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Mecanismos de Obtención de Energía por Microorganismos Respiración y Fermentación Son procesos Catabólicos mediante los cuales las células obtienen la energía necesaria para por procesos anabólicos elaborar sus macromoléculas esenciales y demás constituyentes. El enlace entre las reacciones que suministran energía y las que lo consumen lo proporciona una sustancia denominada Trifosfato de Adenosina (ATP) a partir del Dinucleotido de Adenosina (ADP) y del ácido Fosfórico. Existen dos fuentes de energía externa empleada por los microorganismos: Luz Solar y Energía Química Obtención Energía Química Donador de Electrones Aceptor de H + Aceptor de H + Químiotrofos Inorgánicos Orgánicos Inorgánicos Respiración No ocurre Orgánicos Respiración Fermentación Respiración: Es la oxidación de una fuente de energía con un aceptor externo de electrones. Los H + del NADH son transferidos al Oxígeno u otro compuesto inorgánico (aceptor externo) por un sistema “Transportador de Electrones”, el sustrato se oxida generalmente en forma completa. La producción de ATP se realiza en forma asociada a la cadena de transporte por un mecanismo denominado “Fosforilación Oxidativa” . Fermentación: Es la oxidación productora de energía en la cual el oxidante es un compuesto orgánico. Los H + son transferidos a la coenzima NAD, la cual se reduce a NADH para luego reoxidarse transfiriendo los H + a un compuesto intermedio de la reacción, la cual se puede definir como una “Reacción de Oxido reducción Interna” PRINCIPALES VÍAS METABÓLICAS GENERADORAS DE ENERGÍA DE LOS QUIMIOHETEROTROFOS FERMENTACION Ej:fermentación alcohólica Glucosa Etanol C6H12O6 Otras fermentaciones láctica, acética, acetobutílica, etc. Dióxido de carbono 2 C2H6O + + 2 CO2 Energía RESPIRACION AEROBIA Glucosa C6H12O6 + Oxígeno Agua 6 O2 6 H2O RESPIRACION ANAEROBIA Glucosa Energía C6H12O6 + Dióxido de carbono + + Energía 6 CO2 (Ej: reducción de nitratos) Nitrato Nitrito NO3- NO2- Dióxido de carbono + 6 CO2 + Energía Otros aceptores de H/eSO42- ; CO2; Fe2+ Todas las bacterias •Utilizan otros H de C además de la glucosa (lactosa, sacarosa, maltosa, etc.) Muchas bacterias •Tienen al menos 2 posibilidades (respiración aerobia/fermentación; respiración anaerobia/fermentación; etc. •Tienen otras vías para generar energía a partir de proteínas, lípidos y hasta ¡plásticos y petróleo! Oxígeno El oxígeno es un componente universal de las células y es suministrado siempre en grandes cantidades por el agua (H2O). Sin embargo, los procariotas muestran un amplio rango de respuestas al oxígeno molecular (O2). Aerobios obligados Requieren oxígeno para su crecimiento, ellos usan el O2 como un aceptor final de electrones en la respiración. Anaerobios obligados, o estrictos No requiere O2, no necesitan el O2 como un nutriente. De hecho, el oxígeno es una sustancia tóxica, el cual mata o inhibe su crecimiento. Los procariotas anaerobios obligados pueden vivir por fermentación, respiración anaeróbica, fotosíntesis bacteriana, o el primitivo proceso de la metanogénesis. Anaerobios facultativos Son organismos que pueden cambiar entre tipo de metabolismo aeróbico y anaeróbico. Bajo condiciones anaeróbicas ellos crecen por fermentación o respiración anaeróbica, pero en presencia de oxígeno ellos cambian a respiración aeróbica. Anaerobios aerotolerantes Son bacterias con un tipo de metabolismo exclusivamente anaeróbico (fermentativo), pero ellos son insensibles a la presencia de O2. Ellos viven solamente por fermentación sin importar si el oxígeno está o no presente en su entorno. Organismo Relación con el O2 Patología Bacillus cereus Aerobio estricto Gastroenteritis Salmonella spp. Anaerobio facultativo Gastroenteritis Clostridium perfringens Anaerobio estricto Gangrena Campylobacter jejuni Microaerófilo Diarrea Respiración Aeróbica: El aceptor externo de electrones es el Oxigeno. Respiración Anaeróbica : El aceptor externo de electrones es otro compuesto inorgánico. Reductores y Oxidantes en respiración Bacteriana Reductor Oxidante Producto Organismo H2 O2 H2O Bacterias del Hidrogeno H2 SO4= S= + H2O Desulfovibrio Compuestos Orgánicos O2 CO2 + H2O Mayoría de Bacterias NH3 O2 NO2- + H2O Bacterias Nitrificantes Compuestos Inorgánicos NO3- N2 + CO2 Bacterias Desnitrificantes NO2-- O2 NO3- + H20 Bacterias Nitrificantes Fe++ O2 Fe++ Ferrobacillus S= O2 SO4=+ H20 Tiobacillus Jarra para cultivos anaerobicos estrictos Jarra de anaerobiosis Respiración Aeróbica Alimento Proteínas Polisacáridos Amino Ácidos Grasas Azucares Simples Ácidos Grasos y Glicerol Membrana NADH g l u c o l i s i s ATP Piruvato NADH CO2 Acetil Co A CO2 Krebs Ciclo ac. Cítrico Poder Reductor en forma de NADH NH3 NH 3 O2 T r a n s p o r t e l e c t r o n e s e HO2 f o s f o r i l i z a c i i o n Productos Residuales TRIFOSFATO DE ADENOSINA (ATP) El trifosfato de adenosina (ATP) o adenosín trifosfato es una molécula que consta de un grupo reducido de enlaces iónicos Su fórmula es C10H16N5O13P3. ATP Y METABOLISMO En la célula son oxidados los nutrientes por una serie de reacciones químicas degradativas (catabolismo). Como productos del catabolismo se obtienen metabolitos simples y energía. Ambos son los precursores para la síntesis de los componentes celulares. Todo el conjunto de reacciones de síntesis se llama anabolismo. En el catabolismo (oxidación) se produce una liberación de electrones que son captados por moléculas transportadoras de electrones como el NAD+ (que al aceptar electrones se reduce a NADH). Por otra parte, la energía liberada queda retenida en su mayoría en el ATP. La síntesis (anabolismo) de los compuestos celulares se realiza con los metabolitos simples, utilizando la energía contenida en el ATP y los electrones contenidos en el NADH, ya que éste es un proceso reductivo (toma electrones). El ATP es esa moneda de intercambio energético debido a su estructura química. Cuando se hidroliza libera mucha energía que va a ser captada por las enzimas que catalizan las reacciones de biosíntesis. HIDRÓLISIS DEL ATP Se puede representar así: A-P~P~P Donde “~” son los enlaces anhídrido de ácido, que son de alta energía. En la hidrólisis del ATP se está hidrolizando uno de esos enlaces anhídrido de ácido. Esto libera gran energía, concretamente 7'7kcal/mol. Es decir: ΔG = -7,7 kcal/mol Es una reacción muy exergónica. Su keq es 11. Así se comprende que el ATP tiene tendencia a hidrolizarse de forma natural y liberar energía. NICOTINAMIDA ADENINA DINUCLEÓTIDO (NAD) Es una coenzima que contiene la vitamina B3 y cuya función principal es el intercambio de electrones e hidrogeniones en la producción de energía de todas las células. El NAD+ interviene en múltiples reacciones del metabólicas de óxido-reducción. Cuando un enzima oxida un substrato por deshidrogenación, los átomos de hidrógeno arrancados a dicho substrato son cedidos por el enzima al NAD+; éste actúa como agente oxidante al aceptar dos electrones (y un protón), quedando libre en el medio otro protón: A-H2 + NAD+ → A + NADH+H+ Por tanto, el NADH es la forma reducida del NAD+, ya que posee dos electrones (y un protón) más. El NADH actúa como transportador de 2e- y 1H+, para acabar cediéndolos. En el catabolismo aerobio, el NADH cede sus electrones al complejo NADH-deshidrogenasa (el primer elemento de la cadena respiratoria); en el catabolismo anaerobio como en la fermentación láctica, el NADH cede sus electrones al ácido pirúvico que se reduce a ácido láctico. FLAVÍN ADENÍN DINUCLEÓTIDO (FAD) El flavín adenín dinucleótido o dinucleótido de flavinaadenina es una molécula compuesta por una unidad de riboflavina (vitamina B2), unida a un pirofosfato (P-P), éste unido a una ribosa y ésta unida a una adenina. Por tanto, la molécula es en realidad ADP unido a riboflavina; o también AMP unido al coenzima FMN. Bioquímicamente es un coenzima que interviene como dador o aceptor de electrones y protones (poder reductor) en reacciones metabólicas redox; Al reducirse capta dos protones y dos electrones, lo que lo capacita para intervenir como dador de energía y/o poder reductor en el metabolismo . Por ejemplo, el FAD (y también el NAD), se reducen en el ciclo de Krebs y se oxida en la cadena respiratoria (respiración aeróbica). La función bioquímica general del FAD es oxidar los alcanos a alquenos, mientras que el NAD+ oxida los alcoholes a aldehídos o cetonas. Esto es debido a que la oxidación de un alcano (como el succinato) a un alqueno (como el fumarato) es suficiente exergónica como para reducir el FAD a FADH2, pero no para reducir el NAD+ a NADH. La reoxidación del FADH2 (es decir, la liberación de los dos electrones y dos protones capturados) tiene lugar en la cadena respiratoria, lo que posibilita la formación de ATP (fosforilación oxidativa). GLUCÓLISIS • • • Es la vía metabólica encargada de oxidar o fermentar la glucosa y así obtener energía para la célula. Ésta consiste de 10 reacciones enzimáticas que convierten a la glucosa en dos moléculas de piruvato. Es la vía inicial del catabolismo (degradación) de carbohidratos, y tiene tres funciones principales: La generación de moléculas de alta energía (ATP y NADH) como fuente de energía celular en procesos de respiración aeróbica (presencia de oxígeno) y anaeróbica (ausencia de oxígeno). La generación de Piruvato que pasará al Ciclo de krebs, como parte de la respiración aeróbica. La producción de intermediarios de 6 y 3 carbonos, los que pueden ser ocupados por otros procesos celulares. Cuando hay ausencia de oxígeno (anoxia o hipoxia), luego que la glucosa ha pasado por este proceso, el piruvato sufre la fermentación, una segunda vía de adquisición de energía que, al igual que la glucólisis, es poco eficiente. El tipo de compuesto obtenido de la fermentación suele variar con el tipo de organismo. En los animales, el piruvato fermenta a lactato y en levadura, el piruvato fermenta a etanol. Balance energetico • 2 NAD = 6 ATP + 2 ATP = 8 ATP por molécula de glucosa En eucariotas y procariotas, la glucólisis ocurre en el citosol de la célula. El tipo de glucólisis mas común y más conocida es la vía de Embden-Meyerhoff, explicada inicialmente por Gustav Embden y Otto Meyerhof, El término puede incluir vías alternativas, como la vía de Entner-Doudoroff. No obstante, Glucólisis será usada aquí como sinónimo de la vía de Embden-Meyerhoff. El ATP (Adenosín trifosfato) es la fuente de energía universal de la célula. NADH y H+, otorgan la capacidad de reducir otros compuestos pertenecientes a otras vías metabólicas, o bien para sintetizar ATP. El piruvato es la molécula que seguirá oxidandose en el ciclo de Krebs, como parte de la respiración aeróbica, 1er Paso: Hexoquinasa La primera reacción de la glucólisis es la fosforilación de la glucosa, para activarla (aumentar su energía) y así poder utilizarla en otros procesos cuando sea necesario. Esta activación ocurre por la transferencia de un grupo fosfato del ATP, una reacción catalizada por la enzima Hexoquinasa, la cual puede fosforilar (añadir un grupo fosfato) a moléculas similares a la Glucosa, como la fructosa y manosa. 2do Paso: Fosfohexosa isomeraza Glucosa-6-fosfato a Fructosa-6-fosfato Éste es un paso importante, puesto que acá se define la geometría molecular que afectará los dos pasos críticos en la glucólisis: El próximo paso, que agregará un grupo fosfato al producto de esta reacción, y el paso 4, cuando se creen dos moléculas de gliceraldehido que finalmente serán las precursoras del piruvato. En esta reacción, la Glucosa-6-fosfato se isomeraza a Fructosa-6-fosfato, mediante la enzima Fosfohexosa isomeraza. La isomerización ocurre en una reacción de 4 pasos, que implica la apertura del anillo y un traspaso de protones a través de un intermediario cis-enediol 3er paso: Fosfofructoquinasa Fructosa-6-fosfato + ATP Fructosa-1,6-bifosfato + ADP Fosforilación de la fructosa 6-fosfato en el carbono 1, con gasto de un ATP, a través de la enzima Fosfofructoquinasa-1 (PFK1). También este fosfato tendrá una baja energía de hidrólisis. Por el mismo motivo que en la primera reacción, el proceso es irreversible. El nuevo producto se denominará Fructosa-1,6Bisfosfato. La irreversibilidad es importante, ya que la hace ser el punto de control de la glucólisis. Como hay otros sustratos aparte de la glucosa que entran en la glucólisis, el punto de control no está colocado en la primera reacción, sino en ésta. La fosfofructoquinasa tiene centros alostéricos, sensibles a las concentraciones de intermediarios como citrato y ácidos grasos. Liberando una enzima llamada fosfructocinasa-2 que fosforila en el carbono 2 y regula la reacción. 4to Paso: Aldolasa Fructosa-1,6-bifosfato Dihidroxiacetona-fosfato + Gliceraldehido-3-fosfato La enzima Aldolasa (Fructosa-1,6-bifosfato aldolasa), mediante una condensación aldólica reversible, rompe la fructosa-1,6-bifosfato en dos moléculas de tres carbonos (triosas): Dihidroxiacetona fosfato y Gliceraldehído-3-fosfato. Ésta reacción tiene una energía libre (ΔG) entre 20 a 25 kJ/mol, por lo tanto en condiciones estándar ésta reacción no ocurre de manera espontánea. Sin embargo, en condiciones intracelulares la energía libre es pequeña debido a la baja concentración de los sustratos, lo que permite que ésta reacción sea reversible. 5to Paso: Triosa-fosfato-Isomerasa Dihidroxiacetona-fosfato a Gliceraldehido-3-fosfato Puesto que sólo el Gliceraldehído-3-fosfato puede seguir los pasos restantes de la glucólisis, la otra molécula generada por la reacción anterior (Dihidroxiacetona-fosfato) es isomerizada a Gliceraldehído-3fosfato. Ésta reacción posee una energía libre en condiciones estandar positiva, lo cual implicaría un proceso no favorecido, sin embargo al igual que para la reacción 4, considerando las concentraciones intracelulares reales del reactante y el producto, se encuentra que la Energía Libre total es negativa, por lo que la dirección favorecida es hacia la formación de G3P. Éste es el último paso de la "Fase de Gasto de Energía". Sólo hemos gastado ATP en el primer paso (Hexoquinasa) y el tercer paso (Fosfofructoquinasa-1). Cabe recordar que el 4to paso (Aldolasa) genera una molécula de Gliceraldehído-3-fosfato, mientras que el 5to paso genera una segunda molécula de éste. De acá en adelante, las reacciones a seguir ocurrirán dos veces, debido a las 2 moléculas de gliceraldehido generadas de ésta fase. Hasta esta reaccion hay intervencion de energia (ATP) 6to Paso: Gliceraldehido-3-fosfato deshidrogenasa Se utiliza un fosfato inorgánico y una molécula de NAD+ para producir 1,3Bifosfoglicerato y una molécula de NADH + H+. Esta reacción la cataliza la gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa o GAP-deshidrogenasa. Esta sexta reacción tiene una importancia capital en la regulación de la glucolisis; si el NAD+ consumido en formar NADH + H+ no se regenera, el ciclo glucolítico se verá comprometido llegando incluso a detenerse. Una de las funciones principales de la vía fermentativa es oxidar el NADH + H+ generado para así permitir a la ruta glucolítica continuar. En caso de haber oxígeno, el NADH + H+ obtenido se destina a la cadena transportadora de electrones para la obtención de energía. 7mo Paso: Fosfoglicerato quinasa Se desfosforiliza el 1,3-bifosfoglicerato gracias a la fosfoglicerato quinasa, formándose una molécula de ATP por cada una de 1,3-BPG y dando lugar al 3-fosfoglicerato. 8vo Paso: Fosfoglicerato mutasa Se isomeriza el 3-fosfoglicerato procedente de la reacción anterior dando 2-fosfoglicerato, la enzima que cataliza esta reacción es la Fosfoglicerato mutasa. Lo único que pasa aquí es el cambio de posición del fosfato del C3 al C2. Son energías similares y por tanto reversibles, con una variación de energía libre cercana a cero. 9no Paso: Enolasa La enzima enolasa propicia la formación de un doble enlace en el 2fosfoglicerato, eliminando una molécula de agua formada por el hidrógeno del C2 y el OH del C3. El resultado es el fosfoenolpiruvato. 10mo Paso: Piruvato quinasa Desfosforilación del Fosfoenolpiruvato, obteniéndose piruvato y ATP. Reacción irreversible mediada por la Piruvato quinasa. La enzima Piruvato Quinasa es dependiente de magnesio y potasio. La energía libre es igual a -31.4, por lo tanto la reacción es favorable e irreversible. El rendimiento total de la glucólisis de una sola glucosa(6C) es de 4 ATP(dos por cada gliceraldehido fosfato(3C) y 2 NADH (que dejarán los electrones H en la cadena de transporte de electrones para formar 3 ATP por cada electrón). Reacciones del ciclo de Krebs Leyenda de colores: enzimas, coenzimas, nombres de sustratos, iones metálicos, moléculas inorgánicas, inhibición, estimulación . El acetil-CoA es el principal precursor del ciclo. El ácido cítrico (6 carbonos) o citrato se regenera en cada ciclo por condensación de un acetil-CoA (2 carbonos) con una molécula de oxaloacetato (4 carbonos). El citrato produce en cada ciclo una molécula de oxaloacetato y dos CO2, por lo que el balance neto del ciclo es: Acetil-CoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi + 3 H2O → CoA-SH + 3 (NADH + H+) + FADH2 + GTP + 2 CO2 + 3 H+ Los dos carbonos del Acetil-CoA son oxidados a CO2, y la energía que estaba acumulada es liberada en forma de energía química: GTP y poder reductor (electrones de alto potencial): NADH y FADH2, son coenzimas (moléculas capaces de unirse a enzimas) capaces de acumular la energía en forma de poder reductor para su conversión en energía química en la fosforilación Oxidativa. VISIÓN SIMPLIFICADA Y RENDIMIENTO DEL PROCESO • El paso previo es la oxidación del piruvato, produciendo un acetil-CoA y un CO2. • El acetil-CoA reacciona con una molécula de oxaloacetato (4 carbonos) para formar citrato (6 carbonos), mediante una reacción de condensación. • A través de una serie de reacciones el citrato se convierte de nuevo en oxaloacetato. • Durante estas reacciones, se substraen 2 átomos de carbono del citrato (6C) para dar oxalacetato (4C); dichos átomos de carbono se liberan en forma de CO2 • El ciclo consume netamente 1 acetil-CoA y produce 2 CO2. También consume 3 NAD+ y 1 FAD, produciendo 3 NADH + 3 H+ y 1 FADH2. • El rendimiento de un ciclo es (por cada molécula de piruvato): 1 GTP, 3 NADH, 1 FADH2, 2CO2. • Cada NADH, cuando se oxide en la cadena respiratoria, originará 2,5 moléculas de ATP (3 x 2,5 = 7,5), mientras que el FADH2 dará lugar a 1,5 ATP. Por tanto, 7,5 + 1,5 + 1 GTP = 10 ATP por cada acetil-CoA que ingresa en el ciclo de Krebs. • Cada molécula de glucosa produce (vía glucólisis) dos moléculas de piruvato, que a su vez producen dos acetil-CoA, por lo que por cada molécula de glucosa en el ciclo de Krebs se produce: 4CO2, 2 GTP, 6 NADH, 2 FADH2; total 20 ATP. REGULACIÓN Muchas de las enzimas del ciclo de Krebs son reguladas por retroalimentación negativa, por unión alostérica del ATP, que es un producto de la vía y un indicador del nivel energético de la célula. Entre estas enzimas se incluye el complejo de la piruvato deshidrogenasa que sintetiza el acetil-CoA necesario para la primera reacción del ciclo a partir de piruvato, procedente de la glucólisis o del catabolismo de aminoácidos. También las enzimas citrato sintasa, isocitrato deshidrogenasa y α-cetoglutarato deshidrogenasa, que catalizan las tres primeras reacciones del ciclo de Krebs, son inhibidas por altas concentraciones de ATP. Esta regulación frena este ciclo degradativo cuando el nivel energético de la célula es bueno. Algunas enzimas son también reguladas negativamente cuando el nivel de poder reductor de la célula es elevado. El mecanismo de esta inhibición es una inhibición competitiva por producto (por NADH) de las enzimas que emplean NAD+ como sustrato. Así se regulan, entre otros, los complejos piruvato deshidrogenasa y citrato sintasa. Productos del ciclo del ácido cítrico Reactivos/ Coenzimas Productos/ Coenzima Molécula Enzima Tipo de reacción I. Citrato II. cis-Aconitato 1. Aconitasa 2. Aconitasa Deshidratación Hidratación H2O III. Isocitrato 3. Isocitrato deshidrogenasa Oxidación NAD+ NADH + H+ IV. Oxalosuccinato 4. Isocitrato deshidrogenasa Descarboxilación NAD+ + CoA-SH NADH + H+ + CO2 5. α-cetoglutarato V. α-cetoglutarato deshidrogenasa Descarboxilación Oxidativa H2O VI. Succinil-CoA 6. Succinil-CoA sintetasa Hidrólisis GDP + Pi GTP + CoA-SH VII. Succinato 7. Succinato deshidrogenasa Oxidación FAD FADH2 Adición (H2O) H2O Oxidación NAD+ VIII. Fumarato IX. L-Malato X. Oxaloacetato 8. Fumarato Hidratasa 9. Malato deshidrogenasa 10. Citrato sintasa Condensación NADH + H+ Cadena de Transporte de Electrones y Fosforilación Oxidativa • El ciclo de Krebs siempre es seguido por la fosforilación oxidativa. Este proceso extrae la energía en forma de electrones de alto potencial de las moléculas de NADH y FADH2, regenerando NAD+ and FAD, gracias a lo cual el ciclo de Krebs puede continuar. Los electrones son transferidos a moléculas de O2, rindiendo H2O. Pero esta transferencia se realiza a través de una cadena transportadora de electrones capaz de aprovechar la energía potencial de los electrones para bombear protones. Esto genera un gradiente electroquímico de H+, que es utilizado para la síntesis de ATP mediante la enzima ATP sintetasa. De este modo el ciclo de Krebs no utiliza directamente O2, pero lo requiere al estar acoplado a la fosforilación oxidativa. CaCadena de Transporte de Electrones LA CADENA DE TRANSPORTE DE ELECTRONES Es una serie de transportadores de electrones que se encuentran en la membrana plasmática de bacterias, en la membrana, que median reacciones bioquímicas que producen adenosina trifosfato (ATP), que es el compuesto energético que utilizan los seres vivos. Sólo dos fuentes de energía son utilizadas por los organismos vivos: reacciones de oxido-reducción (redox) y la luz solar (fotosíntesis). Los organismos que utilizan las reacciones redox para producir ATP se les conoce con el nombre de quimiotrofos, mientras que los que utilizan la luz solar para tal evento se les conoce por el nombre de fototrofos. Ambos tipos de organismos utilizan sus cadenas de transporte de electrones para convertir la energía en ATP. La misión de la cadena transportadora de electrones es la de crear un gradiente electroquímico que se utiliza para la síntesis de ATP. Dicho gradiente electroquímico se consigue mediante el flujo de electrones entre diversas sustancias de esta cadena que favorecen en último caso la translocación de protones que generan el gradiente anteriormente mencionado. De esta forma podemos deducir la existencia de tres procesos totalmente dependientes: Un flujo de electrones desde sustancias individuales. Un uso de la energía desprendida de ese flujo de electrones que se utiliza para la translocación de protones en contra de gradiente, por lo que energéticamente estamos hablando de un proceso desfavorable. Un uso de ese gradiente electroquímico para la formación de ATP mediante un proceso favorable desde un punto de vista energético Cuatro complejos unidos a membrana han sido identificados. El flujo de electrones global se esquematiza de la siguiente forma: NADH o FADH → FMN → Q → Citocromo b → Citocromo c → Citocromo a → O2 TRANSPORTADORES DE QUINONA Las quinonas son transportadores móviles liposolubles. En general desempeñan las mismas funciones que la quinona mitocondrial, aunque las bacterias presenten quinonas específicas como son por ejemplo la ubiquinona o la menaquinona. BOMBAS DE PROTONES El citocromo bc1 es una bomba de protones encontrada en muchas bacterias, aunque no en todas, por ejemplo Escherichia coli. CITOCROMOS Los citocromos son proteínas que contienen porfirinas que tienen ligado un átomo de hierro. Existen citocromos que son hidrosolubles, otros que son liposolubles. Otra peculiaridad es que existen citocromos móviles como por ejemplo el citocromo c. CADENA DE TRANSPORTE DE ELECTRONES NADH/FADH El "complejo I" o NADH deshidrogenasa o NADH:ubiquinona oxidoreductasa capta dos electrones del NADH y los transfiere a un transportador liposoluble denominado ubiquinona (Q). El producto reducido, que se conoce con el nombre de ubiquinol (QH2) puede difundir libremente. Al mismo tiempo el NADH transloca cuatro protones, produciendo un gradiente de protones. El flujo de electrones ocurre de la siguiente forma: El NADH es oxidado a NAD+, reduciendo al FMN a FMNH2 en un único paso que implica a dos electrones. Citocromos Citocromo b; obtiene dos electrones desde QH2 y se los transfiere a dos moléculas de citocromo c, que es un transportador de electrones hidrosoluble. Al mismo tiempo, transloca dos protones por los dos electrones transportados desde el ubiquinol. Citocromo c y a; capta cuatro electrones de la cuatro moléculas de citocromo c y se transfieren al oxígeno (O2), para producir dos moléculas de agua (H2O). Al mismo tiempo se translocan cuatro protones, por los cuatro electrones. Además "desaparecen" de la matriz 4 protones que forman parte del H2O. RESUMEN La cadena de transporte de electrones utiliza electrones desde un donador ya sea NADH o FADH 2 y los pasa a un aceptor de electrones final, como el O2, mediante una serie de reacciones redox. Estas reacciones están acopladas a la creación de un gradiente de protones generado por los transportadores. Dicho gradiente es utilizado para generar ATP mediante la ATP sintasa. Las reacciones catalizadas por los citocromos están en equilibrio. Las concentraciones de reactivos y productos son aproximadamente los mismo. Esto significa que estas reacciones son reversibles. Cadena transportadora de electrones en bacterias En eucariotas, el NADH es el donador de electrones más importante. En procariotas, es decir bacterias y arqueas la situación es algo más complicada, debido a que hay un gran numero de donante de electrones y un gran numero de aceptores. Si generalizamos el transporte en bacterias este podría quedar de la siguiente forma: Donador Donador Donador . ↓ ↓ ↓ . deshidrogenasa → quinonas → bc1 → citocromo . ↓ ↓ . oxidasa (reductasa) oxidasa(reductasa) . ↓ ↓ . Aceptor Aceptor OXIDASAS Y REDUCTASAS TERMINALES Cuando una bacteria crece en ambientes aeróbicos, el aceptor final de los electrones es reducido hasta agua por un enzima que se denomina oxidasa. Cuando una bacteria crece en ambientes de hipoxia, el aceptor de electrones es reducida por una enzima que se denomina reductasa. Las bacterias aeróbicas pueden un utilizar varias oxidasas. Escherichia coli, no presenta Citocromo oxidasa, por lo que en condiciones aeróbicas utiliza dos Quinolonas oxidasa diferentes para reducir el oxígeno a agua. Ambas quinolonas oxidasas actúan a su vez como bombas de protones. Las bacterias anaeróbicas no pueden utilizar el oxígeno como aceptor final de los electrones, por lo que requieren reductasas especializadas para cada una de los aceptores. Escherichia coli puede usar por ejemplo: una Fumarato reductasa, la nitrato reductasa, la nitrito reductasa ACEPTORES DE ELECTRONES Al igual que existen un gran número de donadores de electrones, también existen un gran número de aceptores que pueden ser de ambos tipos, es decir de origen orgánico o inorgánico. Si el oxígeno está disponible, se usará como aceptor, ya que genera mayor producción energética. En los ambientes anaeróbicos, se puede utilizar NO3-, NO2-, Fe3+, SO42-, CO2 y pequeñas moléculas orgánicas como por ejemplo el fumarato. RESPIRACIÓN AERÓBICA 1ATP Sustrato NADH NAD FMN Potenciales O/R -0,36 0,05 V -0,27 0,27 V -0,12 0,64 V 0,12 0,90 V 0,22 1,22 V Cit. c red. 0,26 1,32 V Cit. a ox. 0,30 1,44 V FMNH Quinonas Cit. b red. Inhibidor CLO3- Cit. b ox. 1 ATP . Cit. c ox. Inhibidor Antimicina Cit. a red. 1 ATP Inhibidor CN-,N3-,CO O2 H2O 0,82 1,50 V LA FOSFORILACIÓN OXIDATIVA Es la transferencia de electrones de los equivalentes reducidos NADH, FADH, obtenidos en la glucólisis y en el ciclo de Krebs hasta el oxígeno molecular, acoplado con la síntesis de ATP. Este proceso metabólico está formado por un conjunto de enzimas complejas, ubicadas en la membrana, que catalizan varias reacciones de óxido-reducción, donde el oxígeno es el aceptor final de electrones y donde se forma finalmente agua. La fosforilación oxidativa es un proceso bioquímico que ocurre en las células. Es el proceso metabólico final (catabolismo) de la respiración celular, tras la glicólisis y el ciclo del ácido cítrico. De una molécula de glucosa se obtienen 38 moléculas de ATP mediante la fosforilación oxidativa. Dentro de las bacterias, la fosforilación oxidativa se produce en la membrana plasmática y en eucariotas es la membrana de las dos de que consta la mitocondrial. El NADH y FADH2, moléculas donadores de electrones que "fueron cargadas" durante el ciclo del ácido cítrico, se utilizan en un mecanismo intrincado (que implica a numerosas enzimas como la NADH-Q reductasa, la citocromo c oxidasa y la citocromo reductasa), gracias a la bomba H+ que moviliza los protones contra un gradiante de membrana. Un gran complejo proteico llamado ATP-sintasa situado en la membrana, permite a los protones pasar en ambas direcciones; genera el ATP cuando el protón se mueve a favor de gradiente. La reacción es: ADP3- + H+ + Pi ↔ ATP4- + H2O Cada molécula de NADH contribuye suficientemente a generar la fuerza motriz de un protón que produzca 2,5 moléculas de ATP. Cada molécula de FADH2 produce 1,5 m Moléculas de ATP. Todas juntas, las 10 moléculas de NADH y las 2 FADH2 provenientes de la oxidación de la glucosa (glucólisis, descarboxilación oxidativa de piruvato en acetil-CoA y ciclo de Krebs) a formar 28 de las 38 moléculas totales de ATP transportadoras de energía. Hay que decir que estos valores de moléculas de ATP son máximos. En realidad cada molécula de NADH contribuye a formar entre 2 y 3 moléculas de ATP, mientras que cada FADH2 contribuye a un máximo de 2 moléculas de ATP. ACOPLAMIENTO CON LA FOSFORILIZACIÓN OXIDATIVA La hipótesis del acoplamiento quimiosmótico, explica que la cadena de transporte de electrones y la fosforilación oxidativa están acopladas por el gradiente de protones. El eflujo de protones crea un gradiente de pH y un gradiente electroquímico. Este gradiente de protones es usado por la ATP sintasa para formar ATP vía la fosforilación oxidativa. El acoplamiento con la fosforilación oxidativa es un paso clave en la producción de ATP. Las bacterias pueden usar múltiples cadenas de transporte de electrones, e incluso simultáneamente. Las bacterias pueden usar varios donadores diferentes de electrones. Por ejemplo, Escherichia coli, cuando crece en condiciones aeróbicas usando glucosa como fuente de energía, usa dos NADH deshidrogenasas diferentes y dos quinolonas oxidasas diferentes, un total de cuatro cadenas de transporte que funcionan simultáneamente. Las bacterias también generan un gradiente de protones, para ello utilizan al menos tres bombas de protones, al igual que las mitocondrias, aunque se han descrito casos en los que solo existen dos o incluso una. Evidentemente siempre tiene que existir al menos una bomba de protones para poder generar el gradiente electroquímico, que es esencial para la generación de ATP. COCIENTE RESPIRATORIO = CR Anhídrido producido/ Oxigeno consumido = CR Glúcidos = 1 Alcoholes y aminoácidos < 1 Ácidos > 1 EL EFECTO TÓXICO DEL OXÍGENO: El oxígeno es el aceptor final de electrones de la respiración aeróbica. Aunque desde hace mucho se sabe que el oxígeno es tóxico para las bacterias anaerobias estrictas, sorprende saber que el oxígeno tiene también una acción tóxica sobre los microorganismos aeróbicos, y que la mayoría de los organismo disponen de enzimas que desarrollan un efecto protector sobre los productos perniciosos del oxígeno. En el campo biológico hay que diferenciar tres tipos de activación del oxígeno, que se caracterizan por el número de electrones que se transfieren simultáneamente a una molécula de oxígeno. (1) O2 + 4e- à O2- + O2(2) O2 + 2e- à O2 (3) O2 + e- à O2 La reacción 1 está catalizada por la enzima citocromo-oxidasa, el enzima terminal de la cadena de transporte de electrones. Se transfieren simultáneamente cuatro electrones, formándose dos iones O2-, cada uno de los cuales forma agua con dos protones. La reacción 2 es característica de enzimas que contienen flavinas. Transfieren simultáneamente 2 electrones, y reducen el O2 al ión peróxido O2, que con protones pasa a peróxido de hidrógeno H2O2. Esta sustancia es tóxica para la célula y es descompuesta por la enzima catalasa en agua y oxígeno. La mayoría de las bacterias aeróbicas disponen de la enzima catalasa. La reacción 3 está catalizada por un gran número de oxidasas. Únicamente se transfiere un electrón, con lo que se forma el ión superóxido, O2 que como radical es muy reactivo. El efecto protector frente a los radicales superóxido lo desarrolla la superóxido-dismutasa. RESPIRACIÓN ANAEROBICA En la respiración anaeróbica no se usa oxígeno, sino que para la misma función se emplea otra sustancia oxidante distinta, como el sulfato o el nitrato. En las bacterias con respiración anaerobia interviene también una cadena transportadora de electrones en la que se reoxidan los coenzimas reducidos durante la oxidación de los substratos nutrientes; es análoga a la de la respiración aerobia, ya que se compone de los mismos elementos (citocromos, quinonas, proteínas ferrosulfúricas, etc.). La única diferencia, por tanto radica, en que el aceptor último de electrones no es el oxígeno. Todos los posibles aceptores en la respiración anaerobia tienen un potencial de reducción menor que el O2, por lo que, partiendo de los mismos sustratos (glucosa, aminoácidos, triglicéridos), se genera menos energía en este metabolismo que en la respiración aerobia convencional. No hay que confundir la respiración anaeróbica con la fermentación, en la que no existe en absoluto cadena de transporte de electrones, y el aceptor final de electrones es una molécula orgánica; estos dos tipos de metabolismo tienen solo en común el no ser dependientes del oxígeno. En la siguiente tabla se muestran distintos aceptores de electrones, sus productos y algunos ejemplos de microorganismos que realizan tales procesos: RESPIRACIÓN ANAERÓBICA Sustrato NADH 1ATP NAD FMN FMNH Inhibidor CLO3- 1 ATP . Cit. b ox. Resp. Anaeróbica NO3-/NO2- Cit. c ox. -0,27 0,27 V -0,12 0,64 V Resp. Anaeróbica Fe++/Fe+++ y SO4=/SO2= Quinonas Cit. b red. Potenciales O/R -0,36 0,05 V Inhibidor Antimicina Cit. c red. 0,12 0,90 V 0,22 1,22 V 0,26 1,32 V Resp. Anaeróbica NO2-/NO Cit. a red. Cit. a ox. 0,30 1,44 V 1 ATP Inhibidor CN-,N3-,CO 0,82 1,50 V ACEPTORES RESPIRACIÓN ANAEROBICA Aceptor Producto final Microorganismo Nitrato Nitritos, óxidos de nitrógeno y N2 Pseudomonas, Bacillus Sulfato Sulfuros Desulfovibrio, Clostridium Azufre Sulfuros Thermoplasma CO2 Metano Methanococcus, Methanosarcina, Methanopyrus Fe3+ Fe2+ Shewanella, Geobacter, Geospirillum, Geovibrio Mn4+ Mn2+ Shewanella putrefaciens Selenato Selenito Arsenato Arsenito Desulfotomaculum Fumarato Succinato Wolinella succinogenes, Desulfovibrio, E. coli DMSO DMS Campylobacter, Escherichia TMAO TMA Clorobenzoato Benzoato Desulfomonile • FERMENTACIÓN: La fermentación es un proceso de generación de energía que utiliza una molécula orgánica como aceptor final de electrones, que no necesita cadena transportadora de electrones y que no requiere oxígeno (aunque puede realizarse en su presencia). En todas ellas se parte del ácido pirúvico. Hay varios tipos de fermentación, dependiendo de la ruta metabólica seguida. • • • • • • Tipo de fermentación Microorgasnismo Producto final Fermentación láctica Streptococcus, Lactobacillus, Bacillus Ácido láctico Fermentación alcohólica Saccharomyces (levadura) Etanol y CO2 Fermentación propiónica Anaerobios Ácido propiónico Ácido acético, CO2 y H2 Fermentación fórmica Enterobacterias Ácido láctico, Ácidofórmico, Butanodiol, CO2 y H2 Fermentación butírica Clostridium Ácido butírico, Butanol, Acetona, Isopropanol y CO2 Fermentación mixta Escherichia Salmonella Ácido láctico, Ácido succínico, Ácido acético, CO2 y H2 EL EFECTO PASTEUR Es un efecto de inhibición de la fermentación alcohólica debido a la participación de oxígeno (O2). La fermentación es un proceso completamente anaeróbico (sin la participación del aire) y la inclusión del oxígeno detiene o minimiza los procesos biológicos de las levaduras. El proceso de producción de un compuesto decrece y el consumo de glucosa disminuye, debido a que en presencia de oxigeno el NADH es oxidado por el sistema de transporte de electrones y no está presente para la transformación de piruvato a etanol. Además aumenta mucho la producción de ATP y cambia el cociente ATP/ADP inhibiendo la enzima fosfofrutoquinasa y la formación de compuestos intermedios de la glucolisis. El efecto fue descubierto en el año 1857 por el biólogo francés Louis Pasteur, que observó por primera vez que las levaduras dejaban de crecer al ser aireadas. CUADRO RESUMEN Tipo de Bacteria Aeróbica (estricta) Anaeróbica (estricta) Crecimiento en medios aeróbicos + - Crecimiento en medios anaeróbicos - + Producción de Catalasa Comentario Ejemplo Necesita O2 no fermenta Pseudomona Mycobacterium - Muere en O2 fermenta en ausencia O2 Clostridium Bacteroides + Respira en O2 fermentan sin O2 Escherichiae Staphylococcus Shigella Fermentan con y sin O2 Enterococcus Cresen con poco O2 y sin O2 Campyrobacter + Facultativa + Aerotolerant es Microaerofi licas + + escaso + + + + + escaso