Download Diagnóstico de enfermedades vegetales 2015

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Transcript
Diagnóstico de
enfermedades vegetales
Participantes
{
{
{
{
{
{
{
{
{
{
Vivienne Gepp
Agueda Scattolini
Laura Hernández
Sandra Alaniz
Mª José Montelongo
Pablo González
Elsa Perdomo
Carina Ojeda MGAP
Jacques Borde MGAP
Diego Maeso INIA
2015
Participantes
{
{
{
{
{
{
{
{
INTRODUCCIÓN
Santiago Cores
Vanessa Cuozzo
Pablo Haubman
Valentina Martinez S
Brian Raskin
Federico Scaparoni
Ariel Scarzella
Lucía Villagrán
Cronograma
Objetivos
Desarrollar habilidades para realizar diagnósticos
de enfermedades en plantas
Desarrollar criterio de análisis
Repasar métodos convencionales
Aplicar métodos convencionales
17 de setiembre: Clínica. Diagnóstico. Diagnóstico de bióticas y
abióticas. Esterilización. Medios de cultivo.
23 de setiembre: Áreas del laboratorio. Preparado de medios.
Microscopía básica. Observación de estructuras de hongos
24 de setiembre: Diagnóstico de enfermedades causadas por hongos
y virus. Identificación por T. moleculares. Inoculación de
fitopatógenos.
1 de octubre: Identificación morfológica de H. de inóculo e inoculación
de hongos y virus
8 de octubre: Diagnóstico de enfermedades causadas por nematodos
e identificación de nematodos. Visita al MGAP
15 de octubre: Diagnóstico de enfermedades causadas por bacterias
Aislamiento, identificación e inoculación de bacterias
Adquirir los conocimientos fundamentales para
hacer funcionar una clínica de diagnóstico
22 de octubre: Serología, microscopio electrónico Diagnóstico de
enfermedades causadas por virus. Visita a INIA-LB
29 de octubre: EVALUACION
1
Metodología de trabajo y evaluación
{
Clases presenciales teóricas y prácticas
{
Tareas personales o grupales teóricas y prácticas
{
{
DIAGNÓSTICO
Entrega de informes:
Comentario sobre el reporte de una
enfermedad
Informe de diagnóstico y ejercicios prácticos
Las tareas personales de laboratorio (coordinar)
Evaluación
Flexibilidad de horarios y asistencias
Exigencia en los plazos de entrega
Ejemplo de un proceso de diagnóstico
DIAGNÓSTICO
{
PASOS DEL DIAGNOSTICO
Proceso para determinar la causa de
una enfermedad.
IDENTIFICACIÓN
{
El resultado de este proceso.
Ejemplo de un resultado de diagnóstico
Niveles de confianza de un diagnóstico
{Diagnóstico
positivo
100% confiable
Cuando los postulados de Koch son cumplidos.
{Diagnóstico
“correcto”
>99% confiable
Se registran todas las características de la enfermedad o si no, se explica la razón de
su ausencia.
{
Diagnóstico “útil”
95-99% confiable
Las principales características de la enfermedad están presentes. Es el mas
frecuente
{Diagnóstico
“indicativo” 85-95% confiable = diagnóstico “presuntivo”
La información disponible permite establecer varias posibles causas
{Diagnóstico
“excluyente” 100% confiable
No se sabe la causa pero se descartan algunas posibles
Shurtleff & Averre (1997).
2
Niveles de complejidad
Procedimiento de diagnóstico
LIBROS
DIAGNÓSTICO
SIGNO
1.
{
PLANTA ENFERMA
SÍNTOMA
EXPERIENCIA
Caracterizar el problema
Características de la planta normal y de la
variedad (orígen, grado de resistencia, estado
fisiológico y fenológico)
{
Consulta
de
expertos
mismo,en su entorno y manejo)
{
Planificar diagnóstico
Procedimiento de
comprobación
Caracterizar el cultivo de donde proviene (en si
{
Consultar bibliografía y/o expertos sobre el
cultivo (ppales enfermedades)
Valoración del problema
Procedimiento de diagnóstico
Procedimiento de diagnóstico
2.
3. Comprobación de hipótesis
Plantear presuntas causas
HIPÓTESIS
{
Posible/s causa/s:
{
{
Características biológicas
Procedimientos de confirmación
Siembra y aislamientos
Identificación
Prueba de patogenicidad
(eventualmente)
4. Aceptación o rechazo de hipótesis
Se repasan los pasos 1 y 2 y se replantea
el procedimiento para la misma u otra
hipótesis
Conocer el huésped
Conocer el cultivo!!!!!
3
Importancia de describir síntomas
Cancros y gomosis
Manchas
foliares
en vid
Varias causas posibles
Mirar todo el vegetal
Identificar el síntoma
{
{
{
{
Primario
Secundario
Específico
Síndrome
Identificar los recursos
disponibles
Distribución en el cultivo
Características de una buena muestra
{
Representativa del problema del campo
{
Que incluya síntomas primarios
{
Abundante para:
Observar síntomas en distinto grado de avance
Hacer análisis destructivos
{
{
Eventualmente planta entera con tierra
Bien empaquetada con humedad
suficiente pero no excesiva
4
CLÍNICA DE DIAGNÓSTICO
Tiempo para decantar
¿Qué información adicional necesitamos para
ayudarnos a identificar posibles causas?
(hipótesis)
Actividades
Infraestructura
¿De qué elementos podemos valernos antes de
enviar la muestra a una clínica?
¿Cuales son los pasos que podemos hacer
independientemente de si se necesita o no un
servicio de clínica?
Actividades
1.
Recepción - Formulario de diagnóstico
2.
Análisis primario - Laboratorio “sucio”
3.
Clínica de Diagnóstico
1.
Recepción
(Almacenaje)
z
Formulario de diagnóstico
z
Acondicionamiento de la muestra
z
Recepción de la inquietud del remitente
z
Propósitos del diagnóstico
Para manejo y prevención
4.
Análisis - Laboratorio “limpio”
5.
Resultado
Clínica de Diagnóstico
2. Análisis primario:
zmuestra
zinformación
del formulario
Para reclamo comercial
Para peritaje
Clínica de Diagnóstico
4. Análisis de laboratorio propiamente
acordes a:
z
la hipótesis (bacterias, hongos,…)
z
la infraestructura
z
Las técnicas disponibles
zBibliografía
zDiagnóstico
presuntivo
zderivación
a una “línea de análisis”
zDerivación
o consulta a un experto en el tema
3. Almacenaje en heladera y/o inducción de signo
5. Resultado según el diagnóstico: INFORME
z
Confirmar presencia
z
Identificar causa
z
Realizar peritaje
z
Aconsejar manejo
5
Infraestructura para una Clínica
Laboratorio
Plantas para análisis biológicos
Equipos de trabajo y análisis
Materiales
Materiales básicos
Laboratorio: equipamiento
{ Refrigerador
{ Autoclave
{ Horno
esterilización
{ Incubadora
{ Lupa
{ Microscopio
{ Área de trabajo estéril
Laboratorio: áreas
Unidad de Fitopatología:
{
{
{
{
{
{
{
{
{
Agua destilada o deionizada
Alcohol
Hipoclorito de sodio
Agar
Medios nutritivos
Hidróxido de sodio al 10%
Acido acético o láctico al 10%
Lactofenol y ác. láctico con y sin colorante azul
Lactofuchsina
¿Qué está faltando?
Área de recepción
y laboratorio “sucio”
Lavado, esterilización,
preparación de medios.
Laboratorio “limpio”
Almacenaje
e incubación
Inoculación
de plantas
u órganos
¿Enfermedades bióticas o abióticas?
Los componentes no bióticos del
entorno ambiental de las plantas
pueden causarles daños directamente
o predisponerlas a ser atacadas por
agentes bióticos
6
Enfermedades abióticas, ambientales o fisiológicas
Un factor abiótico es patogénico si:
{
Su valor está por fuera del rango de tolerancia
de la planta
{
Momento de aparición, evolución rápida o no
existente.
Distribución en el cultivo asociada al factor:
z
z
z
El daño es mayor
cuanto más alejado del rango de normalidad
cuanto más dure el valor extremo
cuanto más brusca sea la variación del factor
{
Distribución en las plantas
z
{
En todo el cultivo
En bandas o según manejo realizado
En zonas con determinada característica
Igual posición en todas
Distribución en predio o zona:
z
en plantas de ≠especie
Es MUY IMPORTANTE la información adicional de ambiente y manejo del cultivo de
donde proviene la muestra. Mucho mas que para una enfermedad de origen biótico.
¿Cómo diferencio un mosaico de un variegado?
¿Cómo se si una ornamental miniatura lo es por
una característica varietal o por enanismo?
Signo
¿Causa biótica o abiótica?
¿Cuáles son las pautas que indican que el
síntoma es provocado por un factor abiótico?
7
¿Causa biótica o abiótica?
“Deberes”
A. Diseñe un formulario para el ingreso de
muestras para uno de estos casos:
1.
Enfermedades de cereales
2.
Enfermedades de frutales
3.
Enfermedades de praderas
4.
Enfermedades de cultivos hortícolas
5.
Enfermedades de cultivos florales
6.
Enfermedades de árboles forestales
B. Lea dos reportes de enfermedad y escriba
un informe contestando las preguntas
que se le entregan adjuntas.
8