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BIOCATALIZADORES Se llaman biocatalizadores a las sustancias que aceleran las reacciones economizando energía. TIPOS DE BIOCATALIZADORES: Oligoelementos: son elementos que se encuentran en pequeñas cantidades ( menos del 0,1 ) se obtienen a partir de los alimentos y son imprescindibles para la vida Vitaminas.: son moléculas de naturaleza proteica o lipidíca sintetizadas por los seres autótrofos y microorganismos. Los animales deben de ingerirlas en la dieta. Hormonas: son sustancias de naturaleza protéica o lipidica. Sintetizadas en un lugar diferente del que actúan. Enzimas: son sustancias de naturaleza protéica, que actúan en el mismo lugar donde son sintetizadas. ENZIMAS PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS PARA SER CONSIDERADAS VERDADEROS CATALIZADORES • Aumentan la velocidad de las reacciones economizando energía. • Permanecen inalterables al finalizar la reacción • Son efectivas a bajas concentraciones • No desplazan el equilibrio de la reacción que catalizan. ESTUCTURA DE LAS ENZIMAS Se distinguen dos tipos de enzimas, uno estrictamente protéico y otro con parte protéica y parte no protéica. HOLOENZIMA = PROTEICA + NO PROTEICA HOLOENZIMA = APOENZIMA + COFACTOR Molécula Molécula Orgánica Inorgánica Coenzima Grupo prostético Unido al apoenzima unido al apoenzima Por enlaces débiles por enlaces covalentes APOENZIMA parte proteica del holoenzima constituida por tres tipos de aminoácidos : • Aminoácidos estructurales: son los encargados de mantener la estructura tridimensional del enzima. • Aminoácidos de fijación: fijan la enzima al sustrato por enlaces débiles. • Aminoácidos catalíticos :fijan la enzima al sustrato por enlaces fuertes y lo rompen en sus productos Centro activo es el lugar donde el enzima se une al sustrato encajando perfectamente como una mano y un guante. Está formado por los aminoácidos de fijación y los catalíticos. ACTIVIDAD ENZIMÁTICA En toda reacción enzimática, el sustrato es convertido en producto de la siguiente manera: el sustrato se fija a la enzima se forma un complejo enzima-sustrato , la enzima rompe al sustrato en sus productos y ella se recupera inalterable FACTORES QUE AFECTAN A LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA TEMPERATURA: Si se suministra a una reacción enzimática energía en forma de calor, al ser captada por las moléculas es transformada en energía cinética ello favorece la movilidad de las moléculas y por lo tanto el número de encuentros se incrementa si la,temperatura es excesiva la enzima al ser una proteína se desnaturaliza PH: todos los enzimas poseen dos valores de PH entre los cuales son efectivos traspasados estos valores la enzima se desnaturaliza, entre estos valores siempre hay un PH óptimo en el cual la velocidad es máxima. Cambios en el PH afectan a la distribución de las cargas eléctricas de la molécula y a las interacciones electrostáticas que fijan la estructura nativa. CINÉTICA ENZIMÁTICA: EFECTO DE LA CONCENTRACION DE SUSTRATO. Cuando se mantiene constante la concentración de enzima, se observa que el aumento de la velocidad de reacción es proporcional al incremento en la concentración de sustrato. Este proceso se mantiene hasta que en cierto momento por más que aumentemos la concentración de sustrato no aumenta la velocidad, decimos que se alcanzo la velocidad máxima y toda la enzima estaría saturada. KM: representa la concentración de sustrato a la cual la enzima alcanza la mitad de la velocidad máxima. Y mide la afinidad que tiene la enzima por el sustrato, pues cuanto más pequeña es KM más afinidad hay pues con menos sustrato la formación del producto es más rápida. ACTIVADORES: Son sustancias que al combinarse con el enzima potencian su acción. PROENZIMAS O ZIMOGENOS: Son enzimas que se sintetizan de forma inactiva y que posteriormente por la acción de otras enzimas o iones pasan a su forma activa. Ej: enzimas del aparato digestivo tripsinógeno--------tripsina INHIBIDORES : Hay inhibición cuando disminuye la actividad y la eficacia de un enzima. TIPOS DE INHIBICION : REVERSIBLE : La enzima se une al inhibidor por enlaces débiles siendo su unión temporal. Hay dos tipos: -Competiviva : El inhibidor y el sustrato se parecen y compiten por meterse en el centro activo. No competiviva: El inhibidor se une a la enzima en un lugar distinto del centro activo, con lo cual este se deforma impidiendo el acceso al sustrato. IRREVERSIBLE O ENVENENAMIENTO DEL ENZIMA : La enzima se une al inhibidor por enlaces covalentes (fuertes) siendo su unión permanente. REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA ENZIMAS ALOSTÉRICAS Son enzimas que presentan dos conformaciones diferentes, estables e interconvertibles: una es la forma activa que tiene una gran afinidad por el sustrato y la otra es la forma inactiva que presenta baja afinidad por el sustrato. •Estas enzimas poseen además del centro activo, otro centro llamado centro regulador o alostérico donde se puede unir un modulador o regulador alostérico que, puede ser un activador o un inhibidor de la enzima. Si el centro regulador esta vacío la enzima actúa a velocidad normal; si está ocupado por el regulador se producen cambios en la conformación y dependiendo de que sea activador o inhibidor adoptara una forma más o menos activa. El paso de la forma inactiva a la forma activa se produce al fijarse en el centro regulador un activador alostérico o modulador positivo suele ser el sustrato. El paso de la forma activa a la forma inactiva se produce al fijarse en el centro regulador un inhibidor alostérico o modulador negativo suele ser el producto final. •Estas enzimas están formadas por varias subunidades, por lo que tienen estructura cuaternaria. •Presentan efecto cooperativo entre la subunidades, es decir que si se activa o inhibe una de ellas provoca el mismo efecto en las demás. •En las enzimas alostéricas la cinética de las reacciones es diferente a la de las demás enzimas, la gráfica de la velocidad frente al sustrato es una curva sigmoidea en lugar de hiperbólica como ocurre en las demás enzimas. Los enzimas alostéricos desempeñan un papel muy importante en la regulación de las reacciones metabólicas, suelen actuar en puntos estratégicos de las rutas metabólicas como son: la primera reacción de una ruta metabólica o los puntos de ramificación de una ruta metabólica. El propio sustrato de la primera reacción es el que actúa como activador alostérico, al unirse con el enzima produce el cambio que da lugar a la conformación activa. También el producto final de la ruta metabólica puede actuar como inhibidor alostérico, produciendo la aparición de la conformación inactiva. Regulación alostérica Es un tipo de regulación metabólica en la cual el producto de una ruta metabólica inhibe a una enzima alostérica que cataliza una reacción dentro de dicha ruta (retroinhibición). Explicación: Una ruta metabólica es un conjunto de reacciones acopladas en cadena, de manera que el producto de la primera reacción es el sustrato de la siguiente, y así sucesivamente. Cuando la concentración del producto final es elevada, éste actúa como un inhibidor, se une a la primera enzima, ésta se inactiva y toda la cadena de reacciones se detiene. Esto se conoce como feed-back o retroinhibición .PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS Especificidad, desnaturalización y solubilidad. Especificidad: Sólo existe una actividad enzimática cuando los radicales de los aminoácidos de fijación coinciden con los radicales del sustrato, de manera que se produzca su unión. Esta especificidad viene determinada por dos características: - El sustrato debe de poseer algún grupo funcional que le permita unirse a la enzima y situar a la molécula de forma precisa sobre el centro activo. - El sustrato debe de poseer un enlace que la enzima pueda atacarlo y romperlo. Fischer comparó la especificidad entre la enzima y el sustrato con la que existe entre la llave y una cerradura, pero posteriormente Koshland la comparó con una mano y un guante (teoría del ajuste inducido), dado que la enzima puede cambiar de forma. TIPOS DE ESPECIFICIDAD - Absoluta: Cuando la enzima reconoce un único tipo de sustrato. Ejemplo: la D-fructosa 6 fosfotransferasa actúa sólo sobre la D-fructosa. - De grupo: Cuando la enzima reconoce a un grupo de moléculas similares que poseen un determinado enlace. Ejemplo: la α-glucosidasa actúa sobre los glúcidos que poseen enlaces α. - De clase: Cuando la activación de la enzima sólo depende del enlace. - Estereoquímica: Cuando actúa sobre uno de los dos isómeros ópticos. CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS Los enzimas se clasifican en 6 grupos en función de la acción que realizan. Para denominar un enzima se utiliza generalmente el nombre del sustrato sobre el que actúa con la terminación -asa (por ejemplo, sacarasa). ·Clase I Oxidorreductasas: Catalizan reacciones de oxido-reducción o redox. A H2 reducido + oxidado B -----------> A + oxidado B H2 reducido ·Clase II Transferasas: Catalizan reacciones en las que se transfieren grupos funcionales de un compuesto a otro. A-X + B ------> A + B-X ·Clase III Hidrolasas: Catalizan reacciones de hidrólisis, es decir la ruptura de enlaces con la intervención del agua. A este grupo pertenecen las enzimas digestivas. A-B + H2O ------> A-OH + B-H. Clase IV Liasas: Catalizan la adición y separación de grupos funcionales sin la intervención de agua, mediante la eliminación o la formación de dobles enlaces. A-B------>A=B + X X ·Clase V Isomerasas: Catalizan reacciones de isomerización, que producen reordenaciones de los átomos dentro de la molécula. ·Clase VI Ligasas o sintetasas: Catalizan la unión de dos moléculas para sintetizar una mayor. Obtienen la energía necesaria para crear el enlace de la hidrólisis del ATP. A + B + ATP ------> A-B + ADP+P COENZIMAS Los coenzimas son cofactores orgánicos unidos a la enzima por enlaces débiles. Suelen alterarse durante la reacción, pero una vez acabada se regeneran volviendo a ser funcionales. Se dividen en tres grupos: Energéticos: Intervienen en reacciones de transferencia de grupos fosfato. Ejemplo: ATP, AMP y ADP. Los metabólicos que intervienen en reacciones re-dox. Ejemplo: FADH2 y NADH2. FAD FADH2. Los derivados de vitaminas como el complejo B. VITAMINAS Son moléculas de naturaleza proteica o lipídica, sintetizadas por los seres autótrofos y microorganismos. Aves y ratas sintetizan la C y los rumiantes el grupo B. El organismo las necesita en pequeñas cantidades, ya que se regenera cuando finaliza la reacción. La carencia extrema de vitaminas recibe el nombre de avitaminosis. Su estado deficitario, hipovitaminosis. Y sus excesos, hipervitaminosis. Se clasifican, de acuerdo a su solubilidad, en hidrosolubles y liposolubles. Liposolubles: Su acumulación, al no ser solubles y no poder excretarse por la orina, puede desarrollar transtornos graves. - Vitamina A: Necesaria para percibir la luz. Vitamina D: Facilita y regula la absorción de calcio y fósforo; da estabilidad a los huesos. Su carencia origina el raquitismo. Vitamina E: Antioxidante y restauradora de la fertilidad. Vitamina K: Interviene en la coagulación sanguínea. Hidrosolubles: Su exceso no es tóxico, pues al ser solubles se eliminan por la orina. - Vitamina C: Su carencia provoca el escorbuto, aparición de hemorragias, caída de dientes y pelo. Vitamina B1: Su carencia ocasiona el Beri-Beri (degeneración de las neuronas). Vitamina B2: El déficit provoca alteraciones en la piel (dermatitis) Vitamina B3: Su carencia provoca la pelagra (trastornos cutáneos, nerviosos y mentales). Vitamina B12: Su carencia provoca anemia perniciosa (disminución de glóbulos rojos). ENZIMAS 1) Indica como afectaría (aumentando ou disminuindo) (0,1x4=0,4 ptos.) a velocidade dunha reacción catalizada por un enzima se a) aumenta a concentración do sustrato, b) aumenta a concentración do enzima: aumenta, c) se engade un inhibidor do enzima, d) aumenta a temperatura. Xustifica as respostas a) Aumenta porque o aumento do sustrato facilita a formación do complexo enzima-sustrato pero cando todo o sustrato está unido á enzima alcánzase a velocidade máxima, b) aumenta porque ó aumentar a concentración do enzima os complexos enzima sustrato fórmanse mais rápidamente, c) disminue porque o inhibidor se une á enzima impedindo a unión de ésta co sustrato, d) aumenta porque a temperatura favorece a mobilidade das moléculas, pero si temperatura supera un certo valor a enzima desnaturalízase e perde actividade. ¿Que é un holoenzima? (0,15 ptos.): Enzima que para realizar a sua función necesita estar unida a un compoñente non proteico (cofactor). ¿E un apoenzima? (0,15 ptos.): Porción proteica dunha holoenzima. 2) Na seguinte reacción enzimática: (E+S→ ES→ E+P) a) Indica o significado de E, S, ES e P b) ¿Como inflúe a concentración de substrato na velocidade das reaccións enzimáticas? Fai unha representación gráfica sinalando as constantes cinéticas c) ¿De que xeito afecta a temperatura e o pH á actividade enzimática? d) ¿Que é un enzima alostérico? e) Explica o papel dos cofactores e os coenzimas nas reaccións enzimáticas a)E é o encima; S, o substrato; ES é o complexo enzima substrato; e P, o produto ou produtos da reacción (0,4p). b) Inflúe de maneira que, cando aumenta a concentración do substrato manténdose constante a concentración do enzima, prodúcese un incremento proporcional da velocidade de reacción ata alcanzar un punto no que o enzima se satura e xa non aumenta a velocidade aínda que se aumente a concentración de substrato. Neste momento alcánzase a velocidade máxima da reacción enzimática (0,4x 2 = 0,8p). c) Ao seren os enzimas proteínas, vese afectada a súa conformación nativa por cambios bruscos de pH e de temperatura. Existe un pH óptimo, para cada enzima, ao que se produce a máxima actividade catalítica. Cambios de pH afectan á distribución de cargas eléctricas da molécula e ás interaccións electrostáticas que fixan a estrutura nativa. Polo tanto, altérase a conformación espacial do enzima que afectan á súa actividade. En xeral, o aumento de temperatura incrementa a velocidade da reacción. A valores moi altos, a proteína desnaturalízase e perde a súa actividade d) Enzima alostérico é o que ten un ou máis centros reguladores distintos do centro activo, que é o lugar por onde se une ao substrato. e) Os cofactores son substancias que se combinan co enzima potenciando a súa acción catalítica. Algúns son de natureza orgánica e denomínanse coenzimas. Para algúns enzimas, a presenza de cofactores ou coenzimas é imprescindible para seren activos porque actúan como portadores transitorios de grupos químicos (0,4p). 3) Representa a formula xeral dun aminoácido e indica qué tipo de enlace se forma entre dous aminoácidos. Que é un enzima? Cales son os principais factores que afectan á actividade enzimática? Razoa a resposta. Cita dúas propiedades dos enzimas polas que se poidan considerar como biocatalizadores Fórmula xeral dun aminoácido Fórmase un enlace peptídico entre o grupo carboxilo dun aminoácido e o grupo amino doutro (0,5p). Un encima é unha proteína con función catalizadora que aumenta a velocidade dunha reacción (ou diminúe a enerxía de activación) mediante a súa asociación pasaxeira co substrato. O encima nin se modifica nin se consome (0,5p). Son a temperatura, o pH e os inhibidores. En xeral, o aumento de temperatura incrementa a velocidade da reacción. A valores moi altos, a proteína desnaturalizase e perde a súa actividade Existe un pH óptimo, para cada encima, ao que se produce a máxima actividade catalítica. Cambios de pH afectan á distribución de cargas eléctricas da molécula e ás interaccións electrostáticas que fixan a estrutura nativa. Os inhibidores son sustancias que diminúen a actividade dun encima (0,5p). Capacidade de rexeneración: precísanse pequenas cantidades; necesidade dun medio de reacción óptimo: Tª e pH; especificidade: tanto respecto ao substrato como ao tipo de reacción que catalizan; non alteran o equilibrio da reacción (0,5p).