Download Patologia Digital

Document related concepts
no text concepts found
Transcript
Servicio de Salud
de Castilla-La Mancha
La Patología digital en el
trabajo asistencial y en la
investigación traslacional.
MARCIAL GARCÍA ROJO
Coordinador SSII. Hospital General de Ciudad Real
Junta Directiva de la SEIS
Servicio de Anatomía Patológica
martes 20 de diciembre de 11
Anatomía Patológica
DIAGNÓSTICO
TRATAMIENTO
PRONÓSTICO
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
2
Introducción
Las nuevas tecnologías de la información en Patología
(sistemas de información, fotografía digital,
microscopía virtual) están permitiendo un trabajo más
eficiente en los servicios de Anatomía Patológica.
Existe una creciente automatización en la
especialidad.
La imagen digital de gran calidad permite
diagnósticos similares al microscopio.
El SESCAM creó en 2004 un Centro de Innovación en
Tecnología de la Información (CITI) para Patología.
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
3
Microscopía virtual. Términos
Digitalización completa de toda la preparación
(whole slide imaging, WSI)
Preparación digital = Preparación virtual (virtual
slide)
Componentes:
Escáner (microscopio robotizado)
Visor de preparaciones
Gestión de imágenes
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
4
Cortes histológicos
Las preparaciones convencionales son
frágiles,
No son permanentes, sobre todo
inmunofluorescencia, cristales articulación, …
En citología, no es posible distribuir copias.
Área de tejido de unos 25 x 20 mm
VENTAJAS DE PREPARACIÓN
VIRTUAL
¡ Pequeños aumentos con calidad
extraordinaria.
¡ Mapa dinámico de preparación
¡ Enviar imágenes de mayor resolución
recibiendo sólo el área seleccionada.
¡ Grabar y reproducir la trayectoria
seguida por el patólogo durante su
examen de la preparación o laminilla y
¡ Las imágenes quedan almacenadas
permanentemente, y sobre ellas es
posible realizar anotaciones que también
pueden quedar grabadas.
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
5
Nuevas redes de telepatología
Red Europea: Action IC0604: Telepathology Network
(EURO-TELEPATH)
http://www.conganat.org/eurotelepath
Red de Telepatología de Castilla-La Mancha.
Proyecto Serendipia del SESCAM
Objetivo común: Crear una herramienta de comunicación
interprofesional eficiente entre los departamentos de
Patología, utilizando una plataforma web estándar.
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
6
Objetivo de SERENDIPIA
Los principales objetivos de Serendipia son:
o  Proveer de todo el equipamiento necesario para
crear servicios digitales de Anatomía Patológica.
o  La creación de una red regional de telepatología.
Para conseguir estos objetivos Serendipia se ha
basado en las principales guías y estándares
médicos.
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
7
Tipos de imágenes
4
3
2
1
5
6
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
8
Características de las Virtual Slide
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
9
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
10
Hospital General de Ciudad Real’s
Aperio images
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
11
Alcance y situación actual
Implantación en siete hospitales de la comunidad.
Tres son hospitales satélite que dependen de los
hospitales de referencia (Áreas clínicas).
Situación Actual:
o  Suministro de equipamiento informático y
dispositivos de adquisición de imágenes.
o  SI que interconecta con los diferentes
sistemas y dispositivos de adquisición de
imágenes.
o  Implantación en el hospital de Manzanares.
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
12
Infraestructura
Hospitales
Satélites
Hospitales de
referencia
• 
Lectores de códigos de
barras para
contenedores, casetes
y slide.
• 
• 
Sala de autopsias.
Estación de
Macroscópica.
• 
Sala de
videoconferencia.
• 
Escáner > 50 slide.
• 
Almacenamiento (40
TB)
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
•  Lectores de
códigos de
barras.
•  Estación de
macroscópica.
•  Impresora de
etiquetas.
•  Foto microscopia.
•  Escáner > 5 slide.
•  Almacenamiento
(8 TB)
20/12/11
13
Necesidades de Almacenamiento
o  Número de muestras por año: 5.000 - 40000.
o  Tamaño medio de preparaciones virtuales sin
comprimir: 30 GB – 40 GB.
o  Media de tamaño por preparaciones virtuales
usando JPEG2000 a un aumento de 40X: 0.5 – 4
GB.
o  Digitalización de todas las imágenes salvo las
preparaciones virtuales.
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
14
Necesidades de Almacenamiento
Estimación de Almacenamiento en 4 años:
o  Albacete Hosp. (800 camas)
40 Terabytes.
o  Almansa (100 camas)
8 Terabytes.
o  Villarrobledo (100 camas)
8 Terabytes.
o  Alcázar de San Juan (400 camas)
o  Tomelloso (100 camas)
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
32 Terabytes.
8 Terabytes.
15
DICOM. Suplemento 122. Fichero
único: JPEG2000/JPIP
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
16
Sup145 multi-frame tiling (WG26)
Use multi-frame image objects (not object per tile)
Single frame image
Thumbnail Image
Multi-frame image
(single object)
Intermediate Image Tiles
Multi-frame image
(single object)
may include multiple
Z-planes, color planes
Baseline
Image Tiles
In 1 or more DICOM Series
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
17
Aplicaciones desarrolladas
1. El primero es un SI para el gestionar el flujo de
trabajo. Próxima versión: Entorno web
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
18
S.I. de Patología en entorno Web
Visualizar fotos y preparaciones
digitales
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
19
Aplicaciones desarrolladas
El segundo SI es un portal Web de Telepatología:
o  Segunda opinión
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
20
Aplicaciones desarrolladas
El segundo SI es un portal Web de Telepatología:
o  Foro de consulta
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
21
Aplicaciones desarrolladas
El segundo SI es un portal Web de Telepatología:
o  Biblioteca pedagógica
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
22
Análisis de imagen
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
23
Componentes
•  Integrador: SATEC
•  SI de Anatomía Patológica (Novopath à VitroPath)
•  PACS 5.6 (Udiat): JPGEG2000 links (JPIP)
•  Aplicación Web J2EE (Satec)
•  Servidor y visualizador de imágenes (Aurora)
•  Escáner de Virtual slide (Aperio)
•  Gestión de usuarios: LDAP, Kerberos
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
24
Arquitectura Lógica
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
25
Arquitectura: 8 hospitales
Publicación de informes
e imágenes.
Publicación y anonimización
de informes, DICOM y JP2K
Publicación de informes
e imágenes.
Servicios Centrales
Repositorio imágenes
anónimas
Segunda opinión
y biblioteca pedagógica
(incluyendo imágenes)
Usuario Externo
Repositorio
JPEG2K
Portal
Foro, segunda opinión,
biblioteca pedagógica y
escaneos remotos.
Inventario e incidencias.
Aurora Image
Server
Portal
SESCAM
Aurora Image
Server
PÚBLICO
PACS de Backup
PRIVADO
JP2K: backup
Consulta Worklist WS
ÁREA CLÍNICA 1
ÁREA
PACS: envío backup.
Consulta proxy.
CLÍNICA 2
Centro
Hospitalario 1
Repositorio imágenes
Aperio
Centro
Hospitalario 2
HIS
Repositorio imágenes PACS
Aperio
Ingestión Imágenes,
escaneos locales, consulta de
estudios online.
Usuario SESCAM
HIS
Repositorio imágenes
Aperio
PACS
Repositorio imágenes
Aperio
Hospital Dependiente 1.1
Usuario SESCAM
Repositorio imágenes
Aperio
Hospital Dependiente 1.2
PIS
PIS
Portal
Portal
Hospital Nodriza 2
Repositorio imágenes
Aperio
Repositorio imágenes
Aperio
Aurora Image
Server
Aurora Image
Server
Hospital Nodriza 1
Repositorio
(Edificio2)
JPEG2K
Repositorio
JPEG2K
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
Hospital Dependiente 2.1
Hospital Dependiente 2.2
Storage commitment
de digitalizaciones remotas
20/12/11
26
El S.I. de Patología debe estar
integrado con:
¡ Historia clínica electrónica: BBDD pacientes única,
petición electrónica, informe en la HCE sin olvidar
atención primaria
¡ Dispositivos automáticos del laboratorio
¡ PACS: Servidores de imágenes
¡ Portal de telepatología (telemedicina)
¡ Registro hospitalario de tumores
¡ Biobancos (banco de tumores)
¡ Gestión de calidad
¡ Datawarehouse à Minería de datos
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
27
IHE. Actores y Transacciones
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
28
Hacia una medicina personalizada
¡ Integración SIAP-Gestión de imágenes: IHE
¡ Información incluida en los ficheros de imágenes
(metadatos): DICOM
¡ Codificación: SNOMED
¡ Biblioteca de imágenes
¡ Guías clínicas:
l  Sistema Bethesda 2001
l  Guía de consenso de la ASCCP
l  Guía multidisciplinaria cáncer laringe de Holanda
l  Informe AP en el cáncer de mama
l  Colegio Americano de Patólogos
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
29
Gestión del conocimiento
¡ Pilares: Informática y patología basada en
pruebas
¡ Documentos de organización
(manuales, protocolos)
¡ Enlace a BBDD bibliográficas
Medline, Web Of Knowlegde
¡ Portal de telepatología
¡ Portal del empleado
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
30
Beneficios del proyecto
¡ Automatizar procesos críticos para optimizarlos y minimizar
posibles causas de errores.
¡ Diagnóstico, evaluación terapéutica y pronóstica más
rápidos y de más calidad, aspectos especialmente relevantes
en los estudios intraoperatorios.
¡ Facilita la consulta intradepartamental y entre diversos
especialistas del mismo centro.
¡ Mejor seguimiento del proceso diagnóstico.
¡ Segunda opinión más rápida a los centros de referencia.
¡ Introducir la utilización de herramientas de procesado y
análisis de imagen como herramientas de ayuda en el
diagnóstico por ordenador en Anatomía Patológica.
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
31
Retos en medicina traslacional
Micromatrices de tejido (TMAs)
Integración de información genética/molecular
Otras modalidades de imagen:
Inmunofluorescencia, FISH.
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
32
FISH – Un reto tecnológico
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
33
Conclusiones
o  SERENDIPIA es la primera red de telepatología
con fines asistenciales
o  Inclusión dentro de la HCE (MAMBRINO XXI).
o  Mejora la gestión del conocimiento
o  Ayuda a los pacientes a recibir mejores
diagnósticos y mejor evaluación pronóstica y a
seleccionar las mejores opciones terapéuticas
(biomarcadores).
o  Interconexión con otras redes de telepatología.
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
34
http://www.telepathology2010.com
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
35
Muchas gracias.
[email protected]
Servicio de Salud de Castilla-La Mancha
20/12/11
36