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Genética de Poblaciones I: La revolución Darwiniana Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 1 Tema 17: Genética de Poblaciones I: La revolución darwiniana, el equilibrio de Hardy-Weinberg y sistemas de apareamiento Puntos principales a tratar: •La revolución darwiniana: el pensamiento poblacional •La selección natural •Principios de la selección natural •La variación genética y sus estimación •Población mendeliana •Apareamiento aleatorio y ley de Hardy-Weinberg •Apareamiento no aleatorio •Apareamiento clasificado •Endogamia Tema 17: Genética Poblaciones I 2 Dr. Antonio Barbadilla Nada tiene sentido en biología Nothing in Biology makes si no es a la luz de la sense except in the light of evolución evolution Theodosius Theodosius Dobzhansky Dobzhansky Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 3 EL PARADIGMA POBLACIONAL: la variación en el seno de las poblaciones es la materia prima de la evolución Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 5 Lo único que se trasmite a la descendencia son genes Genotipo Siguiente generación Fenotipo Expresión génica, desarrollo Transmisión Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 6 Evolución desde la perspectiva poblacional: Es el cambio acumulativo en la composición genética de las poblaciones Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 7 Población mendeliana: Conjunto de individuos intercruzables que comparten un acervo genético común Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 8 La problemática de la genética de poblaciones es la descripción y explicación de la variación genética dentro y entre poblaciones Theodosious Dobzhansky Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 9 •Variación genética o polimorfismo genético: existencia en una población de dos o más formas alélicas en frecuencias apreciables •Frecuencia génica o alélica (unidad básica de evolución): f(A) proporción de un alelo dado en la población Gen X, alelos A y a p = f(A) A a q = f(a) Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 10 La Genética de Poblaciones es una Teoría de Fuerzas Factores que cambian las frecuencias génicas en las poblaciones Deriva genética Migración p = f(A) Mutación Dr. Antonio Barbadilla Selección natural Tema 17: Genética Poblaciones I 11 El problema empírico: la lucha por la medida de la variación genética Variación fenotípica cuantitativa: morfológica, fisiológica, conductual Genética Cuantitativa Continua y discreta -> Experimentos de selección, endogamia X Dr. Antonio Barbadilla X Conclusión: Existe variación genética para casi cualquier carácter Tema 17: Genética Poblaciones I 12 El problema empírico: la lucha por la medida de la variación genética (2) Variación cualitativa: polimorfismos genéticos y variantes raras •Polimorfismo morfológico (color, tamaño, forma) •Polimorfismo inmunológico (grupos sanguíneos: AB0, Rh, NM,... 40 en humanos) •Polimorfismo cromosómico (inversiones paracéntricas en Drosophila, reordenaciones) Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 13 Caracol de huerta europeo Cepaea nemoralis Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 14 Geómetra del abedul Biston betularia Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 15 Cromosomas politénicos de Drosophila Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 16 Teorías de la variación en los 60 Teoría clásica Teoría equilibradora •Ausencia de variación •Variación ubicua •Selección purificadora •Selección equilibradora •Genotipo salvaje es óptimo •No existe un genotipo salvaje •Muller (laboratorio) •Dobzhansky (naturalista) •Eugenesia Dr. Antonio Barbadilla •¡Viva la diversidad!, no interferencia Tema 17: Genética Poblaciones I 17 El problema empírico: la lucha por la medida de la variación genética (y 3) Dr. Antonio Barbadilla •Polimorfismo proteico (alozímico) Electroforesis de proteínas en gel (Lewontin & Hubby 1966; Harris 1966) -> era alozímica: la variación es ubicua. Consecuencia teórica: teoría neutralista. Nace la evolución molecular. •Polimorfismos en el nivel del DNA •RFLPs •Microsatélites Tema 17: Genética Poblaciones I •Secuencias de DNA 18 Polimorfismos de DNA Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 19 Polimorfismos de DNA SNPs Single Nucleotide Polymorphism AGAGTTCTGCTC G AG G GTTATG C G C G Secuencia 11 Secuencia 22 Secuencia 33 Secuencia Secuencia Secuencia Secuencia Secuencia Secuencia Dr. Antonio Barbadilla 4 5 6 7 7 88 9 acgtagcatcgtatgcgttagacgggggggtagcaccagtacag acgtagcatcgtatgcgttagacggggtggtagcaccagtacag acgtagcatcgtatgcgttagacggcggggtagcaccagtacag acgtagcatcgtttgcgttagacgggggggtagcaccagtacag acgtagcatcgtttgcgttagacgggggggtagcaccagtacag acgtagcatcgtttgcgttagacggcatggcaccggcagtacag acgtagcatcgtttgcgttagacggcatggcaccggcagtacag acgtagcatcgtttgcgttagacggcatggcaccggcagtacag acgtagcatcgtttgcgttagacggcatggcaccggcagtacag Tema 17: Genética Poblaciones I 20 Medidas de la diversidad genética Ejemplo: Estudio electroforético de la enzima glucosa fosfato isomerasa en una población de ratones Genotipo F/F F/S S/S Total N. individuos 4 7 5 16 N. alelos F 8 7 0 15 N. alelos S N. alelos F + S 0 8 7 14 10 10 17 32 •Frecuencia genotípica f(FF) = 4 / 16 f(FS) = 7 /16 •Frecuencia alélica o génica 4 + (1/2) 7 ^ = f(F) = p = 0,469 •Heterocigosidad Dr. Antonio Barbadilla f(SS) = 5/16 ^=1- p ^ = 0,531 q 16 ^ Tema 17: Genética Poblaciones I H = 7/16 = 0,4375 21 Frecuencias genotípicas y alélicas para el locus del grupo sanguíneo MN en varias poblaciones humanas Genotipo Dr. Antonio Barbadilla Frecuencias alélicas Población MM MN NN p(M) p(N) Esquimal 0,835 0,156 0,009 0,913 0,087 Aborigen Australia Egipcia 0,024 0,304 0,672 0,176 0,824 0,278 0,489 0,233 0,523 0,477 Alemania 0,297 0,507 0,196 0,550 0,450 China 0,332 0,486 0,182 0,575 0,425 Nigeria 0,301 0,495 0,204 0,548 0,452 Tema 17: Genética Poblaciones I 22 Frecuencia de los alelos IA, IB, e i en el locus del grupo sanguíneo ABO en varias poblaciones humanas IA IB i Esquimal 0,333 0,026 0,641 Sioux 0,035 0,010 0,955 Belga 0,257 0,058 0,684 Japonés 0,279 0,172 0,549 Pigmea 0,227 0,219 0,554 Población Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 23 Patrones de variación electroforética Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 24 Ley del equilibrio de Hardy-Weinberg Considera como se relacionan las frecuencias alélicas y genotípicas en una población mendeliana bajo una serie de supuestos ideales •Generaciones discretas y no solapantes •Apareamiento aleatorio •Tamaño de población infinito •No mutación, no migración entre poblaciones •No diferencias en eficacia biológica (selectivas) entre los distintos genotipos Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 25 Los supuestos implican una unión aleatoria de los alelos para formar genotipos Esperma p A Frecuencias alélicas A p a q AA p2 Aa pq Aa pq aa q2 q a Huevos Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 26 Ley del equilibrio de Hardy-Weinberg Consecuencias de los supuestos: •Reducción de la dimensionalidad de una población. Conociendo las frecuencias alélicas podemos predecir las genotípicas •Equilibrio alélico y genotípico. •Las frecuencias alélicas no cambian de generación en generación (equilibrio alélico) •Las frecuencias genotípicas no cambian de generación en generación (equilibrio genotípico). Después de una generación de apareamiento aleatorio, se alcanzan las frecuencias genotípicas de equilibrio •Sistema conservativo, análogo al principio de inercia. Solución al problema de cómo se conserva la variación genética •Modelo nulo por excelencia: Aunque las desviaciones son difíciles de detectar, cualquier desviación es una indicación de que algo pasa en la población Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 27 Demostración de la ley de Hardy-Weinberg Frecuencia cigotos (progenie) Apareamiento Frecuencia apareamiento AA Aa aa P2 1 0 0 AA x Aa 2PQ ½ ½ 0 AA x aa 2PR 0 1 0 Aa x Aa Q2 ¼ ½ ¼ Aa x aa 2QR 0 ½ ½ aa x aa R2 0 0 1 P = f(AA) Q = f(Aa) AA x AA R = f(aa) Totales próxima generación P’ P’ = P2 + 2PQ/2 + Q2/4 = (P + Q/2)2 = p2 Dr. Antonio Barbadilla igualmente se demuestra que Q’ = 2pq y R’ = q2 Tema 17: Genética Poblaciones I Q’ R’ 28 0 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 0,7 0,8 0,9 1,0 Frecuencia Gráfico de p2, 2pq y q2. q2 (aa) p2 (AA) 2pq (Aa) 0 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 0,7 0,8 0,9 1,0 p = f(A) Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 29 Prueba de ajuste a Hardy-Weinberg Genotipo N. N. N. N. individuos alelos M alelos N alelos M + N MM MN NN Total 1787 3574 0 3574 3037 3037 3037 6074 1305 0 2610 2610 6129 6611 5647 12258 Frecuencia alélica M = 6611/12258 = 0,53932 = p Frecuencia alélica N = 5647/12258 = 0,46068 = q Frecuencia esperada Número esperada (Frecuencia X 6129) p2 = 0,2908 2pq = 0,4969 q2 = 0,2122 1782,7 3045,6 1300,7 1,000 6129 (número observado número esperado ) 2 X 0,04887 número esperado 2 Dr. Antonio Barbadilla 2 3,84 0 , 05 ;1 g .l . Poblaciones Tema 17: Genética I 30 Generalización del Equilibrio de Hardy-Weinberg •Dominancia Se puede estimar las frecuencias alélicas si suponemos que la población está en equilibrio Hardy-Weinberg. Ej. Individuos con fenotipo Rh+ 85%. Si suponemos H-W la frecuencia del alelo Rh+ es del 85.8% •Múltiples alelos Ejemplo, 3 alelos con frecuencias p,q y r. Las frecuencias genotípicas son las que resultan de las expansión (p+q+r)2 = p2 + 2pq + 2pr + q2 + 2qr + r2 •Un gen ligado al X A1 A1 A1 A2 A2A2 A1 A2 P2 2pq q2 p q Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 31 Desviaciones del apareamiento aleatorio •Apareamiento clasificado: los distintos fenotipos no se aparean al azar •positivo: tendencia a aparearse con fenotipos semejantes (altura, color de piel,...) •negativo: tendencia a aparearse con fenotipos opuestos •Endogamia: cuando el cruce entre parientes es más común de lo que se espera por azar (exogamia es el concepto opuesto) Diferencias entre ambos conceptos: el apareamiento clasificado afecta a los fenotipos preferidos, mientras que la endogamia afecta a todo el Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 32 genoma Consecuencias de las desviaciones del apareamiento aleatorio •Desviación de las frecuencias genotípicas de las esperadas por Hardy-Weinberg •Mayor homozigosidad: apareamiento clasificado positivo y endogamia •Mayor heterozigosidad: apareamiento clasificado negativo •No cambio en las frecuencias alélicas Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 33 Problemas de exámenes pasados •En una població que està en equilibri de Hardy-Weinberg, la freqüència de l’al.lel A és de 0,7 i la de l’al.lel a és de 0,3. a) Quin percentatge de la població serà homozigòtica? b) Quines seran les freqüències gèniques i genotípiques després d’una generació, si solament s’encreuen els heterozigots? •Si el 4% dels individus d’una població que es troba en equilibri Hardy-Weinberg manifesta un fenotip recessiu, quina és la probabilitat de que un descendent de dos individus que no expressin aquest caràcter recessiu, si que l’expressi? •En una població animal, el 20% dels individus són AA, el 60% són Aa i el 20% són aa. Quines són les freqüències al.lèliques? •En aquesta població els encreuaments sempre són entre fenotips semblants, però dins de cada grup fenotípic és a l’atzar. Quines freqüències genotípiques i al.leliques hi haurà a la següent generació? •En una població humana constituida per 100.000 individus, el 40% són del grup sanguini A, el 28% del B, el 25% de l'AB i la resta del 0. a) Calculeu les freqüències gèniques i genotípiques. b) En quin supòsits us heu basat per respondre l'apartat anterior? •Comenteu l’efecte que té la deriva genètica en les poblacions naturals. De què depèn la força de la deriva genètica? Expliqueu dos casos típics de deriva genètica, il•lustrant-los amb exemples reals. •El daltonisme és causat per un al.lel recessiu lligat al sexe. Un de cada deu homes és daltònic. Si suposem que la població està en equilibri de Hardy-Weinberg, a) Quina és la proporció de dones daltòniques? b) Quants homes daltònics hi ha per cada dona daltònica? c) En quina proporció de les parelles afectarà el daltonisme a la meitat dels fills de cada sexe? d) Quina és la proporció de parelles en les que tots els fills són normals? Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 34 Links de interés Web de genética de poblaciones (A. Barbadilla) Ensayos de evolución (A. Barbadilla) EvoTutor: Learning through interactive simulation (on line y off line) Sitio excelente para aprender los procesos genético poblacionales mediante simulación Calculadora de Hardy-Weinberg Dr. Antonio Barbadilla Tema 17: Genética Poblaciones I 35