX Foro de Colaboración Pública Privada sobre “Olivar y aceite de oliva”
Córdoba, 20 junio 2013
Dra. Blanca B. Landa
E-mail: [email protected]
Grupo AGR-136 “Sanidad Vegetal” PAIDI
Fitopatología de Sistemas Agrícolas Sostenibles
Departamento de Protección de Cultivos
Instituto de Agricutura Sostenible, Córdoba
Consejo Superior de Investigaciones Científicas
“Utilización de la biotecnología para mejorar el estado
sanitario y la calidad biológica de suelos de olivar”
Proyectos de Investigación:
● Effect of olive management systems on biological fertility and
phytosanitary status of olive orchards soils as determined by
biological and functional diversity of the rhizosphere ecosystem.
Ministerio de Educación y Ciencia (2008-2011). IP: BB Landa
● Genetic structure and antagonistic potential of microbial communities
associated with wild and domestic olive trees. Ministerio Ciencia e
Innovación-Acciones Integradas Hispano-Austriacas. CSIC-Graz
University of Technology (2009-2010). IP: BB Landa
● Sistema de secuenciación masiva de ADN para análisis genómico y
transcriptómico que favorezca el desarrollo de una Agricultura
Sostenible. CSIC10-1E-562. FEDER. Ministerio de Economía y
Competitividad (2010-2012). IP: BB Landa
● Diseño y aplicación de bioindicadores y metagenómica para la
caracterización del estatus fitosanitario y nivel de supresividad de
suelos de olivar a la Verticilosis. Cosejería Ciencia e Innovación,
Junta Andalucía (2011-2014). IP: B.B. Landa
Líneas de Investigación:
1. Caracterizar y aislar poblaciones naturales de antagonistas
microbianos para su uso como ACBs de la Verticilosis
> 3000 bacterias
Vd
PATENTE: P201031655
Bacterias
Líneas de Investigación:
2. Determinar el impacto de diferentes sistemas de manejo
(finca, suelo, etc.) en la calidad biológica y estado sanitario
de los suelos de olivar (Supresividad a Vercilosis)
Equipo Pirosecuenciador
Junior Roche (500 bp)
80.000 seqs/20 muestras
Líneas de Investigación:
454 FLX- Bar-coded pyrosequencing técnica para
caracterizar el metagenoma de un suelo (organismos y
genes): bacterias, hongos, micorrizas, archaea, eukariotas
Primer metagenoma de suelo y rizosfera de olivar
Número Total de secuencias: > 3.000.000 (150 suelos)
Número de secuencias
10000
Número
medio
y total
de
secuencias
por
Suelo
 Bacterias:
3.054 294.000
5000
0
1 5 9 13 17 21 25 29 33 37 41 45 49 53 57 61 65 69 73 77 81 85 89 93
 Hongos:
530
50.600
1500
1000
500
0
1 5 9 13 17 21 25 29 33 37 41 45 49 53 57 61 65 69 73 77 81 85 89 93
 Micorrizas:
205
19.752
(96 suelos)
1000
500
0
1 5 9 13 17 21 25 29 33 37 41 45 49 53 57 61 65 69 73 77 81 85 89 93
 Eukariotas:
1.570 150.700
3000
2000
1000
Total:
5.360 514.275
0
1 5 9 13 17 21 25 29 33 37 41 45 49 53 57 61 65 69 73 77 81 85 89 93
Líneas de Investigación:
2. Determinar el impacto de diferentes sistemas de manejo
(finca, suelo, etc.) en la calidad biológica
Landa, Montes-Borrego, Aranda, Soriano, Gómez & Navas-Cortés. AEENV (2013)
Líneas de Investigación:
2. Determinar el impacto de diferentes sistemas de manejo en
estado sanitario de los suelos de olivar (Supresividad a VO)
Landa, Montes-Borrego, Castillo, Navas-Cortés et al. En preparación (2013)
Líneas de Investigación:
1. Evaluación y diseño de procedimientos de análisis molecular
de V. dahliae en suelo y en planta (resistencia)
Gramaje, Pérez, Montes-Borrego, Navas-Cortés, Jiménez-Díaz, Landa. Phytopathology (2013)
Resultados “ofertables” de la Investigación:
●
●
●
●
Colección de >3000 aislados bacterianos “autóctonos” de la rizosfera
de olivo de distintas zonas de Andalucía con capacidad antagonista
frente V. dahliae (100 aislados caracterizados a nivel de especie
bacteriana y producción de metabolitos antifúngicos), algunos con
actividad potencial de biocontrol frente a la VO demostrada
Aplicación de técnicas de secuenciación masiva para el estudio de
poblaciones microbianas-nematodos-eukariotas residentes en suelo y
rizosfera de olivar y sus cambios por sistemas de manejo/aplicación
productos fitosanitarios...
Diferentes protocolos moleculares (PCR) para detectar V. dahliae en
suelo y planta: Evaluar resistencia en olivo y detectar infecciones
asintomáticas. Caracterizar la diversidad de poblaciones de V. dahliae
en zonas geográficas a distinta escala (parcela-región-país)
Evaluar el efecto de productos biológicos, fertilizantes de olivar y/o
formulaciones de productos químicos de síntesis, naturales y
fortificantes en el desarrollo de enfermedades y cambios en la
microbiota de suelos de olivar