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Transcript
Poblaciones pequeñas
Ing. Zoot. Juan José Jorrat
Genes
Similares en estado o condición
Producen el mismo fenotipo.
Dos individuos llevan el mismo gen pero no se
conoce que provengan de un mismo antecesor
común.
Provienen de genes ancestrales distintos.
Idénticos por descendencia
Son copias del mismo segmento de ADN
Genes idénticos por descendencia
Antepasado común
de B y C
A ( a1 _ )
C ( a1 _ )
B ( a1 _ )
O ( a1 a1)
Árbol genealógico o pedigrí: Las letras representan individuos y las flechas
relaciones de descendencia en la dirección progenitor progenie
Coeficiente de consanguinidad (F)
Pr. Que los dos genes presentes en un locus de un individuo, sean
idénticos por descendencia.
Pr. que el individuo O reciba simultáneamente vía paterna y materna
copias del mismo gen (a1) del antecesor común A.
A ( a1 _ )
B ( a1 _ )
C ( a1 _ )
O ( a1 a1)
Medidas de consanguinidad y parentesco
Coeficiente de consanguinidad: Mide la Pr. que dos
genes presentes en un locus de un individuo sean
idénticos por descendencia
Es un reflejo de la homocigosis. No mide la homocigosis en un
sentido absoluto ya que se mide una pob. base. De hecho, es
una cantidad relativa que lo que realmente mide es el
descenso de la heterocigosis en relación a una población base
en la que todos los individuos se supone que no estan
relacionados y que tienen una consanguinidad cero.
El parentesco entre dos individuos cualesquiera es el
número esperado de genes en un locus de un individuo
que son idénticos por descendencia con un gen tomado
al azar en el mismo locus del otro individuo.
Directo: puede seguirse en una línea de descendiencia
de antepasado a descendiente. Ej: Hijos, padres, abuelos,
bisabuelos.
Parentesco
Colateral: el trayecto entre 2 parientes colaterales
consta de 2 líneas de descendencia: una desde el
antepasado común hasta uno de los parientes y la otra
desde el antepasado común hasta el otro pariente. Ej:
hermanos, tíos, sobrinos, primos.
Ejemplo
Individuo
Padre
Madre
C
A
-
B
A
-
X
B
C
A ( APAM)
C
B
X Pr (APAP o AMAM)
Consanguinidad de X
FX = (1/2)
2+1
= 1/8
(Fx= (1/2)
n+1)
Donde 2 = n (número de generaciones entre los padres de X a
través del antecesor común).
¿Antepasado común consanguíneo?
Si A ya fuese consanguíneo, es posible que
AP = AM con una Pr. FA
FX = (1/2)n+1 (1+FA)
¿Y si existen más de un antecesor común?
FX = ∑ [(1/2)n+1 (1+FAc i)]
Reglas:
Identificar todos los antecesores comunes
Calcular FA para cada antecesor común
Identificar todas las vías posibles de unión entre los padres
de X
Ejemplo en el Genup
1
An. Pa. Ma
2
4
3
6
5
7
8
9
1
0
0
2
0
0
3
1
2
4
1
2
5
4
3
6
4
2
7
5
6
8
5
6
9
7
8
Población Base
Para medir el coeficiente de consanguinidad se toma como
base a un grupo de individuos, -de ahí el nombre de
población base-, que se supone no estan emparentados.
En la práctica, suponemos que tienen consanguinidad cero
(F=0), todos aquellos individuos sobre los que no disponemos
de información.
Qué hacemos en situaciones reales donde tenemos
Muchos animales
Parentescos complejos
Método tabular
Tiene la ventaja de calcular el parentesco entre todos los
individuos de la población, permitiendo prever cuál será la
consanguinidad resultante de un apareamiento determinado.
Reglas





Ordenar los individuos por fecha de nacimiento, los padres
antes que los hijos.
Construir una matriz con tantas filas y columnas como
individuos en la población.
Por encina de la primera fila, colocar los animales en
secuencia cronológica e identificar los respectivos padres.
Ídem para la primera columna.
Calcular secuencialmente los parentescos, comenzando desde
el lado superior izquierdo y avanzando hacia la derecha y
hacia abajo.
Calcular siempre el parentesco entre los más viejos y los más
nuevos, no a la inversa.
Poblaciones pequeñas
En una población animal de tamaño grande y bajo
panmixia las frecuencias génicas y genotípicas
permanecerán constantes de generación en generación,
en ausencia de migración, mutación o selección.
¿Poblaciones pequeñas?
Proceso dispersivo
Deriva Genética
Diferenciación entre
subpoblaciones
Homocigocidad
incrementada
Uniformidad dentro de
subpoblaciones
Varianza Genética
Si subdividimos una población en líneas de dimensión finita, la
consanguinidad y deriva genética resultante llevarán a un
mayor grado de uniformidad dentro de cada una de las líneas
y a una mayor diferenciación entre las líneas
Luego de t generaciones:
Varianza intra-líneas : (1-Ft) σ2A0
(1-0.5) *10 = 5
Varianza inter-líneas: (2 Ft) σ2A0
2* 0.5 * 10= 10
Varianza total :
(1+0.5) * 10 = 15
(1 + Ft) σ2A0
El incremento en la consanguinidad puede provocar:
•
Depresión consanguínea
• Disminución en la varianza aditiva
• El límite a la selección se alcanza más
rápidamente.
Muchas gracias