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Habilidades para la búsqueda de información biomédica Iñaki Gutiérrez Ibarluzea Servicio de Evaluación de Tecnologías Sanitarias (Osteba) Departamento de Sanidad - Gobierno Vasco Objetivos del taller Dotar a los participantes de los conocimientos teóricos y de las habilidades prácticas necesarios para elaborar estrategias de búsqueda de información relevante, que resuelvan lagunas de conocimiento específicas en biomedicina Objetivos del taller Aprender a elaborar preguntas de búsqueda pertinentes. Conocer la estructura básica de la información recogida en las diferentes bases de datos. Aprender a seleccionar y priorizar bases de datos informáticas dependiendo de la pregunta de búsqueda. Diseñar y testar estrategias de búsqueda adaptadas a las necesidades de información. Realizar un análisis de relevancia de las información recuperada. Apreciar las limitaciones de la exhaustividad y la importancia de la precisión en una búsqueda bibliográfica en biomedicina. Material curso Manuales: Tripdatabase, Pubmed, Cochrane, Enlaces, ETESA. Hojas de elaboración de preguntas y traducción al lenguaje documental y hoja de enumeración de bases de datos Necesidad de información Una información adecuada y de calidad es la base de las decisiones a todos los niveles: - Investigación básica - Planificación de estrategias - Gestión de programas - Desarrollo de actividades preventivas Problemática en la Recuperación de Información Actualizada Aumento de la documentación científica (information overload) Nuevas fuentes de información – Revistas con resúmenes estructurados y comentarios clínicos – Revisiones sistemáticas: Cochrane Library Acceso a Bases de Datos Bibliográficas Otros problemas en la utilización de la información científica • Manejo de la información • Sesgo de publicación • Barreras idiomáticas • Calidad de los estudios • Integración de los resultados • Actualización de los datos • Dispersa ampliamente/poco indizada • La búsqueda ideal es una perdida de tiempo salvo en investigación básica • No es posible saber que hemos encontrado todo Gran volumen de información disponible Sólo en biomedicina: más de 16.000 revistas Medline: 16 millones de citas 4 millones desde 1993 40.000 citas nuevas por mes > 4.600 revistas “If a man will begin with certainties, he shall end in doubts; but if he will be content to begin with doubts, he shall end with certainties” Francis Bacon in “The advancement of learning” (1605) Búsqueda ¿Qué? ¿Cómo? ¿Cuánto? ¿Dónde? Búsqueda inicial Tengo un paciente hipertenso ¿Lo trataría con fármacos para prevenir un infarto cerebral? Pasos en el desarrollo de una búsqueda 1-Formular una pregunta clínica o el tema a investigar 2-Identificar las bases de datos adecuadas 3-Definir la estrategia de búsqueda (adaptarnos a la base de datos) Dividir la pregunta en términos de búsqueda 4-Realizar la búsqueda Determinar los operadores booleanos Usar el tesauro o vocabulario controlado adecuado 5-Analizar críticamente los resultados 7- Contestar a la pregunta 6-Depurar la búsqueda si fuera necesario 1-Formular una pregunta clínica o el tema a investigar “Quien no sabe lo que busca, no puede interpretar lo que encuentra”. Es preferible acometer una evaluación aproximada de una buena pregunta que elaborar la respuesta exacta a una mala pregunta (Feinstein) “La pregunta bien formulada”: . Intervención o exposición . condición de interés . población . outcomes (resultados) Escenario Diagnóstico Pronóstico Etiología Tratamiento o prevención Impacto económico Formular el problema Problema Pacientes o población Patología o condición ¿Cómo describiría un grupo de pacientes similar al mío? Intervención Intervención ó Éxposición ¿Qué intervención principal estoy considerando? Comparación Resultados Intervención o exposición alternativa en el caso de existir Resultados que se quiere considerar para valorar su impacto ¿Cuál es la ¿Qué puedo alternativa esperar obtener principal con la de esta que puedo intervención? ó comparar la ¿Qué efecto intervención o la puede causar exposición? realmente esta exposición? Ejemplo Problema Pacientes o población Patología o condición Intervención Intervención ó Éxposición ¿En los pacientes ….el tratamiento con cáncer de quimioterápico estómago adyuvante… localizado y actualmente clínicamente libres de la enfermedad.. Comparación Resultados Intervención alternativa en el caso de existir Resultados que se quiere considerar para valorar su impacto … …resulta efectivo en términos de incremento de supervivencia y calidad de vida? ¿El tratamiento farmacológico de la HTA previene los infartos cerebrales? En nuestra pregunta Problema Pacientes o población Intervención ¿En los pacientes hipertensos… Patología o condición ó Éxposición ….el tratamiento farmacológico… Comparación Resultados Intervención alternativa en el caso de existir Resultados que se quiere considerar para valorar su impacto … …previene los infartos cerebrales? Traducción al lenguaje propio de la base de datos Que no al tesauro, ni a descriptores Problema Intervención Comparación Resultados ¿En los pacientes con cáncer de estómago localizado y actualmente clínicamente libres de la enfermedad.. Cáncer de estómago localizado Libres de enfermedad Gastric cancer, gastric tumour, gastric neoplasm, stomach cancer Free of disease, healed, resected ….el tratamiento quimioterápico adyuvante… … …resulta efectivo en términos de incremento de sobrevivencia y calidad de vida? Quimioterapia adyuvante Supervivencia Pronóstico Calidad de vida Adjuvant chemotherapy, anticancer therapy Survival, prognosis, quality of life, treatment outcome Problema Intervención Comparación Resultados ¿En los pacientes hipertensos… ….el tratamiento farmacológico … … …previene los accidentes cerebrovasculares? Problema Intervención Comparación Resultados ¿En los pacientes hipertensos… ….el tratamiento farmacológico … … …previene los infartos cerebrales? hipertensión tratamiento fármacos prevención infartos cerebrales Problema Intervención Comparación Resultados ¿En los pacientes hipertensos… ….el tratamiento farmacológico… … …previene los infartos cerebrales? hipertensión Fármacos, tratamiento prevención infartos cerebrales hypertension Drugs, treatment prevention stroke 2-Identificar las bases de datos adecuadas ¿Qué es una base de datos? Colección organizada de registros de información ¿Qué es una base de datos electrónica? Colección organizada de registros de información a la que se puede acceder de forma electrónica Bases de Datos Bibliográficas Registros = Referencias = Records Campos Vocabulario controlado = Fields = Tesauro Registro / Referencia NO : 1 AU : Bohle B;Schwihla H;Hu HZ;Friedl-Hajek R;Sowka S;Ferreira F AD : Department of General and Experimental Pathology,University of Vienna, Austria TI : Long-lived Th2 clones specific for seasonal and perennial allergens can be detected in blood and skin by their TCR-hypervariable regions. SB : A M X LA : ENG SO : J Immunol. 1998 Feb 15. 160 (4). P 2022-7 MH : Allergens:*BL/*IM. Hay Fever:BL/*IM. Receptors,Antigen,T-Cell *AN/GE. Rhinitis,Allergic,Perennial:BL/*IM. Skin:CH/CY/*IM. Th2 Cells:*IM. Base Sequence. Check Tags:Adult. Human. AB : We investigated the longevity of allergen-specific Th cells derived from patients suffering from either allergic rhinitis or atopic derma titis......... PT : JOURNAL ARTICLE IS : 0022-1767 ¿Cómo elegir una base de datos? Disponibilidad real o económica Especificidad temática (Cancerlit, AIDsLit,..) Si son genéricas (EMBASE o Medline) conviene buscar en las dos Muy importante que tengan lenguaje propio de conceptos (tesauro) Cuente con información a texto completo Bases de Datos Bibliográficas Biomédicas MEDLINE EMBASE HealthSTAR Indice Médico Español Cochrane Library Lilacs Pascal Biosis MEDLINE National Library of Medicine (NLM) Biomedicina 19504.600 revistas Actualización semanal Tesauro : MeSH Varias formas de acceso (Pubmed, Grateful Med,…) 16.000.000 de citas EMBASE Elsevier Biomedicina y Farmacología 1974 4.100 revistas Actualización semanal Tesauro : EMTREE 16.000.000 de citas Solapamiento entre MEDLINE y EMBASE 1.600 25.8% EMBASE 2.500 40.4% 2.100 33.8% MEDLINE Indice Médico Español CSIC Artículos de revistas biomédicas españolas 1971321 revistas Descriptores 174.764 registros Cochrane Library Colaboración Cochrane 1992Revisiones sistemáticas de ECA Actualización trimestral Descriptores y MeSH De libre acceso en el estado español Actualmente colaboración iberoamericana www.cochrane.es Bases de datos electrónicas aspectos positivos y negativos + Fácil acceso Mejora edición Inclusión de abstracts - Sólo 6000 revistas Localización de ECC dificultosa Aprox, 60-70% de ECC identificados * En España se pierde una tercera parte de ECC sólo usando Medline Clasificación de los recursos electrónicos Fuentes bibliográficas – Bases de datos libres - revistas: referencias & abstracts (raramente texto completo) – Bases de datos mediante subscripción – Catálogos de bibliotecas - título y a veces comentarios sobre el contenido Fuentes electrónicas Fuentes de texto completo – – – – – – – – – Webs de MBE y guías de práctica clínica Publicaciones de ETS Publicaciones gubernamentales/oficiales Asociaciones profesionales Listas y subscripciones de correo electrónico Búsquedas generales por internet Revistas que permiten acceso a texto completo http://www.freemedicaljournals.com http://www.freebooks4doctors.com/ Bases de libre acceso (Medline y otras) Pubmed Cancerlit Cochrane Library plus Databases del CRD - (DARE, NHS EED, HTA) Lilacs (revistas iberoamericanas) Literatura gris La que se produce en niveles altos de la administración, académicos, de negocios y en la industria. Formato electrónico o impreso. No controlada por las grandes empresas de publicación. No convencionales y muchas veces efímeras Organismos gubernamentales u oficiales (literatura gris) Programas y políticas de salud Muchos documentos a texto completo Acceso a estadísticas y datos de supervivencia Muchos nuevos accesos menores con datos de interés Algunos sitios oficiales o gubernamentales de interés Health Canada US Centers for Disease Control World Health Organisation UK Department of Health US National Cancer Institute Australian Dept Health & Aged Care Instituto de salud Carlos III Algunas fuentes de literatura gris The New York Academy of Medicine http://www.nyam.org/library/grey.shtml Internet en general Menor eficiencia Evaluar la autoridad (.ac .edu .org) Conviene leer las indicaciones previamente Sólo usar cuando se agotan otras busquedas Gran ayuda en los buscadores locales De gran utilidad para la literatura gris Buscadores Usar el formato http://www.nombre que aparece en la otra columna.com Google Altavista Northernlight Yahoo (regional) Metacrawler Dogpile Nuevos buscadores en construcción La biblioteca del NHS del Reino Unido NeHL National electronic Library for Health http://www.nelh.nhs.uk Bases de Datos de la National Library of Medicine indizadas con Medical Subject Headings (MeSH) AIDSLINE: Literatura sobre SIDA AVLINE: Materiales audiovisuales para profesionales de la salud BIOETHICS: Literatura sobre ética biomédica CANCERLIT: Literatura sobre cáncer HealthSTAR: Planificación y gestión sanitaria MEDLINE: Literatura biomédica TOXLINE: Literatura sobre toxicología Servidores de información ($) OVID SilverPlatter EMBASE.com Trip de pago METABUSCADORES Facilitar al máximo y hacer más eficiente la búsqueda de información. Buscando en múltiples sitios y entregando un resumen de los artículos relevantes acerca del tema que se solicitó. Diferencia entre ellos es la forma de buscar, los lugares en que buscan y como presentan la información. METABUSCADORES Información y guías en castellano en: http://escuela.med.puc.cl/Recursos/MBE2001/metabuscadores.html 3-Definir la estrategia de búsqueda Definir la estrategia de búsqueda Separar la pregunta en conceptos que puedan ser buscados por separado y combinados Determinar los operadores booleanos Determinar los operadores booleanos AND, OR, NOT Stomach neoplasm – AND Chemotherapy, adjuvant – AND survival Operadores de adyacencia o proximidad (adj) Otros operadores El truncamiento (* o $) recombin*: recombinant, recombination,.. Uso de parentesis (((adjuvant chemotherapy or antineoplasic agents) and stomach cancer) or gastric cancer) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi En nuestra pregunta Hypertension treatment drugs Prevention stroke Hypertension AND (treatment OR drugs) AND prevention AND stroke http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi Utilizar el tesauro apropiado o el vocabulario controlado Tesauro Vocabulario controlado de términos que tienen entre ellos relaciones y que se aplican a un campo concreto del conocimiento. – Descriptores : términos que pueden utilizarse en la indización. – No descriptores: términos prohibidos que remiten siempre a un descriptor. Tesauro o Vocabulario controlado En MEDLINE: MeSH y “limitadores” En EMBASE: EMTREE En otras bases de datos: Descriptores Importancia del Tesauro Diccionario especial Se utiliza un término para cada concepto – simplifica la búsqueda – elimina la utilización de sinónimos (teóricamente) – recupera términos más específicos (calificadores) DeCS http://decs.bvs.br/ Hipertensión AND (tratamiento OR fármacos) AND prevención AND infartos cerebrales Problema Intervención Comparación Resultados ¿En los pacientes hipertensos… ….el tratamiento con fármacos … … …previene los accidentes cerebrovasculares? hipertensión fármacos antihipertensivos prevención accidentes cerebrovasculares hypertension antihypertensive agents cerebrovascular accident 4-Realizar la búsqueda Hypertension AND antihypertensive agents AND cerebrovascular accident http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi Consideraciones MeSH MeSH Tree Major Headings Details Subheading Explode http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi 5-Analizar críticamente los resultados Valorar críticamente los resultados Analizar relevancia de los documentos recuperados Relación documentos recuperados que responden a nuestra pregunta frente a documentos recuperados totales (especificidad) Los artículos no responden a mi pregunta Pocos artículos recuperados (o ninguno) Muchos artículos recuperados 6-Depurar la búsqueda si fuera necesario Los resultados no sirven para contestar la pregunta formulada No se han escogido bien los términos del tesauro La combinación de los términos no es correcta Sinónimos Considerar el uso de sinónimos, o términos de texto libre Considerar sufijos, prefijos, “comodines” (truncamientos) Importancia del uso de sinónimos o texto libre Recuperar palabras no indizadas que aparecen en títulos o resúmenes Combinarlas con lenguaje controlado para validar nuestra búsqueda Pocos artículos recuperados (o ninguno) Revisar que los términos empleados estén bien escritos. Intentar identificar otros términos, sinónimos de los utilizados, que sirvan para combinarse entre ellos mediante el operador OR Buscar un término de tesauro más genérico que el utilizado No utilizar calificadores Aumentar la sensibilidad de la búsqueda “Muchos” artículos recuperados Tratar de identificar un descriptor adicional y relevante que se pueda combinar mediante el operador AND Identificar elementos combinados mediante AND que podrían combinarse mediante un operador de adyacencia o proximidad Identificar términos más específicos en el tesauro (por ejemplo cerebral infarction en vez de cerebrovascular accident en el tesauro EMTREE) “Muchos” artículos recuperados (cont.) Añadir al descriptor de tesauro un calificador (por ejemplo: stomach cancer/Drug therapy ) Limitar la búsqueda a un campo concreto Utilizar los límites permitidos por la base de datos Utilizar un filtro de búsqueda Considerar el uso de limitadores Algunas bases de datos permiten limitar la búsqueda a: – tipo de artículo, – idiomas – sexo – grupos de edad – etc. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi Filtros de búsqueda FILTROS: ¿Qué son? Estrategias de búsqueda predefinidas para identificar estudios de la mejor calidad de evidencia Buscan investigaciones de calidad metodológica Eliminan las débiles FILTROS: Tipos Para cada tipo de pregunta clínica: Terapia Diagnóstico Pronóstico Etiología y riesgo Daño Revisiones sistemáticas Evaluación económica FILTROS: Tipos “Clinical queries” Filtros Se preestablecidos ejecutan directamente Pubmed ajusta para sensibilidad o precisión Category Optimized For Broad/ Narrow PubMed Equivalent sensitive/broad 99%/70% (clinical[Title/Abstract] AND trial[Title/Abstract]) OR clinical trials[MeSH Terms] OR clinical trial[Publication Type] OR random*[Title/Abstract] OR random allocation[MeSH Terms] OR therapeutic use[MeSH Subheading] specific/narrow 93%/97% randomized controlled trial[Publication Type] OR (randomized[Title/Abstract] AND controlled[Title/Abstract] AND trial[Title/Abstract]) sensitive/broad 98%/74% sensitiv*[Title/Abstract] OR sensitivity and specificity[MeSH Terms] OR diagnos*[Title/Abstract] OR diagnosis[MeSH:noexp] OR diagnostic * [MeSH:noexp] OR diagnosis,differential[MeSH:noexp] OR diagnosis[Subheading:noexp] specific/narrow 64%/98% specificity[Title/Abstract] sensitive/broad 93%/63% risk*[Title/Abstract] OR risk*[MeSH:noexp] OR risk *[MeSH:noexp] OR cohort studies[MeSH Terms] OR group*[Text Word] specific/narrow 51%/95% (relative[Title/Abstract] AND risk*[Title/Abstract]) OR (relative risk[Text Word]) OR risks[Text Word] OR cohort studies[MeSH:noexp] OR (cohort[Title/Abstract] AND stud*[Title/Abstract]) sensitive/broad 90%/80% incidence[MeSH:noexp] OR mortality[MeSH Terms] OR follow up studies[MeSH:noexp] OR prognos*[Text Word] OR predict*[Text Word] OR course*[Text Word] specific/narrow 52%/94% prognos*[Title/Abstract] OR (first[Title/Abstract] AND episode[Title/Abstract]) OR cohort[Title/Abstract] therapy diagnosis etiology prognosis http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/clinical.html FILTROS: Efectividad S = a/(a+c) X 100 Revisión manual * P = a/(a+b) X 100 E = d/(b+d) X 100 Relevante (gold estándar) No relevante ** a b Filtro de Recuperadas búsqueda No recuperadas c d a+c b+d *Revisión manual: método utilizado para identificar los registros relevantes y no relevantes. ** Gold Standard/quasi gold estándar: conjunto de registros relevantes contra el que el resultado de la estrategia de búsqueda es testado y validado. FILTROS: Checklist A. Objetivo B. Diseño C. Gold estándar D. Evaluación E. Validación F. Presentación G. Implementación http://www.phru.nhs.uk/casp/filters.htm Conclusiones ¡¡¡¡Cuidado con las estrategias con terminos muy generales¡¡¡¡ Construir la pregunta Huir del lenguaje natural (cuando sea posible) Preferir siempre las búsquedas altamente especificas: Usar tesauros y descriptores Filtros metodológicos Rehacer la búsqueda siempre que sea necesario