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Curso OPS- Fundación SABIN. 2013
Achievements and Future Challenges in the
Surveillance of Respiratory Viruses
RSV surveillance in Chile
Dr. Luis Fidel Avendaño
[email protected]
PROGRAMA de VIROLOGIA. ICBM.
Facultad de Medicina. Universidad de Chile
30 Enero 2013
Conclusiones
• La experiencia en Chile muestra que la vigilancia de
RSV es fácil, económica y de gran utilidad.
• La vigilancia debe hacerse todo el año; clínica y de
laboratorio; en 4 niveles de gravedad: ambulatorio,
hospitalizados , UCI, autopsias (centros centinelas).
Debería agregarse “en adultos”.
• La alta transmisibilidad del virus y la variedad de
técnicas de diagnóstico disponibles (IF) son ventajas
• La organización del sistema de salud – aunque no se
disponga de vacunas ni de antivirales – permite reducir
notablemente la letalidad, no así la incidencia del RSV.
Diagnóstico de Infección por VRS
- Diagnóstico clínico y epidemiológico (prensa)
- Inmunodiagnóstico: detección rápida de
antígenos: IF ($), ELISA ($$),
inmunocromatografía ($$)
- Aislamiento en cultivo celular: HEp-2 ($$$$)
- RT-PCR: RLFP, secuenciación ($$$$$$)
- Serología: neutralización, ELISA, IFI; respuesta
celular (LT, citokinas, otras)
Detección de VRS por IFI, aislamiento viral e
inmunocromatografía. Hosp. R. Río, Santiago. Julio 2004
n
Muestras
Muestras
Muestras
140
130
101
Sensibilidad
91
Especificidad
91
Valor Predictivo (+) 91
Valor Predictivo (-) 91
Concordancia total 91
IFI
AISLAM
IC 1
IC 2
66 47%
63 48%
49 49%
56 40%
52 40%
40 40%
74
49
56%
49%
90%
93%
93%
89%
91%
73%
98%
97%
76%
85%
90%
74%
80%
86%
82%
88%
93%
93%
87%
90%
Gold standard (+ verdadero) para 91 muestras: 2 técnicas positivas
IC 1: RSV-1 step ORACHIM
IC 2: RSV Respi – strip, Coris Bio Concept
Yoyo: Cong Microbiol 2004
VIGILANCIA a distintos niveles de población
7 millones de años
1.000 millones de años
Virus
UCI
0.1%
7%
Hospital
2%
Infecciones leves
y moderadas:
consultorios y postas
VRS
Infecciones subclínicas:
TRANSMISION VIRAL
Ambiente
clima, contaminación
4.600 millones de años
Hombre
y mujer
Árbol filogenético de
segmento de 266 nt
de gen G de
VRS A
por NJ
(MEGA)
Ab5076Pt01
SAA1
GA2
GA5
GA3
GA6
GA5
GA7
GA4
GA1
33 VRS de Chile
250 VRS del mundo
Epidemiología en Area Norte de Santiago
• Se hospitaliza el 2% de los niños menores de 2 años.
“Gravedad dependiente del hospedero”:
• Hospitalización > 10 ds.= 15%
(83% con factores de riesgo clásicos)
• Ingresos a UCI para Ventilación Mecánica= 5.8%
(88% con factores de riesgo clásicos)
• Letalidad por VRS en < 2 años, “previamente sanos”
5/4607 = 0.1% (1988-2002)
Palomino MA, Avendaño LF: Pediatría (Stgo) 2003: 38-47
VIGILANCIA DE VIRUS RESPIRATORIOS EN LACTANTES
HOSPITALIZADOS POR INFECCION RESPIRATORIA AGUDA BAJA.
Hospital R. Río. Santiago. 1989 - 2004.
80
1994
70
1996
1998
2002
2000
2004
1989
60
1990
1992
1995
1999
1997
2001
2003
50
40
30
20
10
0
1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4
Avendaño et. al.
ADV
VRS
FLU
PI
Avendaño LF et al. J Clin Microbiol 2003;41:4879-82
RSV Epidemics Shapes. Santiago, 1989-2003.
1989
% RSV detection
100
1991
80
1993
60
1994
1996
40
1998
20
2000
0
2002
J
F
M
A
M
J
J
A
S
O
N
D
MONTHS
100
% RSV detection
1990
80
1992
60
1995
1997
40
1999
2001
20
2003
0
J
F
M
A
M
J
J
A
S
O
N
D
MONTHS
Avendaño et al. J Clin Microbiol 2003; 41: 4879
Determinación de grupos A y B de VRS por IFI
Santiago, Hosp. Roberto del Río. 1994 - 2007
100
%
90
80
70
60
50
A
B
Indet
40
30
20
10
0
1994
1996
1998
2000
2002
2004
2006
Circulan A y B; predominio de A; aumento de B en años pares
Palomino et al. Rev Chil Pediatr 2004; 75: S 18- S 24
Correlación entre diagnóstico microscópico y detección
viral en 66 autopsias de niños fallecidos por neumonía.
Santiago , 1998-2011
AUTOPSIAS
Casos
Virus
Diagn. Microscópico
Nº
VRS
ADV
MPV
FLU
PI
NEG
Neumonía por VRS
13
13
7
2
0
2
0
Neumonía por ADV
11
2
11
0
1
0
0
Neumonía tipo viral
12
5
3
0
1
2
3
Neumonía bacteriana
16
1
4
1
0
1
10
Neumonía mixta
14
1
4
1
0
1
10
Total
66
22
29
4
2
6
17
NO =
26%
Virus detectado
74%
Detección de Virus y Bacterias en 356 ADULTOS con
Neumonía Adquirida en la Comunidad. Santiago, 2005-2007.
Casos estudiados
(-)
(+)
124
232
Bacterias clásicas
S. pneumoniae
H. influenzae
Otros
Bacterias atípicas
M. pneumoniae
Chlamydia sp
Legionella sp.
Sólo virus:
80 (22%)
Sólo bacterias: 92 (26%)
Mixtas:
60 (17%)
35%
65%
75
3
20
32
28
13
41
27
48
41
20
3
27.5 %
73
20.5 %
140
39.3 %
21.1 %
0.8 %
5.6%
9.0 %
7.9 %
5.0 %
Virus
Picornavirus
Influenza
VRS
Metapneumovirus
Coronavirus
ADV
98
11.5 %
7.6 %
13.5 %
11.5 %
5.6 %
0,8%
RT-PCR
RT-PCR
RT-PCR
RT-PCR
CAMPAÑAS DE INVIERNO en Chile (desde 1994):
disminuir muertes por infecciones respiratorias
-
1.
2.
3.
Se inicia la VACUNACION CONTRA INFLUENZA
NIVEL AMBULATORIO
Educar al público (prensa, TV) para consulta precoz
(síntomas y población de riesgo)
Extensión horaria de atención en consultorios ambulatorios
NIVEL HOSPITALARIO
Diagnóstico rápido (IF) permanente de virus respiratorios
Aumento de personal y dotación de camas en todo el país
- se postergan cirugías para reconvertir camas
- intercambio público privado
Disponibilidad de O2 y de ventiladores mecánicos
Girardi G. et al. Rev Chil Pediatr 2001; 73: 292-300.
Dr. P Astudillo, 2008
N° fallecidos
800
760
700
600
500
400
300
200
100
45
0
1990
2007
Conclusiones
• La experiencia en Chile muestra que la vigilancia de
RSV es fácil, económica y de gran utilidad.
• La vigilancia debe hacerse todo el año; clínica y de
laboratorio; en 4 niveles de gravedad: ambulatorio,
hospitalizados , UCI, autopsias (centros centinelas).
Debería agregarse “en adultos”.
• La alta transmisibilidad del virus y la variedad de
técnicas de diagnóstico disponibles (IF) son ventajas
• La organización del sistema de salud – aunque no se
disponga de vacunas ni de antivirales – permite reducir
notablemente la letalidad, no así la incidencia del RSV.
TEMPERATURA Y LLUVIAS
120
n° egresos
Año 2002
nº consultas
100
90
tº media
Agua caida
80
Egresos y consultas
70
80
60
60
50
40
40
30
tº media y mm de agua caída
100
20
20
10
0
10
0
12
14
16
18
20
22
24
26
Semana
28
30
32
34
36
38
40
42
Avendaño et al. Rev Méd Chile 2003;131: 902.
Relación entre hospitalizaciones y consultas
por IRAB y contaminación aérea.
Santiago, Chile. 2002.
n° egresos
Al erta o
pre-emergenci a
120
200
nº consultas
MP10
150
80
100
MP10
Egresos y consultas
100
60
50
40
0
20
0
-50
10
12
14
16
18
20
22
24
26
28
30
32
34
36
38
40
42
Semana
Avendaño et al. Rev Méd Chile 2003;131: 902.
IMPACTO DEL VRS
120
n° consultas
nº egresos
100
90
% VRS
100
80
50
60
% Virus
60
40
40
30
20
20
10
42
40
38
36
34
32
30
28
26
24
22
20
18
16
14
0
12
0
10
Egresos y consultas
70
Año 2002
80
Semana
Avendaño et al. Rev Méd Chile 2003;131: 902.