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Transcript
ROL DE LA GENETICA EN EL ANALISIS
DE RIESGO CARDIOVASCULAR
Dr. Francisco Pérez-Bravo
Laboratorio de Genómica Nutricional
Departamento de Nutrición
Facultad de Medicina
Universidad de Chile
[email protected]
GENERALIDADES
• LA ENFERMEDAD CARDIOVASCULAR (ECV) CONSTITUYE LA PRINCIPAL CAUSA
DE MUERTE EN EL MUNDO
• EN EL AÑO 2002 FALLECIERON 16,7 MILLONES DE PERSONAS POR ESTA
CAUSA
• CONSTITUYEN EL 40% DE TODAS LAS DEFUNCIONES
• LA ECV SE DIVIDE EN CUATRO GRANDES GRUPOS:
•ENFERMEDAD ISQUEMICA DEL CORAZON
•ENFERMEDAD CEREBROVASCULAR
•ENFERMEDAD VASCULAR PERIFERICA
•OTRAS
• EN LA ACTUALIDAD, MAS DEL 80% DE LAS DEFUNCIONES POR ECV SE
PRODUCEN EN PAISES DE INGRESO SOCIOECONOMICO MEDIO Y BAJO
• ESTIMACIONES DE LA OMS CALCULAN ALREDEDOR DE 22 MILLONES DE
DEFUNCIONES ANUALES PARA EL AÑO 2015
UNA MIRADA AL RIESGO……………
EXISTEN MUCHAS FORMAS DE ESTABLECER LA
MEDIDA DE RIESGO:
•
•
•
•
GENÉTICA
HISTORIA FAMILIAR
CARACTERÍSTICAS PERSONALES
EDAD, GÉNERO, OBESIDAD, DIETA, EJERCICIO,
ESTRÉS, TABAQUISMO……....
• MEDICIONES: PRESIÓN SANGUÍNEA,
COLESTEROL, LDL, HDL, TRIGLICÉRIDOS, PCRus,
ETC…….
POR QUÉ IDENTIFICAR A LOS GENES
INVOLUCRADOS CON LA ECV ?
•
•
•
•
•
LA ECV ES MULTIFACTORIAL
GENES + AMBIENTE
SE PUEDE HEREDAR EL RIESGO GENÉTICO
SE PUEDE ADOPTAR UN ESTILO DE VIDA DE RIESGO
SI BIEN NO PODEMOS ALTERAR NUESTRA CARGA
GENÉTICA, PODEMOS AMINORAR NUESTRA CARGA
AMBIENTAL ASOCIADA AL RIESGO
SI PODEMOS IDENTIFICAR ESTA PREDISPOSICIÓN GENÉTICA A LA ECV A TRAVÉS
DE UN “TEST GENÉTICO”, ES PROBABLE QUE SEAMOS MÁS CONCIENTES DE LAS
MODIFICACIONES QUE SE DEBEN HACER EN EL ESTILO DE VIDA
ECV: UNA ENFERMEDAD COMPLEJA
GEN MAYOR
POBLACIÓN GENERAL
E. MONOGÉNICA
X
MUTACIÓN
50 A 100 000
GENES
E. COMPLEJA
POLIGÉNICA/MULTIGÉNICA
GEN MAYOR
1
INTERACCIÓN
GEN - AMBIENTE
2
GENES DE SUSCEPTIBILIDAD
3
4
GEN PROTECTORES
INTERACTION
GEN - GEN
(EPISTASIS)
HETEROGENEIDAD DE LA ECV
LOCUS
MECANISMO
POLIGÉNICO
MECANISMO POR
EPISTASIS GENÉTICA
CHR1
CHR 4
CHR21
CHR 19
APOE
E4
E2
HETEROGENEIDAD
ALÉLICA
RIESGO
AUMENTADO
RIESGO MULTIPLICATIVO
LS=L2XL3
RIESGO
REDUCIDO
RIESGO ADITIVO
LS=L1+L2+L3
BASE GENETICA DE LA ECV
• LA HISTORIA FAMILIAR DE ECV SE ASOCIA CON UN SUSTANCIAL INCREMENTO DEL
RIESGO
• LA HEREDABILIDAD DE LA ECV HA SIDO ESTIMADA EN UN RANGO DE 40 – 60 %
• ES UNA ENFERMEDAD POLIGÉNICA Y SÓLO EN DESÓRDENES MUY ESPECIFICOS COMO
LA HIPERCOLESTEROLEMIA FAMILIAR, EXISTE UNA MUTACION CAUSAL DIRECTA DEL
FENOTIPO
SE HAN PLANTEADO DOS MODELOS DE HEREDABILIDAD PARA LA ECV:
• COMMON DISEASE/COMMON VARIANT (CDCV): LA SUSCEPTIBILIDAD DE LA ECV SE
DEBE A LA ACCIÓN CONJUNTA DE MÚLTIPLES VARIANTES COMUNES COMPARTIDAS POR
LA POBLACIÓN
• RARE VARIANT HYPOTHESIS (RVH): LA SUSCEPTIBILIDAD DE LA ECV SE DEBE A LA
HEREDABILIDAD DE ALELOS RAROS, CON GRAN IMPACTO FENOTIPICO
APROXIMACIONES METODOLÓGICAS
Existen dos aproximaciones principales que relacionan genes y
enfermedad
•
La selección de genes que “aparentan” un rol esencial en la
ECV , de acuerdo a un presunto papel biológico (tecnología de
SNPs= single nucleotide polymorphisms)
•
La identificación de grandes regiones cromosómicas que
muestran asociación con ECV entre familias nucleares (GWS=
genome wide scan). Esta metodología ha logrado “proponer”
loci mayores de susceptibilidad en varios cromosomas 2, 5, 10,
11 y 20
IMPORTANCIA A NIVEL DEL ADN
MUTACIONES
POLIMORFISMOS
POCO COMUNES (<1%)
COMUNES (10 - 20%)
ALTA PENETRANCIA
BAJA PENETRANCIA
BAJO RIESGO ATRIBUÍBLE
ALTO RIESGO ATRIBUÍBLE
ALTO RIESGO INDIVIDUAL
BAJO RIESGO INDIVIDUAL
QUANTITATIVE TRAIT LOCUS (QTL) Y GENES CANDIDATOS
QTL
GEN INVENTADO
VARIACIÓN SECUENCIAS
GEN CANDIDATO
SECUENCIACIÓN
GEN
TIPOS SALVAJES Y
VERSIONES ALÉLICAS
ESTUDIOS POBLACIONALES
ESTUDIOS FUNCIONALES
ESTUDIOS CLÍNICOS
ANIMALES TRANSGÉNICOS
ESTUDIOS IN VITRO
RIESGO MONOCIGOTICO
OR = 1.2
ALELOS COMUNES/
ENFERMEDADES COMUNES
OR = 1.3
OR = 1.5
OR = 2.0
MAFs = Minor Alleles Frequencies
CARACTERÍSTICA DEL ESTUDIO
COMENTARIO
Criterios y definiciones de la ECV
Diversidad de estudios no replicables
Fenotipos ?
Inflamación
Resistencia a la Insulina
Hipertrigliceridemia
Hiperhomocistinemia
Hipertensión
Limitados tamaños de muestra en la
mayoría de los estudios
Potencial error estadístico
Sesgo en selección de familias
Bias y estratificación poblacional?
Modo de Herencia?
Autosómica dominante?
Monogénica ?
Ligada al cromosoma X?
Penetrancia Variable
Dificultad para asignación fenotípica
(afectados versus no afectados)
Heterogeneidad de locus genético
Más de 20 regiones génicas asociadas
Interacción Ambiental
Adaptación compensatoria?
ECV: FENOTIPOS INTERMEDIOS Y FINALES
FOLATOS
OBESIDAD
RESISTENCIA
INSULINICA
HOMOCISTEINA
FUNCION ENDOTELIAL
(NOS; NADH)
EJERCICIO
TROMBOSIS
(FGN; PAI-1)
ECA, ATE 1
HTA
Na+
ESTRES
ECV
METABOLISMO
LIPIDICO
LDL, ApoE, HDL
DIETA
INFLAMACION
IL-6; IL-1β
TABACO
EDAD
SEXO
GENES Y MUTACIONES RELACIONADAS A LA ECV
PATOLOGIA ASOCIADA
GENES
MUTACIONES
HIPERCOLESTEROLEMIA
FAMILIAR
R-LDL
NULA (112insA,
W18X) C358Y,
C1301G, G829A
Apo B
Arg3500Gln
DEFECTO FAMILIAR
de Apo B
FENOTIPO
ECV, ICTUS,
Vascular Periférica
SINDROME DE HDL BAJA
Apo A1
Deficiencia de Apo A1
ENFERMEDAD DE TANGIER
Transportador ABC1
Enfermedad de Tangier
COAGULACION
Protrombina
Factor de V de Leiden
PTA20210G
HIPERTENSION
Sintasa de Aldosterona
11 β hidroxilasa
Canal de Na+
R. Mineralocorticoides
Mosaicismo
HOMOCISTINURIA
DIABETES TIPO 2
Hiperhomocisteinemia
Glucoquinasa
Factor Nuclear Hepático
MODY 1, 2 y 3
Diabetes tipo 2 en jóvenes
PATOLOGIA ASOCIADA
GENES
MUTACIONES
LDL
VLDL
Apo E
E4 (Cys112Arg)
E2 (Arg158Cys)
Apo B100
SpI/D
EcoRI
Msp I
R-LDL
PvuII
Lp (a)
Apo A
Apo (a)
HDL TRANSPORTE
INVERSO
LPL
Asp9Asn
Asn291Ser
Gly188Glu
Ser477Ter
(Hind III, Ct)
CETP
TaqI-B
PON1
-192Q/R 55 L/M
ABC1
Apo A1-CIII-AIV
Lipasa Hepática
-477 T/C
Apo A1
FENOTIPO
LDL
LDL
LDL
LDL
Lp (a) > 30 mg/dl
HDL
TG
HDL
TG
HDL
TG
HDL
HDL
Apo A1
PATOLOGIA ASOCIADA
GENES
MUTACIONES
RESISTENCIA
INSULINICA
IRS-1
IRS-2
Gly972Arg
Gly1057Asp
HTA
AGT
ECA
R-AT1
CMA
CYP11B2
235 M/T
I/D
A/C
A-1905C
-344 T/C
SISTEMA
ADRENERGICO
ADRB2
Arg16Gly
Gln27Glu
Hipertrofia
FUNCION
ENDOTELIAL
NOS3
P22fHox
NAD(P)H Oxidasa
G894T
C/T 242
Vasodilatación
IL-6
IL-1β
CCR
CD14R
G/C -174
C(-511)T
CCR5
C(-260)T
FGB
PAI-1
FACTOR VII
RECEPTOR IIb/IIIa
G/A -455
4G/5G (-675)
R353Q
GPIIIa PIA1-PIA2
INFLAMACION
TROMBOSIS
FENOTIPO
Síndrome Metabólico
SOP
HTA
ECA
HTA
HTA
Aldosteronismo
Vasodilatación
IL-6
FGN
FGN
PAI-1
FVIIa
AGREGACION
EVC: COMPLEJA RELACION CON EL AMBIENTE
DESAFIO AMBIENTAL
DIETA, TABACO, ETC……
LAS VARIACIONES GENÉTICAS
PREDISPONEN A ENFERMEDAD “SOLO” EN
PRESENCIA DE UN FACTOR AMBIENTAL
DIMENSIÓN DEL RIESGO
“NORMAL”
GEN
VARIANTE
GEN
BAJO
ALTO
100%
FUNCIÓN
SALUD
SALUD
75-85 %
FUNCIÓN
SALUD
ENFERMEDAD
PREDISPOSICION GENETICA
RIESGO ALTO
AMBIENTE
ESTRESADO
RIESGO MEDIO
AMBIENTE
REGULADO
RIESGO BAJO
PROTEGIDO
PREDISPUESTO
¿QUÉ GENES RECIBIMOS ?
SCANING GENÉTICO AMPLIO PARA CONSUMIDORES DE GRASA
LOCALIZADO EN EL CROMOSOMA 1 (SIBPAL)
A
0.00001
AMPD1 (p=0.00006)
P-value
0.0001
0.001
0.01
0.1
1
0
50
100
150
200
250
LDB Comp distance (Mb)
“GLOTONUS GENOTYPE” CONCEPTO APOYADO POR DIVERSOS ESTUDIOS QUE
DEMUESTRAN UN COMPONENTE GENÉTICO HACIA EL CONSUMO DE DIETAS RICAS EN
GRASAS, MACRONUTRIENTES Y ENERGÍA
ESTUDIO DE LIGAMIENTO PARA INACTIVIDAD FÍSICA SOBRE EL
CROMOSOMA 2 (QUEBEC FAMILY STUDY)
0.001
p-value
0.01
0.1
1
0
50
100
150
200
250
Chromosome 2 map position, cM
“PEREZOSOUS GENOTYPE” LA PRESENCIA DE COMPONENTES GENÉTICOS ASOCIADOS A
LA INACTIVIDAD FÍSICA (FENOTIPO PAL) TAMBIÉN HA SIDO PROPUESTA CON
LOCALIZACIÓN CROMOSOMAL
REGULACIÓN GÉNICA POR NUTRIENTES
NUTRIGENOMICA Y ECV MÁS ALLA DE LA ASOCIACIÓN POLIMORFICA
EFECTO DE LA VARIANTE (-75A
G)
DEL GEN APO A1 FRENTE A UN ESTIMULO DIETARIO
APO A1
+
HDLc
PROTECTOR
CVD
BAJO HDL
EL GEN DE APOA1 ES
REGULADO POR PUFAs
Dieta baja en grasa
Dieta mixta
Dieta alta en grasa
EL CONSUMO DE LOS ÁCIDOS GRASOS EPA Y DHA INFLUENCIAN LA FUNCIÓN ENDOTELIAL
EN FORMA DIFERENCIAL SEGÚN EL POLIMORFISMO DE LA ENZIMA ÓXIDO NÍTRICO
SINTETASA
SON LAS PRUEBAS GENÉTICAS LA RESPUESTA ?
SÓLO SERÁN UTILES SÍ:
• ELLAS ADICIONAN MAYOR INFORMACIÓN
PREDICTIVA
• PUEDEN TOMAR EN CUENTA LA INFLUENCIA
AMBIENTAL
• SON REALIZABLES, REPRODUCIBLES E
INTERPRETABLES
SI ESTUVIERA DISPONIBLE, USTED TOMARÍA UN
“TEST” GENÉTICO PARA RIESGO DE ECV?
ESTARÍA DISPUESTO A CAMBIAR SU ESTILO DE VIDA SI SE
DEMUESTRA “GENÉTICAMENTE”
QUE USTED ESTÁ EN RIESGO?
DISMINUIR
EL ESTRÉS
EJERCICIO
MEDICAMENTOS
DIETA
DEJAR DE FUMAR
APO E Y HÁBITO TABÁQUICO
FUMAR INCREMENTA EL RIESGO EN TODOS LOS GRUPOS
DEJARÍA USTED DE
FUMAR ?
No Fumador
Fumador
3,5
3
Riesgo Relativo
3
2,5
2
1,8
1,5
1,2
1
0,5
RIESGO
PROMEDIO
POBLACIONAL
0
E3-E3
GENOTIPO
COMÚN
E3-E2
E3-E4
GENOTIPO
SENSIBLE
GENETICA Y ECV: buenas y malas noticias
BUENAS NOTICIAS
MALAS NOTICIAS
•
•
•
•
• ECV ES COMPLEJA
• MÚLTIPLES GENES &
AMBIENTE
• EFECTO DE UN GEN ÚNICO ES
UNA CONDICIÓN RARA
(GRAN EFECTO)
• EFECTO MULTIGÉNICO
PEQUEÑO (MUCHOS GENES
INVOLUCRADOS)
ESTIMACIÓN DE RIESGO
MUCHOS GENES CANDIDATOS
POSIBLES DE MEDIR
HF ES UN BUEN EJEMPLO A
SEGUIR
• PRUEBA GENÉTICA,
SCREENING FAMILIAR
LA NATURALEZA CARGA EL ARMA (genes), PERO NOSOTROS
PODEMOS QUITAR EL DEDO DEL GATILLO (ambiente)
USTED PAGARÍA POR
UN SNP-CARDIOVASCULAR-CHIP
Usted posee 100 variantes
de riesgo para ECV
Usted posee 80 variantes
de riesgo para ECV
USTED PAGARÍA POR
UN ARRAY- CARDIOVASCULAR-CHIP
Usted posee 10 variantes de
riesgo (SNPs) para ECV
Cuando Usted se expone
a una baja concentración
de EPA gatilla la expresión de
10 genes respuesta de alto
riesgo