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April-2005
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Número 11
Año 1
PARQUE CRETÁCICO
Contenido:
por Rocío Domínguez Vidaña
Tal vez suena a ciencia ficción, pero cosas como los viajes espaciales
alguna vez sólo formaron parte de los más alocados sueños de algunas
personas visionarias. Ahora quizás este título no suene tan descabellado,
salvo por el pequeño inconveniente de que no se sabía de la existencia de
material genético de seres prehistóricos, algo bastante desalentador.
Sin embargo, hay un nuevo descubrimiento que
volverá a resurgir los sueños descabellados de
Michael Chrichton: el equipo de Mary H.
Schweitzer de la Universidad Estatal de Carolina
del Norte encontró bazos de tejido suave y
muestras de preservación celular de un
Tyrannosaurus rex; éste fue encontrado en la
base de la formación Hell Creek. El espécimen
estaba en una cama de arena y tenía una
preservación excelente; se le clasificó como
MOR1125 (Museum of the Rockies specimen
1125).
No le aplicaron ningún tipo de
preservativos a los fragmentos del
interior del fémur, reservándose para
análisis químicos. Este espécimen
contenía regiones de tejido óseo
inusual en la superficie endotelial y
cortical.
Estos
tejidos
se
desmineralizaron y se observaron
características inusuales; al remover la
fase mineral fue visible un tejido
vascular que tenía gran elasticidad y
resistencia a la manipulación, también
se revelaron regiones donde el hueso era muy fibroso. En la región cortical se
revelaron canales vasculares orientados paralelamente y que semejaban
tener algunas bifurcaciones en otras áreas.
Uno de los descubrimientos más interesantes de este espécimen es que
muchos de estos bazos tenían microestructuras circulares en varios tonos de
rojo y café, muy similares a los vasos sanguíneos obtenidos del hueso de un
avestruz. Con un microscopio electrónico de barrido (scanning electron
microscopy o SEM) las características vistas en la superficie extrema de los
vasos del dinosaurio son indistinguilbles de las del avestruz. Semejan uniones
de células endoteliales, resultado de la deshidratación; estas microestructuras
tienen pequeños puntitos que podrían ser el núcleo celular.
Continúa en la página...
Parque Cretácico
1,3
Cromosomas 2 y 4
2
Gimnasia Cerebral
3
La columnezca genómica
4,5
Palomitas y Más...
5
HumorENCoNtAcTo
6
CineclubLCG
6
Entrevista
7
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2
Cromosomas 2 y 4
por Claudia Gabriela Gonzaga Jáuregui
El pasado 7 de abril de 2005, se publicó en la edición semanal de la revista Nature, la “Generación y
anotación de las secuencias de DNA de los cromosomas humanos 2 y 4”, donde los investigadores a
cargo de estos dos cromosomas hacen una curación en la anotación de estos dos cromosomas, así
como un análisis de las secuencias de los mismos, realizando estudios comparativos con otras varias
especies de vertebrados como ratón, rata, pollo, chimpancé y fugu, entre otros.
En este artículo se destaca la
cromosomas debido a que el
cromosoma producto de la fusión
acrocéntricos ancestrales y que
forma en el linaje humano, ya que
todavía se puede observar la
cromosomas en lugar de uno. En el
importancia se centra en que
con enfermedades de mucho
de Huntington, genes relacionados
Hirschorn,
la
fenilcetonuria,
distrofia muscular, entre otras.
importancia de estos dos
cromosoma
2
es
un
de
dos
cromosomas
sólo se encuentra de esta
en el resto de los primates,
presencia
de
dos
caso del cromosoma 4, su
contiene genes relacionados
interés como la enfermedad
con el síndrome de Wolfacondroplasia, un tipo de
En este artículo, presentan una
Mbp de secuencia del cromosoma
cromosoma 4 con poco más de
representa más del 99.6% de la
estos cromosomas.
revisión y análisis de 237
2 y 186 Mbp de secuencia del
99.99% de exactitud, lo cual
secuencia eucromática de
En cuanto a las características
generales
de
estas
moléculas, encontraron que para ambos cromosomas el contenido de SINES es menor al promedio de
los autosomas, mientras que el contenido de LINES también para ambos resultó ser mayor que el
promedio, siendo el cromosoma 4 el de mayor contenido de este tipo de elementos. En cuanto al
contenido de GC, éste resultó ser menor al promedio del genoma completo en ambos cromosomas
(40.2% para el chr 2 y 38.2% para el chr 4). Por otro lado, se observó que el cromosoma 4 tiene la menor
densidad de islas CpG de todo el genoma. Asimismo, se observó que estos dos cromosomas tienen
regiones donde se presenta poca o nula recombinación; por lo anterior, la tasa promedio de
recombinación en estos dos autosomas es más baja que en cualquier otro cromosoma.
Se definieron un total de 1,346 genes codificantes en el cromosoma 2 y 796 genes codificantes en el
cromosoma 4. De igual manera, se encontraron 1,865 pseudogenes procesados y 161 no procesados; al
realizar las comparaciones de estos pseudogenes con el genoma del ratón se encontró mucha variación,
lo cual sugiere que estos pseudogenes surgieron de manera independiente en el linaje humano y en el
de ratón.
Finalmente, se encontró que los cromosomas 2 y 4 contienen varios de los más grandes desiertos
génicos de todo el genoma humano; y que estas regiones se mantienen y se han conservado a través de
un largo tiempo, debido a que se puede observar homología entre diferentes especies, de las aves a los
humanos.
Referencias:
Ladeana W. Hiller, et.al, ‘Generation and annotation of the DNA sequences of human chromosomes 2 and 4’ , Nature
Publishing Group, Vol. 434, 7 April 2005.
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PARQUE CRETÁCICO...
El registro fósil puede ser capaz de tener una preservación excepcional: se
han observado plumas, pelos, color o patrones, tejido embrionario suave,
tejido muscular o de órganos internos. Éstos se preservan como películas
de carbón o como réplicas tridimensionales, pero en ningún caso a este
grado.
La preservación de la matriz orgánica puede ser por la densa
mineralización del hueso, porque una porción de la matriz está
intracristalina, y por lo tanto, es extremadamente resistente a la
degradación. Además, los factores biogeoquímicos y ambientales también
pueden haber ayudado.
La elucidación y modelaje de procesos que resultan en la preservación de
tejido pueden ser las bases para la búsqueda, recuperación y caracterización de estructuras similares, lo
cual hace posible la investigación molecular. Aún no se sabe la preservación de material celular o
molecular, pero ha habido casos en los que muestras de huesos tienen algo de antigenicidad.
Referencias:
SCHWEITZER, Mary H et al. “Soft-Tissue Vessels and Cellular Preservation in Tyrannosaurus rex” Science Vol 307
pp1952 (25 march 2005)
GIMNASIA CEREBRAL: Nudos
por Estefanía García Ruiz
PASOS:
1.-Cruza tus pies, en equilibrio.
2.-Estira tus brazos hacia el frente, separados uno del otro.
3-Coloca las palmas de tus manos hacia fuera y los pulgares
apuntando hacia abajo.
4.-Entrelaza tus manos llevándolas hacia tu pecho y pon tus hombros
hacia abajo.
5.-Mientras mantienes esta posición apoya tu lengua en el paladar,
detrás de los dientes.
BENEFICIOS:
*Efecto integrativo del cerebro.
*Activa conscientemente la corteza tanto sensorial como motora de
cada hemisferio cerebral.
*La lengua en el paladar provoca que el cerebro esté atento.
*Conecta las emociones en el sistema límbico cerebral.
*Da una perspectiva integrativa para aprender y responder más
efectivamente.
*Disminuye niveles de estrés enfatizando el aprendizaje.
Referencia:
Aprender mejor con Gimnasia cerebral, Luz María Ibarra
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La columnezca genómica
por Miguel Enrique Rentería
El estudio consistió en la toma de
muestras de sangre de 354 familias
con descendencia múltiple y les
hicieron preguntas para medirlos
según la escala de egoísmo, una
medida
del
comportamiento
altruista. Las respuestas eran
completamente anónimas, para que
así no se maquillaran los resultados
a la hora de describirse a sí
mismos.
Científicos israelíes identificaron
recientemente el primer gen ligado
al comportamiento altruista. Se trata
de una variante de un gen
localizado en el cromosoma once,
que sensibilizaría a los receptores
de la dopamina, un neurotransmidor
que da al cerebro sensación de
Dos tercios de la muestra testigo
bienestar.
llevaban el gen del altruismo.
El descubrimiento fue publicado en Curiosamente, el gen del riesgo,
la edición en línea del Molecular identificado también por Ebstein en
Psychiatry, por el grupo del Dr. los noventa, y vinculado a la
Richard Ebstein de la Universidad disponibilidad a tomar drogas,
Hebrea y el Hospital Herzog f u m a r o m o s t r a r o t r o s
Memorial de Jerusalén, y será comportamientos peligrosos es una
publicado en breve en la versión variante opuesta a la del altruismo.
En lugar de promover la expresión
impresa de la revista.
de la dopamina, la variante del gen
El altruismo -sacrificar los intereses del riesgo la reduce.
propios en beneficio de los de otrosha sido una cuestión importante de "Esto puede significar que las
la teoría evolutiva durante muchos personas que no muestran
años. Los animales superiores suficiente dopamina en su tejido
muestran comportamiento altruista, cerebral tienden a buscar drogas u
pero casi siempre con miembros de otros medios para elevarla", sugiere
la propia familia, a quienes E b s t e i n. " P r o b a b l em e n t e l a
identifican mediante el olor y dopamina juega un papel esencial
distintas
señales.
Y
el en el comportamiento social. Las
comportamiento altruista es muy personas con la región del altruismo
prominente en el comportamiento pueden hacer buenas obras porque
se sienten mejor a través de sus
humano.
actos positivos".
El investigador está seguro de que
éste sólo es el primer gen del
altruismo y de que existen varios
más. "Creo que los genes sólo
tienen la mitad de la influencia
sobre el comportamiento altruista,
dependiendo el resto de factores
del entorno, como la educación".
En este estudio no se encontró que
el gen del altruismo fuera más
común en mujeres que en
hombres", a pesar de su tendencia
hacia las profesiones de cuidados y
los diferentes roles sociales que
juegan cada uno. Sin embargo, las
mujeres anoréxicas ocupan los
primeros lugares. "Pueden llevar el
altruismo al extremo, comiendo lo
mínimo para 'sacrificar' la comida
por otros". ¡Qué consideradas!
Otro estudio, realizado en Inglaterra
por el grupo del Dr. P. Rushton en
un grupo considerable de gemelos,
confirma que los genes influyen en
nuestros comportamientos sociales,
influyendo en nuestras capacidades
de relación con los demás.
Realizaron un cuestionario sobre
responsabilidad social a 174 pares
de gemelos monocigóticos, y a 148
pares de gemelos dicigóticos. Y
compararon las respuestas acerca
de si estaban de acuerdo en 22
preguntas de un cuestionario.
Continúa en la siguiente página...
Cumpleaños:
•
Agustín Ávila
19/abril
•
Alejandra Medina
20/abril
•
Pablo Rodríguez
21/abril
•
Alejandro Alagon
22/abril
•
Selene Fernández
06/mayo
•
Luis Eduardo Servin
10/mayo
•
Dr. David Romero
11/mayo
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Palomitas y Más...
sobre sus experiencias. Sin embargo, su amiga del
concurso de belleza, Cheryl, y el organizador son
secuestrados en Las Vegas, por lo que ella tendrá que
intervenir y rescatarlos. Reparto: Sandra Bullock, Regina
por Claudia Gabriela Gonzaga Jáuregui
En este mes les presento tres
películas que en mi opinión vale la
pena ir a verlas al cine para pasar
un buen rato y distraerse. La primera
es la secuela de una película de
comedia que a mi en lo particular me
causó mucha gracia, Miss Simpatía
2, con Sandra Bullock; y que aunque
obviamente no podemos esperar
una gran historia detrás de esta
película, sí parece que nos hará reír por un par de
horas. En segundo lugar, les presento la reseña de
una película mexicana que a mi me llamó mucho la
atención y que creo que valdrá la pena verla en la
pantalla grande y de paso apoyar al cine mexicano. La
película es Club Eutanasia y el reparto está formado
por varios primeros actores y cómicos que prometen
darle a la película un buen toque de humor negro. Y
por último, está la reseña de una película que parece
estar interesante, La Intérprete, con Nicole Kidman y
Sean Penn, ambos reconocidos actores.
Miss Simpatía 2 (Miss Congeniality 2)
King, Enrique Murciano Jr., Diedrich Bader, Ernie Hudson
Club Eutanasia
Tras la muerte del benefactor del asilo de ancianos
llamado El Refugio, las condiciones de por si ya
deplorables de los ancianos del asilo empeoran
cuando la comida se ve racionada por la malvada
directora. Ante esta situación, cuatro de los ancianos
se dan cuenta de que “entre menos burros, más
olotes” y extrañamente comienzan a ocurrir una serie
de muertes y accidentes entre los demás ancianos del
asilo. Reparto: Chelo Cobo, Sergio Corona, Héctor Gómez,
Javier López ´Chabelo´
La Intérprete
Silvia Broome (Nicole
Kidman)
es
una
intérprete de la ONU,
quien por error escucha
una conversación donde
se planea el asesinato
de
un
importante
diplomático
africano
cuando éste hable en la Asamblea General de las
Naciones Unidas, sin embargo se da cuenta de que
ella también es uno de los objetivos de los asesinos,
por lo que comienza una desesperada búsqueda por
alguien que crea su historia y le ayude a evitar el
asesinato. No obstante, el agente del FBI, Tobin Keller
(Sean Penn) no sólo no le cree sino que la considera la
Nicole Kidman, Sean
principal sospechosa. Reparto:
Tras haber ganado el
reconocimiento
de
Miss Simpatía en el
concurso de belleza de
Miss Estados Unidos,
la agente Gracie Hart
(Sandra Bullock) se ha
convertido en la nueva
imagen del FBI y ahora Penn, Catherine Keener, Max Minghella, Jesper Christensen
se dedica a dar entrevistas y promocionar un libro
La columnezca genómica…
ces, concluyendo que se podría afirmar que la moralidad tiene una base
Las preguntas eran del tipo: "soy biológica y que forma parte de nuesuna persona con la que la gente tra evolución psicológica.
puede contar", "es importante aca- Basándose en un modelo estadístibar aquello que se empieza" o co, afirman que los genes son res"estafar a Hacienda es tan malo co- ponsables en un 42% de las diferenmo robar". En las contestaciones se cias individuales de actitud, que el
usó
una
escala
del
1 23% de la responsabilidad recae en
(completamente en desacuerdo) al el entorno común de los hermanos;
5 (completamente de acuerdo). Las y que el resto de influencias provierespuestas eran estudiadas para ne de los entornos que los gemelos
predecir los comportamientos reales no comparten y que pertenecen a
de cada uno de ellos.
las vidas individuales de cada uno
de ellos.
Los resultados del trabajo del Dr.
Rushton arrojaron que los gemelos
monocigóticos estaban más de
acuerdo entre sí que los gemelos
dicigóticos, por casi el doble de ve-
Por otro lado, el estudio refleja que
los genes tienen mayor influencia en
las actitudes sociales de los hombres que en las de las mujeres (50%
sobre 40%), mientras que la educación familiar tiene mucha más influencia en mujeres que en hombres
(un 40% frente a un 0%). Esto sugiere que los padres controlan con
más cuidado el comportamiento de
las hijas que el de los hijos.
Ya para despedirme... Sugiero que
a nuestros políticos les hagamos
una prueba genética de responsabilidad social. Y que se busque en la
población mexicana los genes de la
impuntualidad, de la irresponsabilidad, y mi favorito: el gen de la hueva.
Saludos, y hasta la próxima gaceta.
Cualquier comentario referente a esta
columnezca, dirigirlo a:
[email protected]
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HumorENCoNtAcTo
“La vejez es la pérdida de la
curiosidad”
José Martínez Ruíz
Feliz Día del
Niño!!!
(30 de abril del
2005)
CINECLUB LCG
por Santiago Sandoval
He aquí una "sinópsis" de las películas que se pasarán en este mes:
Reservoir Dogs (Perros de Reserva)
(21/abril/05)
Un grupo de geniales y extraños "extraños" se asocian por medio de un Jr. y su papito para cometer el crimen
perfecto, mas al dar el golpe, un pequeño disparo conduce a una sangrienta escena donde participan todos los
asociados... ¿Chivo expiatorio tal vez? ¿O mera estupidez de los participantes?
"Todas las películas de policías y ladrones son iguales, menos ésta".
(Periódico semanal Ramón y sus amigos)
Pulp Fiction (28/abril/05)
Sin comentarios... ¡¡¡Es Pulp Fiction!!! Los ángeles se ven envueltos en 3 historias violentas,
espectaculares e irónicas... Da miedo decir algo más...
"Every scene in this movie is tarantined."
(The very best of London Press)
Kill Bill 1 y 2 (05 y 12/mayo/05)
A mi parecer es una de las mejores historias de amor jamás escritas, incluyendo secuencias de
ánime, violencia, acción, parodias (o más bien homenajes) y todas esas cosas que suelen
gustar a la gente, sólo que en este caso están genialmente escritas y dirigidas.
"A must see."
(Journal of Bricks & Baguettes)
Esta programación está sujeta a cambios de última hora sin previo aviso.
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Entrevista
por Claudia Gabriela Gonzaga Jáuregui
Y para cerrar con broche de oro, en esta edición de lcgENCoNtAcTo no podía faltar una entrevista a una de nuestras
compañeras de la licenciatura, Ana Gutiérrez, mejor conocida como Ana Banana, quien recientemente envió un
artículo a la revista Trends in Genetics y el cual pronto será publicado.
¿Cómo y cuándo comenzaste este proyecto?
ANA- En el verano del 2003 inicié este proyecto en el laboratorio de
Biología Computacional del Instituto de Biotecnología, encabezado
por el Dr. Enrique Merino. El inicio del proyecto fue en el área de
bioinformática, comparando los operones de triptofano en diferentes
organismos. Las conclusiones de este proyecto teórico se encuentran
en el artículo que saldrá próximamente (en Julio o Agosto) en la
revista Trends in Genetics. A partir de las conclusiones generadas del
proyecto de bioinformática, que son mas bien predicciones, puesto
que son teóricas, comenzamos un trabajo experimental para tratar de
comprobarlas. Ahora estoy aprendiendo bajo la tutoría de Maria Luisa
Tabche, la parte experimental, donde yo analizaré un organismo
(Oceanobacillus iheyensis) y ella otro (Bacillus cereus).
¿En términos generales de qué trata tu proyecto “Confrontando el dogma de la regulación de operones biosintéticos
de triptofano en bacterias Gram positivas”?
ANA- A grandes rasgos, las bacterias se dividen en dos clases; Gram Positivas y Gram Negativas. Cuando se
descubre algún mecanismo de regulación para algún gen, primero se hace en las bacterias modelo de las respectivas
clases, esto es para las Gram Negativas se trabaja con Escherichia coli, y para las Gram Positivas el modelo es
Bacillus subtilis. La regulación génica es importante en las bacterias, porque las bacterias tienen la capacidad de
sensar los metabolitos que hay en el medio en el que están. Y si hay abundancia de cierto metabolito la bacteria no lo
sintetiza, pues representa un gasto de energía. Si por el contrario, el metabolito se encuentra escaso, la bacteria lo
sintetiza cuando lo necesite.
En mi caso, el metabolito en cuestión es el triptofano, que es un aminoácido que forma parte de las proteínas. En
1977 el Dr. Charles Yanofsky, quien es coautor en el artículo, estableció el mecanismo de regulación del triptofano por
atenuación en el organismo modelo E. coli. Años mas tarde, en 1993, se describió el mecanismo de regulación de
triptofano mediante las proteínas TRAP y AntiTRAP para B. subtilis. Fue entonces cuando se generalizó que todas las
bacterias Gram Positivas regularían la biosíntesis de triptofano usando el mismo mecanismo que B. subtilis. Cuando
entré a trabajar con el Dr. Merino, lo primero que quisimos hacer fue encontrar estas proteínas iguales para el
mecanismo de regulación del triptofano en el resto de las bacterias Gram Positivas, por lo que empecé a hacer
BLAST de las proteínas TRAP y AntiTRAP para encontrar sus ortólogas en otros organismos. Nuestra sorpresa fue
que eran muy raras las bacterias que tenían estas proteínas y a partir de ahí surgió la pregunta de cómo se regulaban
las otras bacterias si carecían de estas proteínas. Posteriormente se encontró que lo hacían mediante un mecanismo
conocido como T-box. Y este mecanismo de atenuación, llamado T-box resultó ser más abundante entre las bacterias
Gram Positivas que el mecanismo que fue propuesto en el organismo modelo; llegando así, a la conclusión de que en
este caso B. subtilis no es un modelo, sino una excepción.
Ahora que has comenzado investigación en informática, ¿piensas quedarte en esa área?
ANA- Pues la bioinformática me gusta bastante, pero no quiero cerrarme a otras posibilidades, aunque no sé
exactamente en que otra área me gustaría hacer investigación, sin embargo, el tema de regulación me interesa
mucho, así que me gustaría seguir investigando sobre eso.
En tu opinión, ¿de qué carece el programa de la Licenciatura que sería de utilidad al trabajar en la vida real en
genómica?
ANA- Creo que lo que más le falta al programa de la Licenciatura es la parte práctica, sería importante ver las
técnicas que se realizan comúnmente en un laboratorio de forma práctica, así como más conocimientos de
bioquímica.