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FACULTAD DE CIENCIAS NATURALES
DEPARTAMENTO DE CIENCIAS BIOLÓGICAS
Código-Materia:
Evolución (21026)
Requisito: Genética y laboratorio, Fisiología Animal, Fisiología Vegetal, Ecología General
Programa-Semestre: Octavo semestre
Período académico: 2016-2
Intensidad semanal: 3 horas
Créditos: 4 Créditos
Objetivos
Descripción
La evolución biológica es la transformación o cambio de las especies a través del tiempo que a
partir de un ancestro común ha dado origen a la gran diversidad de formas de vida que existen
sobre la Tierra.
General:
Conocer las principales ideas que soportan la evolución biológica, entender los mecanismos que
generan la variación genética, y comprender y aplicar los principales métodos filogenéticos
para el estudio de la historia de los seres vivos.
Terminales:
Al finalizar el semestre el estudiante estará en capacidad de:
 Comprender y explicar los procesos que conllevan a la evolución a diferentes escalas
(micro y macroevolución)
 Construir y utilizar hipótesis filogenéticas en estudios evolutivos
 Entender los conceptos básicos de la especiación
Específicos:
1.
Conocer, analizar, y explicar los conceptos básicos de la evolución biológica
2.
Conocer los mecanismos que permiten el cambio evolutivo
3.
Aprender a utilizar métodos filogenéticos para estudios evolutivos
De formación académica:
Unidad 1. Conceptos básicos de Teoría Evolutiva
Se introduce la teoría propuesta por Charles Darwin y la múltiples contribuciones de científicos
que en combinación dieron origen a la Síntesis Moderna. Se estudiarán diferentes métodos para
inferir las relaciones evolutivas entre organismos, utilizando matrices de información de
moléculas de ADN.
Unidad 2. Biogeografía, Filogeografía y Microevolución
Se introducen los conceptos de biogeografía y filogeografía, y los conceptos básicos de la
evolución molecular, y como las diferentes fuerzas de selección natural, deriva genética,
mutación, y migración producen cambios en las poblaciones.
Unidad 3. Macroevolución
Se introducen y discuten los conceptos de especie y especiación, la selección sexual, la coevolución, las tasas de especiación y extinción, las radiaciones adaptativas, y la evolución
genómica.
De formación en valores y capacidades
Las clases serán estructuradas de tal forma que enseñen al estudiante los conceptos básicos de
evolución, con miras a desarrollar la curiosidad y el pensamiento crítico frente al tema. Se
incentivará al estudiante a sintetizar los conceptos adquiridos en materias anteriores y ligarlos
al contexto evolutivo. La dinámica de la clase pretende incentivar la participación y discusión
de los estudiantes.
Metodología
Actividades del estudiante
Antes de clase:
El estudiante preparará las lecturas de los libros guía asignadas para la clase. Por turnos, según
la asignación del profesor, cada estudiante propondrá tres artículos recientes y relevantes para
el tema de la sesión asignada; el profesor escogerá un artículo que será leído por toda la clase.
Adicionalmente, el estudiante preparará el artículo científico asignado y entregará un resumen
de 1 hoja, describiendo las preguntas formuladas por los autores, los métodos utilizados, los
resultados obtenidos, y formularán comentarios y preguntas para ser discutidas en clase.
Durante la clase:
El profesor presentará de forma general los conceptos básicos del tema asignado para la sesión
y abrirá el espacio para que los estudiantes resuelvan ellos mismos las preguntas que surjan,
complementando las respuestas cuando sea necesario. Se asumirá una lectura y estudio del
material asignado por parte de los estudiantes. La discusión del tema, y el artículo científico
escogido, será dirigidas por el estudiante asignado con asistencia del profesor.
Después de la clase:
El estudiante revisará el material cubierto durante la clase.
Trabajo final:
El trabajo final consiste en la reconstrucción filogenética, a partir de datos moleculares
obtenidos en Genbank, de un grupo (e.g., especie, género) seleccionado por el estudiante. El
estudiante además decidirá qué método de inferencia filogenética utilizar a partir del
conocimiento adquirido en clase. El documento final se debe entregar en forma de artículo
científico y los resultados se deben presentar en forma de exposición oral.
Evaluación
Evaluación
Primer Parcial
Segundo Parcial
Tercer Parcial
Presentación y discusión de
Porcentaje
15%
15%
15%
15%
Unidad (Fecha)
1 (semana 6)
2 (semana 11)
3 (semana 16)
Artículo propuesto por el estudiante y
artículo científico
Talleres Prácticos (2)
Trabajo final
7.5% c/u
25%
aprobado por el profesor
Resolución del cuestionario guía
Artículo científico de reconstrucción
filogenética
Bibliografía
Libros guías:
Losos, J.B., D.A. Baum, D.J. Futuyma, H.E. Hoekstra, R.E. Lenski, A.J. Moore, C.L. Peichel, D.
Schluter, M.C. Whitlock. (eds). 2014. The Princeton Guide to Evolution. Princeton University
Press. Woodstock, Oxfordshire, UK.
Futuyma, D.J. 2013. Evolution 3rd. Edition. Sinauer Associates Inc. Sunderland, Massachussetts,
USA.
Otras referencias:
 Coyne, J., H.A. Orr. 2004. Speciation. Sinauer Associates Inc. Sunderland, Massachussetts,
USA.
 Felsenstein, J. 2003. Inferring Phylogenies. Sinauer Associates Inc. Sunderland,
Massachussetts, USA.
 Page, R.D.M., E.C. Holmes. 2004. Molecular Evolution: A Phylogenetic Approach. Blackwell
Science. Malden, Massachussetts, USA.
 Paradis, E. 2012. Analysis of Phylogenetics and Evolution with R. 2nd. Edition. Springer. New
York, USA.
 Schluter, D. 2000. The Ecology of Adaptive Radiation. Oxford Series in Ecology and Evolution.
Oxford University Press. Oxford, UK.
 Templeton, A. 2006. Population Genetics and Microevolutionary Theory. John Wiley & Sons.
Hoboken, New Jersey, USA.
Código - Evolución 21026
Planeación para 2016-2
Profesor: María del Rosario Castañeda
Fechas a tener en cuenta
Inicio del curso: 2 de Agosto 2016
Primer parcial: 6 de Septiembre 2016
Segundo parcial: 11 de Octubre 2016
Tercer parcial: 15 de Noviembre 2016
Finalización de clases: 18 de Noviembre 2016
Entrega de notas individuales: 28 de Noviembre 2016
Planeación por sección:
Fecha
Semana Sesión
semana
08/01/2016 1
1
2
08/08/2016 2
1
2
08/15/2016 3
1
08/22/2016 4
2
1
2
08/29/2016 5
1
2
09/05/2016 6
09/12/2016 7
09/19/2016 8
09/26/2016 9
10/03/2016 10
10/10/2016 11
10/17/2016 12
1
2
1
2
1
2
1
2
1
2
1
2
1
Contenido
Introducción
Qué es la Evolución - Historia de las ideas en evolución
Historia de las ideas en evolución 2
Registro fósil
Eventos significativos en la evolución de procariota,
eucariota, plantas y animales
Evolución humana
Árboles filogenéticos: Inferencia e interpretación
Taller práctico: Obtención secuencias de DNA (Genbank),
alineamiento (MAFFT, Clustal X), edición de matrices
(Mesquite), selección del modelo evolutivo (jModelTest)
Evolución molecular: reloj molecular, calibración de
filogenias
Taller práctico: Selección de particiones de datos
(PartitionFinder), análisis de máxima verosimilitud
(RAxML, Garli), y Bayesiano (MrBayes, BEAST)
Parcial 1
Taller práctico: Informe preliminar del trabajo final
Biogeografía
Filogeografía
Principios de variación genética: Principio de HardyWeinberg
Selección natural
Adaptación
Deriva genética y coalescencia
Mutación
Migración
Parcial 2
Especies y especiación: Taxonomía
Conceptos de especie
10/24/2016 13
10/31/2016 14
11/07/2016 15
11/14/2016 16
11/21/2016 17
2
1
2
1
2
1
2
1
2
1
Patrones de especiación
Selección sexual
Co-evolución
Macroevolución: Tasas de evolución 1
Tasas de evolución 2
Radiación adaptativa
Evolución de genes y genomas
Parcial 3
Presentación de trabajos finales
Presentación de trabajos finales