Download Guía de síntesis de proteínas
Document related concepts
Transcript
SINTESIS DE PROTEINAS Depto BIOLOGIA RNL/rnl MRA/mra DOGMA CENTRAL El dogma central indica que la información fluye del ADN a las proteínas en una sola dirección, así el genotipo determina el fenotipo, dictando la composición de las proteínas. Sin embargo, las proteínas no alteran al genotipo, excepto en algunos casos como en el proceso de transcripción inversa, en donde la información codificada por algunos virus que contienen ARN se transcribe al ADN por acción de la enzima transcriptasa inversa. El hecho de que la información fluye del ADN al ARN y de éste a las proteínas, confirmó la teoría darwinista de la evolución que afirma que la selección natural actúa sobre las variaciones heredables que se encuentran en el ADN. TRANSCRIPCION El proceso de síntesis proteica ocurre en los ribosomas que se encuentran fuera del núcleo, el ADN se encuentra dentro del núcleo y no sale de él, es por esto que a pesar de contener la información genética no puede servir de molde directo para la formación de proteínas y por ello debe ocurrir la transcripción, que es un proceso de copia del ADN para formar ARN (En este caso ARN m). Para que se pueda realizar la síntesis el ADN transfiere su información al ARNm, y además origina otros dos tipos de ARN que colaborarán en la traducción del mensaje: El ARN de transferencia (ARNt) que ubica a cada aminoácido en su lugar correspondiente según las indicaciones del ARNm, y El ARN ribosómico (ARNr) que integra (junto con proteínas asociadas) el ribosoma, que es asiento celular del proceso. La síntesis de estos distintos ARN a partir de determinados segmentos de ADN se denomina transcripción. Cada sector del ADN cuya transcripción da como resultado una molécula de ARN se llama gen estructural. Esta denominación esta relacionada con los segmentos de donde se transcriben ARNm, que luego se traducirán dando proteínas con alguna actividad celular (catalítica, estructural, mecánica, de transporte, etc). Además de los genes estructurales, el ADN presenta otros segmentos relacionados con la regulación de la expresión génica; llamados reguladores e incluyen: Sectores del ADN que no se transcriben, sino que funcionan como "conmutadores" que "prenden" (permiten) o "apagan" (impiden) la transcripción de una proteína o varios genes estructurales; Sectores del ADN que se transcriben y se traducen posteriormente originando proteínas llamadas represoras, capaces de bloquear la transcripción de genes estructurales. Para la síntesis de ARN se requieren: A) Unidades de transcripción: los ribonucleótidos de adenina, guanina, citosina y uracilo. B) Fuente de energía: dado que el proceso es anabólico y endergónico, se requiere energía que es aportada por los mismos ribonucleótidos-tri-fosfato (ATP, GTP, CTP y UTP). C) Información: los ARN copian la información del ADN, cada ARN copia un sector específico D) Enzima específica: la formación de los ribonucleótidos para formar las cadenas de los distintos ARN es catalizada por una enzima que se denomina transcriptasa o ARN polimerasa-ADN dependiente. E) Lugar celular del proceso: La transcripción se realiza en el núcleo, durante los períodos denominados G1 y G2 de la interfase, cuando el ADN se encuentra como cromatina. TRANSCRIPCION EN EUCARIONTES La transcripción de un gen se inicia con la descondensación de la cromatina (ADN asociado a proteínas). Una vez que el ADN se encuentra en estado laxo, una serie de enzimas producen la separación de las hebras de ADN (helicasas).Este proceso permite que la maquinaria de transcripción reconozca y lea aquella hebra de ADN que contiene la secuencia del gen a transcribir. Al mismo tiempo, proteínas llamadas factores de transcripción detectan la localización de un gen uniéndose a una región cercana al sitio de inicio (secuencia de tres nucleótidos TAC). Los factores de transcripción facilitan la actividad de las enzimas de transcripción. Una vez que el factor de transcripción se ha unido a una región cercana al gen por transcribir, la enzima ARN polimerasa inicia la lectura del ADN en la secuencia TAC y la síntesis del ARNm complementario y finaliza al llegar a una secuencia de término conformada por uno de los siguientes trinucleótidos: ATT, ACT o ATC. Cada molécula de ARNm tiene un tiempo de vida limitado, que puede variar entre 30 minutos a10 horas o más. Una vez que el ARNm participa en la síntesis de proteínas muchas de estas moléculas son degradadas por enzimas especiales llamadas endonucleasas. Una vez que se ha sintetizado el ARNm, en las células eucariontes, esta molécula sufre una serie de modificaciones dentro del núcleo, antes de ser transportado al citoplasma. Este proceso se denomina maduración del ARNm y se caracteriza por la eliminación de segmentos de ARNm que no participan en la síntesis de proteínas .Estos segmentos se denominan intrones y son eliminados por enzimas especiales que se encuentran en el núcleo (ribonucleoproteínas). Los segmentos de ARN que participan en la síntesis de proteínas se denominan exones, y son unidos entre sí por otro grupo de ribonucleoproteínas. Por lo tanto, en las células de organismos eucariontes, la maduración del ARNm incluye un proceso de corte de intrones y empalme de exones, lo que determina que la molécula de ARNm recién transcrita, sea más larga, que la molécula de ARNm maduro. El corte de intrones y empalme de exones (proceso denominado splicing) se realiza a través de un complejo formado por proteínas y ARN, llamado spleisosoma. Otra modificación que sufre el ARNm, en eucariontes, corresponde a la adición de largas secuencias de adenina en el extremo 3` prima de la molécula de ARNm. Este proceso se denomina poliadenilación y a la larga secuencia de 150 a 200 nucleótidos de adenina se le denomina cola poliA. Esta cola de poli A constituye una señal, para "exportar" la molécula de ARNm hacia el citoplasma, donde la síntesis de proteínas se lleva a cabo y además protege al ARNm de ser digerido por enzimas nucleasas. En el extremo 5` prima se añade un capuchón de guanina metilada que también impide el ataque de nucleasa. Por lo tanto el ARNm queda protegido por ambos extremos para salir al citoplasma. TRADUCCION. SINTESIS DE PROTEINAS La síntesis de proteínas ocurre en los ribosomas estructurados por dos subunidades, una grande y una pequeña, cada una formada por ARNr y proteínas específicas. Para la síntesis de proteínas, también se requiere de moléculas de ARNt, que están plegadas en una estructura secundaria con forma de hoja de trébol. Estas moléculas pequeñas pueden llevar un aminoácido en un extremo y el anticodón. La molécula de ARNt es el adaptador que aparea el aminoácido correcto con cada codón de ARNm durante la síntesis de proteínas. Hay al menos un tipo de molécula de ARNt para cada tipo de aminoácido presente en las células. Las enzimas conocidas como aminoacil-ARNt sintetasas catalizan la unión de cada aminoácido a su molécula de ARNt específica. El flujo de información en eucariotas es: La transcripción ocurre en el núcleo y el ARN, luego de sufrir un procesamiento, se dirige al citoplasma donde se produce la síntesis de proteínas. La síntesis de proteínas ocurre en varias etapas: a) Iniciación: La subunidad ribosómica más pequeña se une al extremo 5' de una molécula de ARNm. La primera molécula de ARNt, que lleva el aminoácido modificado Met, se acopla con el codón iniciador AUG de la molécula de ARNm. La subunidad ribosómica más grande se ubica en su lugar, el complejo ARNt-Met ocupa el sitio P (peptídico). El sitio A (aminoacil) está vacante. El complejo de iniciación está completo ahora. b) Elongación: Un segundo ARNt, con su aminoácido unido, se coloca en el sitio A y su anticodón se acopla con el ARNm. Se forma un enlace peptídico entre los dos aminoácidos reunidos en el ribosoma. Al mismo tiempo, se rompe el enlace entre el primer aminoácido y su ARNt. El ribosoma se mueve a lo largo de la cadena de ARNm en una dirección 5' a 3', y el segundo ARNt, con el dipéptido unido, se mueve desde el sitio A al sitio P, a medida que el primer ARNt se desprende del ribosoma. Un tercer aminoacil-ARNt se coloca en el sitio A y se forma otro enlace peptídico por la acción de la enzima peptidil transferasa. La cadena peptídica naciente siempre está unida al ARNt que se está moviendo del sitio A al sitio P y el ARNt entrante que lleva el siguiente aminoácido siempre ocupa el sitio A. Este paso se repite una y otra vez hasta que se completa el polipéptido. c) Termino: Cuando el ribosoma alcanza un codón de termino (en este ejemplo UGA), el polipéptido se escinde del último ARNt y el ARNt se desprende del sitio P. El sitio A es ocupado por un factor de liberación que produce la disociación de las dos subunidades del ribosoma. A partir del DNA cromosómico se transcriben: diferentes moléculas de ARNr que, combinadas con proteínas específicas, forman los ribosomas; los diferentes tipos de moléculas de ARNt correspondientes a los distintos aminoácidos y los ARNm, que llevan la información para la secuencia de aminoácidos de las proteínas. CODIGO GENETICO Los genes se organizan en base a 4 nucleótidos (A, U, C y G), su unidad funcional está formada por 3 nucleótidos: el triplete o codón, por ejemplo AUU, CAG, CCA, etc. El número máximo de codones diferentes que se pueden formar son 64 (43). El conjunto de estos 64 codones del ARNm conforman el código genético, el cuál está encargado de codificar los 20 aminoácidos diferentes que existen en la naturaleza. Este código genético es universal, ya que todos los organismos usan los mismos codones para determinar los aminoácidos. 3 de los 64 codones se denominan sin sentido debido a que no determinan ningún aminoácido y su rol es el de señalar el término de la traducción (stop). Los 61 codones restantes se encargan de determinar los 20 aminoácidos diferentes por lo que un aminoácido puede ser determinado por más de un codón diferentes, ejemplo, el aminoácido valina es determinado por los codones GUU, GUC, GUA y GUG. Esta propiedad algunos la han llamado ambigüedad o degeneración del código genético. Resumiendo el código genético presenta las siguientes características: - Es universal Es ambiguo o degenerado Está organizado en secuencia de 3 nucleótidos, cada secuencia es llamada codón Presenta codón de inicio Presenta codón de término MUTACIONES Es una alteración en la secuencia de ADN. Puede ser desde una alteración de un solo par de bases nucleotídicas hasta la ganancia o pérdida de cromosomas enteros, son causadas por daños producidos por agentes físicos, biológicos o químicos o por errores durante la replicación y la reparación del ADN. Una consecuencia de las mutaciones a corto plazo puede ser una enfermedad genética, a largo plazo las mutaciones son esenciales para nuestra existencia, ya que, no habría cambio y no podríamos evolucionar. Las mutaciones se dividen en: 1. Mutaciones génicas. 2. Mutaciones cromosómicas estructurales. 3. Mutaciones cromosómicas numéricas o genómicas. Mutaciones génicas Son las que producen la alteración de la secuencia de nucleótidos de un gen. Las mutaciones génicas son de dos tipos: 1. sustituciones: provocan la alteración de un único triplete y, por tanto, salvo que indiquen un triplete de parada, o un aminoácido del centro activo de una enzima, pueden no ser perjudiciales. a. transición: Si se cambia una base púrica por otra púrica, o bien una base pirimídica por otra pirimídica. b. transversión: En el caso de que el cambio sea púrica por pirimídica o viceversa. 2. pérdida o inserción de Nucleótidos: generan una alteración en el orden de lectura. Son de dos tipos adiciones y deleciones. No Todas las mutaciones génicas afectan la estructura y función de las proteínas, ya que al ser el código genético degenerado, si modificamos una base nitrogenada puede coincidir que el codón obtenido indique el mismo aminoácido. Cambio sinónimo: El codón producto de la mutación especifica el mismo aminoácido, como el código genético es DEGENERADO produce la misma proteína Cambio NO-sinónimo: La mutación altera el codón y esto cambia el aminoácido; su efecto depende de que aminoácido cambió y su posición en la proteína. Mutación sin sentido: Convierte un codón de aminoácido en un codón de termino. El efecto en la proteína depende de cuantos aminoácidos perdió con el corte prematuro, normalmente es drástico. Inverso a lo anterior: un codón de terminación se convierte a uno que especifica aminoácidos y la cadena de polipéptidos tiene mayor extensión. Un ejemplo de mutación génica ocurre con la Anemia Falciforme, La Hemoglobina normal contiene el aminoácido Ácido Glutámico que se cambia por el aminoácido Valina produciendo la anemia falciforme. La diferencia proviene de un cambio en el momento de la trascripción donde una adenina se cambia por un uracilo. Este mínimo cambio de una base, cambia el aminoácido y es suficiente para provocar la enfermedad, ya que se producen glóbulos rojos en forma de Hoz y se produce la liberación del grupo hemo, que interacciona con la membrana de los glóbulos rojos, causando hemólisis y la consecuente anemia. La enfermedad está acompañada de varios síntomas característicos. Existen otras enfermedades producidas por alteraciones en las bases nitrogenadas como la Fibrosis quística, Daltonismo, Distrofia muscular, Hemofilia, Talasemia, Diabetes mellitus, Anemia de células falciformes, Albinismo, en este caso, la carencia de pigmentación en la piel pelos y ojos, se presenta debido a la incapacidad del organismo para elaborar un pigmento conocido como melanina. La mayoría de los albinos carece de una de las enzimas necesarias para producir la melanina. Sin embargo otros albinos tienen la enzima, pero esta no puede penetrar en las células pigmentarias. Ambas formas de albinismo se heredan como recesivos autonómicos. ACTIVIDADES 1. ¿Cómo se denomina a la última molécula que se forma por transcripción? 2. ¿A qué se refiere el procesamiento del ARN después de su formación? 3. Caracterice qué son los exones e intrones 4. ¿Qué es el splicing?dibuje 5. ¿Cuál es la función del ribosoma en la traducción? 6. Dibuje y describa las características físicas del ribosoma 7. Describa que es un triplete, un codón y un anticodón 8. ¿Qué es la secuencia TAC? 9. Indique cuáles son codones de inicio y de término 10. ¿Qué es la Metionina(MET)? 11. Indique a qué se refiere el término elongación 12. Caracterice el sitio P y A del ribosoma 13. ¿Cuál es la función del ARNt? 14. ¿Qué función tiene el factor de liberación? 15. A partir de la siguiente secuencia de ADN determine, la cadena complementaria, las cadenas de ARNm, la cadena de ARNt y los aminoácidos que tendrá esta proteína. AUG AAU AGC CGA CGG GAA GGC ACU AAG AGG UAG UGA 16. A partir de 4 nucleótidos que estructuran al ARN, ¿cuántos codones se pueden formar? 17. ¿Qué características tiene el código genético? 18. Indique las diferencias entre una mutación por Sustitución, Deleción o Adición Observa la siguiente secuencia de acontecimientos con respecto al flujo de información desde el ADN hacia la proteína que forma. Secuencia del ADN TAC TTA TCG GCT GCC CTT CCG Secuencia del ARN AAU AGC CGA CGG GAA GGC GGC Secuencia proteica Met Asn Ser Arg Arg Glu Gly 19. Supongamos que en el ADN se produce una mutación que afecta al nucleótido número 17, o sea T, que es reemplazado por A. ¿Qué consecuencia tiene sobre el ARNm? (anote el codón que se presentaría en este caso) AUG AAU AGC CGA CGG _____ GGC 20. ¿Qué consecuencia tiene sobre la secuencia de aminoácidos de la proteína o estructura primaria?. Anota el aminoácido que formaría ahora parte de la proteína Met Asn Ser Arg Arg _____ Gly 21. Defina que son las mutaciones y cuantos tipos existen 22. ¿Qué es una mutación puntual? 23. Un individuo expuesto a rayos UV ha sufrido una mutación por transverción. Explique en que consiste 24. Un especie de ganado ovino hereda una mutación que se caracteriza por que convierte un codón de aminoácido en un codón de termino. ¿Qué tipo de mutación es? Caracterícela 25. Explique con sus propias palabras en qué consiste la anemia falsiforme y cuáles son sus consecuencias