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La Medicina Individualizada,
una Oportunidad para la Innovación
Genes determinantes del riesgo a DMT1
en población vasca
Donostia 22/06/2006
J. RAMON BILBAO
HOSPITAL DE CRUCES
¿qué es la diabetes mellitus de tipo 1?
La DMT1 es una enfermedad del SISTEMA INMUNE,
que se manifiesta como un dŽficit de insulina .
AMBIENTE
100%
Cƒ LULA §
FRACASO Cƒ LULA §
DIABETES
CLINICA
10%
GENƒ TICA
PROCESO AUTOINMUNE
¿qué es la diabetes mellitus de tipo 1?
La DMT1 es una enfermedad del SISTEMA INMUNE,
que se manifiesta como un dŽficit de insulina .
AMBIENTE
100%
Cƒ LULA §
FRACASO Cƒ LULA §
INSULITIS
10%
Inflintraci—
n del islote por
macr—
fagos
y linfocitos
T
TICA
GENƒ
AUTOINMUNE
PROCESO
DIABETES
CLINICA
¿qué es la diabetes mellitus de tipo 1?
La DMT1 es una enfermedad del SISTEMA INMUNE,
que se manifiesta como un dŽficit de insulina .
insulinaAMBIENTE
100%
Cƒ LULA §
GAD
FRACASO Cƒ LULA §
DIABETES
CLINICA
IA-2
INSULITIS
10%
Inflintraci—
n del islote por
macr—
fagos
y linfocitos
T
TICA
GENƒ
AUTOINMUNE
PROCESO
Otros:
CPH
Autoanticuerpos circulantes
ICA69
Anti-islote (ICA)
...
¿qué es la diabetes mellitus de tipo 1?
La DMT1 es una enfermedad del SISTEMA INMUNE,
que se manifiesta como un dŽficit de insulina .
AMBIENTE
100%
Cƒ LULA §
FRACASO Cƒ LULA §
DIABETES
CLINICA
10%
GENƒ TICA
PROCESO AUTOINMUNE
¿qué es la diabetes mellitus de tipo 1?
La DMT1 es una enfermedad del SISTEMA INMUNE,
.
que se manifiesta como un dŽficit de insulina
TERAPIA
SUSTITUTIVA
AMBIENTE
DEFICIT DE
INSULINA
100%
Cƒ LULA §
FRACASO Cƒ LULA §
DIABETES
CLINICA
10%
GENƒ TICA
PROCESO AUTOINMUNE
¿qué es la diabetes mellitus de tipo 1?
La DMT1 es una enfermedad del SISTEMA INMUNE,
de insulina . DE
que se manifiesta como un dŽficit TRANSPLANTE
ISLOTES
CÉLULAS TRONCALES
AMBIENTE
DEFICIT DE
INSULINA
100%
Cƒ LULA §
FRACASO Cƒ LULA §
DIABETES
CLINICA
10%
GENƒ TICA
PROCESO AUTOINMUNE
¿qué es la diabetes mellitus de tipo 1?
La DMT1 es una enfermedad del SISTEMA INMUNE,
de insulina . DE
que se manifiesta como un dŽficit TRANSPLANTE
PREVENCIÓN
ISLOTES
CÉLULAS TRONCALES
AMBIENTE
DEFICIT DE
INSULINA
100%
Cƒ LULA §
FRACASO Cƒ LULA §
DIABETES
CLINICA
10%
GENƒ TICA
PROCESO AUTOINMUNE
¿qué es la diabetes mellitus de tipo 1?
La DMT1 es una enfermedad del SISTEMA INMUNE,
que se manifiesta como un dŽficit de insulina .
PREVENCIÓN
AMBIENTE
DEFICIT DE
INSULINA
100%
Cƒ LULA §
FRACASO Cƒ LULA §
DIABETES
CLINICA
10%
GENƒ TICA
PROCESO AUTOINMUNE
¿qué es la diabetes mellitus de tipo 1?
La DMT1 es una enfermedad del SISTEMA INMUNE,
que se manifiesta como un dŽficit de insulina .
PREVENCIÓN
AMBIENTE
100%
Cƒ LULA §
RESULTADOS ADA2002
DEFICIT DE
INSULINA
FRACASO Cƒ LULA §
DIABETES
CLINICA
O
1
2
3 4
169 144 96 69 39
10%TTO
NO EFECTIVO
CTROL170
131PROCESO
101 69 AUTOINMUNE
40
GENƒ TICA
¿qué sabemos de la genética de DMT1?
RIESGO POR FAMILIARIDAD
DM TIPO 1
Poblaci—n general
0,4%
R.R.
Familiares
Padres
3%
8
Hijos
4%
10
Hermanos
6%
15
30-50 %
50
Gemelos
¿qué sabemos de la genética de DMT1?
ENFERMEDAD POLIG ƒ NICA
LOCUS
CHROMOSOME
CROMOSOMA
MARKERS
MARCADOR
IDDM 1
IDDM 2
IDDM 3
IDDM 4
IDDM 5
IDDM 6
IDDM 7
IDDM 8
8
IDDM
IDDM 9
IDDM10
IDDM11
IDDM11
IDDM12
IDDM12
IDDM13
IDDM13
IDDM15
IDDM15
IDDM17
IDDM17
6p21.3
11p15.5
15q26
11q13.3
6q25
18q12-q21
2q31-q33
6q27
6q27
3q21-q25
10p11
14q24-q31
14q24-q31
2q33
2q33
2q34
2q34
6q21
6q21
10q25
10q25
HLA DR/DQ
INS-VNTR
D15S107
FGF3/D11S1917
ESR/a046xa9
D18S64/D18S487
D2S152
D6S281
D6S281
D3S1303
D10S193
D14S57
D14S57
CTLA4
CTLA4
D2S164
D2S164
D6S283
D6S283
D10S1750/D10S1773
D10S1750/D10S1773
DM TIPO 1
CANDIDATE
GENES
CANDIDATO
HLA genes
INSULIN
ICE, CD3, ...
TNDM, SOD2
IL1R1, HOXD
MnSOD
MnSOD
ENSA, SEL-IL
SEL-IL
ENSA,
CTLA4
CTLA4
IGFBP2, IGFBP5
IGFBP5
IGFBP2,
TNDM
TNDM
s
2,6
1,3
1,4
1,07
1,16
1,1
1,3
1,4
1,4
1,3
1,5
1,6
1,6
1,6
1,6
1,34
1,34
¿qué sabemos de la genética de DMT1?
susceptibilidad gen Žtica
LOCUS CROMOSOMA
MARCADOR
IDDM1 Genes HLA clase II del CMH (6p21)
p
PRESENTACIî N DE ANT’GENOS
q
¥ educaci—n linfocitaria
¥ activaci—n de respuesta inmune
6p21
A
C
~50%
B
Clase I
TNF
Bf
C2
C4
Clase III
pŽ
p tido
MHC TCR
DR
DQ
DP
Clase II
Linfocito T
MUY POLIMîRFICOS
¥ GENES 6p21
DR - DRB1
DQ - DQB1
0301B
A3 - C
C4
2 -TNF
0201Bf C2
4 - 0401
8 - 0302
2 - 1501
6 - 0602
...
...
susceptibilidad gen Žtica
LOCUS CROMOSOMA
MARCADOR
IDDM1 Genes HLA clase II del CMH (6p21)
p
NUMBER OF ALLELES
450
q
PRESENTACIî N DE ANT’GENOS
412
¥ educaci—n linfocitaria
¥ activaci—n de respuesta inmune
6p21
400
350
271
300
250
A
C
200
207
B
TNF
150 I
Clase
Bf
C2
C4
DR
Clase III
100
50
DQ
MUY POLIMîRFICOS
¥ GENES 6p21
DP
100
Clase II
93
45
2
0
20pŽ
p tido
19
MHC TCR
A
DR
~50%
B1 A1 B1 A1
DQ
Linfocito T
B1
A
B
C
DP
Class II Alleles
Class I Alleles
DR - DRB1
DQ - DQB1
0301B
A3 - C
C4
2 -TNF
0201Bf C2
4 - 0401
8 - 0302
2 - 1501
6 - 0602
...
...
susceptibilidad gen Žtica
LOCUS CROMOSOMA
MARCADOR
IDDM1 Genes HLA clase II del CMH (6p21)
p
PRESENTACIî N DE ANT’GENOS
q
¥ educaci—n linfocitaria
¥ activaci—n de respuesta inmune
6p21
A
C
~50%
B
Clase I
TNF
Bf
C2
C4
Clase III
DR
DQ
DP
Clase II
¥¥
GENES
MUY
POLIM
î RFICOS
6p21
GENES
MUY
POLIMîRFICOS
¥ DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO
DR - DRB1
DR - DRB1
pŽ
p tido
MHC TCR
Linfocito T
0301
A33 -- C
0301B
44 -- 0401
0401
DQ - DQB1
DQ - DQB1
C4
2
0201
Bf
C2
2 - TNF
0201
0302
88 - - 0302
22 -- 1501
1501
0602
66 - - 0602
...
...
......
susceptibilidad gen Žtic
LOCUS CROMOSOMA
MARCADOR
IDDM1 Genes HLA clase II del CMH (6p21)
p
PRESENTACIî N D
q
¥ educaci—n linfoc
¥ activaci—n de re
6p21
A
C
B
Clase I
TNF
Bf
C2
C4
Clase III
pŽ
p tido
MHC TCR
DR
DQ
DP
Clase II
MUY P
¥ GENES 6p21
DR3 / DR4
DR - DRB1
DQ2 / DQ8
Linfocito T
0301B
A3 - C
4 - 0401
2 - 1501
...
susceptibilidad gen Žtic
LOCUS CROMOSOMA
MARCADOR
IDDM1 Genes HLA clase II del CMH (6p21)
p
PRESENTACIî N D
q
¥ educaci—n linfoc
¥ activaci—n de re
6p21
A
C
B
Clase I
TNF
Bf
C2
C4
Clase III
pŽ
p tido
MHC TCR
DR
DQ
DP
Clase II
MUY P
¥ GENES 6p21
DR3 / DR4
DR - DRB1
DQ2 / DQ8
Linfocito T
0301B
A3 - C
4 - 0401
2 - 1501
...
DR3/4 >DR4/DR4>DR4/DRx> DR3/DR3=DR3/DRy
susceptibilidad gen Žtic
LOCUS CROMOSOMA
MARCADOR
IDDM1 Genes HLA clase II del CMH (6p21)
DM TIPO p1 ESTUDIO DAISY
q
ND
FAMILIAR
DE DM1
no DR3 / DR4
¥ educaci—n linfoc
6.90
¥ activaci—n de re
(RR
= 5.0)
C
B
TNF
DR3 / DR4
36.60 ¥ GENES 6p21
MUY P
6p21
A
PRESENTACIî
R.R.
Clase I
Bf
C4
DR
Clase III
POBLACIî N
GENERAL
(RR = 1.0)
C2
DQ
DP
Clase II
pŽ
p tido
no TCR
DR3
MHC
/ DR4
Linfocito T
DR3 / DR4
DR3 / DR4
DR - DRB1
DQ2 / DQ8
A3 < 1.00
0301B
C
4 - 0401
1.40
2 - 1501
...
DR3/4 >DR4/DR4>DR4/DRx> DR3/DR3=DR3/DRy
%
60
149 T1DM alleles
128 AFBAC alleles
50
40
30
20
10
0
1501 1502 0301 0401 0402 0403 0404 0405 1301 1302 1401 0701
D R2
OR
0
D R3
9 .4 2
D R4
D R6
0 .1
D R7
0 .2 8
Únicamente DRB1*0301 confiere riesgo a
T1DM en nuestra población
DR3/3 y DR3/X son tan frecuentes como
DR3/4 en nuestros pacientes T1DM
30
25
20
15
10
5
0
DR3/DR3
DR3/X
DR3/DR4
DR4/DR4
DR4/X
X/X
DR3/3 y DR3/X son tan frecuentes como
DR3/4 en nuestros pacientes T1DM
30
25
20
15
80% son DR3+
10
5
0
DR3/DR3
DR3/X
DR3/DR4
DR4/DR4
DR4/X
X/X
DR3/3 y DR3/X son tan frecuentes como
DR3/4 en nuestros pacientes T1DM
30
25
20
15
35% son DR4+
10
5
0
DR3/DR3
DR3/X
DR3/DR4
DR4/DR4
DR4/X
X/X
Objective
HLA (6p21)
F
A
HLA (6p21)
TWO INDEPENDENT SUSCPETIBILITY REGIONS
TWO
INDEPENDENT
SUSCPETIBILITY
F
A
C
B
C4
DR
TNF Bf C2 REGIONS
C D6sHLA-F
B
D6s265
Bf
TNF
C2
C4TNFa
D6s273
DR
DQ
D6s1014
DP
DQ
DP
DQCar TAP1
D6s291
MIC-A
D6sHLA-F
D6s265
TNFa
D6s273
D6s1014
DQCar TAP1
D6s291
MIC-A
Independent contribution of
MICA to Autoimmunity
Independent contribution of
MICA to Autoimmunity
DRB1
DQA1 DQB1
DRB1
DQA1
DQB1
0301
DQA1 DQB1
DQB1
0501
0201
R
0102
A
0602
P
DRB1
DRB1
DQA1
0301
0501
0201
1501
0102
A
0602
1501 R
P
To determine whether shared susceptibility
markers extend from the central (HLA-DRB1)
through the telomeric MHC region
Objective
HLA (6p21)
F
A
HLA (6p21)
TWO INDEPENDENT SUSCPETIBILITY REGIONS
TWO
INDEPENDENT
SUSCPETIBILITY
F
A
C
B
C4
DR
TNF Bf C2 REGIONS
C D6sHLA-F
B
D6s265
Bf
TNF
C2
C4TNFa
D6s273
DR
DQ
D6s1014
DP
DQ
DP
DQCar TAP1
D6s291
MIC-A
D6sHLA-F
D6s265
TNFa
D6s273
D6s1014
DQCar TAP1
D6s291
MIC-A
Independent contribution of
MICA to Autoimmunity
Independent contribution of
2º
MICA to Autoimmunity
locus
DRB1
DRB1
DRB1
DQA1 DQB1
DRB1
DQA1
DQB1
0301
DQA1 DQB1
DQB1
0501
0201
R
0102
A
0602
P
DQA1
1501 R
0301
0501
0201
1501
0102
A
0602
P
To determine whether shared susceptibility
markers extend from the central (HLA-DRB1)
through the telomeric MHC region
Objective
HLA (6p21)
F
A
HLA (6p21)
TWO INDEPENDENT SUSCPETIBILITY REGIONS
TWO
INDEPENDENT
SUSCPETIBILITY
F
A
C
B
C4
DR
TNF Bf C2 REGIONS
C D6sHLA-F
B
D6s265
Bf
TNF
C2
C4TNFa
D6s273
DR
DQ
D6s1014
DP
DQ
DP
DQCar TAP1
D6s291
MIC-A
D6sHLA-F
D6s265
TNFa
D6s273
D6s1014
DQCar TAP1
D6s291
MIC-A
Independent
contribution ofen la
¿Existe otro
gen de susceptibilidad
región telomérica
a HLA clase II?
MICA to Autoimmunity
DRB1
DQA1 DQB1
DRB1
DQA1
DQB1
Independent contribution of
0301
¿La contribución de este gen,DRB1
es idéntica
en DQB1
DQA1
DRB1
DQA1 DQB1
MICA to Autoimmunity
todos los haplotipos HLA de riesgo?
0501
0201
R
0102
A
0602
P
1501 R
0301
0501
0201
1501
0102
A
0602
P
To determine whether shared susceptibility
markers extend from the central (HLA-DRB1)
through the telomeric MHC region
Objective
HLA (6p21)
F
A
HLA (6p21)
TWO INDEPENDENT SUSCPETIBILITY REGIONS
TWO
INDEPENDENT
SUSCPETIBILITY
F
A
C
B
C4
DR
TNF Bf C2 REGIONS
C D6sHLA-F
B
D6s265
Bf
TNF
C2
C4TNFa
D6s273
DR
DQ
D6s1014
DP
DQ
DP
DQCar TAP1
D6s291
MIC-A
D6sHLA-F
A
D6s265
TNFa
D6s273
BMIC-A MICA
D6s1014
COMPL.
DQCar TAP1
DRB1 DQA1 DQB1
Independent contribution of
MICA to Autoimmunity
Independent contribution of
30
18
4
F1C30
OR
DRB1
DRB1
MICA to Autoimmunity
70 (47.5%)
8.8
(4.4-17.2)
D6s291
DRB1
DQA1
DQB1
0301
DQA1 DQB1
DQB1
0501
0201
DQA1
0301
0501
0201
1501
0102
A
0602
12 ( 9.3%)
DQA1 DQB1
DRB1
0301
DPB1
1501
0501
R
P
0102
A0201 0602
R
0202
P
0401
1 determine
8
5.1
SC01
To
whether shared susceptibility
markers extend from the central (HLA-DRB1)
through the telomeric MHC region
Objective
HLA (6p21)
F
A
HLA (6p21)
TWO INDEPENDENT SUSCPETIBILITY REGIONS
TWO
INDEPENDENT
SUSCPETIBILITY
F
A
C
B
C4
DR
TNF Bf C2 REGIONS
C D6sHLA-F
B
D6s265
Bf
TNF
C2
C4TNFa
D6s273
DR
DQ
D6s1014
DP
DQ
DP
DQCar TAP1
D6s291
MIC-A
D6sHLA-F
D6s265
A
TNFa
D6s273
BMIC-A MICA
D6s1014
COMPL.
18 (12.1%)
D6s291
DRB1 DQA1 DQB1 DPB1
Independent contribution of
MICA to Autoimmunity
OR
47 (36.7%)
Independent
contribution of
10.2
30
18
4
F1C30
DRB1
DRB1
MICA to Autoimmunity
(4.6-22.7)
8 ( 6.2%)
OR
15.8
DQCar TAP1
DRB1
DQA1 DQB1
DRB1
DQA1
DQB1
0301
DQA1 DQB1
DQB1
0501
0201
R
0202
DQA1
0301
0301
0501
0201
1501
0501
R
1501
0102
A
0602
P
0102
A0201 0602
P
0401
8
5.1
SC01
To
determine
whether
shared
susceptibility
(1.7-20.2)
3 ( 2.3%)
markers extend from the central (HLA-DRB1)
through the telomeric MHC region
Objective
HLA (6p21)
F
A
HLA (6p21)
TWO INDEPENDENT SUSCPETIBILITY REGIONS
TWO
INDEPENDENT
SUSCPETIBILITY
F
A
C
B
C4
DR
TNF Bf C2 REGIONS
C D6sHLA-F
B
D6s265
Bf
TNF
C2
C4TNFa
D6s273
DR
DQ
D6s1014
DP
DQ
DP
DQCar TAP1
D6s291
MIC-A
D6sHLA-F
D6s265
A
TNFa
D6s273
D6s1014
B MICA COMPL.
MIC-A
18 (1 2. 1%)
D6s291
DRB1 DQA1 DQB1
Independent contribution of
MICA to Autoimmunity
OR
47 (3 6. 7%)
Independent
contribution of
1
0.
2
30
18
4
F1C30
DRB1
DRB1
MICA to Autoimmunity
(4.6-22.7)
8 ( 6 .2%)
OR
15 .8
DQCar TAP1
DRB1
DQA1 DQB1
DRB1
DQA1
DQB1
0301
DQA1 DQB1
DQB1
0501
0201
DQA1
0301
0301
0501
0201
1501
0102
A
0602
DPB1
1501
0501
R
P
0102
A0201 0602
R
0202
P
0401
8
5.1
SC01
To
determine
whether
shared
susceptibility
(1.7-20.2)
3 (2 .3%)
markers extend from the central (HLA-DRB1)
through the telomeric MHC region
Objective
HLA (6p21)
F
A
HLA (6p21)
TWO INDEPENDENT SUSCPETIBILITY REGIONS
TWO
INDEPENDENT
SUSCPETIBILITY
F
A
C
B
C4
DR
TNF Bf C2 REGIONS
C D6sHLA-F
B
D6s265
Bf
TNF
C2
C4TNFa
D6s273
DR
DQ
D6s1014
DP
DQ
DP
DQCar TAP1
D6s291
MIC-A
D6sHLA-F
D6s265
A
TNFa
D6s273
D6s1014
B MIC-A
MICA COMPL.
DQCar TAP1
DRB1 DQA1 DQB1
Independent contribution of
MICA to Autoimmunity
Independent contribution of
30 18
4
F1C30 DRB1
DRB1
MICA to Autoimmunity
0301
D6s291
DRB1
DQA1 DQB1
DRB1
DQA1
DQB1
0301
DQA1 DQB1
DQB1
0501
0201
R
0202
DQA1
1501 R 0201
0102
A
0301
0501 0501
0201
OR
1501
29
(19,6%)
6.0
1To determine
8
5.1
SC01
whether
5 ( 3.9%) (2.2-16.1)
DPB1
0102
A
0602
P
0602
P
0401
shared susceptibility
markers extend from the central (HLA-DRB1)
through the telomeric MHC region
Objective
HLA (6p21)
F
A
HLA (6p21)
TWO INDEPENDENT SUSCPETIBILITY REGIONS
TWO
INDEPENDENT
SUSCPETIBILITY
F
A
C
B
C4
DR
TNF Bf C2 REGIONS
C D6sHLA-F
B
D6s265
Bf
TNF
C2
C4TNFa
D6s273
DR
DQ
D6s1014
DP
DQ
DP
DQCar TAP1
D6s291
MIC-A
D6sHLA-F
D6s265
A
TNFa
D6s273
D6s1014
B MIC-A
MICA COMPL.
DQCar TAP1
DRB1 DQA1 DQB1
Independent contribution of
MICA to Autoimmunity
Independent contribution of
30 18
4
F1C30 DRB1
DRB1
MICA to Autoimmunity
0301
1501
D6s291
DRB1
DPB1
DQA1 DQB1
DRB1
DQA1
DQB1
0301
DQA1 DQB1
DQB1
0501
0201
R
0202
DQA1
1501 R 0201
0102
A
0301
0501 0501
0201
0102
A
0602
P
0602
P
0401
8
5.1
SC01
To1 determine
whether shared susceptibility
markers extend from the central (HLA-DRB1)
0101
through the telomeric MHC region
Objective
HLA (6p21)
F
A
HLA (6p21)
TWO INDEPENDENT SUSCPETIBILITY REGIONS
TWO
INDEPENDENT
SUSCPETIBILITY
F
A
C
B
C4
DR
TNF Bf C2 REGIONS
C D6sHLA-F
B
D6s265
Bf
TNF
C2
C4TNFa
D6s273
DR
DQ
D6s1014
DP
DQ
DP
DQCar TAP1
D6s291
MIC-A
D6sHLA-F
D6s265
A
TNFa
D6s273
D6s1014
B MIC-A
MICA COMPL.
DQCar TAP1
DRB1 DQA1 DQB1
Independent contribution of
MICA to Autoimmunity
Independent contribution of
30 18
4
F1C30 DRB1
DRB1
MICA to Autoimmunity
0301
1501
D6s291
DRB1
DPB1
DQA1 DQB1
DRB1
DQA1
DQB1
0301
DQA1 DQB1
DQB1
0501
0201
R
0202
DQA1
1501 R 0201
0102
A
0301
0501 0501
0201
0102
A
0602
P
0602
P
0401
8
5.1
SC01
To1 determine
whether shared susceptibility
markers extend from the central (HLA-DRB1)
0101
through the telomeric MHC region
CD
0.4%
7%
UNTREATED CD
DM
0.4%
Allele count
60
count
Allele
count
T1DM Allele
Allele count
60
pc=0.00065
AFBAC
40
pc=0.00065
40
50
T1DM
CD
CD
AFBAC
AFBAC
AFBAC
50
40
30 30
40
30
pc=0.02
30pc=0.02
20 20
pc=0.02
20
pc=0.02
pc=0.08
pc=0.08
20
10 10
10
10
0
A4
A5
A5.1
A6
0
A9
00
A4
A5
A5.1
A6
A9
45
80
40
70
35
60
30
50
25
40
20
30
15
20
10
5
10
0
0
DR01
DR15
DR16
DRB1
RISK
DR03
DR04
DR05
DR13
DQA1
DQB1
RR (95% CI)
pc
DR07
DR08
DR09
DR01 DR15 DR16 DR03 DR04 DR05 DR13 DR14 DR07 DR08 DR09 DR10
DR10
LINKAGE DISEQUILIBRIUM
DPB1
n
R
A5.1-DR3
3.85 (1.35-13.5) 0.015
26
R
A4-DR3
8.56 (3.39-25.5) <10-6
48
P
A5.1-DR2
0.00 (0.00-0.60) <10-6
14
P
A9
0.27 (0.08-0.74) 0.02
D’
DRB1
RISK
p
DQA1
DQB1
RR (95% CI)
pc
LINKAGE DISEQUILIBRIUM
DPB1
D’
n
4.62 (1.75-13.6) 0.0006 33 0.3533
p
ns
R
A5.1-DR3
0.6241
0.0045
R
A4-DR3
5.7 (1.2-54.9)
0.015
13
0.4067
0.008
5.7 (1.2-54.9)
0.015
14
0.2857
0.0017
0.0430
R
A6-DR7
0.6609
PP
A9
A9
--
--
-
-
0.18(0.00-0.47)
(0.02-0.93) 0.004
0.08
0.06
0.0003
Pacientes y Métodos
72 Familias con DM tipo 1
• 81 pacientes (42 v / 39 m), edad media al Diagnóstico = 14,5± 9,9 años
239 familiares de primer grado
81 TRIOS con Enfermedad Celiaca
• 81 pacientes (edad media al diagnóstico 3,98± 3,94 años)
HLA-DR3 homocigotos
20 DM1
16 CD
CARACTERIZACION DEL HAPLOTIPO EXTENDIDO
45%
DM1
EC
40%
35%
30%
25%
20%
15%
10%
5%
0%
B18-DR3 /
B18-DR3
B18-DR3 /
X
B18-DR3 /
B8-DR3
B8-DR3 /
X
B8-DR3 /
B8-DR3
p<10-6
Genotipado de SNPs de alta densidad de
la región HLA en 6p21
1. Caracterización de haplotipos en la población
2. Búsqueda de recombinantes discordantes
MHC PANEL SET (Illumina Inc.)
- 2,360 SNPs en 5 Mb (media de distancia 2kb)
- región Crom.6: 28.9-33.9 Mb
Genotipado de SNPs de alta densidad de
la región HLA en 6p21
MHC PANEL SET (Illumina Inc.)
- 2,360 SNPs en 5 Mb (media de distancia 2kb)
- región Crom.6: 28.9-33.9 Mb
-
19 pacientes con DM tipo 1
32 hermanos discordantes
Trios Control (Población General )
HLAidénticos?
NUEVO LOCUS
RECESIVO
NUEVO LOCUS
RECESIVO
NUEVO LOCUS
ALELO DE RIESGO
FIJADO en
A30-B18-DR3
NUEVO LOCUS
HOMOCIGOSIDAD
DIABETOGENICIDAD
El haplotipo extendido DR3 característico de la
población vasca (A30-B18-DR3-DQ2-DP2) confiere
mayor riesgo a DMT1, indicativo de la presencia de
otro locus mayor de susceptibilidad en MHC.
Este
haplotipo
muestra
una
extraordinaria
conservación alo largo de 5Mb de la región MHC, que
probablemente incluye el alelo de riesgo de este
segundo locus.
Las regiones que muestran un grado de homozigosidad
aumentado podrían indicar la localización de este gen
de susceptibilidad.
El haplotipo extendido DR3 característico de la
población vasca (A30-B18-DR3-DQ2-DP2) confiere
mayor riesgo a DMT1, indicativo de la presencia de
otro locus mayor de susceptibilidad en MHC.
Este
haplotipo
muestra
una
extraordinaria
conservación alo largo de 5Mb de la región MHC, que
probablemente incluye el alelo de riesgo de este
segundo locus.
Las regiones que muestran un grado de homozigosidad
aumentado podrían indicar la localización de este gen
de susceptibilidad.
El haplotipo extendido DR3 característico de la
población vasca (A30-B18-DR3-DQ2-DP2) confiere
mayor riesgo a DMT1, indicativo de la presencia de
otro locus mayor de susceptibilidad en MHC.
Este
haplotipo
muestra
una
extraordinaria
conservación alo largo de 5Mb de la región MHC, que
probablemente incluye el alelo de riesgo de este
segundo locus.
Las regiones que muestran un grado de homozigosidad
aumentado podrían indicar la localización de este gen
de susceptibilidad.
HOSPITAL de CRUCES
- Endocrinología / E Pediátrica
- Gastroenterología Pediátrica
- Unidad de Investigación
CIC BIOgune (Bilbao)
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BDC (Denver)