Download PCR multiplex

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Transcript
Secuenciación de Última Generación (NGS) :
Una nueva aproximación en el laboratorio clínico
Sebastián E. Yurrita, MSc
Proteínas
Evalúa el
resultado de una
mutación
genética
PCR
PCR multiplex
Evalúa una
mutación
específica dentro
de un gen en
particular
Evalúa varias
mutaciones
ubicadas en el
mismo o en
distintos genes,
al mismo tiempo
Microarreglos
Evalúa miles de
mutaciones en
cientos de
genes, al mismo
tiempo
Las enfermedades NO son
mono-mutacionales
Secuenciación de última
generación (NGS)
Análisis
multi
mutacional
vrs.
multigénico
Objetivo de la biología molecular:
Reconocer variantes (mutaciones). Con algo
de suerte estas variantes tendrán relevancia
clínica y podrán asociarse al fenotipo
observado.
Los dos enfoques genéticos
Multi
mutacional
Multi
génico
• Debo saber lo que quiero buscar.
• Debo crear herramientas individuales para
cada variante que quiero identificar.
• Si algo se escapa de mis conocimientos,
jamás será evaluado.
• No debo saber qué buscar, solamente
dónde buscarlo.
• Debo crear herramientas que me
permitan evaluar todo el panorama, pero
sin ser muy específico.
• No importa si algo se escapa de mis
conocimientos, puesto que cuando lo
mire, lo reconoceré.
Análisis multi mutacional
Lista de mutaciones:
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
Indecisiones
Miedo
Poderoso
Destructivo
Mentira
Egoismo
Derrota
Soberbia
Rencor
injusticia
“Hoy es el día más hermoso de nuestra vida, querido
Sancho; los obstáculos más grandes, nuestras propias
indecisiones; nuestro enemigo más fuerte, el miedo al
poderoso y a nosotros mismos; la cosa más fácil,
equivocarnos; la más destructiva, la mentira y el egoísmo;
la peor derrota, el desaliento; los defectos más peligrosos, la
soberbia y el rencor; las sensaciones más gratas, la buena
conciencia, el esfuerzo para ser mejores sin ser perfectos, y
sobre todo, la disposición para hacer el bien y combatir la
injusticia donde quiera que estén. ”
“Hoy es el día más hermoso de nuestra vida, querido
Sancho; los obstáculos más grandes, nuestras propias
indecisiones; nuestro enemigo más fuerte, el miedo al
poderoso y a nosotros mismos; la cosa más fácil,
equivocarnos; la más destructiva, la mentira y el
egoísmo; la peor derrota, el desaliento; los defectos más
peligrosos, la soberbia y el rencor; las sensaciones más
gratas, la buena conciencia, el esfuerzo para ser
mejores sin ser perfectos, y sobre todo, la disposición
para hacer el bien y combatir la injusticia donde
quiera que estén. ”
Variante A
Variante B
Variante C
Variante D
Variante E
G
E
N
Enfermedad 1
Enfermedad 2
Enfermedad 3
Enfermedad 4
Enfermedad 5
Frecuencia genética en la población
Anteriores, MUTYH,
NBN, NF1, PTEN,
RAD50, TP53
BRCA´s, ATM, BARD1,
BRIP1, CDH1…
BRCA1 y BRCA2
Paneles
genéticos
Mutación
familiar
conocida
Rearreglos
BART
Cáncer de
mama
Deleciones/du
plicaciones
BRCA1 y BRCA2,
Perfil Colombia
BRCA1 y
BRCA2
Algoritmo de solicitud
Mutación
familiar
conocida
Paneles
genéticos
Deleciones/duplicaciones
Cualquier otro tipo de grande
rearreglos